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      基于聚類分析的河南荷花品種資源分類1)

      2013-08-08 07:22:18管志濤郝改蓮孔德政
      東北林業(yè)大學學報 2013年9期
      關鍵詞:野生種重瓣株型

      管志濤 郝改蓮 孔德政

      (濮陽職業(yè)技術學院,濮陽,457000) (河南農(nóng)業(yè)大學)

      確定荷花品種主要性狀對鑒定新品種及分類至關重要[1]。面對眾多的荷花品種,只有了解品種的特性和相互之間的關系,才能更好地為選擇親本,培育更優(yōu)質(zhì)品種服務。在借鑒以往研究方法的基礎上,研究選用河南地區(qū)127個荷花品種及野生種,借助聚類分析方法,對荷花品種進行遺傳距離研究,旨在為荷花育種、分類、應用及親緣關系的研究提供依據(jù)。

      1 材料與方法

      試驗所用荷花品種均來源于河南省各城市公園、風景區(qū)、蓮藕生產(chǎn)地及野生藕生長地培育及生長的花蓮、藕蓮和子蓮。在2008年調(diào)查的96個品種[2]基礎上,擴大調(diào)查范圍,加深調(diào)查力度,增加了扣馬白蓮等31個品種及野生種,因野生種目前尚未申報命名,筆者采用發(fā)現(xiàn)野生種的地名命名。供試荷花品種名稱見表1。

      參照《中國蓮》[3]《中國荷花品種圖志》[4]《中國荷花》[5],確定荷花品種性狀指標,對24個生物學性狀進行統(tǒng)計與測量,將性狀分為數(shù)值性狀和質(zhì)量性狀。其中又將質(zhì)量性狀分為二元性狀和有序多態(tài)性狀。本研究采用等級數(shù)量編碼方法進行性狀編碼[6],二元性狀以0,1表示,有序多態(tài)性狀以1,2,3…表示,數(shù)值性狀取平均值直接轉(zhuǎn)人下一步數(shù)學運算。

      試驗數(shù)據(jù)應用DPS軟件統(tǒng)計分析??椎抡龋?]認為卡方距離最長距離法分辨力最好,聚類分析時最適合蓮屬資源分類。

      2 結果與分析

      2.1 R型聚類分析結果

      根據(jù)分類的需要,對荷花的生物學性狀進行的R型聚類。分析結果見圖1,依據(jù)聚合水平,計算出跳變值,在圖1中作結合線L=9.401 7。分析顯示,大多數(shù)性狀間都彼此獨立,說明這些性狀間的變異和演進是互不干擾的。

      2.2 Q型聚類分析結果

      對127個荷花品種進行卡方距離最長距離法聚類,結果見圖2。由圖2可以看出,在結合線L1=3.745 3處將荷花品種分為兩大類,即大株型群(Ⅰ類)和中小株型群(Ⅱ類);結合線L2=2.823 4又將大株型群分為三大類,即A組、B組、C組。結合線L4=2.567 1又將中小株型群分為3類,即重臺類(D組)、重瓣類(E組和 F組)、少瓣和半重瓣類(G組)。這些大類下面又可分為若干小類。

      A組:所含品種類型為少瓣類。結合線L3=2.623 9將其分為兩類①組和②組。①組品種均為花蓮品種,但還在大株型群中出現(xiàn)了‘娃娃蓮’、‘金珠落玉盤’、‘風采’、‘紅領巾’等中株型群品種,這說明碗蓮品種性狀進化不穩(wěn)定,給其適合的條件和環(huán)境,有變回大株型的趨勢[2];②組均為藕蓮品種。

      表1 供試荷花品種

      圖1 24個形態(tài)性狀R型聚類

      B組:所含品種類型為少瓣類。結合線L5=2.547 1將其分類為③組和④組。③組均為目前全國廣為栽培的藕蓮品種。鄂蓮5號為鄂蓮1號和鄂蓮2號的雜交品種,鄂蓮系列從遺傳距離中可看出,親緣關系較近,這與實際生產(chǎn)相符。但觀賞品種‘眼兒媚’、‘一丈青’與藕蓮品種聚為一類,說明其在親緣關系中與藕蓮較近,只是在生產(chǎn)中作為花蓮推廣。④組均為河南本土野生種,因野生種負載荷花的原始信息,故它們聚為一類。又因野生種目前尚未申報命名,故在聚類和生物學性狀描述時,筆者采用發(fā)現(xiàn)野生種的地名命名。

