李 梵 綜述,陳國鳳,徐東平 審校
乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)感染是一個(gè)全球公共衛(wèi)生問題。HBV感染人體后可以引起急性肝損傷和慢性病毒感染。慢性HBV感染者疾病的臨床轉(zhuǎn)歸包括:慢性肝炎、肝硬化、肝細(xì)胞癌以及肝衰竭。宿主、病毒因素[1]、環(huán)境、藥物、酒精等因素與慢性HBV感染的進(jìn)程相關(guān)。在諸多因素中,HBV基因突變是影響病毒生物學(xué)特性的基本因素。因HBV聚合酶無校對功能,病毒在復(fù)制過程中容易產(chǎn)生變異。循環(huán)中變異病毒數(shù)量巨大,突變在一定范圍內(nèi)累積,使得在感染者體內(nèi)HBV是以準(zhǔn)種形式存在,在環(huán)境選擇壓力下,準(zhǔn)種的病毒組合不斷變化,引起病毒生物學(xué)特點(diǎn)的變化。突變隨著HBV感染時(shí)間的延長而逐步累積,不同疾病階段突變率有顯著差別。以下將可能與臨床疾病進(jìn)展相關(guān)的各個(gè)HBV基因區(qū)突變做一綜述。
前 C區(qū) (nt 1814-1901)參與編碼 HBV E抗原(HBeAg),由29個(gè)氨基酸組成。最常見的突變是HBV前C區(qū)G1896A突變,HBeAg的合成終止,但HBV核心抗原(HBcAg)的正常翻譯卻未受影響。HBeAg是小分子可溶性蛋白,可以緩解細(xì)胞毒T淋巴細(xì)胞(cytotoxic lymphocyte,CTL)對細(xì)胞膜上HBcAg的攻擊,導(dǎo)致HBV感染的肝細(xì)胞無法被清除[2],如果HBeAg合成或分泌障礙,CTL容易攻擊感染肝細(xì)胞,造成肝細(xì)胞損傷。G1896A突變還增加HBV nt1847-1917莖環(huán)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性,上調(diào)HBcAg的表達(dá);HBcAg由核型轉(zhuǎn)為胞漿型,增加了其對肝細(xì)胞的毒性。
核心啟動(dòng)子區(qū)(core promoter,CP)(nt1643-1849)是直接引發(fā)前基因組RNA轉(zhuǎn)錄的啟動(dòng)子,包括基本核心啟動(dòng)子區(qū)(basic core promoter,BCP)(nt1742-1849)和其上游調(diào)節(jié)元件。CP區(qū)能夠調(diào)節(jié)前核心RNA(precoreRNA)轉(zhuǎn)錄、HBeAg產(chǎn)量以及影響病毒前基因組(pregenome RNA,pgRNA)的復(fù)制和HBcAg的表達(dá)。
BCP區(qū)是研究的熱點(diǎn)。目前,常見T1753A/C、T1754C/G、A 1762T、G 1764A、C1766T等突變形式,其中以1762/1764雙聯(lián)突變最為常見,聯(lián)合突變可以上調(diào)pgRNA的轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)pgRNA衣殼化,增加HBcAg產(chǎn)量,從而增強(qiáng)HBV復(fù)制力。細(xì)胞轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn)顯示,聯(lián)合突變可以抑制precoreRNA的轉(zhuǎn)錄,繼而降低HBeAg合成。多聯(lián)突變的影響高于雙聯(lián)突變,例如1762/1764雙聯(lián)突變病毒復(fù)制力和HBeAg合成量分別是野生株的2倍和80%,而1753/1762/1764三聯(lián)突變分別是4倍和70%,1753/1762/1764/1766四聯(lián)突變則達(dá)到了8倍和20%[3]。另外,BCP區(qū)基因突變還可以增加肝細(xì)胞凋亡[4]。
C區(qū)(1901-2452)有500多個(gè)核苷酸,表達(dá)的HBcAg是CTL攻擊的靶抗原,可導(dǎo)致表達(dá)靶抗原的感染肝細(xì)胞死亡,C基因突變可引起HBcAg抗原表位發(fā)生改變,從而直接影響到宿主對HBV的免疫應(yīng)答。例如,Sugiyama等的研究認(rèn)為,A2339G變異會(huì)在體外增強(qiáng)HBV復(fù)制,發(fā)生此變異的患兒ALT峰值較沒有該變異的患兒高[5]。
