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      吉林地區(qū)華支睪吸蟲蟲卵的鑒定及PCR檢測方法的建立

      2013-04-29 19:18:14唐藝芝郝玉花孫青松等
      湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2013年7期
      關(guān)鍵詞:鑒定

      唐藝芝 郝玉花 孫青松等

      摘要:對華支睪吸蟲病流行地區(qū)人糞樣進行華支睪吸蟲(Clonorchis sinensis)蟲卵的鑒定、收集及DNA的提取,然后根據(jù)華支睪吸蟲基因設(shè)計兩對特異性引物,以糞便中提取的蟲卵DNA為模板,采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)方法擴增目的基因片段,對PCR方法的各種反應(yīng)條件進行優(yōu)化。結(jié)果兩對引物中以上游引物(5′-TGGCCTGACTGGCTGGCCGG-3′)、下游引物(5′-CGGCACCCCACACACATACA-3′)為最適引物,用PCR方法可擴增到分子量大小為255 bp的特異性條帶,測序結(jié)果經(jīng)BLAST工具進行分析,與中國沈陽分離株(AF217099)和朝鮮分離株(AF217094)的同源性為100%;50 μL PCR反應(yīng)體系的最優(yōu)化反應(yīng)條件為:dNTP 2.6 μL;10×PCR Buffer(含Mg2+)4.0 μL;上下游引物各0.5 μL;DNA模板5.5 μL;Taq DNA聚合酶0.4 μL。擴增程序為:94 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃變性30 s,56 ℃退火1 min,72 ℃延伸30 s,30個循環(huán),72 ℃延伸5 min,4 ℃保存。試驗成功對吉林地區(qū)人糞樣中華支睪吸蟲蟲卵進行了鑒定,并建立了華支睪吸蟲蟲卵PCR檢測方法,為從分子生物學(xué)角度檢測華支睪吸蟲病提供了理論依據(jù)。

      關(guān)鍵詞:華支睪吸蟲(Clonorchis sinensis);蟲卵DNA;鑒定;PCR

      中圖分類號:R446.5 文獻標(biāo)識碼:A 文章編號:0439-8114(2013)07-1601-03

      華支睪吸蟲病是廣泛流行于東亞地區(qū)和中國大部分省市的食源性寄生蟲病,由寄生于人體肝膽管內(nèi)的華支睪吸蟲(Clonorchis sinensis)引起,可產(chǎn)生嚴重的肝膽并發(fā)癥,與膽管癌的關(guān)系也非常密切[1-6]。目前,對華支睪吸蟲的研究主要集中在對其成蟲或囊蚴的研究,而對蟲卵的研究甚少,僅限于對蟲卵的形態(tài)學(xué)研究。本試驗采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)對人糞便中的蟲卵進行鑒別,從而鑒定人是否患有華支睪吸蟲病,為PCR技術(shù)在華支睪吸蟲病診斷中的應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      糞樣來自吉林省白城市鎮(zhèn)賚縣流行區(qū)村民。

      主要試劑及儀器:2% Triton X-100,KOH,蔗糖/KCl溶液,PCR擴增試劑,T載體,lower DNA Marker,瓊脂糖,DNA凝膠回收試劑盒。Gene Amp PCR systerm 9700(AB公司),AR1140電子天平(USA),PY-120水平脫色搖床(北京鼎國生物技術(shù)發(fā)展中心),OLYMPUS CX31RTSF生物顯微鏡,NANODROP2000(Thermo公司),水浴鍋,超凈工作臺,磁力攪拌器,振蕩器,組織勻漿機。

      1.2 方法

      1.2.1 糞便的收集與篩選 每一糞樣先進行初步篩選,將少量生理鹽水加入糞樣中,洗去微量糞液,洗下的糞液在顯微鏡下觀察,每個糞樣做3個載玻片,若發(fā)現(xiàn)華支睪吸蟲蟲卵,即為陽性;沒有發(fā)現(xiàn)蟲卵則為陰性。將陽性糞便進行收集。

      1.2.2 蟲卵的收集 用沉淀集卵法收集蟲卵。先將每個糞樣中加入1 000 mL蒸餾水充分攪拌溶解,用40目篩過濾,除去濾渣后,濾液中再加入500 mL蒸餾水進行溶解攪拌,再用260目篩子進行過濾;濾液中再加入300 mL蒸餾水進行溶解攪拌,充分沉淀后,去上清液,留取沉淀,如此過程進行,依次降低蒸餾水的用量,直到上清液澄清,最后留取沉淀量20 mL,分裝到2 mL EP管中,于-20 ℃保存。

      1.2.3 蟲卵DNA的提取 按參考文獻[7]的方法并進行了適當(dāng)改進。將冰凍的含蟲卵的糞便樣品取出,于清水中融化,放入沸水中煮10 min, 12 000 r/min離心5 min,除去少量上清液后,將剩余的液體和沉淀移入2 mL的EP管中,并重懸;將EP管放入沸水中煮5 min, 12 000 r/min離心5 min;去上清液,各管中分別加入2% Triton X-100及KOH各200 μL,振蕩器振蕩混勻,12 000 r/min離心5 min,去上清液,再加2% Triton X-100及KOH各200 μL反復(fù)進行此過程,直至上清液變清澈;去上清液,每管加入800 μL蔗糖/KCl溶液,并充分振蕩均勻后, 12 000 r/min離心8 min;將上清液移入新的2 mL EP管中,蒸餾水加滿,12 000 r/min離心10 min,去上清液,重復(fù)加滿蒸餾水,清洗沉淀,至最后殘留200 μL沉淀物及液體;用組織勻漿機勻漿殘留的沉淀物及液體; 12 000 r/min離心5 min,留取上清液并移入新管中,沸水煮5 min,作為PCR模板。

