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      拮抗農(nóng)業(yè)致病真菌放線菌菌株CTF619—D的分離、篩選及初步鑒定

      2014-07-18 21:27:38康敬芹呂躍東王勇劉楊張良
      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年1期
      關(guān)鍵詞:放線菌霉菌病菌

      康敬芹 呂躍東 王勇 劉楊 張良

      摘要:從黃河中分離篩選出若干放線菌菌株,并對放線菌菌株進行分離純化,采用瓊脂塊法進行初篩,用紙片擴散法和生長速率法對抑菌效果較好的菌株進行抑菌活性復(fù)篩,發(fā)現(xiàn)菌株CTF619-D的發(fā)酵產(chǎn)物對番茄炭疽病菌、黃瓜炭疽病菌、蘋果腐爛病菌等10多種真菌均有不同程度的抑制作用,其中對番茄炭疽病菌的抑菌圈最大能達到2.8 cm。通過對CTF619-D菌株形態(tài)特征、培養(yǎng)特征、生理生化特征、16S rDNA序列及系統(tǒng)發(fā)育分析等方面的研究發(fā)現(xiàn),CTF619-D菌株與淡紫灰鏈霉菌(Streptomyces lavendulae)FSHJ9菌株的序列同源性達100%,但在形態(tài)特征、培養(yǎng)特征和生理生化特性方面與其存在差異,因此初步確定CTF619-D為淡紫灰鏈霉菌的一個新變種。

      關(guān)鍵詞:放線菌;拮抗;生理生化;16S rDNA

      中圖分類號:S182文獻標(biāo)志碼:A文章編號:1002-1302(2014)01-0086-04

      收稿日期:2013-06-06

      基金項目:遼寧省教育廳項目(編號:2009A374)。

      作者簡介:康敬芹(1987—),女,山東樂陵人,碩士研究生,研究方向為生物制藥及劑型加工與應(yīng)用。E-mail:xiaokang586@126.com。

      通信作者:呂躍東,副教授,主要從事生物制藥及劑型加工與應(yīng)用研究。E-mail:lyd9900@163.com。放線菌是一類具有廣泛實際用途和巨大經(jīng)濟價值的微生物資源。它突出的特性之一是能產(chǎn)生大量的、種類繁多的抗生素,是生產(chǎn)抗生素的主要菌群,是研制新醫(yī)藥、新農(nóng)藥和生物防治活菌劑的源頭[1]。據(jù)估計,在全世界發(fā)現(xiàn)的8 000多種生物活性物質(zhì)中,近70%是由放線菌產(chǎn)生的[2]。因此,為了達到高效、環(huán)保的生物防治目的,篩選和利用拮抗放線菌已成為當(dāng)前農(nóng)業(yè)科學(xué)研究的熱點之一。在新抗生素的篩選分離過程中,從黃河土壤中分離出了1株具有較強活性的放線菌菌株CTF619-D,該菌株對多種植物農(nóng)業(yè)病原真菌具有較強的抑制作用。本研究主要對該菌株的形態(tài)特性、培養(yǎng)特征、生理生化特征、16S rDNA序列及系統(tǒng)發(fā)育分析等方面進行分析,以確定其分類地位,并對活性成分的抗菌譜進行初步研究,旨在發(fā)現(xiàn)新的抗生素或原有抗生素新的防治特性,為豐富防治水果蔬菜病菌的生物農(nóng)藥種類提供實踐經(jīng)驗和理論依據(jù),為農(nóng)用抗生素的研究與應(yīng)用奠定基礎(chǔ)。

