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      抗菌肽融合表達(dá)研究進(jìn)展

      2011-02-09 09:31:48馬青山余占橋韓冰張日俊
      生物工程學(xué)報(bào) 2011年10期
      關(guān)鍵詞:抗菌肽谷胱甘肽宿主

      馬青山,余占橋,韓冰,張日俊

      中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)飼料生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室 動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100193

      抗菌肽融合表達(dá)研究進(jìn)展

      馬青山,余占橋,韓冰,張日俊

      中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)飼料生物技術(shù)實(shí)驗(yàn)室 動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100193

      抗菌肽抗菌譜廣、活性穩(wěn)定,且具有與抗生素不同的抗菌機(jī)制,在抑殺病原微生物的同時(shí)不易產(chǎn)生耐藥性,因而在食品、飼料、醫(yī)藥等領(lǐng)域具有重要的應(yīng)用價(jià)值。基因工程技術(shù)是降低抗菌肽生產(chǎn)成本的主要方式,其中融合表達(dá)在提高抗菌肽產(chǎn)量方面起到了重要作用。文中綜述了抗菌肽融合表達(dá)的國(guó)內(nèi)外研究進(jìn)展,探討了部分融合標(biāo)簽用于抗菌肽表達(dá)的策略,并對(duì)今后的發(fā)展提出了自己的看法。

      抗菌肽,基因工程技術(shù),融合表達(dá)

      1 抗菌肽融合表達(dá)概述

      1.1 抗菌肽生物學(xué)特性

      抗菌肽是由生物細(xì)胞通過(guò)核糖體合成機(jī)制產(chǎn)生的一類具有抗菌活性的多肽或蛋白質(zhì),按來(lái)源可分為哺乳動(dòng)物抗菌肽、昆蟲抗菌肽、魚類抗菌肽、蛙類抗菌肽、植物抗菌肽和微生物抗菌肽 (細(xì)菌素);按結(jié)構(gòu)特點(diǎn)可分為 α-螺旋型抗菌肽、β-折疊型抗菌肽、具有片層結(jié)構(gòu)的抗菌肽和具有環(huán)狀結(jié)構(gòu)的抗菌肽[2]??咕目咕V廣,且有著不同于傳統(tǒng)抗生素的抗菌機(jī)制,一般由20~60個(gè)氨基酸殘基組成,分子量約為2~7 kDa,通常為陽(yáng)離子形式存在,具有強(qiáng)堿性,同時(shí)具有熱穩(wěn)定性和較寬的pH耐受范圍等特點(diǎn),許多抗菌肽在100 ℃加熱10 min后仍能保持一定活力[3]。

      抗菌肽在體內(nèi)可以通過(guò)自身的免疫機(jī)制來(lái)抵御環(huán)境中容易侵染宿主的病原微生物[4-5],而且近年研究發(fā)現(xiàn),某些抗菌肽同時(shí)具有選擇殺傷腫瘤細(xì)胞[6]、抑制HBV、HIV等病毒的復(fù)制等功能,且抗菌肽僅作用于原核細(xì)胞和發(fā)生病變的真核細(xì)胞,對(duì)正常的真核細(xì)胞幾乎無(wú)作用[7-8]。

