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      干細(xì)胞整體研究水平將進(jìn)入國(guó)際第一陣營(yíng)

      2013-01-30 16:20:55整理撰稿人中科院上海生命科學(xué)信息中心人口健康與生物醫(yī)藥團(tuán)隊(duì)
      中國(guó)科學(xué)院院刊 2013年5期
      關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)分化體細(xì)胞科研人員

      整理撰稿人:中科院上海生命科學(xué)信息中心人口健康與生物醫(yī)藥團(tuán)隊(duì)

      徐萍(E-mail:xuping@sibs.ac.cn)、王玥、許麗

      審稿專(zhuān)家:中科院動(dòng)物所周琪研究員

      干細(xì)胞是一類(lèi)具有自我更新和分化能力的細(xì)胞,這一特性使其在人類(lèi)疾病研究和治療、組織器官構(gòu)建、生殖等領(lǐng)域具有巨大的應(yīng)用潛力。

      1 國(guó)際研究現(xiàn)狀與趨勢(shì)

      干細(xì)胞的巨大應(yīng)用前景激發(fā)了全球科研人員的研究熱情,截至2013年8月,SCI收錄的干細(xì)胞領(lǐng)域論文總量已達(dá)24萬(wàn)篇①論文統(tǒng)計(jì)包括期刊論文和會(huì)議論文,研究?jī)?nèi)容主要圍繞干細(xì)胞的獲取與構(gòu)建、干細(xì)胞調(diào)控機(jī)理研究以及干細(xì)胞應(yīng)用等領(lǐng)域。

      1.1 干細(xì)胞的獲取技術(shù)

      尋找穩(wěn)定的干細(xì)胞來(lái)源,并建立干細(xì)胞系是開(kāi)展干細(xì)胞相關(guān)研究的基礎(chǔ)。除了發(fā)現(xiàn)并純化不同組織中存在的成體干細(xì)胞外,胚胎干細(xì)胞(ESC)的獲取技術(shù)一直是科研人員希望突破的領(lǐng)域,但由于倫理問(wèn)題,無(wú)法獲取大量的ESC供科研和臨床應(yīng)用。2011年[1]和2013年[2]的兩項(xiàng)研究,均通過(guò)克隆技術(shù),利用卵母細(xì)胞將成人體細(xì)胞重編程,克隆出ESC。這兩項(xiàng)研究盡管僅為初步探索,但為ESC的研究提供了發(fā)展方向。

      1.2 干細(xì)胞相關(guān)調(diào)控機(jī)理研究

      干細(xì)胞自我更新、多能性維持、休眠與激活以及分化的調(diào)控機(jī)制仍是目前干細(xì)胞研究的主要內(nèi)容??蒲腥藛T已經(jīng)從基因、蛋白和表觀遺傳等多個(gè)角度對(duì)相關(guān)調(diào)控機(jī)制進(jìn)行了探索,同時(shí)也利用高通量技術(shù)對(duì)干細(xì)胞相關(guān)的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和功能特性進(jìn)行了“批量”研究。2011年,國(guó)際干細(xì)胞計(jì)劃(International Stem Cell Initiative)構(gòu)建了全球最大規(guī)模人類(lèi)ESC遺傳變異圖譜[3];同年奧地利與美國(guó)科學(xué)家共同從全基因組水平上繪制了神經(jīng)干細(xì)胞維持自我更新與分化之間平衡的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖譜[4];2012年11月,美國(guó)科學(xué)家又利用轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù),繪制出首張干細(xì)胞(造血干細(xì)胞)發(fā)育基因表達(dá)譜[5]。

      1.3 誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)技術(shù)

      誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(iPSC)技術(shù)自2006年誕生伊始便掀起了研究熱潮,日本山中伸彌教授也因發(fā)明該項(xiàng)技術(shù)而于2012年獲得諾貝爾獎(jiǎng)。經(jīng)過(guò)7年的發(fā)展,SCI收錄iPSC論文總量已近3000篇,其中2012年發(fā)表論文數(shù)量近900篇②論文統(tǒng)計(jì)包括期刊論文和會(huì)議論文。近幾年的研究揭示了iPSC誘導(dǎo)效率低等問(wèn)題的機(jī)制,針對(duì)iPSC存在的基因缺陷,探索了不同誘導(dǎo)因子組合(包括非基因小分子物質(zhì))對(duì)iPSC重編程的影響,進(jìn)而對(duì)iPSC誘導(dǎo)技術(shù)進(jìn)行了優(yōu)化,并改善了iPSC技術(shù)的安全性。2009年,中國(guó)科研人員首次證實(shí)iPSC具有和ESC相同的發(fā)育能力。2012年,美國(guó)科研人員繪制了iPSC重編程分子路線(xiàn)圖[6],為iPSC技術(shù)的未來(lái)發(fā)展奠定了基礎(chǔ)。2013年,中國(guó)科研人員成功實(shí)現(xiàn)了僅利用小分子化合物誘導(dǎo)iPSC,并獲得了正常的小鼠,這一成果避免了iPSC技術(shù)應(yīng)用中的安全問(wèn)題。

