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      與黃瓜霜霉病抗性相關(guān)基因連鎖的分子標(biāo)記研究

      2014-05-09 07:41:12孟攀奇蔡麗靜張桂華杜勝利
      關(guān)鍵詞:分子標(biāo)記霜霉病黃瓜

      孟攀奇 蔡麗靜 張桂華 杜勝利

      摘 要:以黃瓜抗霜霉病和感霜霉病親本組合(Q9×Q10)的F2分離群體為試材,采用BSA法篩選到了1個(gè)AFLP引物組合P11M70在抗病池和感病池間表現(xiàn)多態(tài),抗病池和抗病親本均具有大小約304 bp的特異譜帶,感病池和感病親本均擴(kuò)增出了大小約為301 bp的特異片段。經(jīng)F2單株驗(yàn)證及連鎖分析,該特異片段與霜霉病抗病相關(guān)基因相連鎖,連鎖距離為5.22 cM。對(duì)特異片段的測(cè)序結(jié)果顯示,兩片段的大小分別為304 bp和301 bp,且2個(gè)片段的差異僅為3個(gè)“A”堿基的插入或缺失以及1個(gè)“C-T”的堿基突變。將該AFLP標(biāo)記成功地轉(zhuǎn)換為了簡(jiǎn)單實(shí)用的SCAR標(biāo)記。

      關(guān)鍵詞:黃瓜;霜霉??;抗性相關(guān)基因;分子標(biāo)記

      黃瓜霜霉病是黃瓜三大主要病害之一,流行年份可導(dǎo)致黃瓜減產(chǎn)達(dá)30%~50%。應(yīng)用抗病品種防治植物病害是最為經(jīng)濟(jì)、安全、有效的途徑。以往抗病品種的選育主要采用常規(guī)育種技術(shù),對(duì)材料抗病性的鑒定依靠田間鑒定方法,受環(huán)境因素影響較大,鑒定結(jié)果也不夠準(zhǔn)確,即便是采用人工接種抗病鑒定技術(shù),也由于其病原菌活體寄生的原因而受到季節(jié)限制。分子標(biāo)記技術(shù)的飛速發(fā)展,為利用與目標(biāo)基因緊密連鎖的分子標(biāo)記進(jìn)行性狀鑒定提供了一條新途徑。

      目前關(guān)于黃瓜霜霉病的分子標(biāo)記研究已有部分報(bào)道。丁國(guó)華等[1]找到了1個(gè)RAPD標(biāo)記,與黃瓜霜霉病抗性基因之間的連鎖距離為7.85 cM。白智龍等[2]分春秋兩季進(jìn)行了黃瓜霜霉病抗性QTL的檢測(cè),共檢測(cè)到3個(gè)QTLs,其中貢獻(xiàn)率最大的1個(gè)QTL在春秋兩季的貢獻(xiàn)率分別達(dá)到了36.4%和27.3%。張素勤等[3]篩選到了1個(gè)與控制黃瓜霜霉病某個(gè)感病基因連鎖的AFLP標(biāo)記,該標(biāo)記解釋霜霉病抗性表型變異的11.34%。但上述文獻(xiàn)所報(bào)道的分子標(biāo)記與黃瓜霜霉病抗性基因間的遺傳連鎖距離均較遠(yuǎn),用于黃瓜霜霉病抗性輔助育種尚有較大誤差。

      本研究分別以高抗和高感黃瓜霜霉病的2個(gè)材料為親本,配制F2分離群體,采用苗期人工接種抗病性鑒定技術(shù)和田間抗病性直接鑒定方法,對(duì)F2分離后代的抗性進(jìn)行了鑒定;同時(shí),結(jié)合BSA法(分離群體混合分析法)采用AFLP技術(shù),篩選與黃瓜抗霜霉病性狀基因相連鎖的分子標(biāo)記,為利用分子技術(shù)進(jìn)行黃瓜抗霜霉病輔助育種以及霜霉病抗性基因的克隆奠定基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 試驗(yàn)材料

      供試材料為高抗和高感黃瓜霜霉病的黃瓜高代自交系Q9、Q10及其F2分離后代。AFLP引物購(gòu)自上海生工生物工程公司。

      試驗(yàn)于2002-2004年在天津科潤(rùn)農(nóng)業(yè)科技股份有限公司黃瓜研究所完成。

      1.2 試驗(yàn)方法

      ①抗性分離群體的構(gòu)建及黃瓜霜霉病抗病性鑒定 將供試材料播種于塑料溫室中,常規(guī)管理。采用噴霧法于3片真葉期進(jìn)行霜霉病苗期人工接種抗性鑒定。采用呂淑珍等[4]所述的分級(jí)標(biāo)準(zhǔn),分別于接種后7、14、20 d左右調(diào)查霜霉病的發(fā)病情況。