      1.2 抗菌肽融合表達(dá)及意義

      迄今為止,大約有 2 000多種抗菌肽已經(jīng)被分離出來(lái),部分已應(yīng)用于畜牧業(yè)、食品加工業(yè)、醫(yī)療衛(wèi)生業(yè)等行業(yè)[9],但由于生產(chǎn)成本居高不下,制約了抗菌肽大規(guī)模應(yīng)用。同天然提取及化學(xué)合成法相比,通過(guò)生物表達(dá)系統(tǒng)異源表達(dá)抗菌肽顯著降低了生產(chǎn)成本,具有良好的應(yīng)用前景[10]。但由于抗菌肽一般是一些陽(yáng)離子小分子多肽,極易在蛋白酶的作用下降解,而且表達(dá)產(chǎn)物往往對(duì)宿主細(xì)胞有毒性作用,易造成宿主細(xì)胞的死亡,因此,為了降低抗菌肽對(duì)宿主細(xì)胞的毒性,同時(shí)提高其表達(dá)量、簡(jiǎn)化分離純化過(guò)程,抗菌肽的異源表達(dá)經(jīng)常融合一些蛋白標(biāo)簽,其作用類似于天然抗菌肽產(chǎn)生過(guò)程中能夠保護(hù)抗菌肽及宿主菌的前導(dǎo)肽部分[11]??咕娜诤媳磉_(dá)經(jīng)常使用的融合標(biāo)簽如下:谷胱甘肽硫轉(zhuǎn)移酶 (Glutathione S-transferase)[12-14],硫氧化還原蛋白 (Thioredoxin)[15-17],綠色熒光蛋白 (Green fluorescent protein)[18-19],Protein PaP3.30[20],外殼蛋白 (Site-mutated coat protein)[21-22],類彈性蛋白(Elastin-like polypeptides)[23-25],CMP-3-脫氫-D-甘露-辛酮糖酸合成酶 (CMP-KDO synthetase)[26],酮類固醇異構(gòu)酶 (Ketosteroid isomerase)[27],小分子泛素樣修飾蛋白 (Small ubiquitin-related modifier)[28-29]等(見(jiàn)表1)。

      以上標(biāo)簽與抗菌肽融合表達(dá)最終是為了獲取抗菌肽,因此需要將融合蛋白進(jìn)行切割,進(jìn)一步分離純化出抗菌肽。近年,亦有部分研究者將抗菌肽與其他功能蛋白融合表達(dá),使融合蛋白具有雙功能特性,融合蛋白即是目的蛋白,不需進(jìn)一步分離。Pan等將具有免疫原性的Ag85B基因與α2b干擾素基因在酵母中融合表達(dá),在發(fā)酵上清中檢測(cè)到了具有抗病毒活性的融合蛋白,該融合蛋白可能同時(shí)實(shí)現(xiàn)Ag85B刺激產(chǎn)抗體功能及α干擾素的抗病毒和免疫調(diào)節(jié)因子功能[30]。

      表1 抗菌肽融合表達(dá)統(tǒng)計(jì)表Table 1 Antimicrobial peptides expressed as fusion proteins

      續(xù)表1

      1.3 抗菌肽融合蛋白標(biāo)簽設(shè)計(jì)原則

      抗菌肽融合蛋白標(biāo)簽的選擇常遵循以下原則:1) 融合蛋白標(biāo)簽的分子量最好為抗菌肽的3~4倍,這樣將有利于后期抗菌肽的分離、純化。2) 等電點(diǎn)至少高于或低于抗菌肽等電點(diǎn) 2個(gè) pH單位。Wei等選擇等電點(diǎn)為 5.83的桿狀病毒多角體蛋白(Baculoviral Polyhedrin Protein) 作為融合蛋白標(biāo)簽,表達(dá)等電點(diǎn)為8.24的抗菌肽Halocidin,獲得占菌體蛋白 30%、純度 90%以上的目的抗菌肽[37]。3) 由于目前發(fā)現(xiàn)的抗菌肽多具有陽(yáng)離子性質(zhì),所以可選擇酸性的融合蛋白標(biāo)簽以中和其正電荷,以降低對(duì)宿主菌的毒性[38]。Wang等將抗菌肽HKABF與酸性前導(dǎo)肽融合表達(dá),而后利用腸激酶進(jìn)行切割,發(fā)現(xiàn)表達(dá)的重組抗菌肽顯示出良好的抑菌活性[10]。4) 融合蛋白標(biāo)簽同抗菌肽的融合位點(diǎn)應(yīng)存在化學(xué)試劑或蛋白酶特異切割位點(diǎn),以便抗菌肽的活性恢復(fù)及后續(xù)的分離純化[39]。5) 對(duì)表達(dá)宿主無(wú)害。Rao等以綠膿桿菌噬菌體蛋白 PaP3.30為融合蛋白標(biāo)簽,該蛋白完全滿足上述 5個(gè)條件,將該蛋白的編碼基因連接入pQE-32構(gòu)建成大腸桿菌表達(dá)載體pQE-PaP30,成功實(shí)現(xiàn)了6種抗菌肽hPAB-β、MSI-78、蜂毒素、天蠶素 A、一種來(lái)源于羊的陰離子多肽在大腸桿菌中的高效表達(dá)[20]。

