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      大腸埃希菌外排系統(tǒng)與多重耐藥研究

      2013-02-19 02:14:25陳伶利
      檢驗(yàn)醫(yī)學(xué) 2013年8期
      關(guān)鍵詞:外排埃希菌大腸

      陳伶利,李 杰

      (湖南中醫(yī)藥大學(xué),湖南 長沙 410208)

      細(xì)菌耐藥性是指細(xì)菌對(duì)抗菌藥物的相對(duì)抗性。如果從弗萊明1929年發(fā)表《論青霉菌培養(yǎng)物的抗菌作用》論文算起,抗菌藥物與病菌之間的“拉鋸戰(zhàn)”已有80年。人類為了對(duì)付層出不窮的致病微生物,不斷研發(fā)出各類新型抗菌藥物。而細(xì)菌為了生存,不斷變異進(jìn)化,形成可耐受多種抗菌藥物的多重耐藥細(xì)菌,典型的代表菌如大腸埃希菌、銅綠假單胞菌、金黃色葡萄球菌等[1]。細(xì)菌耐藥性已成為21世紀(jì)全球關(guān)注的熱點(diǎn),我們主要對(duì)大腸埃希菌外排系統(tǒng)與多重耐藥最新進(jìn)展進(jìn)行綜述。

      一、大腸埃希菌的耐藥機(jī)制

      細(xì)菌的耐藥機(jī)制非常復(fù)雜,從遺傳學(xué)角度來說,細(xì)菌的耐藥分為固有性耐藥和獲得性耐藥。前者來源于該細(xì)菌本身染色體上的耐藥基因,代代相傳,具有典型的種屬特異性;而后者是由于細(xì)菌在生長繁殖過程中,其DNA發(fā)生改變而使其形成或獲得了耐藥性表型,介導(dǎo)DNA改變的因素包括染色體突變和質(zhì)粒、轉(zhuǎn)座子、整合子等介導(dǎo)的耐藥基因的獲得。一直以來,人們都認(rèn)為細(xì)菌的耐藥性是隨著抗菌藥物的使用而后天獲得的一種能力,但是最新的研究表明,這種能力是先于現(xiàn)代抗菌藥物選擇壓力之前細(xì)菌本身所固有的。來自加拿大麥克馬斯特大學(xué)的研究人員在距今3萬年以前的古細(xì)菌體內(nèi),首次發(fā)現(xiàn)了多種抗菌藥物的耐藥基因[2]。但耐藥基因是如何轉(zhuǎn)移的,還有待于研究。

      細(xì)菌的耐藥可由滅活酶或鈍化酶的產(chǎn)生、細(xì)胞膜通透性的改變、藥物作用靶位的改變、細(xì)菌自身代謝狀態(tài)改變、細(xì)菌生物被膜的形成、多重藥物外排機(jī)制等多因素引起。對(duì)于細(xì)菌來說,外排基因占所有轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白基因的6% ~18%,所以外排基因編碼的外排泵是導(dǎo)致其多重耐藥的重要機(jī)制。如最新研究表明結(jié)核分枝桿菌對(duì)異煙肼和乙氨丁醇的耐受就是由一種藥物外排基因jefA引起的[3]。而耐藥菌株陰溝腸桿菌對(duì)喹諾酮的抗性也是由多藥及毒性化合物外排家族(mutidrug and toxic compound extrusion,MATE)主動(dòng)外排藥物所介導(dǎo)[4]。對(duì)于大腸埃希菌來說,其表達(dá)的AcrABTolC外排泵更是被作為外排系統(tǒng)的經(jīng)典模型來研究。研究結(jié)果也表明,臨床分離的多重耐藥的大腸埃希菌,其耐藥性往往與某些基因的超表達(dá)相關(guān),而這些基因是調(diào)控多重藥物外排泵的轉(zhuǎn)錄因子,能上調(diào)多重藥物外排泵AcrAB-TolC和下調(diào)膜蛋白的通透性[5-6]。所以,以下我們將詳細(xì)介紹引起大腸埃希菌多重耐藥的外排系統(tǒng)。

