Reaxys數(shù)據(jù)庫的功能提升與檢索技巧

孫 君 楊毓麗 夏立娟

（大連理工大學(xué)圖書館，遼寧 大連 116024）

孫 君 女，1971年生。碩士，館員。

Reaxys是全球三大出版集團(tuán)之一愛思維爾（Elsevier）公司在2009年新推出的一款新穎實(shí)用的檢索和合成路線設(shè)計(jì)工具，目前國內(nèi)十幾所高校圖書館通過CALLS組團(tuán)的方式正式購買，大家已經(jīng)可以享受到Reaxys數(shù)據(jù)庫給化學(xué)化工等領(lǐng)域的專業(yè)人士帶來的極大便利。

1 Reaxys數(shù)據(jù)庫簡(jiǎn)介

Reaxys數(shù)據(jù)庫是Elsevier公司將原有的Crossfire Beilstein、Crossfire Gmelin以及新增的專利化學(xué)數(shù)據(jù)庫內(nèi)容進(jìn)行整合后的升級(jí)產(chǎn)品，比以前的數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)量增加了20%。

1.1 CrossFire Gmelin數(shù)據(jù)庫

CrossFire Gmelin數(shù)據(jù)庫是一個(gè)數(shù)值和事實(shí)型數(shù)據(jù)庫，它將傳統(tǒng)的Gmelin手冊(cè)電子化，并將其內(nèi)容大大豐富了，CrossFire Gmelin數(shù)據(jù)庫所覆蓋的范圍是無可比擬的，包括來源于《Gmelin Handbook of Inorganic and Organometallic Chemistry》（1772 ～1975）的數(shù)據(jù)，以及來源于1975年以后的包括材料科學(xué)期刊中的數(shù)據(jù)，是無機(jī)和金屬有機(jī)化學(xué)領(lǐng)域收錄數(shù)據(jù)最廣泛的數(shù)據(jù)庫，是高質(zhì)量無機(jī)和金屬有機(jī)化學(xué)數(shù)據(jù)的同義詞。

1.2 CrossFire Beilstein數(shù)據(jù)庫

CrossFire Beilstein數(shù)據(jù)庫是世界上最大的有機(jī)化學(xué)事實(shí)數(shù)據(jù)庫，數(shù)據(jù)來源為1779年至1959年《Beilstein Handbook》、《Beilstein有機(jī)化學(xué)大全》從正編到第四補(bǔ)編的全部?jī)?nèi)容和1960年以來的原始文獻(xiàn)（各種國際性的科學(xué)雜志以及專利文獻(xiàn)、某些重要的學(xué)位論文和會(huì)議報(bào)告等）中述及的所有有機(jī)化合物的性質(zhì)及其制備方法。CrossFire Beilstein數(shù)據(jù)庫以電子方式提供包含可供檢索的化學(xué)結(jié)構(gòu)和化學(xué)反應(yīng)、相關(guān)的化學(xué)和物理性質(zhì)，以及詳細(xì)的藥理學(xué)和生態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)在內(nèi)的最全面的信息資源，最早的數(shù)據(jù)可追溯到1771年。

1.3 專利化學(xué)數(shù)據(jù)庫

Reaxys中新增加的專利化學(xué)數(shù)據(jù)庫（Patent Chemistry database），是來自世界知識(shí)產(chǎn)權(quán)組織（1978年至今）、歐洲專利局（1978年至今）以及美國專利局（1976年至今）的英文專利信息。新增的這部分內(nèi)容，可以使科學(xué)家們獲得完整的反應(yīng)操作步驟、Markush結(jié)構(gòu)以及專利的用途等。

Reaxys對(duì)原始文獻(xiàn)中的數(shù)據(jù)，根據(jù)其重要性和相關(guān)性進(jìn)行篩選和整合，提供化學(xué)結(jié)構(gòu)、化學(xué)反應(yīng)、相關(guān)的化學(xué)和物理性質(zhì)以及詳細(xì)的藥理學(xué)信息，使科學(xué)家們能夠更快更準(zhǔn)確地得到相關(guān)數(shù)據(jù)。

2 Reaxys新功能

與前代的CrossFire數(shù)據(jù)庫相比，Reaxys數(shù)據(jù)庫新增了如下功能：

①網(wǎng)絡(luò)訪問模式：Reaxys服務(wù)平臺(tái)改變了原有CrossFire的客戶端訪問模式，提供了基于網(wǎng)絡(luò)訪問的工作流模式。用戶只需在網(wǎng)絡(luò)瀏覽器輸入www.reaxys.com就可以直接進(jìn)入數(shù)據(jù)庫，Reaxys基于IP進(jìn)行訪問，用戶只要在有效IP范圍內(nèi)，均可以快速登錄系統(tǒng)。另外，與Crossfire Commander相比，Reaxys數(shù)據(jù)庫的界面也更直觀、更人性化，使用界面更符合大眾使用習(xí)慣，更容易入手。

