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      四氫呋喃-甲烷水合物穩(wěn)定性的分子動(dòng)力學(xué)模擬

      2014-08-08 09:52:18張慶東李玉星王武昌
      化工進(jìn)展 2014年1期
      關(guān)鍵詞:氧原子均方水合物

      張慶東,李玉星,王武昌

      (中國(guó)石油大學(xué)(華東)儲(chǔ)運(yùn)與建筑工程學(xué)院,山東 青島266580)

      天然氣水合物是在高壓、低溫條件下烴類(lèi)氣體與水形成非化學(xué)計(jì)量的、外形似冰的包絡(luò)型化合物[1],其中主體分子(水分子)之間通過(guò)氫鍵相互作用構(gòu)成晶穴,客體分子(烴類(lèi)分子)填充于晶穴中,主客體分子間的作用力為范德華力。自然界中的天然氣水合物一般以Ⅰ型[2(512)6(51262)]和Ⅱ型[16(512)8(51264)]為主[2],且晶穴占有率不高(平均只有大約1/3的晶穴被氣體分子占據(jù))[3]。Saito等[4]的研究結(jié)果表明甲烷水合物的儲(chǔ)氣量在純水體系中均達(dá)不到40%(晶穴占有率<22.2%)。Stern等[5]通過(guò)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)甲烷晶穴占有率達(dá)不到100%(最高為94.3%)。分子動(dòng)力學(xué)(MD)模擬是一種處理分子體系的動(dòng)態(tài)研究方法,可以模擬系統(tǒng)隨時(shí)間演化的微觀過(guò)程。它依據(jù)Netwon經(jīng)典力學(xué)求解核骨架的行為,在計(jì)算每個(gè)瞬時(shí)的勢(shì)能上依據(jù)量子力學(xué),在求算各種體系性質(zhì)上依據(jù)統(tǒng)計(jì)力學(xué)。分子動(dòng)力學(xué)模擬可以用來(lái)研究目前實(shí)驗(yàn)手段難以考察的物理現(xiàn)象和過(guò)程,在分子水平上深入分析其反應(yīng)機(jī)理。目前水合物的研究已廣泛采用MD模擬,主要有水合物穩(wěn)定性機(jī)理的MD模擬研究[6-7]、天然氣水合物儲(chǔ)氫穩(wěn)定性的MD模擬[8]、天然氣水合物傳熱系數(shù)的MD模擬計(jì)算[9]、動(dòng)力學(xué)抑制劑對(duì)水合物的作用的微觀機(jī)理模擬[10]。Rodger等[11]應(yīng)用分子動(dòng)力學(xué)模擬深入研究了客體甲烷分子對(duì)Ⅰ型甲烷水合物穩(wěn)定性的影響,結(jié)果表明沒(méi)有甲烷分子填充的水合物晶格是不穩(wěn)定的。丁麗穎等[12]模擬了不同晶穴占有率和不同溫度時(shí)Ⅰ型甲烷水合物晶體穩(wěn)定性。萬(wàn)麗華等[13-14]研究了不同晶穴占有率對(duì)Ⅰ型甲烷水合物導(dǎo)熱性能和結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性的影響。

      四氫呋喃(THF)不僅可以和水在常壓、0℃條件下生成Ⅱ型水合物[15],而且可以降低天然水合物的相平衡壓力[16]。為此,本文構(gòu)造了8個(gè)Ⅱ型水合物晶體模型,分別采用四氫呋喃(THF)和甲烷組合作為客體分子填充晶胞孔穴,應(yīng)用MD模擬方法,系統(tǒng)地研究客體分子種類(lèi)、溫度、不同晶穴占有率(θ=0,33.3%,66.7%,100%)對(duì)Ⅱ型水合物穩(wěn)定性的影響。

      1 模型搭建和模擬方法

      構(gòu)建的水合物模型為2×2×2個(gè)Ⅱ型水合物晶胞,每個(gè)單胞中包括136個(gè)水分子,由8個(gè)大孔穴(51264)和16個(gè)小孔穴(512)組成。THF分子尺寸比較大,只能占據(jù)大孔穴,CH4分子可以同時(shí)占據(jù)大孔穴和小孔穴。本模擬將THF和CH4按不同組合填充于大孔穴和小孔穴中,以研究THF和CH4對(duì)THF-CH4水合物結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性的影響。