      2 常用抗菌肽融合蛋白標(biāo)簽及其表達(dá)策略

      如前所述,降低抗菌肽對(duì)表達(dá)宿主的毒性作用及被蛋白酶降解的程度,同時(shí)簡(jiǎn)化后續(xù)的分離純化工作是選擇融合蛋白標(biāo)簽的主要目的[27],通過(guò)對(duì)最新文獻(xiàn)檢索發(fā)現(xiàn),抗菌肽融合蛋白標(biāo)簽的使用主要集中在硫氧化還原蛋白 (Trx)、谷胱甘肽硫轉(zhuǎn)移酶(GST) 等 (表 2),而表達(dá)宿主主要是大腸桿菌表達(dá)系統(tǒng) (表3)。

      2.1 硫氧化還原蛋白 (Trx) 融合標(biāo)簽

      硫氧化還原蛋白是一類存在于細(xì)菌、植物及動(dòng)物等多種生物體內(nèi)的耐熱蛋白[41],作為E. coli核苷酸還原酶的電子供體第一次被發(fā)現(xiàn)[42],相對(duì)分子質(zhì)量為17 kDa,溶解度很高,大腸桿菌中最高表達(dá)量可達(dá)到菌體蛋白總量的40%。由于Trx融合蛋白不僅能夠增加重組蛋白的可溶性,降低重組蛋白被宿主蛋白酶降解的機(jī)率,而且能夠催化胞質(zhì)中重組蛋白二硫鍵的形成[43],所以目前利用Trx蛋白融合表達(dá)的重組抗菌肽數(shù)目遠(yuǎn)多于使用其他融合標(biāo)簽[40]。但是,由于 Trx融合蛋白標(biāo)簽不能用專門的親和基質(zhì)純化,所以融合蛋白構(gòu)建時(shí)最好與可用于純化的小親和標(biāo)簽聯(lián)用,如 6×His標(biāo)簽。Bang等將抗菌肽hin/MSH與6×His-Trx蛋白融合表達(dá),發(fā)現(xiàn)融合蛋白占菌體總蛋白的 20%以上,并且 50%以上以可溶形態(tài)存在,后期通過(guò) Ni柱親和層析純化及腸激酶切割復(fù)性,重組抗菌肽產(chǎn)量達(dá)210 mg/L,且具有良好的抗菌活性[31]。另外,Wang等利用Trx融合蛋白系統(tǒng)表達(dá)人源防御素-4,融合蛋白占菌體蛋白量高達(dá)60%,切割純化后目標(biāo)蛋白產(chǎn)量達(dá)102 mg/L,且具有良好的生物活性[30]。值得注意的是在使用Trx融合蛋白時(shí)采用低溫誘導(dǎo)能夠提高融合抗菌肽的可溶性[44]。至于切割方式的選擇,不同的研究有著不同的結(jié)果,大部分研究認(rèn)為酶切是比較有效的切割方式,但也有些研究表明化學(xué)切割效率更高[45-48]。

