穰 真,崔 凡,李 薇,王有為
(1.四川大學華西醫(yī)院皮膚性病科,四川 成都 610041;2.四川省醫(yī)學科學院·四川省人民醫(yī)院皮膚病性病研究所,四川 成都 610031)
目前已知的11種馬拉色菌中,除厚皮馬拉色菌外,都屬于嗜脂性酵母[1]。Benham于1939年首次發(fā)現(xiàn)馬拉色菌的生長依賴于培養(yǎng)基中含有的脂類物質(zhì)[2]。由此,一系列的馬拉色菌培養(yǎng)基應(yīng)運而生,使得馬拉色菌的培養(yǎng)和鑒定不再困難。在此基礎(chǔ)上關(guān)于馬拉色菌的致病機制和分型方面的研究得以順利開展。目前比較常用的馬拉色菌培養(yǎng)基有兩種,分別為 Leeming&Notman 培養(yǎng)基[3]和 Dixon 培養(yǎng)基[4]。由于馬拉色菌胞壁富含脂類而韌性高,為破壁提取DNA增加了難度。因此,為了保證所提取DNA的數(shù)量和質(zhì)量,實驗所用菌量非常重要。目前馬拉色菌在傳統(tǒng)Leeming&Notman培養(yǎng)基以及Dixon培養(yǎng)基上的生長條件為35℃,7天。本研究利用馬拉色菌對于脂質(zhì)的依賴性,通過改變Leeming&Notman培養(yǎng)基中橄欖油和吐溫60的含量,摸索出能顯著提高馬拉色菌培養(yǎng)菌產(chǎn)量的方案,并驗證。
1.1 馬拉色菌培養(yǎng) 傳統(tǒng)的Leeming&Notman培養(yǎng)基配方為:1%蛋白胨、0.5%葡萄糖、0.1%酵母浸膏、0.4%牛膽鹽、0.1%甘油、0.05%單硬脂酸甘油酯、0.05%吐溫60、1%全脂奶、2%橄欖油、1.2%瓊脂、0.5%放線菌酮、0.05%氯霉素。本研究共設(shè)3組,每組設(shè) 3個樣本:第 1組含 1%橄欖油和0.025%吐溫60,其余成分含量不變;第2組含2%橄欖油和0.05%吐溫60,即標準的Leeming&Notman培養(yǎng)基;第3組含4%橄欖油和0.1%吐溫60。制備上述3種培養(yǎng)基各10ml,倒入小平皿內(nèi)。取一環(huán)球形馬拉色菌在1ml滅菌蒸餾水中研磨均勻,用移液器各取5μl含菌懸液滴加入培養(yǎng)基中央,置恒溫箱35℃保存。自培養(yǎng)第3、5、7天,每天測量菌落直徑并拍照。
1.2 馬拉色菌DNA提取及含量分析 在培養(yǎng)第7天,刮取各菌落,用CTAB法提取馬拉色菌基因組DNA[5]。將DNA 溶解于50μl純凈水,吸取 10 μl DNA溶液,轉(zhuǎn)移至990μl純凈水,于分光光度計下讀取260nm波段的OD值。DNA濃度(mg/m l)=50×(260 nm的OD值)×稀釋倍數(shù)(本實驗為100)。
1.3 擴增馬拉色菌ITS1-2區(qū) 參照文獻[6]設(shè)計真菌ITS1和ITS2引物(由上海生物工程有限公司合成),擴增馬拉色菌基因組ITS1-2區(qū)。反應(yīng)體系為 DNA 1 μl、10×buffer 5 μl、Mgcl2(25 mmol/L)3 μl、dNTP(10 mmol/L)1 μl、引物(10μmol/L)各 1 μl、Taq DNA 聚合酶(BBI)2.5 U,用去離子水補足至50μl。反應(yīng)條件:94℃預變性5 min,94℃ 1 min,60 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,連續(xù)35 個循環(huán),最后72℃延伸10 min。得到的PCR產(chǎn)物于120 V泳動20分鐘,經(jīng)EB染色后凝膠呈像。
1.4 統(tǒng)計學方法 所得數(shù)據(jù)以均數(shù)±標準差表示,使用SPSS 11.0軟件進行組間差異性比較,P<0.05表示差異有統(tǒng)計學意義。