      二、大腸埃希菌主動(dòng)外排泵

      細(xì)菌轉(zhuǎn)運(yùn)體系統(tǒng)相當(dāng)復(fù)雜,從細(xì)菌轉(zhuǎn)運(yùn)體進(jìn)化與功能角度來看,與抗菌藥物耐藥性有關(guān)的主動(dòng)外排泵系統(tǒng)主要?dú)w為以下5個(gè)家族:三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)結(jié)合盒超家族(ATP-binding cassettes[ABC]transporters,ABC)、小多重耐藥家族(small multidrug resistance,SMR)、主要易化子超家族(major facilitator superfamily,MFS)、MATE和耐藥節(jié)結(jié)化細(xì)胞分化家族(resistance nodulation cell division,RND)[7]。以上各類轉(zhuǎn)運(yùn)體中,除ABC家族以ATP作為能源外排藥物,MATE家族以鈉離子或質(zhì)子驅(qū)動(dòng)力為能量外,其余各類均以質(zhì)子驅(qū)動(dòng)力為能量并形成質(zhì)子與藥物的反轉(zhuǎn)運(yùn)體,即質(zhì)子與藥物在轉(zhuǎn)運(yùn)過程中,質(zhì)子進(jìn)入胞內(nèi)而藥物被排至胞外。以下將對(duì)每個(gè)外排家族的功能進(jìn)行介紹。

      1.ABC ABC家族能介導(dǎo)一系列藥物的外排。細(xì)菌中很多外排泵屬于這一類型,如金黃色葡萄球菌的 AbcA、Sav1866,鼠傷寒沙門菌的MacAB,肺炎鏈球菌的PatA、PatB、SP2073/SP2075,結(jié)核分枝桿菌的 Rv0194、Rv1258C、Rv2686c、Rv2687c、Rv2688c等。對(duì)于大腸埃希菌來說,2005年Salomón帶領(lǐng)的團(tuán)隊(duì)在其體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)屬于 ABC 的外排泵——YojI[8],雖然該外排泵的具體結(jié)構(gòu)還不是很清楚,但研究結(jié)果表明,其與外膜蛋白TolC聯(lián)合后可介導(dǎo)多肽類抗菌藥物小菌素J25的外排[9]。亮氨酸應(yīng)答調(diào)節(jié)蛋白能誘導(dǎo)YojI的表達(dá),如果亮氨酸應(yīng)答調(diào)節(jié)蛋白被抑制,則會(huì)導(dǎo)致YojI表達(dá)受阻。最近在嗜麥芽窄食單胞菌中發(fā)現(xiàn)一個(gè)ABC外排家族的新成員,命名為SmrA,該外排泵能增加大腸埃希菌對(duì)氟喹諾酮類、四環(huán)素、阿霉素及多種染料分子等物質(zhì)的抗性,甚至還能減少大腸埃希菌對(duì)諾氟沙星的攝入及增加其外排[10]。

      2.SMR SMR家族的成員超過250個(gè),在這些外排成員中,有的是由染色體編碼,如在鮑曼不動(dòng)桿菌體內(nèi)發(fā)現(xiàn)的AbeS[11],也有的是由質(zhì)粒編碼。SMR主要外排一些殺毒劑以及氨基糖苷類抗菌藥物。大腸埃希菌的EmrE是SMR的典型外排泵,其是一個(gè)由4個(gè)穿膜蛋白構(gòu)成的同源二聚體并以此形式來發(fā)揮作用。雖然EmrE外排泵只能將其底物分子外排到其膜間隙,但其與AcrAB-TolC之類的RND外排泵聯(lián)合作用仍然可以引起對(duì)底物分子的超強(qiáng)耐受性。在大腸埃希菌中還存在很多SMR外排泵如Mef(B)、QepA、QepA2等,他們都是由質(zhì)粒編碼的外排泵,前者可以外排一些重金屬鹽[12],而后兩者都能介導(dǎo)氟喹諾酮類藥物的耐藥[13-14]。

