2013年1月16日，首批“國家級非物質文化遺產保護研究基地”授牌儀式在中國藝術研究院舉行。南通藍印花布藝術館成為首批獲得授牌的4家傳承單位之一。文化部副部長董偉、中國藝術研究院院長王文章等人為研究基地授牌。中國民間文藝家協(xié)會副主席、中國工藝美術大師、國家級非物質文化遺產傳承人、南通大學藍印花布藝術研究所所長吳元新，中國社會科學院榮譽學部委員劉魁立，北京師范大學教授、博士生導師蕭放等參加了授牌儀式。

“國家級非物質文化遺產保護研究基地”是中國非物質文化遺產保護中心從已列入國家級非物質文化遺產名錄的1366個項目中首批遴選出4個保護成效好，具備一定研究能力并已推出初步成果的國家級項目傳承單位。目前，南通藍印花布藝術館（研究所）在藍印花布收藏、研究、傳承、創(chuàng)新方面做出了突出貢獻。藝術館曾出版了國家重點圖書并承接了國家社科基金藝術學重點課題，推動了該項目的理論研究和實踐保護工作。