      1材料與方法

      1.1材料

      1.1.1供試放線菌放線菌由采自黃河的不同水樣和土樣中分離得到。

      1.1.2供試病原菌以下病原菌均由遼寧科技大學(xué)生物工程系生物制藥工藝室提?。海?)香蕉灰紋病菌(Cordana musae);(2)油菜菌核病菌(Sclerotinia sclerotiorum);(3)黃瓜炭疽病菌(Colletotrichum orbiculare);(4)番茄灰霉病菌(Botrytis cinerea);(5)辣椒疫霉病菌(Phytophthora capsici);(6)黃瓜黑星菌(Cladosporium cucumerinum);(7)番茄葉霉病菌(Fulvia fulva);(8)水稻惡苗病菌(Fusarium moniliforme);(9)番茄炭疽病菌(Colletotrichum lycopersici);(10)稻曲病菌(Ustilaginoidea virens);(11)小麥紋枯病菌(Rhizoctonia cerealis);(12)棉花黃萎病菌(Fusarium oxysporum);(13)小麥根腐霉病菌(Helminthosporium sorokinianum);(14)蘋果腐爛病菌(Cytospora sp.);(15)黃瓜枯萎病菌(Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum);(16)水稻紋枯病菌(Rhizoctonia solani);(17)小麥赤霉病菌(Fusarium graminearum);(18)稻瘟病菌(Pyricularia oryzae);(19)黃瓜角斑病菌(Pseudomonas syringae pv. lachrymans);(20)姜瘟病菌(Pseudomonas solanacearum)。

      1.1.3培養(yǎng)基分離所用培養(yǎng)基:高氏一號培養(yǎng)基+重鉻酸鉀[3-5](0.6×10-6~0.7×10-6 g/L),pH值為7.4;放線菌培養(yǎng)所用培養(yǎng)基:高氏一號瓊脂培養(yǎng)基;病原菌培養(yǎng)及拮抗試驗所用培養(yǎng)基:PDA培養(yǎng)基;鑒定所用培養(yǎng)基參照《放線菌:屬和種的分類、鑒定和描述》[6]。

      1.1.4主要儀器與設(shè)備LRH-250A型生化培養(yǎng)箱,TGL-16C型高速離心機,ZHWY-2102型恒溫培養(yǎng)振蕩器,Autoelavo ES-315型高壓滅菌鍋,T-203型電子天平,SW-CJ-5 型超凈工作臺,Motic BA400型數(shù)碼成像光學(xué)顯微鏡,JSM-6360LV型電子掃描顯微鏡,TaKaRa Thermal Cycler Dice TP600型PCR擴增儀,Mupid型核酸電泳儀,Image Master VDS電泳成像裝置,EPS300型蛋白質(zhì)電泳儀,ABI PRISMTM 3730XL DNA Sequencer型DNA測序儀。測序用試劑:BigDye Terminator V3.1 Cycle Sequencing Kit 試劑盒;TaKaRa MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit Ver.3.0試劑盒。

      1.2方法

      1.2.1放線菌的分離和純化將土壤自然風(fēng)干,在28 ℃條件下放置5~7 d,用研缽磨細以重鉻酸鉀[3-5](0.6×10-6~0.7×10-6 g/L)為抑菌劑,采用稀釋涂布法對土壤中的放線菌進行分離,然后置于28 ℃生化培養(yǎng)箱內(nèi)倒置培養(yǎng)7~10 d,觀察放線菌的生長情況,根據(jù)菌落形態(tài)選取不同菌株,經(jīng)純化后將單菌落轉(zhuǎn)接到高氏一號斜面培養(yǎng)基上編號培養(yǎng)14 d,然后于4 ℃保藏。

      1.2.2菌株的初篩采用固體平板發(fā)酵培養(yǎng)的方法篩選[7],即高氏一號培養(yǎng)放線菌7~10 d,將長好的放線菌打孔后反向放置于接種了農(nóng)業(yè)治病真菌的平板中央,在25 ℃條件真菌培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2~3 d后觀察測量抑菌圈。試驗過程均設(shè)3個重復(fù)。