由于上述可能的機(jī)制,許多研究發(fā)現(xiàn)隨著乙肝病情嚴(yán)重程度的增加,前C/BCP區(qū)突變檢出率隨之增高。例如:前C區(qū)1896位突變和1762/1764雙聯(lián)突變更多見于HBeAg陰性和疾病進(jìn)展程度更高的患者;同時(shí)不論基因B型還是C型,1762/1764雙聯(lián)突變都會(huì)加速疾病的進(jìn)展和增加肝癌的發(fā)生機(jī)率[6-9]。
一項(xiàng)多中心研究對250例慢性HBV(基因B或C型)患者1762/1764雙聯(lián)突變率進(jìn)行了分析,結(jié)果提示隨著疾病嚴(yán)重程度增加,1762/1764雙聯(lián)突變率也相應(yīng)增加;而且該雙突變陽性率在肝癌患者中顯著增高,是HBV攜帶者發(fā)生肝癌的病毒學(xué)預(yù)測因素[6]。另一研究得出相似的結(jié)果,該研究對400例HBV攜帶者進(jìn)行長期縱向隨訪,發(fā)現(xiàn)1762/1764雙聯(lián)突變是疾病進(jìn)展和發(fā)生肝癌的獨(dú)立預(yù)測因素[10]。另外,先前Meta分析表明從無癥狀攜帶者到肝硬化,C1653T、T1753V及1762/1764雙聯(lián)突變檢出率逐漸增加,CP區(qū)其他位點(diǎn)突變也與肝癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)性的增加密切相關(guān)[11],且CP區(qū)其他位點(diǎn)突變大部分發(fā)現(xiàn)始終與1762/1764雙聯(lián)突變相伴隨,提示1762/1764雙聯(lián)突變在肝癌發(fā)生中可能具有重要作用??v向的研究表明1762/1764雙聯(lián)突變在診斷肝癌之前很多年就發(fā)生,而其他位點(diǎn)突變在臨近診斷肝癌時(shí)發(fā)生,說明1762/1764雙聯(lián)突變在肝癌早期階段發(fā)生具有作用,而CP區(qū)其他位點(diǎn)突變在促進(jìn)肝癌發(fā)生也有作用的[12]。Yin等完成的一項(xiàng)大樣本橫斷面(846名無癥狀攜帶者、235名慢性肝炎、188名肝硬化患者、190名肝癌)研究[13]提示:在HBV基因C型感染的患者中,肝硬化患者 HBV C1673T、A1726C、A1727T、C1730G、C1766T、T1768A、C1773T、C1799G 的 突 變率明顯高于慢性乙型肝炎患者,肝癌患者上述位點(diǎn)突變率高于肝硬化,逐步多因素回歸分析提示HBV基因C型、患者年齡、性別、轉(zhuǎn)氨酶水平,及T1768A、A1762T/G1764A和A1846T突變與肝硬化的發(fā)病獨(dú)立相關(guān);肝癌發(fā)生的獨(dú)立預(yù)測因素有患者年齡、異常轉(zhuǎn)氨酶、HBVD NA≥104IU/ml、基因C型以及C1653T、T1674C/G、T1753V和A1762T/G1764A突變。除了T1674 C/G以外,這些發(fā)現(xiàn)和Meta分析的結(jié)論[11]一致。在該項(xiàng)研究中,即使平衡年齡因素的影響,CP區(qū)變異仍與肝癌的發(fā)生密切相關(guān)。我們之前大樣本量的研究也表明,前C/BCP區(qū)基因突變與疾病的嚴(yán)重程度密切相關(guān)[14]。
S基因包括前 S1區(qū)(nt2848-3204),前 S2區(qū)(nt3205-0154),S區(qū)(nt155-835)。分別編碼 119個(gè)氨基酸(amino acid,aa)殘基的前S1蛋白、55個(gè)aa的前S2蛋白和226個(gè)aa的S蛋白。