      C組:所含品種類型為少瓣類,并且均為冬荷品種,故聚為一類。

      D組:所包含的品種類型為重臺類,少數(shù)為重瓣類。D組中重瓣類品種的心皮大部分瓣化或泡狀,很少結實,有向重臺類進化的趨勢,故其與重臺類聚類在一起。結合線L6=2.147 8將D組分類為⑤、⑥、⑦3組。⑤組品種全為粉色系。⑥組品種為紅蓮系,因復色品種‘蝶戀花’由紅蓮進化而成,故與紅蓮聚類在一起。白色品種‘小碧臺’因其遺傳性狀與其他品種相近而聚類在一起。⑦組品種為白色系。粉色品種‘紅寶石’、‘壽星蓮’由白色系進化而成,故與白色系聚類在一起。

      E組:所包含的品種類型為半重瓣和重瓣型。結合線L7=1.987 1將E組分類為⑧組和⑨組。⑧組品種為少瓣和半重瓣品種,因重瓣品種‘別樣紅’、‘友誼紅2號’因花色與其他品種相同,又因花瓣數(shù)為重瓣品種中的較少數(shù),與重瓣相近,故與半重瓣聚類為一類。⑨組品種均為重瓣類。

      G組:所包含品種類型為大中型株型群?;ㄐ蜑橹匕晷秃蜕侔晷?。結合線L8=2.595 7將G組分類為⑩組和○11組。⑩組品種為重瓣型,從遺傳距離上看,⑩組和⑨組較遠,故⑩組沒和⑨組聚類在一起?!?1組品種為少瓣類,且為大株型群。但其沒和I組聚類在一起,大概是因為生物學性狀與Ⅱ組其他品種較近,而與其聚類在一起。這一問題需要進一步研究討論。

      圖2 127個荷花品種聚類分析

      3 結論與討論

      依據(jù)主成分分析結果,對荷花品種的24個性狀進行R型聚類。聚類結果表明,大多數(shù)性狀間都彼此獨立,性狀間的變異和演進是互不干擾的。只有少數(shù)性狀具有連帶和相互關系,在以后的運用中可淘汰掉部分性狀。

      本研究采用卡方距離最長距離法對127個荷花品種的24個性狀進行Q型聚類分析,通過分析,將其劃分為兩大類,又依據(jù)各品種的相似性狀,細分為11小類。通過對荷花每一品種分類位置進行分析與比較[4,7-8],筆者認為,數(shù)量分類結果行之有效,并可減少細胞學標記分類、蛋白質(zhì)標記分類、DNA分子標記分類等工作的試驗繁雜。與形態(tài)學形狀分類比較,又增強了科學性及客觀性。如唐招提寺蓮[9]通過數(shù)量分類和RAPD鑒定都聚在藕蓮中,但在生產(chǎn)中則作為花蓮栽培,有充分理由將其認定為藕蓮。

      R型和Q型聚類分析結果具有客觀性,必要時能為修改和改進分類提供幫助,聚類分析方法本身只是一種運算方法,不提供新的分類系統(tǒng),但其客觀地檢查現(xiàn)有的分類結果,還能在許多情況下為完善和改進現(xiàn)有的分類提供啟示作用。尤其在研究品種和野生種遺傳距離時,聚類分析可從繁雜的現(xiàn)象中,找出主要問題。目前,關于聚類分析方法,已被廣泛應用于李[10]、茄子[11]、山藥[12]等果蔬及農(nóng)作物,加之數(shù)理分類方法可以檢驗和重復,因此,在研究植物分類中應充分利用。

      [1] 王其超,張行言.荷花新品種性狀記載項目的制定[J].中國園林,2012,28(1):74-77.

      [2] 管志濤.河南省荷花資源調(diào)查及其品種分類的研究[D].鄭州:河南農(nóng)業(yè)大學,2008.

      [3] 倪學明.中國蓮[M].北京:科學出版社,1987.

      [4] 王其超,張行言.中國荷花品種圖志[M].北京:中國林業(yè)出版社,2004.

      [5] 鄒秀文,趙效銳,靳曉白.中國荷花[M].北京:金盾出版社,1997.

      [6] 徐克學.數(shù)量分類學[M].北京:科學出版社,1994.

      [7] 孔德政,管志濤.基于主成分和聚類分析的荷花品種生物學性狀的比較研究[J].中國園林,2008,24(8):86-89.

      [8] 趙海艦.荷花部分品種資源調(diào)查及孢粉學研究[D].鄭州:河南農(nóng)業(yè)大學,2010.

      [9] 郭宏波.蓮屬(Nelumbo)資源的分類[D].武漢:華中農(nóng)業(yè)大學,2003.

      [10] 焦揚,葛慧玲.聚類分析在李品種譜系分析中的應用[J].東北農(nóng)業(yè)大學學報,2011,42(5):72-76.

      [11] 趙德新,孫治強,任子君,等.茄子形態(tài)學性狀主成分分析及聚類分析[J].河南農(nóng)業(yè)大學學報,2009,43(4):393-397.

      [12] 梁任繁,王軍民,覃芳,等.廣西山藥種質(zhì)資源聚類分析[J].中國蔬菜,2009(4):30-34.

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