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      猴痘病毒PCR檢測(cè)方法的建立

      2011-11-18 06:29:22陳國(guó)強(qiáng)張敬友唐泰山
      中國(guó)動(dòng)物檢疫 2011年8期
      關(guān)鍵詞:猴痘痘病毒質(zhì)粒

      張 睿,陳國(guó)強(qiáng),張敬友,朱 娜,蔣 原,姜 焱,唐泰山

      (江蘇出入境檢驗(yàn)檢疫局,江蘇南京 210001)

      1958年,人們就已在實(shí)驗(yàn)獼猴中發(fā)現(xiàn)猴痘病毒[1]。自1970年首次報(bào)導(dǎo)扎伊爾地區(qū)出現(xiàn)人的猴痘病例以后,非洲中西部雨林國(guó)家都有零星病例發(fā)生[2],特別是1996年2月至1997年10月在剛果發(fā)生了有史以來(lái)的最大的一次疫情暴發(fā),確診病例達(dá)511人[3-4],2003年5月美國(guó)威斯康星州報(bào)導(dǎo)有猴痘病例的發(fā)生[5-6],至此猴痘引起了人們的高度關(guān)注。

      猴痘是動(dòng)物傳播的一種以皮膚出疹為特征的熱性病毒性疾病,通過(guò)直接密切接觸,可由動(dòng)物傳染給人,并可在人與人之間傳染,屬人畜共患傳染病。猴痘病毒檢測(cè)方法有血清學(xué)方法,但猴痘病毒與痘病毒之間存在抗原交叉,特異性不夠,不能準(zhǔn)確檢測(cè)猴痘病毒,此外還有病原分離方法,但檢測(cè)周期太長(zhǎng),且猴痘病毒被分類為生物安全Ⅲ級(jí)生物因子,對(duì)實(shí)驗(yàn)室生物安全要求極高。因此,兩種方法在實(shí)際應(yīng)用中存在一定的局限性。利用PCR方法對(duì)猴痘病毒核酸進(jìn)行檢測(cè),靈敏度高,快速僅需幾小時(shí)即可得到結(jié)果,國(guó)外也已有相關(guān)報(bào)導(dǎo)[7-10],但國(guó)內(nèi)就此方面的報(bào)道還為數(shù)不多。本試驗(yàn)旨在建立更敏感和特異的猴痘病毒PCR檢測(cè)方法。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      猴痘陽(yáng)性模板為人工合成的MPV(AF380138)F3L基因片段(48 048~48 509 bp),插入質(zhì)粒pUC57,由南京生興生物技術(shù)公司合成。小鼠出血熱病毒、小鼠淋巴細(xì)胞脈絡(luò)叢腦膜炎病毒、鼠痘病毒、鼠仙臺(tái)病毒、鼠肝炎病毒、鼠肺炎病毒、呼腸孤病毒、腦脊髓炎病毒、多瘤病毒、細(xì)小病毒、猴皰疹病毒Ⅰ型、羊痘、雞痘、鴿痘等滅活病毒,購(gòu)自中國(guó)藥品生物制品檢定所動(dòng)物標(biāo)準(zhǔn)化室。

      Taq酶、dNTP Mixture、溴化乙錠(EB)、Marker DL-2000、瓊脂糖等試劑均由Takara公司生產(chǎn);PCR凝膠回收試劑盒、HincⅡ限制性內(nèi)切酶購(gòu)自大連Takara公司 。

      1.2 引物設(shè)計(jì)

      根據(jù)猴痘陽(yáng)性模板的序列,利用primer 5.0軟件設(shè)計(jì)引物,由上海生工公司合成。合成的引物用雙蒸水稀釋至10 pmol/μL,-20℃保存?zhèn)溆?。擴(kuò)增目的片段為301 bp,引物序列如下。

      上游引物:5'TTCCGTCAATGTCTACACAGGCA 3';

      下游引物:5'TACAGTTCCGACGATACTCCTC C 3'。

      1.3 DNA提取

      取陰性對(duì)照滅活病毒200μL,加入400μL裂解液、600μL的酚/氯仿混合液混勻,4℃12 000 r/min離心3~5 min;取上清加入600μL的氯仿混勻,4℃12 000 r/min離心5 min;取上清;加入0.8倍體積的異丙醇混勻,4℃10 000 r/min離心10 min,盡量?jī)A去上清液;加入70%乙醇洗滌,離心3~5 min,晾干后加入50μL TE溶解沉淀。

      1.4 質(zhì)粒濃度的測(cè)定

      取4μL提取的質(zhì)粒,加入96μL的蒸餾水對(duì)待測(cè)的樣品進(jìn)行稀釋,以蒸餾水作為空白,在波長(zhǎng)260 nm處調(diào)節(jié)紫外分光光度計(jì)的讀數(shù)至零。加入質(zhì)粒的稀釋液,測(cè)定260 nm處的吸光值,記錄OD260的值通過(guò)計(jì)算確定濃度dsDNA=50×OD260×稀釋倍數(shù)(濃度單位為:mg/mL)。