      2.2 谷胱甘肽硫轉(zhuǎn)移酶 (GST) 融合標(biāo)簽

      GST融合表達(dá)是將谷胱甘肽S轉(zhuǎn)移酶與目標(biāo)蛋白以融合蛋白的方式進(jìn)行外源表達(dá),融合蛋白可從未經(jīng)處理的裂解液中用固定化的谷胱甘肽瓊脂糖親和層析加以純化,結(jié)合的融合蛋白在非變性條件下用10 mmol/L還原型谷胱甘肽進(jìn)行洗脫[49],融合蛋白通過(guò)位點(diǎn)專一的蛋白酶如凝血酶或 Xa-因子切除GST部分,獲得目的蛋白。由于GST標(biāo)簽有助于保護(hù)重組蛋白免受胞外蛋白酶的降解,提高其穩(wěn)定性、可溶性,并且通過(guò)親和層析簡(jiǎn)化后續(xù)的純化工作,所以抗菌肽同GST標(biāo)簽融合表達(dá)將顯著提高其表達(dá)量、降低生產(chǎn)成本。本研究組利用GST標(biāo)簽表達(dá)植物乳桿菌素PlnE和PlnF,經(jīng)親和層析純化后,獲得2種產(chǎn)量高達(dá)30%的純品融合蛋白,表明此種融合表達(dá)對(duì)宿主不會(huì)產(chǎn)生毒害作用,但酶切后未檢測(cè)到抑菌活性,這可能是由于酶切后PlnE和PlnF摩爾配比未達(dá)到最佳造成,不過(guò)值得肯定的是GST標(biāo)簽在表達(dá)對(duì)宿主細(xì)胞有毒害作用的蛋白中發(fā)揮的重要作用[50]。另外,F(xiàn)an等將4.7 kDa的抗菌肽PR-39與 GST標(biāo)簽融合表達(dá),通過(guò)谷胱甘肽瓊脂糖親和層析純化及腸激酶切割,獲得具有抗菌活性目的蛋白 1.9 mg/L[13]。但是,也有研究發(fā)現(xiàn)將抗菌肽CecropinB和 GST標(biāo)簽融合表達(dá)后造成了宿主細(xì)胞

      E. coli的死亡,這可能是由于融合蛋白具有殺傷原核細(xì)胞的作用[51],形成包涵體或者利用真核細(xì)胞表達(dá)系統(tǒng)可能是解決這一問(wèn)題的一個(gè)途徑。GST融合蛋白標(biāo)簽表達(dá)抗菌肽的另一個(gè)問(wèn)題是由于其分子量比較大 (27 kDa),而抗菌肽通常是小分子量多肽,這樣會(huì)造成抗菌肽在融合蛋白中比例偏低,降低表達(dá)效率[40]。

      表2 抗菌肽融合表達(dá)標(biāo)簽使用情況統(tǒng)計(jì)表Table 2 Tags for fusion expression of antimicrobial peptides

      表3 重組抗菌肽不同表達(dá)宿主使用情況統(tǒng)計(jì)表Table 3 Antimicrobial peptides expressed with different host

      2.3 小分子泛素樣修飾蛋白 (SUMO) 融合標(biāo)簽

      最近,一種新型的表達(dá)系統(tǒng)漸漸發(fā)展了起來(lái),即將小分子泛素樣修飾蛋白基因與目的蛋白基因連接,組成融合表達(dá)載體進(jìn)行表達(dá)。SUMO是一種同泛素結(jié)構(gòu)類似但功能不同的小分子量蛋白質(zhì) (大約由 100個(gè)氨基酸組成),能夠幫助目的蛋白正確折疊,由于其具有疏水的核心及親水的表面,可明顯提高目的蛋白的可溶性及表達(dá)量[52]。融合蛋白表達(dá)出來(lái)后,經(jīng)過(guò)特異性的SUMO蛋白酶進(jìn)行切割,不同于其他的蛋白酶,SUMO蛋白酶能夠特異識(shí)別SUMO的三級(jí)結(jié)構(gòu),這樣就能夠完全避免對(duì)目的抗菌肽的切割,使酶切后的目的蛋白具有天然的 N端,這對(duì)于保持抗菌肽活性至關(guān)重要[53-55]。另外,同Trx融合標(biāo)簽類似,SUMO融合標(biāo)簽分子量比較小 (12 kDa),提高了目的肽在融合蛋白中的比例,這對(duì)提高抗菌肽的產(chǎn)量比較有利。基于以上優(yōu)點(diǎn),SUMO表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)抗菌肽獲得比較理想的效果,在我們目前的研究工作中,利用大腸桿菌SUMO表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)細(xì)菌素 Lactin Q,融合蛋白 6×His SUMO-Lactin Q主要以可溶形態(tài)存在,過(guò) Ni-NTA柱純化后,其產(chǎn)量約為 110 mg/L,融合蛋白經(jīng)SUMOase切割后,發(fā)現(xiàn)重組Lactin Q對(duì)金黃色葡萄球菌有明顯抑制作用。Li等利用大腸桿菌SUMO表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)天蠶抗菌肽ABP-CM4、人源防御素-4,表達(dá)量分別達(dá)到48 mg/L、166 mg/L,并且抗菌活性與天然抗菌肽相當(dāng)[28,32]。Chen等構(gòu)建枯草芽胞桿菌SUMO表達(dá)系統(tǒng)并用其表達(dá)重組抗菌肽 Cecropin AD,產(chǎn)量達(dá)到30.6 mg/L,對(duì)金黃色葡萄球菌的MICs (Minimal inhibitory concentrations,最小抑菌濃度)僅為0.2 μg/mL[56]??偟膩?lái)看,SUMO融合表達(dá)抗菌肽的報(bào)道還不是很多,但隨著商品化的SUMO表達(dá)載體的開(kāi)發(fā),SUMO融合表達(dá)系統(tǒng)以其高的表達(dá)量、簡(jiǎn)單高效的純化方式,必將在抗菌肽生產(chǎn)中發(fā)揮重要作用。