②從名字生成化學(xué)結(jié)構(gòu)（generate structure from name）功能：對(duì)于一個(gè)復(fù)雜結(jié)構(gòu)的化學(xué)物質(zhì)來說，通過畫圖工具來畫出它的化學(xué)結(jié)構(gòu)不是一件輕松的事，有了這個(gè)工具，用戶就可以通過已知的化學(xué)商品名、化學(xué)名（Chemical Name）、化學(xué)物質(zhì)登記號(hào)（CAS-No）、簡(jiǎn)化分子線性輸入規(guī)范（Smiles）和IUPAC國際化工標(biāo)識(shí)符（InChI-Key）等途徑快速獲得它的結(jié)構(gòu)式，極大地節(jié)省了用戶的畫圖時(shí)間。而且化學(xué)結(jié)構(gòu)圖在反應(yīng)檢索和物質(zhì)檢索界面可以自由轉(zhuǎn)換，只需單擊“Copy to reactions（substances）tab”就可以實(shí)現(xiàn)二者的輕松轉(zhuǎn)換。

③檢索結(jié)果自動(dòng)排列功能：Reaxys將檢索式和每一次的檢索結(jié)果以方框的形式自動(dòng)按檢索順序排列在每個(gè)檢索結(jié)果界面的上方，通過點(diǎn)擊需要的方框回到上一個(gè)查詢結(jié)果，可以再次進(jìn)行其他條件的篩選，從而獲得多角度、多方面的檢索結(jié)果。

④合成路線的智能設(shè)計(jì)：Reaxys為用戶提供了方便快捷的化學(xué)反應(yīng)路線圖，用戶通過點(diǎn)擊合成（synthesize）和添加（add）按鈕就可以輕松獲得從原材料到產(chǎn)物的多部反應(yīng)路線圖，而且每一個(gè)反應(yīng)中間體都可以同時(shí)獲得多種反應(yīng)途徑，這是其他數(shù)據(jù)庫所無法比擬的。

⑤二次篩選功能：Rreaxys提供了便利的二次檢索功能，當(dāng)用戶對(duì)第一次檢索結(jié)果不滿意時(shí)，通過右邊的限定條件可以方便地對(duì)檢索結(jié)果進(jìn)行限定，展開的二次檢索欄目，已經(jīng)自動(dòng)分類，并通過多次多角度的檢索獲得滿意的檢索結(jié)果。而且Rreaxys系統(tǒng)增加了排除功能，對(duì)不需要的檢索條目，需要從檢索結(jié)果中去除，利用此功能可以方便地把一些不需要的檢索結(jié)果去除掉，多步驟的二次檢索功能避免了一次檢索時(shí)因檢索條件太嚴(yán)格漏掉有用信息，二次篩選功能是快速、高效檢索文獻(xiàn)的利器。

⑥便捷的更新提醒功能：Reaxys提供了更加方便的個(gè)性化提醒功能，無論是檢索結(jié)果界面還是檢索歷史界面，在每個(gè)檢索式的下面都提供了一個(gè)創(chuàng)立提醒功能按鈕，用戶只需填寫簡(jiǎn)單的信息就可以輕松獲得每次更新的信息。

⑦檢索結(jié)果的排序功能：Reaxys對(duì)檢索結(jié)果提供了多角度的排序功能，以反應(yīng)檢索為例，系統(tǒng)提供了Reaxys RXID、產(chǎn)物實(shí)用性、反應(yīng)物實(shí)用性、Reaxys分級(jí)、出版年、參考文獻(xiàn)數(shù)、產(chǎn)物的分子量和產(chǎn)量等途徑的排序方式，其他條件相近的情況下，用戶通常希望得到高的產(chǎn)率，用戶只需讓所有反應(yīng)按產(chǎn)率排列，高產(chǎn)率的反應(yīng)就會(huì)排在前面，幫助用戶更快捷地獲得需要的反應(yīng)信息。

此外，系統(tǒng)還提供了檢索條件的本地保存功能、批處理功能以及檢索歷史的在線保存功能等，當(dāng)用戶再次對(duì)相同問題進(jìn)行檢索時(shí)，利用上面的功能就可免去重復(fù)提交檢索條件的麻煩。

