摘要:利用形態(tài)學(xué)標記和微衛(wèi)星標記技術(shù),研究了泥蚶奉化種群和韓國種群的殼形態(tài)和遺傳結(jié)構(gòu)的差異,為泥蚶良種培育提供科學(xué)依據(jù)。對同批2齡泥蚶奉化種群和韓國種群的殼長(SL)、殼高(SH)、殼寬(SW)、殼頂寬(SRW)、總質(zhì)量(TW)、軟體部質(zhì)量(IW)進行測量,以各性狀的相對比值作為形態(tài)分析指標,考察了SH/SL、SW/SL、SRW/SL、IW/TW 4個指標的差異。方差分析和Tukey多重比較結(jié)果表明,韓國種群的SW/SL、SRW/SL 2個形態(tài)指標均極顯著高于奉化種群(P<0.01),表明韓國種群的殼型比奉化種群更加鼓脹;IW/TW極顯著高于奉化種群,表明韓國種群的軟體部含量高,即出肉率高。選用6個高度多態(tài)的微衛(wèi)星標記分析了泥蚶韓國種群和奉化種群的遺傳差異,結(jié)果6個微衛(wèi)星位點在2個種群中共檢測出64個等位基因,其中5個位點的PIC值>0.5,表現(xiàn)出高度多態(tài)性;遺傳多樣性分析表明,奉化種群和韓國種群在等位基因數(shù)、觀測雜合度、期望雜合度、PIC值等遺傳參數(shù)上差異很小,遺傳分化系數(shù)Fst為0022;但2個群體的遺傳距離為0.136 7,在TMP18、ETG7等位點的等位基因數(shù)和期望雜合度等參數(shù)上存在顯著差異,表明2個種群的遺傳結(jié)構(gòu)已經(jīng)發(fā)生了一定程度的變異。
關(guān)鍵詞:泥蚶;地理種群;形態(tài)學(xué)標記;微衛(wèi)星標記;遺傳變異
中圖分類號: S968.31+4;S917.4 文獻標志碼: A 文章編號:1002-1302(2014)03-0183-04
泥蚶(Tegillarca granosa)屬于廣溫廣鹽性貝類,廣泛分布于印度洋-西太平洋,在我國主要分布于山東以南沿海[1],是我國四大養(yǎng)殖貝類之一,具有很高的經(jīng)濟價值。然而,目前人工繁、養(yǎng)殖的泥蚶種質(zhì)是未經(jīng)遺傳改良的野生型,已出現(xiàn)了種質(zhì)退化等制約泥蚶養(yǎng)殖業(yè)健康、可持續(xù)發(fā)展的現(xiàn)象,迫切需要對泥蚶種質(zhì)進行改良[2]。雜交育種是遺傳改良和良種培育常用的有效方法,通過不同種群、不同基因型個體雜交,其雜交后代不僅可綜合雙親的優(yōu)良性狀、增加變異性,還有可能產(chǎn)生超越雙親的雜種優(yōu)勢[3]。關(guān)于海洋經(jīng)濟貝類良種培育方面,已有不少雜交培育成功的先例,特別是不同地理種群間的“遠距離雜交”。不同地理種群間的“遠距離雜交”可克服種間雜交后代生殖和發(fā)育障礙,具有比較明顯的性狀表達等優(yōu)點[4],在海洋經(jīng)濟貝類育種中得到了廣泛的應(yīng)用,如太平洋牡蠣(Crassostrea gigas)[5]、櫛孔扇貝(Chlamys farreri)[6-7]、皺紋盤鮑(Haliotis discus hannai)[8]、文蛤(Meretrix meretrix)[4,9]、馬氏珠母貝(Pinctada martensii)[10]、三角帆蚌(Hyriopsis cumingii)[11]等均開展過不同地理種群的雜交,而關(guān)于泥蚶雜交育種方面的研究國內(nèi)外還未見報道。然而開展泥蚶不同地理種群的“遠距離雜交”的前提是找出雜交親本的優(yōu)良性狀,判斷是否為遠距離雜交的良好材料。雜交親本的優(yōu)良性狀主要表現(xiàn)在生長速度、形態(tài)特征及遺傳多樣性水平高低等方面,因此對泥蚶不同地理種群的形態(tài)特征和遺傳結(jié)構(gòu)差異分析成為開展泥蚶“遠距離雜交”的首要任務(wù)。