      3 結(jié)語(yǔ)

      隨著新型融合標(biāo)簽表達(dá)系統(tǒng)的不斷開(kāi)發(fā),抗菌肽融合表達(dá)越來(lái)越受到研究者的青睞,同Trx、GST及SUMO等標(biāo)簽融合表達(dá)能夠顯著提高重組抗菌肽可溶性、產(chǎn)量;簡(jiǎn)化分離純化過(guò)程;降低生產(chǎn)成本,但不同抗菌肽表達(dá)結(jié)果不同。為提高其產(chǎn)量及活性,需進(jìn)行融合標(biāo)簽同表達(dá)載體及菌株等的優(yōu)化組合并進(jìn)行相關(guān)的遺傳設(shè)計(jì)與改造,同時(shí)需對(duì)溫度、pH、培養(yǎng)基組成等表達(dá)條件進(jìn)行優(yōu)化。

      從長(zhǎng)遠(yuǎn)來(lái)看,在抗菌肽融合表達(dá)研究方面,如何進(jìn)一步提高產(chǎn)量及進(jìn)一步降低分離純化成本仍是需要解決的主要問(wèn)題,串聯(lián)表達(dá)目的抗菌肽及構(gòu)建分泌型表達(dá)載體或許是解決這一問(wèn)題的新途徑。隨著技術(shù)的發(fā)展,越來(lái)越多的融合標(biāo)簽系統(tǒng)用于抗菌肽的異源表達(dá),使低成本大量生產(chǎn)抗菌肽成為可能。在細(xì)菌耐藥性日益嚴(yán)重的今天,抗菌肽的應(yīng)用將在醫(yī)學(xué)、食品衛(wèi)生、畜牧行業(yè)中發(fā)揮重要的作用。

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      Research progress in fusion expression of antimicrobial peptides

      Qingshan Ma, Zhanqiao Yu, Bing Han, and Rijun Zhang
      Laboratory of Feed Biotechnology, State Key Laboratory of Animal Nutrition, China Agricultural University, Beijing 100193, China

      Antimicrobial peptides (AMPs) are of great significance in the field of food, feed and medicine due to their wide spectrum of antimicrobial activity and new mechanism of action different from conventional antibiotics. AMPs production from natural sources is usually limited, and chemical synthesis is not economically practical, especially for the production of long peptides. Therefore, heterologous expression of AMPs has been widely studied as an alternative, and fusion expression plays an important role in increasing production. The present review mainly focuses on the types and bioactivities of AMPs. In addition, the recent strategies to the most commonly used carrier proteins for fusion expression of AMPs and prospects for future research were also discussed.

      antimicrobial peptides, genetic engineering, fusion expression

      目前,細(xì)菌、真菌對(duì)抗生素產(chǎn)生的耐藥性正在以驚人的速度增加,如近些年出現(xiàn)的超級(jí)細(xì)菌,這引起了全世界對(duì)現(xiàn)有抗生素藥物療效的普遍擔(dān)憂[1],新型抗生素替代品的開(kāi)發(fā)迫在眉睫??咕囊蚱鋬?yōu)良的抗菌特性和安全性有望成為抗生素的理想替代品。

      March 11, 2011; Accepted: June 7, 2011

      Supported by:National Natural Science Foundation of China (No. 30972124).

      Rijun Zhang. Tel: +86-10-62731208; E-mail: zhangrj621@yahoo.com.cn

      國(guó)家自然科學(xué)基金 (No. 30972124) 資助。

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