培養(yǎng)第3日,4%橄欖油組馬拉色菌在Leeming&Notman培養(yǎng)基上的生長速度和2%橄欖油組差異無統(tǒng)計學意義[(5.83±0.76)mm vs(4.83±0.29)mm,P=0.101],但在后者的生長速度明顯超過1%橄欖油組[(4.83±0.29)mm vs(2.67±0.58)mm,P=0.004]。培養(yǎng)第5日,4%橄欖油組的生長速度顯著快于2%橄欖油組[(7.33±0.29)mm vs(6.17±0.29)mm,P=0.008]。隨著培養(yǎng)時間的延長,各組之間的差異進一步擴大。第7日,4%橄欖油組的馬拉色菌無論是生長速度還是菌落直徑都高于另兩組(圖1),證明橄欖油含量的增加對馬拉色菌的生長有顯著促進作用。在培養(yǎng)第7天,生長于含4%橄欖油Leeming&Notman培養(yǎng)基的馬拉色菌DNA濃度顯著高于2%橄欖油組[(273.33±24.66)mg/ml vs(205.67±13.32)mg/ml,P=0.014],而后者亦高于1%橄欖油組[(205.67±13.32)mg/ml vs(118.33±15)mg/ml,P=0.002],見圖 2。該結(jié)果提示改良的Leeming&Notman培養(yǎng)基增加培養(yǎng)菌量,從而直接提高DNA的產(chǎn)出。擴增不同組馬拉色菌DNA的ITS1-2區(qū),電泳后可見長度約280 bp片段,同時4%橄欖油組PCR產(chǎn)物的熒光強度明顯高于2%橄欖油組和1%橄欖油組(圖3)。該結(jié)果提示由于含4%橄欖油的培養(yǎng)基增加了馬拉色菌DNA產(chǎn)量,其PCR產(chǎn)物的產(chǎn)量也得到相應(yīng)提高。
圖1 球形馬拉色菌在含不同濃度橄欖油的Leeming&Notman培養(yǎng)基上的生長狀況 a:培養(yǎng)第3、5、7日的菌落形態(tài);b:培養(yǎng)第3、5、7日的菌落直徑
圖2 球形馬拉色菌在含不同濃度橄欖油的Leeming&Notman培養(yǎng)基上的DNA產(chǎn)量
圖3 球形馬拉色菌ITS1-2區(qū)電泳結(jié)果1:DNA marker;2:陰性對照;3:1%橄欖油組;4:2%橄欖油組;5:4%橄欖油組
馬拉色菌是一種嗜脂性的真菌,其生長速度與所處環(huán)境的含脂量成正比。這一點也在與馬拉色菌相關(guān)的疾病中得到證實。馬拉色菌所引起的疾病通常好發(fā)于皮脂豐富的區(qū)域,因為這些區(qū)域為馬拉色菌的生長提供了必需的脂源[7]。
本研究針對Leeming&Notman培養(yǎng)基的橄欖油含量設(shè)立了3組含有不同脂質(zhì)比例的培養(yǎng)基,動態(tài)觀察了菌落的生長狀況。實驗結(jié)果表明4%橄欖油對馬拉色菌生長的促進作用是顯而易見的。無論是馬拉色菌的生長速度還是最終菌落直徑都較標準的含2%橄欖油的Leeming&Notman培養(yǎng)基組和1%橄欖油組高。DNA定量檢測證實在相同培養(yǎng)時間內(nèi),獲得菌量越大,提取的基因組DNA也越多。當前的醫(yī)學真菌學研究更多地使用各種分子生物學技術(shù)對真菌的功能性基因及其編碼的生物活性蛋白進行分析。真菌種屬的分型鑒定研究也離不開相應(yīng)的分子生物學技術(shù)。因此提供足量、優(yōu)質(zhì)的真菌基因組DNA是這些研究的前提。我們擴增了馬拉色菌ITS1-2區(qū),進一步證實更多的DNA產(chǎn)出保證了PCR產(chǎn)物的質(zhì)量。改良的含4%橄欖油的Leeming&Notman培養(yǎng)基有利于提高馬拉色菌科研工作的效率。
本研究的創(chuàng)新之處在于通過將Leeming&Notman培養(yǎng)基中橄欖油含量增加到4%,加速了馬拉色菌的生長速度,縮短了培養(yǎng)周期。我們在增加橄欖油含量的同時,也相應(yīng)增加吐溫60的含量。吐溫60是一種乳化劑。增加吐溫60的目的是使得培養(yǎng)基中的油相和水相更好的交融,避免出現(xiàn)油含量增多導致的油水分層。而吐溫60對球形馬拉色菌的生長沒有促進作用[8],所以可以確定馬拉色菌的快速生長完全是橄欖油作用的結(jié)果。我們也嘗試進一步增加橄欖油含量,結(jié)果會出現(xiàn)培養(yǎng)基的油相和水相分層,而且馬拉色菌生長增快不明顯,最重要的是過多的油介入會影響DNA的提取質(zhì)量。所以經(jīng)改良含4%橄欖油和0.1%吐溫60的Leeming&Notman培養(yǎng)基是保證馬拉色菌生長數(shù)量和質(zhì)量的最佳平衡點。
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