      1.2.3菌株的復(fù)篩采用濾紙片法[8]測定發(fā)酵濾液對植物病原菌的拮抗性。將初篩所得放線菌菌株在28 ℃、150 r/min 條件下液體振蕩培養(yǎng)7 d,將培養(yǎng)液4 000 r/min無菌離心10 min。將無菌濾紙片在離心所得上清液中浸泡 3 min 后置于接種農(nóng)業(yè)致病真菌的PDA平板中央,于25 ℃條件下恒溫培養(yǎng)72 h后,再分別測量抑菌圈直徑。對照為浸無菌水的濾紙片。試驗設(shè)3個重復(fù)。最終確定抑菌活性明顯的菌株作為目的生防菌。

      1.2.4放線菌鑒定通過觀察菌株CTF619-D的菌絲形態(tài)、孢子和孢子絲形狀、菌株在不同培養(yǎng)基上的培養(yǎng)特征以及一系列的生理生化特征,按照《鏈霉菌鑒定手冊》[9]對菌株CTF619-D進行初步的分類鑒定。

      (1)形態(tài)特征。將菌株CTF619-D接種于高氏一號培養(yǎng)基上,在28 ℃下插片培養(yǎng)7~10 d后,分別用光學(xué)顯微鏡和電子掃描顯微鏡觀察插片上的基內(nèi)菌絲、氣生菌絲、孢子絲和孢子的形態(tài)特征。

      (2)培養(yǎng)特征。將菌株CTF619-D分別接種在不同的培養(yǎng)基上(Ⅰ.高氏一號合成培養(yǎng)基,Ⅱ.葡萄糖天門冬素瓊脂培養(yǎng)基,Ⅲ.PDA培養(yǎng)基,Ⅳ.伊莫松培養(yǎng)基,Ⅴ.牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,Ⅵ.無機鹽淀粉瓊脂培養(yǎng)基,Ⅶ.高氏一號培養(yǎng)基,Ⅷ.馬鈴薯浸汁培養(yǎng)基,Ⅸ.蔗糖察氏培養(yǎng)基),置于28 ℃生化培養(yǎng)箱中培養(yǎng),分別在10、20 d觀察培養(yǎng)基內(nèi)菌絲、氣生菌絲、可溶性色素的顏色及表觀特征。

      (3)生理生化指標(biāo)。參照《鏈霉菌鑒定手冊》對菌株CTF619-D進行以下生理生化試驗:Ⅰ.明膠液化試驗,Ⅱ.淀粉水解試驗,Ⅲ.牛奶凝固與胨化,Ⅳ.硝酸鹽還原反應(yīng),Ⅴ.纖維素分解試驗,Ⅵ.產(chǎn)生硫化氫試驗,Ⅶ.產(chǎn)生黑色素試驗,Ⅷ.碳源的利用試驗等,檢測觀察菌株的生理生化指標(biāo)[10]。

      (4)16S rDNA測序及序列分析。在80 ℃下挑取用試管培養(yǎng)的CTF619-D新鮮菌體變性15 min,然后離心取上清液作為模板進行PCR擴增。擴增條件:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃ 變性1 min,55 ℃復(fù)性1 min,72 ℃延伸1.5 min,30個循環(huán);72 ℃延伸5 min。取5 μL進行3%瓊脂糖凝膠電泳,使用Takara MiniBEST Agarose Gel DNA Extraction Kit Ver.3.0試劑盒切膠回收目的片段后,經(jīng)大連寶生物(工程)有限公司完成DNA測序。用微波法[11]提取總DNA,以Seq Forward、Seq Internal、Seq Reverse為引物進行DNA測序,采用正向引物(27 f)5′-AGAGTTTGATCATGGCTCAG-3′、反向引物(1 492 f)5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′將測得的基因序列復(fù)制到Blast程序中,與GenBank中核苷酸數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast)進行對比分析,然后選取與試驗菌株序列相似度較高的菌株,利用DNAstar軟件對目標(biāo)序列繪制系統(tǒng)發(fā)育樹,并對所構(gòu)建的進化樹進行評估[12],確定所測菌株的分類地位[13]。