3 檢索方法和技巧

Reaxys數(shù)據(jù)庫有3種基本檢索方式：文獻(xiàn)檢索（Text、authors and more）、反應(yīng)檢索（Reactions）和物質(zhì)與性能檢索（Substances and Properties）。下面就以具體實(shí)例詳細(xì)介紹Reaxys數(shù)據(jù)庫的3種基本檢索方法。

3.1 文獻(xiàn)檢索（Text、authors and more）

文獻(xiàn)檢索是一種與SCI或EI等其他數(shù)據(jù)庫比較相似的文獻(xiàn)檢索方法，包括基本格式（Form-based）和高級(jí)檢索（Advanced）?；緳z索提供了快速檢索（Quick Search）功能，指的是對(duì)一或兩個(gè)關(guān)鍵詞的檢索，以及對(duì)作者/專利權(quán)人（Author/Assignee）、刊名（Journal Title）、專利號(hào)（Patent Number）、專利國（Patent Country）和出版年（Publication Year）等途徑的檢索。高級(jí)檢索（Advance）是類似于CrossFire中的事實(shí)檢索（Fact Search）的檢索方式，需要編寫檢索式，不過檢索式的編寫非常方便，檢索框下面提供了詳細(xì)的檢索領(lǐng)域，對(duì)需要的檢索域代碼（field code）進(jìn)行雙擊，然后填寫域值（field value），當(dāng)輸入的詞不確定時(shí)，還可以使用截詞符，用“*”代替任意多個(gè)字符，系統(tǒng)支持左截?cái)嗷蛘哂医財(cái)?，然后選擇不同域代碼間的邏輯關(guān)系，邏輯關(guān)系（operate）包括“near”、“and”、“next”、“not”、“or”以及“proximity”等6種布爾組配。

實(shí)例1：查找文章標(biāo)題中有“P-type Semiconductors”的文獻(xiàn)

首先點(diǎn)擊文獻(xiàn)檢索中的高級(jí)檢索，在檢索語法（Check Syntax）框中輸入“title”，點(diǎn)擊“Search for field”顯示如下信息：Bibliographic Data：Citation：Journal Title（CIT.JT）Journal Title（Short）（CIT.JTS）Abstract：Title（AB.TI），引文下的題名是指刊物名稱，文摘中的題名才是我們需要的文章題名，單擊Abstract下的Title，然后單擊省略號(hào)選框并輸入“p”，選擇p（30227）并單擊轉(zhuǎn)換（Transfer）按鈕，用同樣的方法輸入type和Semiconductors，只是在邏輯關(guān)系的選擇時(shí)P與type之間用“next”，表示這兩個(gè)詞是緊挨著并是有順序的，在輸入“Semiconductors”時(shí)會(huì)發(fā)現(xiàn)詞尾有許多變化的形式，為了避免漏檢，我們通常采用截詞形式的檢索式：AB.TI=‘p’next AB.TI=‘type’ANDAB.ti=‘semiconduct*’，然后單擊“Search”按鈕，即得到93條文章題目中有“P-type Semiconductors”的文獻(xiàn)。

3.2 反應(yīng)檢索（Reactions）

反應(yīng)檢索實(shí)際上相當(dāng)于一個(gè)反應(yīng)式檢索（Reactions）和條件檢索（Conditions）組合的聯(lián)合檢索，當(dāng)然也可以單獨(dú)使用反應(yīng)式檢索或條件檢索，通過聯(lián)合檢索可以更加準(zhǔn)確地得到所需要的反應(yīng)。

實(shí)例2：查找產(chǎn)量為80%以上的阿司匹林合成反應(yīng)

雙擊反應(yīng)檢索框，使用畫圖工具畫出阿司匹林的結(jié)構(gòu)式，單擊轉(zhuǎn)換（Transfer）按鈕返回檢索界面，或者在已知阿司匹林化學(xué)名、化學(xué)物質(zhì)登記號(hào)、簡(jiǎn)化分子線性輸入規(guī)范或IUPAC國際化工標(biāo)志符的情況下，點(diǎn)擊由名字生成結(jié)構(gòu)按鈕（Generate structure from name），把上述任何一種標(biāo)識(shí)符輸入檢索框，點(diǎn)擊提交（Submit）按鈕，就可以快速生成結(jié)構(gòu)圖，結(jié)構(gòu)圖的右側(cè)提供了對(duì)所畫結(jié)構(gòu)的限制條件，可以設(shè)定為產(chǎn)物、反應(yīng)物、任何一個(gè)、試劑/催化劑在本題中選擇產(chǎn)物，然后，選定所畫結(jié)構(gòu)或子結(jié)構(gòu)，為了檢索的精確性，選擇精確結(jié)構(gòu)檢索，然后單擊條件（Conditions（form-based））按鈕，在產(chǎn)量（Yield）一欄的運(yùn)算關(guān)系中選擇大于號(hào)，產(chǎn)量一欄填上80，然后點(diǎn)擊檢索按鈕，便可以得到7個(gè)產(chǎn)量在80%以上的阿司匹林的合成反應(yīng)。