      ②DNA的提取 選取高抗霜霉病和高感霜霉病的F2單株各5株,組成抗病池和感病池。分單株提取DNA和PCR擴(kuò)增。DNA提取采用CTAB法[5]。

      ③AFLP分析 參照Vos等[6]的方法進(jìn)行AFLP分析。采用MseI和PstI 2種內(nèi)切酶進(jìn)行基因組DNA的酶切;預(yù)擴(kuò)增引物不含選擇性堿基。

      ③引物篩選及分子標(biāo)記的驗(yàn)證 對(duì)抗、感親本及抗、感池內(nèi)各單株進(jìn)行PCR擴(kuò)增,將在抗感親本間及抗感兩池間同時(shí)產(chǎn)生差異譜帶的引物組合,作為與黃瓜霜霉病抗性相關(guān)基因連鎖的候補(bǔ)引物組合;然后利用F2單株對(duì)候補(bǔ)引物組合進(jìn)行吻合性驗(yàn)證。

      ⑤特異片段的測(cè)序 特異片段的回收純化參照張桂華[5]的方法。序列測(cè)定由大連寶生物公司進(jìn)行。

      ⑥SCAR標(biāo)記引物的設(shè)計(jì)與PCR擴(kuò)增 根據(jù)測(cè)序結(jié)果以及引物設(shè)計(jì)的原則,用primer 3.0軟件設(shè)計(jì)特異性引物。SCAR擴(kuò)增條件:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性1 min, 58℃退火1 min,72℃延伸2 min,35個(gè)循環(huán);然后72℃延伸7 min。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 F2分離群體黃瓜霜霉病抗性的鑒定

      根據(jù)分級(jí)標(biāo)準(zhǔn)將134個(gè)F2單株分為抗病、中間類型和感病3個(gè)級(jí)別,其中抗病單株27株,感病單株32株,中間類型75株,適合性測(cè)驗(yàn)分析顯示,基本符合1∶2∶1的分離比例(表1)。表明在本試驗(yàn)所采用的供試材料的遺傳背景下,黃瓜對(duì)霜霉病的抗性是由單隱性基因控制的,且中間類型單株田間表現(xiàn)偏向于感病親本,感病相對(duì)抗病為顯性且為不完全顯性。

      2.2 與黃瓜霜霉病抗病基因相連鎖的分子標(biāo)記的篩選

      篩選到76對(duì)在雙親間具有多態(tài)性的引物組合,其中共顯性AFLP標(biāo)記(P11M70-304 bp/301 bp)在抗病池和感病池之間也具有相同的多態(tài)性??共∮H本和抗病池單株都具有304 bp的特異片段,感病親本和感病池單株都有301 bp的特異片段(圖1)。

      2.3 候補(bǔ)分子標(biāo)記的驗(yàn)證

      用共顯性標(biāo)記P11M70對(duì)其他F2單株進(jìn)行了吻合率的驗(yàn)證。在其余124個(gè)F2單株中,共有7株發(fā)生了交換。由此計(jì)算,所篩選到的標(biāo)記與目標(biāo)基因之間的遺傳距離為5.22 cM,圖2為引物組合P11M70在部分F2單株中的驗(yàn)證。

      2.4 分子標(biāo)記測(cè)序

      將目標(biāo)片段回收純化后測(cè)序,測(cè)序結(jié)果顯示,2個(gè)片段的大小分別為304 bp和301 bp,該2個(gè)片段的差異僅表現(xiàn)在3個(gè)“A”堿基的插入或缺失以及1個(gè)“C-T”的堿基突變。

      sequence-1:...AAAAGCAATATTCCCTA...304 bp

      sequence-2:...A------GTAATATTCCCTA...301 bp

      2.5 SCAR引物設(shè)計(jì)與擴(kuò)增

      根據(jù)測(cè)序結(jié)果及引物設(shè)計(jì)的一般原則,設(shè)計(jì)了1對(duì)特異性引物,譜帶理論大小為220 bp和217 bp。圖3結(jié)果顯示,抗病親本和抗病單株均具有220 bp的特異譜帶,感病親本和感病單株均具有217 bp的特異譜帶。將該AFLP標(biāo)記成功地轉(zhuǎn)換為了簡(jiǎn)單實(shí)用的SCAR標(biāo)記。與該片段序列有關(guān)的內(nèi)容已申報(bào)國(guó)家發(fā)明專利(專利號(hào)為:ZL200410018667.0)。