      3.MFS 這也是一個(gè)很龐大的家族,細(xì)菌的很多外排泵都有此家族,包括鮑曼不動(dòng)桿菌的SmvA、幽門螺桿菌的 Hp1181、枯草芽孢桿菌的Bmr和LmrB、金黃色葡萄球菌的 NorA和 QacA等。關(guān)于MFS的最新研究是在鮑曼不動(dòng)桿菌體內(nèi)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)新的MFS外排家族成員AmvA,其能介導(dǎo)藥物及殺菌劑的外排[15]。這些外排泵多數(shù)屬于逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白單體,但在革蘭陰性細(xì)菌中發(fā)現(xiàn)的MFS外排泵卻屬于由轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、膜融合蛋白和外膜蛋白共同組成的三聯(lián)復(fù)合體,大腸埃希菌的EmrAB-TolC和EmrKY-TolC就是其中的典型代表。這種復(fù)合體轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制比起單個(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白對(duì)底物的轉(zhuǎn)運(yùn)效率要高一些,因?yàn)閱蝹€(gè)轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白僅能將底物分子運(yùn)送到膜的周質(zhì)空間,然后再由別的外排泵轉(zhuǎn)運(yùn)出去。目前已有很多MFS轉(zhuǎn)運(yùn)體晶體結(jié)構(gòu)已經(jīng)非常清楚,如大腸埃希菌多重耐藥外排泵EmrD,其能介導(dǎo)一系列疏水性分子的外排,如十二烷基磺酸鈉、苯甲羥氨等。在霍亂弧菌體內(nèi)也發(fā)現(xiàn)了EmrD-3外排泵,將該外排泵基因重組到大腸埃希菌體內(nèi)能明顯增加細(xì)胞對(duì)藥物的耐受能力,其中對(duì)利奈唑酮的最低抑菌濃度(minimal inhibitory concentrations,MIC)值升高最明顯,可達(dá) 102 倍(MIC=256 mg/mL)[16]。結(jié)構(gòu)研究表明,在EmrD內(nèi)部有一個(gè)由疏水殘基構(gòu)成的疏水性很強(qiáng)的結(jié)構(gòu),并向細(xì)胞內(nèi)膜內(nèi)側(cè)伸出2個(gè)長環(huán)結(jié)構(gòu),該環(huán)能識(shí)別底物分子[17]。

      4.MATE 這個(gè)家族能介導(dǎo)細(xì)菌對(duì)一系列包括氟喹諾酮類在內(nèi)的陽離子毒性藥物的耐受,但他的底物類型卻比其他外排家族少很多。要通過質(zhì)子或鈉離子與藥物的反向轉(zhuǎn)運(yùn)來提供能量。以副溶血性弧菌NorM外排泵為代表[18],雖然目前報(bào)道的MATE家族成員大約只有20個(gè),但是幾乎在所有生物體內(nèi)都存在MATE蛋白,如在人類染色體上就發(fā)現(xiàn)了編碼MATE蛋白的基因hMATE1和 hMATE17,將hMATE1在HEK293細(xì)胞中表達(dá)后,能介導(dǎo)有機(jī)陽離子和質(zhì)子的交換[19]。