目前,國內(nèi)外已用形態(tài)學(xué)標記[1,12]、同工酶[13]、線粒體COⅠ[14]、RAPD[15-16]、AFLP[2,17]等手段對泥蚶不同群體的遺傳變異進行了研究,但是利用形態(tài)學(xué)標記和SSR標記相結(jié)合的方法來研究泥蚶不同地理種群的遺傳變異還未見報道。本試驗利用形態(tài)學(xué)標記和SSR分子標記技術(shù)研究泥蚶奉化種群和韓國種群間的表型和遺傳差異,可望為下一步開展雜交育種實踐提供科學(xué)依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 試驗材料
從韓國釜山引進泥蚶種群,從浙江奉化自然海區(qū)取本地泥蚶種群,給予同樣的養(yǎng)殖環(huán)境,同時進行人工繁、養(yǎng)殖。隨機選取同批2齡泥蚶奉化種群和韓國種群樣品,活體帶回實驗室,用于形態(tài)學(xué)分析;每個群體隨機各取樣30顆,活體解剖取閉殼肌,無水乙醇固定,置于-20 ℃冰箱中保存,用于基因組DNA提取。
SSR分析所選用的引物來自周小龍等[18]、顧曉英等[19]已開發(fā)的序列,序列信息見表1。PCR反應(yīng)所用Taq酶、dNTP、Buffer等購自TaKaRa公司,瓊脂糖、聚丙烯酰胺膠等均購自上海生工生物工程有限公司,20 bp marker購自美國 Thermo Scientific公司。
3 討論
隨著生物技術(shù)的發(fā)展,評價生物遺傳變異的方法也逐步更新,如形態(tài)學(xué)標記、生化標記、分子標記等。形態(tài)學(xué)標記即肉眼可見的或儀器可測量的特定生物外部形態(tài)特征,如生物體的形態(tài)性狀、生理性狀、雜交特性等表型特征,是最早被使用的一類遺傳標記[20]。形態(tài)特征是生物品種鑒定和分類的重要依據(jù),具有直觀、簡便等優(yōu)點,廣泛應(yīng)用于海洋經(jīng)濟貝類研究中,如以貝類“殼色”這一重要形態(tài)性狀為研究對象,培育出“蓬萊紅”櫛孔扇貝[21]、“中科紅”海灣扇貝[22]等。關(guān)于泥蚶形態(tài)學(xué)標記的研究,國內(nèi)已有相關(guān)報道,如張永普等利用多變量形態(tài)度量學(xué)方法對我國山東、浙江、廣西和韓國4個地理種群的泥蚶形態(tài)變異進行了比較研究,分別測定了不同群體的殼長、殼高、殼頂寬等9個形態(tài)參數(shù),結(jié)果表明泥蚶貝殼性狀(殼寬和殼高)是決定泥蚶不同地理種群的主要性狀[1];蔣濤濤等定量分析了泥蚶殼形態(tài)性狀對活體質(zhì)量和軟體部質(zhì)量的影響,分別測量了殼長、殼寬、殼高、活體質(zhì)量和軟體部質(zhì)量等數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)殼寬和殼高是影響泥蚶活體質(zhì)量、軟體部質(zhì)量的主要因素,為泥蚶選擇育種提供了理論依據(jù)和理想的測度指標[12]。在前人的研究基礎(chǔ)之上,本試驗利用形態(tài)學(xué)標記來研究泥蚶韓國種群和奉化種群的形態(tài)差異,發(fā)現(xiàn)韓國種群的殼型比奉化種群更加鼓脹,且韓國種群的軟體部含量相對較高,即出肉率高,說明韓國種群較奉化種群表現(xiàn)出一定的生長優(yōu)勢。
