朱丹 陳衛(wèi)國 杜嬋娟 付崗 黃興振 付書婕 趙有林 蔣偉哲
金線蓮[Anoectochilusroxburghii(Wall.) Lindl]為蘭科的藥用植物,生長在土壤腐殖質(zhì)較多、光線較弱、相對濕度大的闊葉林中[1],具有保肝、防癌、抗氧化、抗炎等多種藥理作用[2]。近年來,因其生長環(huán)境遭到嚴(yán)重破壞,野生資源被過度采挖,加之具有繁殖率低、生長緩慢等特點,使得金線蓮野生資源瀕臨滅絕[3]。在野生狀態(tài)下,所有蘭科植物都與真菌共生[4-5],野生金線蓮亦與內(nèi)生真菌形成菌根共生關(guān)系,篩選促進(jìn)金線蓮生長發(fā)育的益生菌,研究它們的相互作用具有重大的理論意義。本課題組在廣西桂林等地采集野生金線蓮,并從該植物根中分離出多株菌根真菌,研究發(fā)現(xiàn),這些真菌可以增加植物芽和根的數(shù)量,促進(jìn)金線蓮試管苗的生長。為了進(jìn)一步研究菌根真菌對金線蓮生長發(fā)育的影響,課題組對金線蓮菌根真菌進(jìn)行分離,并采用分子技術(shù)結(jié)合形態(tài)學(xué)特征對分離物進(jìn)行鑒定,為下一步研究奠定基礎(chǔ)。
采集野生金線蓮植株,取其根部用無菌水沖洗干凈,切成0.5~1 cm小段,75%乙醇表面消毒3~5秒,無菌水沖洗凈消毒液后,再用0.1%HgCl2表面消毒6~8分鐘,無菌水沖洗后將根段接種于PDA平皿內(nèi),25℃恒溫培養(yǎng),待從根內(nèi)長出真菌菌絲后,挑取尖端菌絲純化培養(yǎng)。將純化的6株真菌菌株(編號分別為2、5、6、A12、A46、A55)在PDA培養(yǎng)基(馬鈴薯200 g、葡萄糖20 g、瓊脂17 g、水1000 ml)平板上于28℃恒溫下黑暗培養(yǎng),每天觀察菌落的形態(tài)特征和顏色變化,并于顯微鏡下進(jìn)行形態(tài)學(xué)觀察、鑒定。
1.2.1 基因組DNA的提取 收集PDA平板上的菌絲體,采用SDS-CTAB法分別提取各菌株的基因組DNA。具體操作如下:取0.1 g新鮮菌絲體,在液氮中研磨成粉末,迅速轉(zhuǎn)入1.5 ml的離心管中,加入750 μl提取緩沖液,置65℃水浴30分鐘;室溫下12 000 r/min離心10分鐘,取上清液,加入1/10的3 mol/L KAc,冰浴20分鐘;室溫下12 000 r/min離心10分鐘,取上清液,加入等體積的異丙醇,冰浴20分鐘;12 000 r/min離心10~20分鐘;棄上清,加入400 μl ddH2O及5 μl RNAase,37℃水浴1小時;加入等體積的酚/氯仿(1:1)顛倒混勻40次;室溫下12 000 r/min離心10分鐘,取上清液,再加入 1/10 KAc,冰浴20分鐘(重復(fù)1次);用2倍體積無水乙醇沉淀20分鐘,12 000 r/min離心10分鐘;用-20℃ 預(yù)冷的75%乙醇洗滌沉淀3次,室溫干燥5~10分鐘后加入TE溶液溶解沉淀。
1.2.2 PCR擴(kuò)增及純化測序 以各菌株基因組DNA為模板,擴(kuò)增ITS區(qū)的保守區(qū)段,選用真菌通用引物ITS1(5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′)和ITS4(5′-TCCTCCG CTTATTGATATGC-3′)進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增體系為20 μl,其中含10×PCR buffer 2 μl,dNTP0.5 μl,ITS1 0.6 μl,ITS4 0.6 μl,無菌超純水15.1 μl,模板DNA 1 μl,Taq酶0.2 μl。反應(yīng)程序為:94℃預(yù)變性3分鐘;94℃變性55秒,56℃退火50秒,72℃延伸l分鐘,32個循環(huán);72℃延伸7分鐘。擴(kuò)增產(chǎn)物通過瓊脂糖凝膠電泳,以DNA Marker DL2000作為分子量標(biāo)準(zhǔn),穩(wěn)壓120 V下電泳30分鐘。電泳結(jié)果用紫外檢測儀觀察,置于圖像處理儀中處理并保存。目的片段用UNIQ-10柱式膠回收試劑盒回收純化,純化樣品進(jìn)行基因序列測定。