      1.2.4 引物的設(shè)計與選擇 引物設(shè)計根據(jù)華支睪吸蟲基因,用Primer 5.0設(shè)計2對引物如下。

      第1對:上游引物Cs1-1:5′-TTAGAGGAGTTG

      GTGTCCCC-3′,下游引物Cs1-2:5′-AGCGTCACTG

      AACCACACCCAC-3′;

      第2對:上游引物Cs2-1:5′-TGGCCTGACTG

      GCTGGCCGG-3′,下游引物Cs2-2:5′-CGGCACCC

      CACACACATACA-3′。

      用Primer 5.0分析軟件分析其可行性,由上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成。

      1.2.5 PCR條件的優(yōu)化 PCR 特異性擴增:PCR反應(yīng)成分為10×PCR Buffer液(含Mg2+)4 μL,2 mmol/L dNTP 2.5~3.0 μL,10 pmol/L上、下游引物各0.5 μL,DNA模板5~6 μL,Taq DNA聚合酶0.25~0.50 μL,滅菌去離子水加至50 μL。擴增程序為:94 ℃預(yù)變性5 min、94 ℃變性30 s、55~60 ℃退火30 s、72 ℃延伸30 s,35個循環(huán),72 ℃延伸5 min、4 ℃保存。觀察2種引物條帶清晰程度來進行最適引物的選擇。

      1.2.6 瓊脂糖凝膠電泳檢測 用1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR擴增產(chǎn)物,電泳緩沖液為0.5×TBE,加入少許溴化乙錠(EB)使其終濃度為0.5 μg/mL。將上樣緩沖液與擴增產(chǎn)物以1∶10比例混勻,加樣至樣品孔中,以lower DNA Marker為標(biāo)準(zhǔn)分子量。用5 V/cm的電壓進行電泳,當(dāng)溴酚藍至適當(dāng)位置后,切斷電源,在紫外投射反射儀上觀察電泳結(jié)果并拍照。

      1.2.7 連接載體與基因測序 將PCR擴增產(chǎn)物大量回收,用DNA凝膠回收試劑盒回收DNA,然后與T載體進行連接,送上海生工生物工程有限公司進行核苷酸序列測定,運用NCBI中的BLAST工具將測序結(jié)果與基因庫內(nèi)的基因序列進行比對并進行同源性分析。

      2 結(jié)果

      2.1 PCR優(yōu)化結(jié)果

      分別對PCR反應(yīng)體系中的dNTP量、模板量、引物量和Taq DNA聚合酶用量進行優(yōu)化,擬在55~60 ℃的區(qū)間內(nèi)對退火溫度進行摸索,2對引物進行優(yōu)化后最佳結(jié)果見圖1、圖2。結(jié)果顯示第2對引物(圖2)出現(xiàn)的條帶最清晰,而且多次檢測準(zhǔn)確度高,因此選擇第2對引物作為最適引物,摸索后的最佳反應(yīng)條件為:擴增條件為94 ℃預(yù)變性5 min、94 ℃變性30 s、56 ℃退火1 min、72 ℃延伸30 s,30個循環(huán),72 ℃延伸5 min、4 ℃保存。最佳反應(yīng)體系見表1。采用1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測擴增產(chǎn)物,結(jié)果顯示除陰性對照未見條帶外,其余各樣本均可擴增出大小約為255 bp的特異性條帶(圖2)。

      2.2 基因序列比對結(jié)果

      擴增產(chǎn)物的測序結(jié)果應(yīng)用BLAST工具進行比對后,發(fā)現(xiàn)其與華支睪吸蟲基因的內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)2(ITS2):中國沈陽分離株(AF217099)和朝鮮分離株(AF217094)的同源性為100%,證實擴增產(chǎn)物為華支睪吸蟲基因的其中一個片段(圖3)。

      3 小結(jié)與討論

      華支睪吸蟲病的實驗室診斷主要包括病原學(xué)方法和免疫學(xué)方法,分子生物學(xué)診斷方法尚未建立。病原學(xué)檢查以糞便鏡檢蟲卵為主要方法。由于在人體內(nèi)寄生的華支睪吸蟲蟲卵數(shù)一般不多,排卵數(shù)量較少,蟲卵形態(tài)又非常小,該法極易漏診。免疫學(xué)診斷技術(shù)因其具有較高敏感性和特異性,操作簡便易行,但現(xiàn)已研制出的免疫學(xué)診斷方法因使用的抗原非特異性或敏感性低,而主要應(yīng)用于臨床輔助診斷中[8]。近年來,隨著分子生物學(xué)的發(fā)展,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)因其較高的敏感性、特異性以及能夠提供病原微生物在體內(nèi)存在的直接證據(jù)而在臨床診斷中展示了廣闊的應(yīng)用前景[9,10]。本試驗運用PCR技術(shù)檢測自然感染華支睪吸蟲病患者糞便中的蟲卵,設(shè)計多對引物進行選擇,優(yōu)化試驗結(jié)果。因糞便中干擾因素較多,故基因組DNA的成功提取以及穩(wěn)定的PCR反應(yīng)體系的建立便成為開展該方面研究的前提,下一步可以利用蟲卵數(shù)對感染程度的影響進行PCR定量研究,為進一步探索分子生物學(xué)方法在華支睪吸蟲病診斷中的應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

      參考文獻:

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