      5.RND RND外排家族是廣泛分布在革蘭陰性細(xì)菌體內(nèi)的一類外排系統(tǒng),其能主動(dòng)外排抗菌藥物和一些化學(xué)試劑。有研究顯示RND的主動(dòng)外排泵系統(tǒng)與細(xì)菌多重耐藥性密切相關(guān)。大腸埃希菌中此家族包括7個(gè) RND轉(zhuǎn)運(yùn)體,其中AcrAB、AcrEF、AcrD、YhiUV、MdtABC 與藥物的排出有關(guān),他們都需與外膜蛋白TolC聯(lián)合,并通過TolC的開放外排不同的藥物分子[20]。AcrABTolC外排系統(tǒng)是大腸埃希菌中最重要的外排系統(tǒng),在大腸埃希菌的先天性耐藥中起著顯著的作用。近年來對(duì)他的結(jié)構(gòu)和外排機(jī)制進(jìn)行了深入的研究。AcrAB-TolC外排泵是由3個(gè)配體蛋白構(gòu)成的三聯(lián)體復(fù)合物,包括位于細(xì)胞內(nèi)膜上的“輸送器”(AcrB)、錨定在外膜上的“出口通道”(TolC)以及橫跨周質(zhì)空間的“轉(zhuǎn)接蛋白AcrA”[21-22]。AcrA通過脂肪酸鏈連接在內(nèi)膜上,并通過發(fā)卡結(jié)構(gòu)連接在“出口導(dǎo)管”的雙螺旋區(qū)域。他的作用主要是協(xié)調(diào)AcrB和TolC之間的相互作用,Tikhonova等[23]采用表面等離子體技術(shù)研究發(fā)現(xiàn),AcrA上與細(xì)胞膜鄰近的結(jié)構(gòu)域部分的構(gòu)象對(duì)AcrAB-TolC復(fù)合體的形成至關(guān)重要,并將作為新的抑制劑研發(fā)的靶點(diǎn)。內(nèi)膜蛋白AcrB能識(shí)別外排藥物,并通過構(gòu)象改變形成質(zhì)子和藥物分子逆向轉(zhuǎn)運(yùn)的能量轉(zhuǎn)化體[24],他與藥物分子具有很高的親和性,其基因的突變會(huì)導(dǎo)致大腸埃希菌對(duì)鄰氯青霉素MIC值下降512倍[25]。除此以外,AcrB還能與新生霉素、MC-207110等外排泵抑制劑結(jié)合,但此結(jié)合并不會(huì)影響其與AcrA、TolC的相互作用[23]。外膜蛋白TolC是位于外膜上的孔道蛋白,上端為開放結(jié)構(gòu),以便給外排底物提供泵出的寬闊通道;下端為封閉結(jié)構(gòu)。三聯(lián)復(fù)合物構(gòu)象的改變,可使孔道定期開放或閉合。TolC錯(cuò)誤的開放會(huì)引起他們?nèi)呦嗷プ饔玫臏p弱甚至三聯(lián)復(fù)合物的解體[26]。TolC除了在外排藥物中發(fā)揮作用外,研究還發(fā)現(xiàn)其與大腸埃希菌耐受極酸性環(huán)境有關(guān)[26]。在對(duì)大腸埃希菌AcrAB-TolC的外排路徑的研究中發(fā)現(xiàn),AcrB識(shí)別藥物分子,并引起其構(gòu)象改變,形成一條藥物分子進(jìn)出的通道,AcrB構(gòu)象的改變會(huì)帶動(dòng) AcrA和TolC相互作用,開放TolC通道。DARPin能抑制AcrA與AcrB的相互作用,從而引起通道TolC錯(cuò)誤的開放,使他們?nèi)呦嗷プ饔脺p弱甚至復(fù)合物的解體[23]。對(duì)于藥物分子而言,他們先與 AcrB的“較低裂縫 ”部位結(jié)合,然后通過“結(jié)合口袋”運(yùn)輸?shù)健巴ǖ来箝T”,最后到達(dá)連接AcrB與TolC的“漏斗部位”,經(jīng)TolC通道排出細(xì)胞[27]。

      三、展望

      大腸埃希菌是重要的條件致病菌,其外排系統(tǒng)在其多重耐藥中起到非常重要的作用。在過去10多年中,人們主要對(duì)大腸埃希菌外排泵的結(jié)構(gòu)和功能進(jìn)行了研究。隨著研究的深入,新外排泵不斷被開發(fā),外排泵的結(jié)構(gòu)不斷被破解,這對(duì)解決日益嚴(yán)重的耐藥問題具有重要的意義。在這些研究中,很少有針對(duì)外排泵分子機(jī)制的研究,如果更多地關(guān)注外排泵的三維結(jié)構(gòu)、外排泵-底物復(fù)合物的合成以及動(dòng)力學(xué)特征的研究,將有助于選擇外排機(jī)制中的新目標(biāo),從而開發(fā)出具有臨床意義的耐藥性抑制劑。

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