3.3 物質(zhì)與性能檢索（Substances and Properties）

物質(zhì)與性能檢索與反應(yīng)檢索方式相似，是一個(gè)物質(zhì)結(jié)構(gòu)檢索（Substances）和性能檢索（Properties）組合的聯(lián)合檢索，并可單獨(dú)進(jìn)行檢索，通過聯(lián)合檢索可以更加精確地得到你所需要的物質(zhì)。

實(shí)例3：查找具有生物活性的吉非替尼（Gefitinib）

首先通過畫圖工具畫出吉非替尼的結(jié)構(gòu)，或者通過由名字生成結(jié)構(gòu)工具自動(dòng)生成結(jié)構(gòu)，然后限定物質(zhì)結(jié)構(gòu)為精確結(jié)構(gòu)檢索，由于本例只要求吉非替尼具有生物活性，而不要求具體的生物活性數(shù)值，本例中需要通過性能的高級(jí)檢索來實(shí)現(xiàn)。首先單擊性能的高級(jí)檢索（Properties（Advanced））按鈕，接著單擊性能列表中“Bioactivity/Ecotox”旁的“exists”鏈接，然后點(diǎn)擊檢索按鈕，就可以得到33個(gè)具有生物活性的吉非替尼。

4 檢索結(jié)果的顯示與輸出

4.1 檢索結(jié)果的顯示

檢索完成后，Reaxys數(shù)據(jù)庫會(huì)自動(dòng)切換到檢索結(jié)果的界面，以物質(zhì)檢索為例，系統(tǒng)默認(rèn)以表格形式（Table）顯示，表格從左到右依次為：序號(hào)、化學(xué)物質(zhì)結(jié)構(gòu)、化學(xué)名、制備該物質(zhì)的數(shù)量、可獲得的數(shù)值領(lǐng)域、參考文獻(xiàn)數(shù)和沸點(diǎn)。具有超鏈接功能的用紅色顯示，用戶只需單擊感興趣的鏈接就可以獲得需要的反應(yīng)或數(shù)值信息，物質(zhì)也可以以網(wǎng)格（Grid）的形式顯示，這與Crossfire的網(wǎng)格顯示方式相似。

4.2 檢索結(jié)果的輸出

Reaxys能夠靈活地對(duì)檢索結(jié)果進(jìn)行各種處理，幫助用戶以各種方式將檢索內(nèi)容自動(dòng)生成圖表和報(bào)告，并以Word、Excel或XML等多種格式進(jìn)行存儲(chǔ)。用戶只需在所需條目左邊的空白框中做標(biāo)記，然后點(diǎn)擊輸出（Output）按鈕，選擇需要的輸出格式并保存。當(dāng)然還可以對(duì)輸出范圍進(jìn)行限定，可以是全部的也可以是部分內(nèi)容或選定的內(nèi)容，輸出內(nèi)容包括：物質(zhì)結(jié)構(gòu)、可獲得數(shù)值、僅僅是物質(zhì)識(shí)別信息、僅僅是命中信息以及選擇信息。通常我們不對(duì)所有可獲得數(shù)值進(jìn)行輸出，因?yàn)橐敵龅膬?nèi)容太多，會(huì)大大降低數(shù)據(jù)的輸出效率。

綜上所述，與CrossFire比較，Reaxys數(shù)據(jù)庫在功能上更加強(qiáng)大，不僅數(shù)據(jù)涵蓋面非常廣，而且配有強(qiáng)大的搜索引擎，為用戶提供了更加方便、快捷、人性化和高效的檢索途徑，并且檢索結(jié)果的保存、輸出與瀏覽功能更加簡(jiǎn)潔、直觀、省時(shí)易用，同時(shí)對(duì)檢索結(jié)果提供了多角度的二次篩選功能，是化學(xué)化工研究者必不可少的網(wǎng)上檢索工具。

[1]Reaxys Web Set：www.reaxys.com.

[2]CrossFire Gmelin/Beilstein數(shù)據(jù)庫.