前S區(qū)位于S基因的5’端,分為前S1區(qū)和前S2區(qū)。前S1區(qū)包涵有119個(gè)氨基酸,分為2個(gè)部分,N端(aa1-57)和C端(aa58-119);前S2區(qū)包含55個(gè)氨基酸。前S區(qū)具有T細(xì)胞和B細(xì)胞的識(shí)別位點(diǎn),因此易影響免疫反應(yīng)[8,15,16]。前S區(qū)含有在病毒生活周期中起關(guān)鍵作用的結(jié)構(gòu)位點(diǎn)[8],如:肝細(xì)胞結(jié)合區(qū)域(位于前S1域的N端,對感染至關(guān)重要)、熱休克蛋白70-結(jié)合位點(diǎn)(位于前S1域的C端)、細(xì)胞溶質(zhì)停留決定子(cytosolic anchorage determinant,CAD、位于前 S1域的 C端)、核衣殼結(jié)合位點(diǎn)(位于前S1域的C端)、CCAAT結(jié)合因子(CCAAT-binding factor,CBF)結(jié)合位點(diǎn)(位于前 S1域的 C端,對S基因表達(dá)必需的)、多聚人血清白蛋白(polymerized human serum albumin,pHSA)結(jié)合位點(diǎn)、S啟動(dòng)子(位于前S1域的C端)等。研究證實(shí),前S1/前S2區(qū)為HBV變異最大的區(qū)域,最容易發(fā)生缺失突變。前S區(qū)突變位置通常包括在:前S1的3’端缺失和前S2的5’端缺失、前S2的起始密碼子缺失,以及前S2的起始密碼子的點(diǎn)突變等。
前S區(qū)突變可能改變病毒的感染性及分泌能力,改變病毒的抗原性及結(jié)合位點(diǎn)識(shí)別能力,從而影響疾病的發(fā)生、發(fā)展過程。前S1和前S2突變通常使得大蛋白、中蛋白、小蛋白比例失調(diào),大蛋白在肝細(xì)胞內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(endoplasmic reticulum,ER)上過量產(chǎn)生和滯留,增加了ER壓力,導(dǎo)致DNA損傷以及基因組不穩(wěn)定性[17],造成肝細(xì)胞進(jìn)一步損傷及肝癌的發(fā)生。另外,前S2基因的表達(dá)與腫瘤抑制基因p53的表達(dá)高度相關(guān)[17],截短了的前S2片段在整合進(jìn)入宿主基因組時(shí)仍具有轉(zhuǎn)錄交易能力可能是致癌的機(jī)制之一[18],前S2突變誘導(dǎo)周期蛋白依賴性激酶抑制劑的分解,使得細(xì)胞周期不受控制進(jìn)展[19]也是可能致癌的機(jī)制之一。Mun等選取241例不同程度的韓國HBV感染者進(jìn)行分析,結(jié)果提示HBV F141L與肝癌密切相關(guān)。通過穩(wěn)定細(xì)胞系研究,發(fā)現(xiàn)F141L-LHBs可以通過下調(diào)p53和P21、上調(diào)CDK4和細(xì)胞周期蛋白A使得細(xì)胞周期進(jìn)展[20]。前S2基因缺失可形成毛玻璃樣肝細(xì)胞(ground glass hepatocytes,GGHs)類型[18],與肝病進(jìn)展到更嚴(yán)重的階段如肝硬化有關(guān)。
S區(qū)基因在某些藥物如免疫抑制劑、核苷類抗病毒藥物等誘導(dǎo)下,容易發(fā)生突變。S區(qū)基因a決定簇突變是病毒逃避表現(xiàn)抗原免疫的主要原因,這種形式突變常見于出生時(shí)應(yīng)用了乙肝疫苗和免疫球蛋白免疫但卻感染HBV的嬰兒,后來在肝移植患者也發(fā)現(xiàn)。目前報(bào)道較多的有sG145R,其他位點(diǎn)也可見變異,但其臨床意義有待進(jìn)一步研究。
前S基因缺失突變多見于基因C型,病情嚴(yán)重程度較無前S缺失的患者嚴(yán)重,且隨著肝臟疾病嚴(yán)重程度的增加,突變率相應(yīng)增加。因此在較晚的疾病階段患者中前S區(qū)缺失檢出率更高。前S區(qū)缺失突變也與肝癌的發(fā)生密切相關(guān)。Lin等[21]檢測了266名慢性HBV感染患者,包括202例無癥狀攜帶者、64名肝癌患者,總體上前S缺失率為16.5%,肝癌和基因C型者更易發(fā)生前S基因的缺失突變。年輕的肝癌患者前S缺失發(fā)生率更高。香港大學(xué)Yeung等[22]分析69名慢性乙肝患者和115名肝癌患者后發(fā)現(xiàn),前S缺失檢出率為21.9%,規(guī)模從3-189bp,集中在前S1的3’端和前S2的 5’端,可見前S1啟動(dòng)子、前S2啟動(dòng)子區(qū)域缺失突變。人血清白蛋白受體區(qū)及S啟動(dòng)子區(qū)缺失較為多見,而肝細(xì)胞結(jié)合位點(diǎn)及CCAAT盒子缺失較為少見。前S2缺失突變是肝癌發(fā)生的獨(dú)立預(yù)測因素,小于50歲的肝癌患者前S缺失率更高。劉世建等進(jìn)行功能位點(diǎn)分析后前S缺失類型主要以PreS2的 N端缺失和突變最為多見,占缺失突變62.5%,較前S1的更為多見。功能位點(diǎn)分析主要見于病毒分泌、核苷酸結(jié)合位點(diǎn)、轉(zhuǎn)錄和pHSA結(jié)合位點(diǎn)。
