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      細胞支原體巢式PCR檢測方法的建立及應用

      2014-07-21 18:41:01黃海軍高其雙彭霞等
      湖北農業(yè)科學 2014年3期
      關鍵詞:生物制品細胞培養(yǎng)支原體

      黃海軍+高其雙+彭霞等

      摘要:動物生物制品生產過程中細胞(特別是傳代細胞)被支原體污染是個世界性問題。細胞支原體污染可顯著影響生產用細胞的培養(yǎng)及生物功能的發(fā)揮,最終影響生物制品的生產,給生物制品企業(yè)造成巨大損失,建立高效、快速、敏感度高的檢測方法十分必要。建立了一種支原體巢式PCR檢測方法,該方法高效、快速、靈敏,可以最大限度降低假陰性和假陽性結果的出現(xiàn)。該方法的建立對培養(yǎng)細胞、動物疫苗等生物制品企業(yè)的檢測標準化管理有一定的借鑒意義。

      關鍵詞:支原體;細胞培養(yǎng);巢式PCR;生物制品

      中圖分類號:S858.28;Q95 文獻標識碼:A 文章編號:0439-8114(2014)03-0690-03

      細胞培養(yǎng)過程中支原體污染主要來源于所使用的動物源的一些培養(yǎng)材料,如血清、已被支原體污染的細胞株(系)或者是經操作人員傳播。污染培養(yǎng)細胞的支原體一般有寄生于人、牛、豬或狗的少數(shù)幾種類型。細胞培養(yǎng)液中支原體的濃度可達1×107個/mL,而不管是肉眼觀察還是普通顯微鏡下觀察,受支原體污染的細胞狀態(tài)并無明顯變化[1]。但是,越來越多的研究表明,支原體感染發(fā)生后能改變細胞的DNA、RNA及蛋白表達,使研究結果的真實性和可靠性大大下降[2,3]。由于競爭營養(yǎng)及支原體有毒的代謝產物,支原體污染可顯著影響生產用細胞的培養(yǎng)及相應生物學功能的發(fā)揮,影響生物制品的質量。細胞被支原體污染長期困擾著疫苗(特別是生產弱毒苗)的生產企業(yè),增加了企業(yè)生產、投資的風險,特別是在競爭日益激烈的當代社會,這種風險對疫苗生產企業(yè)來說通常是致命的。因此,建立一種高效、快速、敏感度高的檢測方法十分必要。

      目前,普遍公認的細胞支原體污染檢測方法為分離培養(yǎng)法,該方法耗時、敏感性低,甚至可能出現(xiàn)二次污染,影響結果的判斷。隨著分子生物學的發(fā)展,PCR方法已經成為一種常用的有效檢測培養(yǎng)困難和抗原性復雜的微生物的方法[4,5]。本研究建立了一種細胞支原體巢式PCR檢測方法,最大限度降低了假陰性和假陽性結果的出現(xiàn),以期為完善細胞支原體的檢測提供參考。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      供試菌種:豬肺炎支原體(Mycoplasma hyopneumoniae,Mhp)濟南系強毒(菌號CVCC354)購自中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所。

      供試試劑與儀器:Taq DNA polymerase(2.5 U/μL)、10×PCR Buffer、dNTP(2.5 mmol/L)、DNA凝膠回收與純化試劑盒購自武漢天源生物技術公司,對比用支原體PCR檢測試劑盒(EZ-PCR Mycoplasma Test Kit)由以色列BI公司生產。9700型PCR 儀由美國ABI公司生產。

      1.2 方法

      1.2.1 PCR引物 根據(jù)12種常見類型支原體(M. hyorhinis、M. orale、M. hyopneumoniae、M. arginini、

      1.2.2 PCR檢測方法的建立

      1)陽性PCR模板的制備:將豬肺炎支原體培養(yǎng)液沸水水浴10 min,再3 000 r/min離心10 min,取上清液作為支原體陽性PCR擴增的陽性模板。