      2結(jié)果與分析

      2.1活性菌株的分離和篩選

      對20多株放線菌進行抑菌活性的初篩,大多數(shù)菌株抑菌活性很低,但CTF619-D對多數(shù)植物病原真菌有抑制效果,其中對黃瓜炭疽病菌和番茄炭疽病菌抑制效果很好(圖1、表1)。

      2.2放線菌CTF619-D菌株的鑒定

      2.2.1形態(tài)特征觀察 拮抗放線菌CTF619-D菌株在高氏一號培養(yǎng)基上28 ℃培養(yǎng)7~10 d后,可形成基內(nèi)菌絲和氣生菌絲,在電子顯微鏡下觀察,放線菌CTF619-D基內(nèi)菌絲不斷裂,無橫隔,成分枝狀;氣生菌絲發(fā)達,成熟后發(fā)育成孢子

      2.2.2培養(yǎng)特征觀察菌株在不同的培養(yǎng)基上表現(xiàn)出不同的生長情況,并形成豐富的氣生菌絲和基內(nèi)菌絲(表2)。

      2.2.3生理生化特性菌株革蘭氏染色呈陽性,生長溫度范圍為5~40 ℃,最適溫度為28 ℃,生長pH值范圍為5~10,最適pH值為7.0。菌株CTF619-D可使明膠緩慢液化;能夠水解淀粉;使牛奶不凝固,但胨化;不能水解纖維素;硝酸鹽還原反應(yīng)為陽性;能夠產(chǎn)生H2S、黑色素;能利用甘露醇、蔗糖、葡萄糖、麥芽糖、淀粉、D-木糖、果糖、肌醇、乳糖、鼠李糖等(表3)。

      3結(jié)論

      本試驗主要通過稀釋分離的方法從采集的土壤中得到若干放線菌,進而用20種農(nóng)業(yè)致病真菌對其進行初篩和復(fù)篩,選出抑菌效果好的放線菌CTF619-D,對其進行發(fā)酵培養(yǎng),并采用抑制菌絲生長速率法對抗菌物質(zhì)進行抗菌活性測定,結(jié)果表明,CTF619-D對番茄炭疽病菌、黃瓜炭疽病菌有較好的抑菌效果,其中對番茄炭疽病菌的抑菌圈直徑最大能達到2.8 cm。通過形態(tài)學(xué)鑒定、培養(yǎng)特征觀察、生理生化指標(biāo)測定、16s rDAN序列的測定及系統(tǒng)進化樹分析,結(jié)果表明,CTF619-D菌株與淡紫灰鏈霉菌FSHJ9聚為一支,序列同源性達到100%,但其形態(tài)特征、培養(yǎng)特征和生理生化特性方面又存在著明顯的區(qū)別,因此可初步確定CTF619-D為淡紫灰鏈霉菌的一個新變種,命名為淡紫灰鏈霉菌黃河變種。另外

      該菌株是否能看作是農(nóng)用抗生素的一個新來源,還需要后續(xù)試驗來進一步驗證。

      據(jù)報道,在植物病害生物防治中,拮抗微生物主要是鏈霉菌屬及其相關(guān)類群[14],淡紫灰鏈霉菌是一類重要的抗生素產(chǎn)生菌,它產(chǎn)生的醫(yī)用抗生素(如薰衣草菌素、鏈絲菌素)和農(nóng)用抗生素(如中生菌素等)都已有廣泛的用途[15]。目前,國內(nèi)關(guān)于拮抗淡紫灰鏈霉菌鑒定的諸多研究中,除產(chǎn)生中生菌素的淡紫灰鏈霉菌海南變種外,未見有其他淡紫灰鏈霉菌變種的報道。因此CTF619-D是一株有價值的具生物活性的生防菌株,該菌株有效活性成分分離鑒定及其抑菌機理均有待進一步研究,以期開發(fā)在瓜果蔬菜病害防治領(lǐng)域中具有應(yīng)用前景的抗菌物質(zhì)。

      參考文獻:

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