前S1涵蓋了對病毒生活周期相關(guān)的位點(diǎn),如肝細(xì)胞結(jié)合位點(diǎn),S啟動(dòng)子區(qū)域,而前S2涵蓋大量的T細(xì)胞及B細(xì)胞表位,對免疫壓力的反應(yīng)更活躍。前S1和前S2區(qū)缺失可以導(dǎo)致不同的GGHs組織病理類型[23],與前S1相比,前S2缺失具有導(dǎo)致更高的ER壓力能力,通過DNA損傷,更完全的導(dǎo)致肝癌[23],提示前S1和前S2缺失引起疾病進(jìn)展的模式可能不同,因此在針對韓國病人的研究中,前S1缺失比前S2缺失與肝癌更相關(guān),Mun[24]研究檢測了120名乙肝不同疾病程度的患者,發(fā)現(xiàn)總體前S缺失率為30.8%,前S缺失隨著臨床疾病程度增加逐步增加,但是發(fā)現(xiàn)前S1啟動(dòng)子缺失在肝癌患者中比率明顯增高,約22.5%。前S1缺失在肝癌患者中較肝硬化檢出率更高,前S2缺失在肝硬化患者中檢出率高于肝癌,另外韓國數(shù)篇相關(guān)文章研究也認(rèn)為肝癌發(fā)生與前S1缺失更相關(guān)[25,26]。推測其主要原因可能是韓國的研究對象幾乎大部分感染基因C型。Yin[27]等的研究驗(yàn)證了上述結(jié)論,前S2突變和慢性肝病進(jìn)展相關(guān),前S1突變和肝癌發(fā)病相關(guān)。與慢性肝病相比,81%的前S1突變在基因C型中與肝硬化負(fù)相關(guān),多因素回歸分析表明C2964A、C3116T和C7A是肝癌發(fā)病的獨(dú)立預(yù)測因素,同時(shí)A2964C和C3116T是與發(fā)生肝硬化風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)的標(biāo)記。
P基因區(qū)(nt2307-0-1623)共涉及4個(gè)功能區(qū):末端蛋白區(qū)、間隔區(qū)、多聚酶(polymerase,POL)/逆轉(zhuǎn)錄酶(reversetranscriptase,RT)區(qū),核糖核酸酶H區(qū)。RT基因是P基因的重要組成部分,包括 7 個(gè)功能亞區(qū):A、B、C、D、E、F、G 亞區(qū)。RT區(qū)突變意義體現(xiàn)在兩個(gè)方面:一是該區(qū)是抗HBV核苷(酸)類似物的作用靶位,病毒產(chǎn)生耐藥突變后可引起病毒反跳,不合理停藥可導(dǎo)致野生病毒復(fù)制迅速增加,誘導(dǎo)過度免疫反應(yīng),引起病情加重,疾病進(jìn)展。目前常用藥物有拉米夫定、阿德福韋酯、替比夫定、恩替卡韋。拉米夫定最常見的耐藥形式是 rtM204Ⅰ和 rtM204V,rtL80Ⅰ、rtV173L、rtL180M 為其補(bǔ)償突變。我們的研究也發(fā)現(xiàn)rtL229F可繼發(fā)于rtM204I變異,雖然不能直接降低病毒對藥物的敏感性,但可補(bǔ)償rtM204I復(fù)制力的降低,也是一種補(bǔ)償突變[28]。替比夫定與其分子及結(jié)構(gòu)和作用目標(biāo)位點(diǎn)相似,存在交叉耐藥,rtN236T、rtA181V是阿德福韋酯常見的耐藥形式。恩替卡韋的耐藥形式是在拉米夫定耐藥位點(diǎn)基礎(chǔ)上加上T184、S202和/或M250變異;二是該區(qū)突變有可能引起S蛋白抗原表位改變[29],兩者同時(shí)突變有可能影響到病毒的復(fù)制能力,使得病毒復(fù)制動(dòng)力學(xué)變化,加重內(nèi)質(zhì)網(wǎng)壓力,增加肝癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)[30,31]。