      2)陽性支原體的檢測:第一輪PCR反應體系25 μL,10×PCR Buffer 2.5 μL,dNTP(2.5 mmol/L)2 μL,陽性引物Myc-F1和Myc-R1(10 μmol/L)各0.5 μL,陽性模板1 μL,Taq DNA 酶(2.5 U/μL) 0.25 μL,加ddH2O至25 μL。同時以ddH2O為陰性對照。反應條件為:94 ℃ 5 min,94 ℃ 30 s,58 ℃ 30 s,72 ℃ 30 s,35個循環(huán),72 ℃ 10 min。第一輪PCR反應結束后,取1 μL PCR產物作為第二輪PCR反應的模板,反應體系其他成分及反應條件同第一輪PCR。分別取第一輪和第二輪PCR反應產物5 μL進行1%瓊脂糖凝膠電泳,然后對目的片段進行純化,作為PCR陽性模板備用。

      3)陽性Mhp模板稀釋倍數(shù)的確定:按1×10-2、1×10-3、1×10-4、1×10-5、1×10-6濃度梯度稀釋Mhp陽性產物,固定體系其他成分不變進行PCR反應。反應結束后,取10 μL進行1%瓊脂糖凝膠電泳,選擇最適濃度作為Mhp陽性標準品。

      4)反應條件的優(yōu)化:Taq DNA 酶最適使用量的確定,按最適引物濃度,優(yōu)化Taq DNA 酶 (2.5 U/μL)的使用量,分別為0.125、0.25、0.5 μL;dNTP最適使用量的確定,反應體系中dNTP(2.5 mmol/L)的使用量分別為1、2、3 μL。反應體系中其他成分和反應條件均不改變。反應結束后,取PCR反應產物5 μL進行1%瓊脂糖凝膠電泳,確定最適濃度配比。

      1.2.3 應用 從武漢某疫苗生產車間隨機選取3個批次共10個疑似支原體污染的樣本,收集細胞培養(yǎng)上清液。3 000 r/min離心5 min,沉淀培養(yǎng)液中殘留的細胞,然后取上清液5 μL備用。按本研究建立的巢式PCR反應體系及條件,對各樣本的兩種平行樣品進行檢測。并將結果與EZ-PCR Mycoplasma 檢測結果進行比對。將兩種方法檢測為陽性的樣品依次進行10-1~10-4梯度稀釋,分別用本研究建立的方法和支原體PCR檢測試劑盒(EZ-PCR Mycoplasma Test Kit)進行檢測,比較兩者的靈敏度。將本方法診斷陽性的樣品進行病原培養(yǎng),驗證其檢測準確性。

      2 結果與分析

      2.1 陽性標準品的建立

      經PCR擴增得到654 bp的Mhp基因片段,與預期結果相符(圖1)。測定回收的Mhp陽性模板濃度為13.6 μg/mL,結果表明, Mhp陽性模板的稀釋倍數(shù)為1×10-5 時,條帶清晰(圖1),考慮到檢測條件及產物的穩(wěn)定性,將標準品濃度定為2×10-4 μg/mL,即0.2 ng/mL。

      2.2 巢式PCR反應體系的優(yōu)化

      在反應條件及體系其他成分不變的同時,分別對Taq DNA酶和dNTP使用量進行優(yōu)化,并根據(jù)第一次和第二次PCR擴增結果,確定反應體系中Taq DNA酶和dNTP最佳使用量分別為0.25、2 μL。

      2.3 巢式PCR檢測方法的應用

      用所建立的巢式PCR檢測方法對收集的10個疑似支原體污染樣品進行檢測,第一輪PCR擴增結果和第二輪擴增結果分別見圖2和圖3。

      將PCR產物回收送上海生工生物工程有限公司測序,并與Genbank中登錄的相關序列進行比對,結果分別為100%、99.26%、99.19%和99.19%。最終確定2號樣品為豬肺炎支原體(Mycoplasma hyopneumoniae)陽性,7號樣品為口腔支原體(Mycoplasma orale)陽性,4號樣品和8號樣品均為豬鼻支原體(Mycoplasma hyorhinis)陽性。該結果與BI公司的EZ-PCR Mycoplasma 檢測結果完全一致。