      3 討論與結(jié)論

      有關(guān)黃瓜對(duì)霜霉病抗性的遺傳規(guī)律,前人進(jìn)行了大量觀察研究。可能是研究者所采用的材料的遺傳背景不同,即抗性基因組成可能不同,加之沒(méi)有采用統(tǒng)一的抗性鑒定方法及分級(jí)標(biāo)準(zhǔn),研究結(jié)果各不相同。大多研究結(jié)果認(rèn)為,黃瓜對(duì)霜霉病的抗性是由多基因控制[4,7~9],但也有單基因控制的報(bào)道[10]。本研究對(duì)抗霜霉病和感霜霉病親本材料及其F2分離群體進(jìn)行了田間抗病性鑒定和AFLP分子標(biāo)記研究。田間鑒定結(jié)果表明,F(xiàn)2分離群體中抗病、中間類型和感病單株的比例約為1∶2∶1,且中間類型單株的抗病性偏向感病親本,說(shuō)明在本研究采用的試材的遺傳背景下,黃瓜對(duì)霜霉病的抗性是由單隱性基因控制的,感病性相對(duì)于抗病性為不完全顯性。

      BSA分析方法是Michelmore等[11]于1991年建立的一種連鎖標(biāo)記分析方法。該方法適合由單基因控制的質(zhì)量性狀。但筆者在研究中發(fā)現(xiàn),若為完全顯性,很易建立抗感池,若為不完全顯性,在F2后代性狀鑒定分級(jí)時(shí)很容易發(fā)生劃分錯(cuò)誤,即便是一個(gè)單株的鑒定失誤也會(huì)導(dǎo)致分池不準(zhǔn)確。本研究中黃瓜對(duì)霜霉病的抗性就屬不完全顯性,所以參照張桂華等[12]的方法組建抗病池和感病池進(jìn)行標(biāo)記篩選,篩選到了與控制黃瓜霜霉病抗性基因緊密連鎖的AFLP標(biāo)記,并轉(zhuǎn)換為了簡(jiǎn)單實(shí)用的SCAR標(biāo)記。

      參考文獻(xiàn)

      [1] 丁國(guó)華,秦智偉,周秀艷,等.黃瓜霜霉病抗病基因的RAPD及SCAR標(biāo)記[J].西北植物學(xué)報(bào),2007,27(9):1 747-1 751.

      [2] 白智龍,袁曉君,蔡潤(rùn),等.黃瓜霜霉病抗性QTL分析[J].自然科學(xué)進(jìn)展,2008,18(6):706-710.

      [3] 張素勤,顧興芳,張圣平,等.黃瓜霜霉病抗性相關(guān)基因的AFLP標(biāo)記[J].西北植物學(xué)報(bào),2010,30(7):1 320-1 324.

      [4] 呂淑珍,張本群,李淑菊.黃瓜霜霉病抗病遺傳及抗性鑒定方法研究進(jìn)展[C]//中國(guó)主要蔬菜抗病育種進(jìn)展.北京:科學(xué)出版社,1995:392-394.

      [5] 張桂華.黃瓜白粉病抗性相關(guān)基因的分子標(biāo)記研究[D].陜西楊凌:西北農(nóng)林科技大學(xué),2003:23-28.

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      [10] Van Vliet G J A, Meysing W D. Inheritance of resistance to Psuedoperonospore cubensis Rost. in cucumber(Cucumis sativus L.)[J]. Euphytica, 1974, 23: 251-255.

      [11] Michelmore R W, Paranand I, Kessali R V. Identification of markers linked to disease resistance gene by bulked segregant analysis: a rapid method to detect markers in specific genomic regions using segregating populations[J]. Proc Natl Acad Sci USA, 1991, 88: 9 829-9 832.

      [12] 張桂華,杜勝利,王鳴,等.與黃瓜抗白粉病基因連鎖的AFLP標(biāo)記的獲得[J].園藝學(xué)報(bào),2004,31(2):189-192.