X基因區(qū)(nt1374-1838)是HBV最小的開放讀碼框架(open reading frame,ORF),可分為 A-F 6 個(gè)功能區(qū),序列相對保守??赡茉诓《緩?fù)制中發(fā)揮重要作用。HBx可反式激活 BCP,啟動(dòng) pg-RNA和m-RNA的轉(zhuǎn)錄,使HBV復(fù)制和表達(dá)增強(qiáng);可與多種細(xì)胞因子相互作用而增強(qiáng)原癌基因的表達(dá),促進(jìn)細(xì)胞惡變。HBx加強(qiáng)肝細(xì)胞表面 MHC I類和II類抗原的表達(dá),促進(jìn) CTL介導(dǎo)的肝細(xì)胞壞死。另外,HBx基因在HCC癌變過程中起著重要作用。
除了上述以研究HBV不同ORF基因突變對疾病轉(zhuǎn)歸的影響外,目前多區(qū)基因聯(lián)合突變逐漸得到重視。如前所述,HBV基因組非常緊湊,復(fù)制高效。不同基因區(qū)相互重疊,比如S基因完全包含在P基因區(qū)內(nèi),因此某的區(qū)基因突變通常會(huì)導(dǎo)致其它基因功能的異常。因此,在對不同區(qū)基因突變對HBV生物學(xué)、機(jī)體免疫學(xué)等影響進(jìn)行初步了解后,研究HBV基因突變對疾病的影響應(yīng)該在將HBV視為一個(gè)整體的基礎(chǔ)上進(jìn)行,即不同基因區(qū)聯(lián)合突變的進(jìn)一步研究。
Preikschat等[32]縱向觀察38名腎移植術(shù)后感染HBV的患者3年半,其中14名患者隨訪期間患肝硬化,或死于終末期肝病,24名患者隨訪期間無肝硬化。發(fā)生肝硬化的患者有CP基因的插入缺失伴隨C基因的缺失及(或)前S基因的缺失突變。未發(fā)生肝硬化的患者沒有突變或僅有CP突變。發(fā)生肝硬化的患者有如下基因突變特點(diǎn):1、CP基因的插入缺失伴隨C基因的缺失及(或)前S缺失;2、C基因的缺失伴隨CP基因的插入缺失及(和)前S缺失。2006年Chen[8]等分析了46名乙型肝炎攜帶者和106名年齡匹配的不同疾病進(jìn)程的患者(包括38名慢性乙型肝炎、18名肝硬化、50名肝癌患者)結(jié)論:前S缺失和BCP及PC突變患者隨著疾病進(jìn)展發(fā)生率增高,Logistic回歸分析顯示前S缺失聯(lián)合BCP突變在疾病進(jìn)展中更有意義,聯(lián)合突變比單突變更有意義,尤其是聯(lián)合前S突變患者。2007年Chen[15]縱向研究了141例HBeAg陰性的病例,包括45例無癥狀攜帶者、96例慢性乙肝患者。同未發(fā)生肝硬化患者相比,發(fā)生肝硬化的患者基因C型、前S 區(qū) 缺 失 、C/G1753、T1762/A1764、T1766 和/或 A1768、和G1799突變株發(fā)生幾率更高,Cox回歸分析顯示,年齡大、高總膽紅素,HBV DNA水平、前S缺失、T1766和/或 A1768突變與肝硬化發(fā)生有關(guān)?;颊逪BV有復(fù)雜變異模式(前S缺失、T1762/A1764、和T1766和/或A1768突變株)的較單位點(diǎn)突變者更易進(jìn)展至肝硬化階段。且病毒基因型不同,模式也不一樣。更進(jìn)一步說前S基因缺失突變是肝病進(jìn)展有意義的危險(xiǎn)因素。另有研究結(jié)果表明,140名乙肝后肝癌和280名乙肝未患肝癌的病人經(jīng)多因素分析[33]后,基因C型、病毒載量、A2962G、preS2啟動(dòng)子突變、C105T、T1753V 和 A1762T/G1764A與肝癌的發(fā)生獨(dú)立相關(guān);105C和2962G在肝癌患者中檢出率更高;2962G聯(lián)合preS2啟動(dòng)子突變、105C和1762T/1764A突變在肝癌患者檢出率高于其它患者。新近的研究表明[34]:135例乙肝肝癌患者和與之在年齡、性別及HBeAg狀態(tài)匹配的非肝癌的乙肝患者相比,前S缺失在兩者檢出明顯不同,A1762T/G1764A在肝癌組中檢出率增高。兩者聯(lián)合在韓國基因亞型C2中與肝癌發(fā)生強(qiáng)相關(guān)。
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