      將4個檢測為陽性的樣品依次進行10-1~10-4倍梯度稀釋,再作為模板,分別用本研究建立的方法和EZ-PCR Mycoplasma Test Kit進行檢測,結果表明,2種方法均可檢測到稀釋10-3倍的模板,符合率達100%。

      3 小結與討論

      支原體是一種介于細菌和病毒之間的能獨立生存的最小微生物,直徑0.1~0.3 μm,因無細胞壁故具有可塑性,可通過濾菌器,對于一般抗生素的耐受更使其難以清除,是細胞培養(yǎng)污染的一個重要因素[6]。動物疫苗生產過程中細胞(特別是傳代細胞)被支原體污染是個世界性問題。已有許多調查及研究顯示,美國和歐洲正在使用的細胞系中的支原體污染率為10%~15%[7],德國微生物和培養(yǎng)細胞保藏中心(DSMZ)的研究顯示,世界范圍內細胞系的支原體污染率在15%~50%[8,9],而國內使用的細胞系中的支原體的污染更為嚴重,使得生物制品企業(yè)面臨的形勢極為嚴峻[1]。

      支原體感染細胞后,并不引起細胞形態(tài)及功能的急性改變,不易被察覺,但是細胞支原體污染卻給疫苗生產帶來致命打擊。因此,在疫苗生產早期對細胞支原體污染進行監(jiān)測具有重要意義。

      Dussurget等[10]和Kong等[11]研究發(fā)現(xiàn),PCR檢測支原體的引物選用16S rRNA序列保守區(qū),難以在保證特異性強的情況下擴增出所有常見支原體污染種別的DNA,導致假陰性結果的出現(xiàn)。本研究根據(jù)常見支原體16S~23S間隔區(qū)種別特異性序列,設計2對用于巢式擴增支原體的引物,可以準確檢測12種常見支原體,這12種常見支原體代表了98%以上的細胞支原體污染源。本方法檢測整個過程耗時不超過6 h,且設置了陰性對照和陽性對照標準品,避免了假陰性和假陽性,檢測結果與以色列BI公司支原體PCR檢測試劑盒(EZ-PCR Mycoplasma Test Kit)和傳統(tǒng)培養(yǎng)法鑒定結果相一致,也證實了其檢測的可靠性和靈敏性。因此,該方法有望在細胞培養(yǎng)、動物疫苗等生物制品企業(yè)的檢測標準化管理中得到廣泛應用。

      參考文獻:

      [1] 劉玉琴.體外培養(yǎng)細胞工作中支原體污染及對策[J].中華病理學雜志,2004,33(6):571-572.

      [2] FENG S H, TSAI S, RODRIGUEZ J, et al. Mycoplasmal infections prevent apoptosis and induce malignant transformation of interleukin-3-dependent 32D hematopoietic cells[J]. Mol Cell Biol,1999,19(12):7995-8002.

      [3] SCHMIDHAUSER C, DUDLER R, SCHMIDT T, et al. A mycoplasmal protein influence tumor cell invasiveness and contact inhibition in vitro[J]. J Cell Sci,1990,95:499-506.

      [4] 戴 悅,呂允威,張春鳳,等.細胞系中支原體檢測及分型[J].北京大學學報(醫(yī)學版),2005,37(2):207-210.

      [5] 甘一迪,王銀銀,任芳麗,等.培養(yǎng)細胞污染支原體的PCR檢測方法的建立及應用[J].中國醫(yī)藥生物技術,2011,6(4):295-298.

      [6] FLEEKENSTELN E, UPHOFFC C C, DREXLER H G. Effective treatment of mycoplasma contamination in cell lines with enrofloxacin (Baytril)[J]. Leukemia,1994,8(8):1424-1434.

      [7] TULLY J G. Diagnosis of Mycoplasma Infection of Cell Cultures[M]. TULLY J G, RAZIN S. Molecular and Diagnostic Procedures in Mycoplasmology. Vol Ⅱ, diagnostic procedures. San Diego: Academic Press,1996.405-410.