      1.5 PCR反應(yīng)

      采用 20μL 的反應(yīng)體系:2μL 10×buffer、0.4μL的25 mmol/LMgCl2、0.2μLTaq DNA聚合酶、上下游引物各 0.4μL、0.4μL 2.5 mmol/L dNTP、模板 0.5μL,用雙蒸水補(bǔ)至20μL。PCR反應(yīng)程序:95℃預(yù)變性5 min后;95℃1 min,51℃1 min,72℃1 min共 35個(gè)循環(huán);最后72℃延伸10 min。取8μL擴(kuò)增產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖電泳觀察結(jié)果。

      1.6 PCR產(chǎn)物鑒定及序列測(cè)定

      根據(jù)設(shè)計(jì)的PCR擴(kuò)增序列,利用premier 5.0軟件進(jìn)行酶切位點(diǎn)的分析,其中HincⅡ?yàn)閱蚊盖形稽c(diǎn),所以采用此酶進(jìn)行酶切分析。預(yù)期酶切成179 bp和122 bp 2個(gè)DNA片段。并同時(shí)將PCR產(chǎn)物送大連寶生物工程公司測(cè)序并用DNAstar軟件分析。

      1.7 敏感性

      取陽(yáng)性模板質(zhì)粒4μL并按上面的實(shí)驗(yàn)方法測(cè)出其質(zhì)粒濃度為59.3 ng/μL,并將陽(yáng)性模板作10倍系列稀釋,按照上述的方法分別取各稀釋度的陽(yáng)性模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,溴化乙錠染色檢測(cè)靈敏性。

      1.8 特異性

      按上述試驗(yàn)方法提取雞痘等滅活病毒的DNA,在相同的條件下進(jìn)行PCR擴(kuò)增,鑒定其特異性。

      2 結(jié)果

      2.1 PCR擴(kuò)增

      經(jīng)過(guò)對(duì)引物濃度、Mg2+濃度、退火溫度和時(shí)間進(jìn)行優(yōu)化后,用所設(shè)計(jì)的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,能擴(kuò)增出與設(shè)計(jì)目的片段大小一致的特異性條帶(圖1)。

      2.2 PCR產(chǎn)物酶切鑒定結(jié)果

      用HincⅡ進(jìn)行酶切分析,得到與預(yù)期一致的179 bp和122 bp 2個(gè)DNA片段(圖2)。

      2.3 敏感性

      將陽(yáng)性模板作10倍系列稀釋,分別取各稀釋度的陽(yáng)性模板,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,溴化乙錠染色檢測(cè)靈敏性。結(jié)果表明PCR檢測(cè)方法可檢測(cè)的下限為0.3 pg(圖3)。

      2.4 特異性

      分別提取雞痘等滅活病毒的DNA,在相同條件下進(jìn)行PCR擴(kuò)增,發(fā)現(xiàn)除猴痘模擬陽(yáng)性模板出現(xiàn)特異性擴(kuò)增條帶外,其它病毒均沒(méi)有擴(kuò)增條帶(圖4)。

      2.5 PCR產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果

      PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的測(cè)序結(jié)果與GenBank的F3L片段基因核苷酸序列完全一致,同源性達(dá)到100%。

      3 討論

      猴痘是一種以皮膚出疹為特征的病毒性疾病,雖然在我國(guó)至今尚無(wú)猴痘的報(bào)道,但未雨綢繆,做好技術(shù)儲(chǔ)備,很有必要。因此在我國(guó)發(fā)展一種快速特異的猴痘病毒感染的分子診斷方法,對(duì)預(yù)防和控制猴痘病毒的傳入有重要意義。限于我國(guó)尚無(wú)猴痘病毒的毒種,本實(shí)驗(yàn)參照文獻(xiàn)[11-12]人工合成了含特異檢測(cè)猴痘病毒靶基因的F3L片段,并插入質(zhì)粒,作為猴痘病毒檢測(cè)的模擬陽(yáng)性模板。

      本文就針對(duì)F3L片段序列分別設(shè)計(jì)出特異性引物,建立了可對(duì)猴痘病毒進(jìn)行快速診斷與檢測(cè)的PCR方法。該方法具有快速、敏感的優(yōu)點(diǎn),測(cè)序結(jié)果和酶切結(jié)果均證實(shí)了PCR反應(yīng)的特異性。在日常檢測(cè)中的應(yīng)用酶切試驗(yàn),可確保PCR檢測(cè)結(jié)果的特異性。該方法的建立將有助于猴痘病的快速檢測(cè)。

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