      1.4 轉(zhuǎn)分化技術(shù)

      iPSC技術(shù)的興起也催生了轉(zhuǎn)分化技術(shù)的發(fā)展。近年來(lái),科研人員對(duì)轉(zhuǎn)分化機(jī)制進(jìn)行了不斷深入的探索,并對(duì)轉(zhuǎn)分化技術(shù)進(jìn)行了優(yōu)化,逐步實(shí)現(xiàn)了譜系內(nèi)、譜系間、體外和體內(nèi)成體細(xì)胞間的轉(zhuǎn)分化。2012年,德國(guó)科研人員實(shí)現(xiàn)了從成體細(xì)胞向成體干細(xì)胞的轉(zhuǎn)分化[7],是轉(zhuǎn)分化技術(shù)的一項(xiàng)突破;美國(guó)和西班牙科學(xué)家還合作開(kāi)發(fā)出一種稱(chēng)為“間接譜系轉(zhuǎn)換”的轉(zhuǎn)分化新技術(shù)[8],將成體細(xì)胞誘導(dǎo)至一種可塑性的中間狀態(tài),隨后再進(jìn)行分化,該技術(shù)縮短或繞過(guò)iPSC技術(shù)中重編程至多能性的完整過(guò)程,從而減少了iPSC技術(shù)的一些弊端,同時(shí)也提供了一種相比直接轉(zhuǎn)分化技術(shù)更加通用的技術(shù)。

      1.5 干細(xì)胞應(yīng)用研究

      隨著干細(xì)胞相關(guān)基礎(chǔ)研究的深入,其應(yīng)用進(jìn)程不斷向前推進(jìn)。科研人員已在實(shí)驗(yàn)室驗(yàn)證了多種干細(xì)胞來(lái)源的體細(xì)胞在修復(fù)機(jī)體損傷中能夠發(fā)揮正常功能。此外,大量臨床試驗(yàn)開(kāi)展,據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),全球開(kāi)展的干細(xì)胞臨床試驗(yàn)已近5000例③數(shù)據(jù)來(lái)源:美國(guó)ClinicalTrials.gov數(shù)據(jù)庫(kù),統(tǒng)計(jì)的臨床試驗(yàn)包括正在開(kāi)展的和已經(jīng)完成的。一系列臨床試驗(yàn)展現(xiàn)了良好的治療效果,例如,全球唯一獲得批準(zhǔn)的胚胎干細(xì)胞臨床試驗(yàn)在2013年再次證實(shí)對(duì)恢復(fù)患者視力有效[9]。

      在iPSC領(lǐng)域中,已經(jīng)建立起針對(duì)多種疾病的干細(xì)胞模型;世界首例iPSC療法臨床試驗(yàn)獲得日本批準(zhǔn),用于治療老年黃斑變性,同時(shí)日本也開(kāi)始著手建立iPSC庫(kù),旨在為iPSC療法提供細(xì)胞供應(yīng)。

      在利用干細(xì)胞構(gòu)建組織、器官方面,國(guó)際上獲得了大量的組織工程器官。2013年7月,日本科學(xué)家開(kāi)發(fā)了一種培養(yǎng)器官的新方法,利用iPSC構(gòu)建出能夠發(fā)揮功能的立體結(jié)構(gòu)肝臟,為再生醫(yī)學(xué)提供一條全新的道路[10]。

      2 國(guó)內(nèi)研究現(xiàn)狀及優(yōu)勢(shì)

      SCI收錄我國(guó)最早的干細(xì)胞論文發(fā)表于1981年,相比國(guó)際起步較晚,但發(fā)展迅速,至2012年,我國(guó)年度論文數(shù)量已經(jīng)超過(guò)3000篇,僅次于美國(guó),位居國(guó)際第2位。我國(guó)在干細(xì)胞調(diào)控機(jī)制、iPSC技術(shù)和轉(zhuǎn)分化技術(shù)及干細(xì)胞應(yīng)用研究等領(lǐng)域均獲得了一系列國(guó)際領(lǐng)先的成果。尤其iPSC技術(shù)和轉(zhuǎn)分化技術(shù)已躋身國(guó)際干細(xì)胞領(lǐng)域的領(lǐng)先行列。