      [8] UPHOFF C C, DREXLER H G. Comparative PCR analysis for detection of mycoplasma infections in continuous cell lines [J]. In Vitro Cell Dev Biol Anim,2002,38(2):79-85.

      [9] WINNER F, ROSENGARTEN R, CITTI C. In vitro cell invasion of Mycoplasma galisepticum[J]. Infect Immun,2000,68(7):4238-4244.

      [10] DUSSURGET O,ROULLAND-DUSSOIX D. Rapid, sensitive PCR-based detection of mycoplasmas in simulated samples of animal sem[J].Appl Environ Microbio1,1994,60(3):953-959.

      [11] KONG F,JAMES G,GORDON S,et al. Species-specific PCR for identification of common contaminant mollicutes in cell culture[J].Appl Environ Microbiol,2001,67(7):3195-3200.

      2.2 巢式PCR反應體系的優(yōu)化

      在反應條件及體系其他成分不變的同時,分別對Taq DNA酶和dNTP使用量進行優(yōu)化,并根據(jù)第一次和第二次PCR擴增結果,確定反應體系中Taq DNA酶和dNTP最佳使用量分別為0.25、2 μL。

      2.3 巢式PCR檢測方法的應用

      用所建立的巢式PCR檢測方法對收集的10個疑似支原體污染樣品進行檢測,第一輪PCR擴增結果和第二輪擴增結果分別見圖2和圖3。

      將PCR產物回收送上海生工生物工程有限公司測序,并與Genbank中登錄的相關序列進行比對,結果分別為100%、99.26%、99.19%和99.19%。最終確定2號樣品為豬肺炎支原體(Mycoplasma hyopneumoniae)陽性,7號樣品為口腔支原體(Mycoplasma orale)陽性,4號樣品和8號樣品均為豬鼻支原體(Mycoplasma hyorhinis)陽性。該結果與BI公司的EZ-PCR Mycoplasma 檢測結果完全一致。

      將4個檢測為陽性的樣品依次進行10-1~10-4倍梯度稀釋,再作為模板,分別用本研究建立的方法和EZ-PCR Mycoplasma Test Kit進行檢測,結果表明,2種方法均可檢測到稀釋10-3倍的模板,符合率達100%。

      3 小結與討論

      支原體是一種介于細菌和病毒之間的能獨立生存的最小微生物,直徑0.1~0.3 μm,因無細胞壁故具有可塑性,可通過濾菌器,對于一般抗生素的耐受更使其難以清除,是細胞培養(yǎng)污染的一個重要因素[6]。動物疫苗生產過程中細胞(特別是傳代細胞)被支原體污染是個世界性問題。已有許多調查及研究顯示,美國和歐洲正在使用的細胞系中的支原體污染率為10%~15%[7],德國微生物和培養(yǎng)細胞保藏中心(DSMZ)的研究顯示,世界范圍內細胞系的支原體污染率在15%~50%[8,9],而國內使用的細胞系中的支原體的污染更為嚴重,使得生物制品企業(yè)面臨的形勢極為嚴峻[1]。

      支原體感染細胞后,并不引起細胞形態(tài)及功能的急性改變,不易被察覺,但是細胞支原體污染卻給疫苗生產帶來致命打擊。因此,在疫苗生產早期對細胞支原體污染進行監(jiān)測具有重要意義。

      Dussurget等[10]和Kong等[11]研究發(fā)現(xiàn),PCR檢測支原體的引物選用16S rRNA序列保守區(qū),難以在保證特異性強的情況下擴增出所有常見支原體污染種別的DNA,導致假陰性結果的出現(xiàn)。本研究根據(jù)常見支原體16S~23S間隔區(qū)種別特異性序列,設計2對用于巢式擴增支原體的引物,可以準確檢測12種常見支原體,這12種常見支原體代表了98%以上的細胞支原體污染源。本方法檢測整個過程耗時不超過6 h,且設置了陰性對照和陽性對照標準品,避免了假陰性和假陽性,檢測結果與以色列BI公司支原體PCR檢測試劑盒(EZ-PCR Mycoplasma Test Kit)和傳統(tǒng)培養(yǎng)法鑒定結果相一致,也證實了其檢測的可靠性和靈敏性。因此,該方法有望在細胞培養(yǎng)、動物疫苗等生物制品企業(yè)的檢測標準化管理中得到廣泛應用。