1.2.3 數(shù)據(jù)分析 序列經(jīng)BioEdit軟件分析和手工校正后,用NCBI的BLAST程序?qū)y得序列與GenBank中已有菌株的ITS序列進(jìn)行同源性比對,采用MAGA (3.1)軟件進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建。
各菌株在PDA培養(yǎng)基上生長,菌落初期灰白色,漸變?yōu)榈稚秸?,生長速度快,氣生菌絲繁茂,28℃下培養(yǎng)3天后,直徑可達(dá)80 mm,7天即可產(chǎn)生菌核(見圖1)。菌絲初期灰白色,漸變?yōu)榈稚?,直?2~14 μm;菌絲分支處有縊縮,近分支處形成隔膜。菌核由菌絲糾集生成,褐色,內(nèi)外顏色一致,表面粗糙,大小均一,可聚集聯(lián)結(jié);無性態(tài)不產(chǎn)生孢子(見圖2)。
A 金錢蓮菌根真菌早期菌落
B 金錢蓮菌根真菌后期菌落圖1 金錢蓮根真菌菌落特征
A 幼嫩菌絲
B 老熟菌絲
C 菌核圖2 金線蓮菌根真菌菌株的顯微形態(tài)
各菌株的基因組DNA經(jīng)PCR擴(kuò)增,回收后,通過序列測定得到分別為668bps~686bps的各菌株的ITS堿基序列,見表1。
表1 菌株rDNA ITS區(qū)序列測定結(jié)果
在GenBank中與已有的相關(guān)菌株的ITS序列進(jìn)行同源性比較,用MAGA(3.1)軟件將以上菌株與來自GenBank的27株真菌一起構(gòu)建基于ITS序列的系統(tǒng)發(fā)育樹。發(fā)育樹的構(gòu)建,以親緣關(guān)系相對較遠(yuǎn)的低等真菌(Pythiumsp.)為外群,見圖3。結(jié)果顯示A12菌株與5號菌株出現(xiàn)在同一最小分支,說明這兩菌株的親緣關(guān)系最近;2號菌株與6號菌株出現(xiàn)在同一最小分支,說明這兩菌株的親緣關(guān)系最近;A46菌株和A55菌株與前述4株真菌的親緣關(guān)系相對較遠(yuǎn),但仍同處于同一較小分支內(nèi)。所得菌株均與Thanatephorussp.及Rhizoctoniasp.具有較高的同源性。結(jié)合各菌株的形態(tài)特征和ITS區(qū)域基因序列特征,將A12菌株、5號菌株、2號菌株、6號菌株、A46菌株和A55菌株鑒定為絲核菌(Rhizoctoniasp.),其有性態(tài)為Thanatephorussp.或Ceratobasidiumsp.。
絲核菌(Rhizoctoniasp.)屬的有些成員是農(nóng)作物的病原菌,如立枯絲核菌(Rhizoctoniasolani)能引起棉花的立枯病[6]和水稻、玉米的紋枯病[7]。也有報道某些種類的絲核菌可與蘭科植物共生,利于植株的生長[8]。本研究獲得的6株絲核菌從金線蓮根部分離,可促進(jìn)金線蓮的生長發(fā)育,對其他蘭科植物是否具有促生作用,還有待進(jìn)一步研究。
圖3 基于ITS序列同源性的各菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹
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