      在干細(xì)胞相關(guān)調(diào)控機(jī)制研究領(lǐng)域,我國(guó)擁有了良好的基礎(chǔ)。我國(guó)科學(xué)家解釋了ESC中5-甲基胞嘧啶去甲基化的機(jī)制[11];對(duì)小鼠ESC早期譜系特化的機(jī)理進(jìn)行了探索[12];發(fā)現(xiàn)了多能干細(xì)胞向神經(jīng)細(xì)胞分化的譜系特異性調(diào)控通路[13]。

      iPSC是我國(guó)干細(xì)胞研究的優(yōu)勢(shì)領(lǐng)域之一。2007年,我國(guó)成為繼日本和美國(guó)后第三個(gè)掌握iPSC技術(shù)的國(guó)家[14]。此后,又陸續(xù)建立了獼猴[15]和大鼠[16]的iPSC系;利用四倍體囊胚注射的方法獲得了世界上第一只iPSC小鼠,證實(shí)了iPSC的全能性[17];發(fā)現(xiàn)了間質(zhì)上皮轉(zhuǎn)化過(guò)程是體細(xì)胞重編程的主要分子機(jī)制[18];發(fā)現(xiàn)維生素C能夠顯著提高重編程效率[19];實(shí)現(xiàn)了將尿液細(xì)胞重編程為iPSC,為iPSC提供了“無(wú)盡”的來(lái)源[20];探明了iPSC重編程過(guò)程中的“路障”[21];利用小分子化合物替代經(jīng)典的重編程基因,實(shí)現(xiàn)了小鼠體細(xì)胞的重編程,率先實(shí)現(xiàn)了各國(guó)科研人員一直探索的技術(shù)突破[22]。一系列突破性成果為我國(guó)在世界干細(xì)胞領(lǐng)域占據(jù)有利地位奠定了基礎(chǔ)。

      我國(guó)在轉(zhuǎn)分化技術(shù)領(lǐng)域也處于國(guó)際領(lǐng)先水平,獲得了一系列突破性科研成果。2011年5月,中科院的科研人員將小鼠成纖維細(xì)胞直接重編程為成熟的肝細(xì)胞樣細(xì)胞,成為肝臟再生研究的里程碑[23];2012年,中科院一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)還將尿液細(xì)胞直接重編程為神經(jīng)祖細(xì)胞[24]。2013年,中科院研究人員再次通過(guò)三維培養(yǎng)技術(shù),將體細(xì)胞直接轉(zhuǎn)分化為具有增殖和分化能力的神經(jīng)干細(xì)胞[25]。

      此外,我國(guó)在大動(dòng)物模型構(gòu)建方面具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),國(guó)家重大科學(xué)研究計(jì)劃和“973”計(jì)劃對(duì)該領(lǐng)域進(jìn)行布局,這也將推動(dòng)我國(guó)在該領(lǐng)域的快速發(fā)展和產(chǎn)業(yè)化的實(shí)現(xiàn)。

      在干細(xì)胞應(yīng)用方面,我國(guó)已經(jīng)開(kāi)展的干細(xì)胞相關(guān)臨床試驗(yàn)有165項(xiàng)④數(shù)據(jù)來(lái)源:美國(guó)ClinicalTrials.gov數(shù)據(jù)庫(kù),統(tǒng)計(jì)的臨床試驗(yàn)包括正在開(kāi)展的和已經(jīng)完成的,主要用于糖尿病、肝臟疾病等的治療。國(guó)內(nèi)首個(gè)組織工程三類(lèi)醫(yī)療新技術(shù),組織工程軟骨移植也于2010年實(shí)現(xiàn)了臨床轉(zhuǎn)化,至今已為多位患者解除了病痛。

      與此同時(shí),近期出臺(tái)的一系列干細(xì)胞臨床應(yīng)用相關(guān)監(jiān)管法規(guī),將使干細(xì)胞領(lǐng)域發(fā)展更加有序。在國(guó)家各項(xiàng)政策支持下,隨著研究的進(jìn)一步加強(qiáng),我國(guó)干細(xì)胞整體研究水平有望進(jìn)入國(guó)際第一陣營(yíng)。

      1 Scott Noggle,Ho-Lim Fung,Athurva Gore et al.Human oocytes reprogram somatic cells to a pluripotent state.Nature,2011,478:70-75.

      2 Masahito Tachibana,PaulaAmato,Michelle Sparman et al.Human Embryonic Stem Cells Derived by Somatic Cell Nuclear Transfer.Cell,2013,153(6):1228-1238.

      3 The International Stem Cell Initiative.Screening ethnically diverse human embryonic stem cells identifies a chromosome 20 minimal amplicon conferring growth advantage.Nature Biotechnology,2011,29:1132-1144.