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      2.2 巢式PCR反應體系的優(yōu)化

      在反應條件及體系其他成分不變的同時,分別對Taq DNA酶和dNTP使用量進行優(yōu)化,并根據(jù)第一次和第二次PCR擴增結果,確定反應體系中Taq DNA酶和dNTP最佳使用量分別為0.25、2 μL。

      2.3 巢式PCR檢測方法的應用

      用所建立的巢式PCR檢測方法對收集的10個疑似支原體污染樣品進行檢測,第一輪PCR擴增結果和第二輪擴增結果分別見圖2和圖3。

      將PCR產物回收送上海生工生物工程有限公司測序,并與Genbank中登錄的相關序列進行比對,結果分別為100%、99.26%、99.19%和99.19%。最終確定2號樣品為豬肺炎支原體(Mycoplasma hyopneumoniae)陽性,7號樣品為口腔支原體(Mycoplasma orale)陽性,4號樣品和8號樣品均為豬鼻支原體(Mycoplasma hyorhinis)陽性。該結果與BI公司的EZ-PCR Mycoplasma 檢測結果完全一致。

      將4個檢測為陽性的樣品依次進行10-1~10-4倍梯度稀釋,再作為模板,分別用本研究建立的方法和EZ-PCR Mycoplasma Test Kit進行檢測,結果表明,2種方法均可檢測到稀釋10-3倍的模板,符合率達100%。

      3 小結與討論

      支原體是一種介于細菌和病毒之間的能獨立生存的最小微生物,直徑0.1~0.3 μm,因無細胞壁故具有可塑性,可通過濾菌器,對于一般抗生素的耐受更使其難以清除,是細胞培養(yǎng)污染的一個重要因素[6]。動物疫苗生產過程中細胞(特別是傳代細胞)被支原體污染是個世界性問題。已有許多調查及研究顯示,美國和歐洲正在使用的細胞系中的支原體污染率為10%~15%[7],德國微生物和培養(yǎng)細胞保藏中心(DSMZ)的研究顯示,世界范圍內細胞系的支原體污染率在15%~50%[8,9],而國內使用的細胞系中的支原體的污染更為嚴重,使得生物制品企業(yè)面臨的形勢極為嚴峻[1]。

      支原體感染細胞后,并不引起細胞形態(tài)及功能的急性改變,不易被察覺,但是細胞支原體污染卻給疫苗生產帶來致命打擊。因此,在疫苗生產早期對細胞支原體污染進行監(jiān)測具有重要意義。

      Dussurget等[10]和Kong等[11]研究發(fā)現(xiàn),PCR檢測支原體的引物選用16S rRNA序列保守區(qū),難以在保證特異性強的情況下擴增出所有常見支原體污染種別的DNA,導致假陰性結果的出現(xiàn)。本研究根據(jù)常見支原體16S~23S間隔區(qū)種別特異性序列,設計2對用于巢式擴增支原體的引物,可以準確檢測12種常見支原體,這12種常見支原體代表了98%以上的細胞支原體污染源。本方法檢測整個過程耗時不超過6 h,且設置了陰性對照和陽性對照標準品,避免了假陰性和假陽性,檢測結果與以色列BI公司支原體PCR檢測試劑盒(EZ-PCR Mycoplasma Test Kit)和傳統(tǒng)培養(yǎng)法鑒定結果相一致,也證實了其檢測的可靠性和靈敏性。因此,該方法有望在細胞培養(yǎng)、動物疫苗等生物制品企業(yè)的檢測標準化管理中得到廣泛應用。

      參考文獻:

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      [11] KONG F,JAMES G,GORDON S,et al. Species-specific PCR for identification of common contaminant mollicutes in cell culture[J].Appl Environ Microbiol,2001,67(7):3195-3200.

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