      3 討論與結(jié)論

      有關(guān)黃瓜對(duì)霜霉病抗性的遺傳規(guī)律,前人進(jìn)行了大量觀察研究??赡苁茄芯空咚捎玫牟牧系倪z傳背景不同,即抗性基因組成可能不同,加之沒(méi)有采用統(tǒng)一的抗性鑒定方法及分級(jí)標(biāo)準(zhǔn),研究結(jié)果各不相同。大多研究結(jié)果認(rèn)為,黃瓜對(duì)霜霉病的抗性是由多基因控制[4,7~9],但也有單基因控制的報(bào)道[10]。本研究對(duì)抗霜霉病和感霜霉病親本材料及其F2分離群體進(jìn)行了田間抗病性鑒定和AFLP分子標(biāo)記研究。田間鑒定結(jié)果表明,F(xiàn)2分離群體中抗病、中間類型和感病單株的比例約為1∶2∶1,且中間類型單株的抗病性偏向感病親本,說(shuō)明在本研究采用的試材的遺傳背景下,黃瓜對(duì)霜霉病的抗性是由單隱性基因控制的,感病性相對(duì)于抗病性為不完全顯性。

      BSA分析方法是Michelmore等[11]于1991年建立的一種連鎖標(biāo)記分析方法。該方法適合由單基因控制的質(zhì)量性狀。但筆者在研究中發(fā)現(xiàn),若為完全顯性,很易建立抗感池,若為不完全顯性,在F2后代性狀鑒定分級(jí)時(shí)很容易發(fā)生劃分錯(cuò)誤,即便是一個(gè)單株的鑒定失誤也會(huì)導(dǎo)致分池不準(zhǔn)確。本研究中黃瓜對(duì)霜霉病的抗性就屬不完全顯性,所以參照張桂華等[12]的方法組建抗病池和感病池進(jìn)行標(biāo)記篩選,篩選到了與控制黃瓜霜霉病抗性基因緊密連鎖的AFLP標(biāo)記,并轉(zhuǎn)換為了簡(jiǎn)單實(shí)用的SCAR標(biāo)記。

      參考文獻(xiàn)

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      [3] 張素勤,顧興芳,張圣平,等.黃瓜霜霉病抗性相關(guān)基因的AFLP標(biāo)記[J].西北植物學(xué)報(bào),2010,30(7):1 320-1 324.

      [4] 呂淑珍,張本群,李淑菊.黃瓜霜霉病抗病遺傳及抗性鑒定方法研究進(jìn)展[C]//中國(guó)主要蔬菜抗病育種進(jìn)展.北京:科學(xué)出版社,1995:392-394.

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      [12] 張桂華,杜勝利,王鳴,等.與黃瓜抗白粉病基因連鎖的AFLP標(biāo)記的獲得[J].園藝學(xué)報(bào),2004,31(2):189-192.

      3 討論與結(jié)論

      有關(guān)黃瓜對(duì)霜霉病抗性的遺傳規(guī)律,前人進(jìn)行了大量觀察研究??赡苁茄芯空咚捎玫牟牧系倪z傳背景不同,即抗性基因組成可能不同,加之沒(méi)有采用統(tǒng)一的抗性鑒定方法及分級(jí)標(biāo)準(zhǔn),研究結(jié)果各不相同。大多研究結(jié)果認(rèn)為,黃瓜對(duì)霜霉病的抗性是由多基因控制[4,7~9],但也有單基因控制的報(bào)道[10]。本研究對(duì)抗霜霉病和感霜霉病親本材料及其F2分離群體進(jìn)行了田間抗病性鑒定和AFLP分子標(biāo)記研究。田間鑒定結(jié)果表明,F(xiàn)2分離群體中抗病、中間類型和感病單株的比例約為1∶2∶1,且中間類型單株的抗病性偏向感病親本,說(shuō)明在本研究采用的試材的遺傳背景下,黃瓜對(duì)霜霉病的抗性是由單隱性基因控制的,感病性相對(duì)于抗病性為不完全顯性。

      BSA分析方法是Michelmore等[11]于1991年建立的一種連鎖標(biāo)記分析方法。該方法適合由單基因控制的質(zhì)量性狀。但筆者在研究中發(fā)現(xiàn),若為完全顯性,很易建立抗感池,若為不完全顯性,在F2后代性狀鑒定分級(jí)時(shí)很容易發(fā)生劃分錯(cuò)誤,即便是一個(gè)單株的鑒定失誤也會(huì)導(dǎo)致分池不準(zhǔn)確。本研究中黃瓜對(duì)霜霉病的抗性就屬不完全顯性,所以參照張桂華等[12]的方法組建抗病池和感病池進(jìn)行標(biāo)記篩選,篩選到了與控制黃瓜霜霉病抗性基因緊密連鎖的AFLP標(biāo)記,并轉(zhuǎn)換為了簡(jiǎn)單實(shí)用的SCAR標(biāo)記。

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