      4 Neumüller RA,Richter C,FischerAet al.Genome-wide analysis of self-renewal in Drosophila neural stem cells by transgenic RNAi.Cell Stem Cell,2011,8(5):580-593.

      5 Shannon McKinney-Freeman,Patrick Cahan,Hu Li et al.The Transcriptional Landscape of Hematopoietic Stem Cell Ontogeny.Cell Stem Cell,2012,11(5):701-714.

      6 James O’Malley,Stavroula Skylaki,KumikoAIwabuchi et al.High-resolution analysis with novel cell-surface markers identifies routes to iPS cells.Nature,2012,499:88-91.

      7 Dong Wook Hansend email,Natalia Tapia,Andreas Hermann et al.Direct Reprogramming of Fibroblasts into Neural Stem Cells by Defined Factors.Cell Stem Cell,2012,10(4):465-472.

      8 Leo Kurian,Ignacio Sancho-Martinez,Emmanuel Nivet et al.Conversion of human fibroblasts to angioblast-like progenitor cells.Nature Methods,2013,10:77-83.

      9 ACT Confirms Clinical Trial Participant Showed Improvement in Vision from 20/400 to 20/40 Following Treatment.ACT Press Releases.2013-5-16.

      10 TakanoriTakebe,KeisukeSekine,Masahiro Enomura et al.Vascularized and functional human liver from an iPSC-derived organ bud transplant.Nature,2013-07-03(online)

      11 Yu-Fei He,Bin-Zhong Li,Zheng Li et al.Tet-Mediated Formation of 5-Carboxylcytosine and Its Excision by TDG in Mammalian DNA.Science,2011,333(6047):1303-1307.

      12 Xiang Li,Lili Zhu,Acong Yang et al.Calcineurin-NFAT Signaling Critically Regulates Early Lineage Specification in Mouse Embryonic Stem Cells and Embryos.Cell Stem Cell,2011,8(1):46-58.

      13 Yunbo Qiao,Yue Zhu,Nengyin Sheng et al.AP2 gamma regulates neural and epidermal development downstream of the BMP pathway at early stages of ectodermal patterning.Cell Research,2012,22(11):1546-1561.

      14 Dajiang Qin,Wen Li,Jin Zhang et al.Direct generation of ES-like cells from unmodified mouse embryonic fibroblasts by Oct4/Sox2/Myc/Klf4.Cell Research,2007,17:959-962.

      15 Haisong Liu,Fangfang Zhu,Jun Yong et al.Generation of Induced Pluripotent Stem Cells fromAdult Rhesus Monkey Fibroblasts.Cell Stem Cell,2008,3(6):587-890.

      16 Jing Liao,Chun Cui,Siye Chen et al.Generation of Induced Pluripotent Stem Cell Lines fromAdult Rat Cells.Cell Stem Cell,2009,4(1):11-15.

      17 Xiao-yang Zhao,Wei Li,ZhuoLv et al.iPS cells produce viable mice through tetraploid complementation.Nature,2009,461:86-90.

      18 Ronghui Li,Jialiang Liang,Su Ni et al.AMesenchymalto-Epithelial Transition Initiates and Is Required for the Nuclear Reprogramming of Mouse Fibroblasts.Cell Stem Cell,2010,7(1):51-63.

      19 MiguelAngel Esteban,Tao Wang,Baoming Qin et al.Vitamin C Enhances the Generation of Mouse and Human Induced Pluripotent Stem Cells.Cell Stem Cell,2009,6(1):71-79.

      20 Ting Zhou,Christina Benda,Sarah Dunzinger et al.Generation of human induced pluripotent stem cells from urine samples.Nature Protocols,2012,7:2080-2089.

      21 Jiekai Chen,He Liu,Jing Liu et al.H3K9 methylation is a barrier during somatic cell reprogramming into iPSCs.Nature Genetics,2012,45:34-42.

      22 PingpingHou,Yanqin Li,Xu Zhang et al.Pluripotent Stem Cells Induced from Mouse Somatic Cells by Small-Molecule Compounds.Science,2013,341(6146):651-654.

      23 Pengyu Huang,Zhiying He,ShuyiJi et al.Induction of functional hepatocyte-like cells from mouse fibroblasts by defined factors.Nature 475,386-389.

      24 Lihui Wang,Linli Wang,Wenhao Huang et al.Generation of integration-free neural progenitor cells from cells in human urine.Nature Methods,2012,10:84-89.

      25 Guannan Sua,Yannan Zhaoa,Jianshu Wei et al.Direct conversion of fibroblasts into neural progenitor-like cells by forced growth into 3D spheres on low attachment surfaces.Biomaterials,2013,34(24):5897-5906.

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