然而形態(tài)學(xué)標記也具有一定的局限性,因為生物的形態(tài)及表型性狀是遺傳因素和環(huán)境因素相互作用的結(jié)果,只研究表型變異不能完全或真實地反映遺傳變異[20],因此須與其他手段相結(jié)合來更真實地反映種群間的遺傳差異。隨著分子生物學(xué)的快速發(fā)展,分子標記技術(shù)已廣泛地應(yīng)用于種群間遺傳多樣性分析。分子標記是利用分子生物學(xué)方法來區(qū)分不同的種群或個體,是以個體間遺傳物質(zhì)內(nèi)核苷酸序列變異為基礎(chǔ)的遺傳標記,是DNA水平遺傳多態(tài)性的直接反映,與形態(tài)學(xué)標記相比,具有不易受環(huán)境或其他因素影響、多態(tài)性高、分辨率高等優(yōu)點[23]。截至目前,已相繼出現(xiàn)了RFLP、RAPD、AFLP、SSR等分子標記技術(shù)。利用分子標記技術(shù)研究泥蚶種群遺傳多樣性的研究,國內(nèi)外已有相關(guān)報道,如李太武等[15]、徐義平等[16]用RAPD技術(shù)研究了泥蚶不同地理種群的遺傳多樣性;鄭文娟等[14]利用線粒體COⅠ基因測序技術(shù)評價了我國沿海7個泥蚶地理群體的遺傳分化;姚韓韓等[2]、董迎輝等[17]利用AFLP技術(shù)對泥蚶不同選育群體進行了遺傳變異分析;而利用SSR分子標記技術(shù)來研究泥蚶不同種群間的遺傳差異,國內(nèi)外還未見報道。與前述幾種分子標記相比,SSR標記具有數(shù)量豐富、共顯性、多態(tài)性高等優(yōu)點[24]。為了更深入地研究泥蚶韓國種群和奉化種群間的遺傳差異,本研究選用6對高度多態(tài)的SSR引物對這2個種群的遺傳多樣性進行評價,結(jié)果表明韓國種群和奉化種群都具有較高的遺傳多樣性(PIC>0.5),種質(zhì)資源處于良好、穩(wěn)定狀態(tài)。從各項遺傳參數(shù)來看,奉化種群的遺傳多樣性要稍高于韓國種群,這有可能與韓國種群的引種有關(guān),即引進的韓國泥蚶種群有可能對我國的養(yǎng)殖環(huán)境不適應(yīng),造成遺傳多樣性有所降低。這2個種群的遺傳距離為0.1367,特別在GTG2、TMP18、ETG7等位點中這2個種群的等位基因數(shù)和期望雜合度等參數(shù)存在顯著差異,表明這2個種群的遺傳結(jié)構(gòu)仍存在一定程度的變異。
利用形態(tài)學(xué)標記和SSR分子標記技術(shù)相結(jié)合的方法來研究泥蚶奉化種群和韓國種群的遺傳變異,對下一步泥蚶優(yōu)良品種選育具有一定的指導(dǎo)意義。根據(jù)韓國種群具有殼型鼓脹、出肉率高等優(yōu)點,奉化種群遺傳多樣性稍高且適應(yīng)環(huán)境能力強等優(yōu)勢,可充分利用這2個種群的優(yōu)勢,進行泥蚶韓國種群和奉化種群的雜交選育,以期培育出出肉率高、適應(yīng)環(huán)境能力強的泥蚶優(yōu)良品種。
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利用形態(tài)學(xué)標記和SSR分子標記技術(shù)相結(jié)合的方法來研究泥蚶奉化種群和韓國種群的遺傳變異,對下一步泥蚶優(yōu)良品種選育具有一定的指導(dǎo)意義。根據(jù)韓國種群具有殼型鼓脹、出肉率高等優(yōu)點,奉化種群遺傳多樣性稍高且適應(yīng)環(huán)境能力強等優(yōu)勢,可充分利用這2個種群的優(yōu)勢,進行泥蚶韓國種群和奉化種群的雜交選育,以期培育出出肉率高、適應(yīng)環(huán)境能力強的泥蚶優(yōu)良品種。
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