      1.1 模型搭建

      Ⅱ型水合物晶胞是面心立方結(jié)構(gòu),空間群為Fd3m,晶格參數(shù)a=17.175(3)×10-10m[17]。氧原子初始坐標(biāo)來(lái)源于X射線單晶衍射實(shí)驗(yàn)[18],氫原子隨意放入晶體中,并且滿足Bernal-Fowler規(guī)則[19]。

      采用簡(jiǎn)單點(diǎn)電荷(simple point charge,SPC)模型[20]控制水的相互作用,控制水分子O—H鍵長(zhǎng) 為0.9570×10-10m,H—O—H鍵 角 為104.52°。甲烷分子采用剛性模型,C—H鍵長(zhǎng)為1.0895×10-10m。THF分子手動(dòng)搭建,并經(jīng)過(guò)幾何與能量最優(yōu)化處理,得到總能量最小、結(jié)構(gòu)最穩(wěn)定構(gòu)象。

      表1 客體分子在模型中的分配

      1.2 模擬方法

      本模擬采用較精確的全原子模擬,在正則系綜(NVT)條件下,水分子之間選用一致性價(jià)力場(chǎng)(consistent valence force field,CVFF),結(jié)構(gòu)優(yōu)化采用最速下降法(steepest descent)和共軛梯度法(conjugate gradient)。

      采用Lennard-Jones勢(shì)能模型描述甲烷分子之間、THF分子之間以及它們與水分子之間的非鍵結(jié)相互作用,采用SPC力場(chǎng)[20]描述水分子之間的相互作用。SPC力場(chǎng)將水分子視為剛性分子,其鍵長(zhǎng)與鍵角的值固定。此力場(chǎng)將二水分子的作用分為范德瓦爾斯與庫(kù)倫作用。僅O—O原子間有范德瓦爾斯作用。水分子的每個(gè)原子均帶有電荷,分子間原子對(duì)有庫(kù)倫靜電作用。SPC力場(chǎng)的形式見(jiàn)式(1)。

      式中,e為基本電荷量;rOO、rOH和rHH分別為不同水分子氧原子之間、氧原子和氫原子之間和氫原 子 之 間 的 距 離;UOO(rOO)、UOH(rOH)和UHH(rHH)則為相應(yīng)的相互作用勢(shì);qO和qH分別為氧原子和氫原子的電荷量;ε和δ為L(zhǎng)ennard-Jones勢(shì)能參數(shù)。本文對(duì)各分子間的Lennard-Jones作用項(xiàng)采用截?cái)嗲蚪?,截?cái)喟霃絉cutoff=15×10-10m,并采用Ewald求和法處理長(zhǎng)程靜電相互作用,Ewald精度為4.182×10-6kJ/mol,采用Lorentz-Berthelot混合規(guī)則處理交互作用參數(shù)。

      進(jìn)行分子動(dòng)力學(xué)模擬時(shí),各分子起始速度由Maxwell-Boltzmann分布隨機(jī)產(chǎn)生,采用周期性邊界條件和時(shí)間平均等效于系綜平均等假設(shè)基礎(chǔ)上,運(yùn)用velocity Verlet[22]算法求解牛頓運(yùn)動(dòng)方程。首先對(duì)體系內(nèi)的分子進(jìn)行最優(yōu)化得到最優(yōu)結(jié)構(gòu),然后對(duì)體系進(jìn)行松弛處理,固定水分子中氧原子位置,使用Nose-Hoover熱容方法控制體系溫度T在263.15K、273.15K的條件下進(jìn)行等溫等容模擬,模擬時(shí)間步長(zhǎng)為1fs,每5000步輸出一幀,模擬時(shí)間長(zhǎng)度為50ps。然后解除對(duì)氧原子的約束,在相同條件下對(duì)模擬體系進(jìn)行等溫等容模擬,每200000步輸出一幀,模擬時(shí)間長(zhǎng)度為4000ps,其中1000ps用于使體系達(dá)到平衡。

      2 模擬結(jié)果及分析

      經(jīng)上述模擬過(guò)程得到晶體最終構(gòu)型,比較在不同溫度下不同水合物籠型結(jié)構(gòu)的變化,初步判斷晶體穩(wěn)定性。通過(guò)計(jì)算水合物中水分子中氧原子的徑向分布函數(shù)、均方位移以及主客體分子間相互作用能,進(jìn)一步分析溫度、晶穴占有率和客體分子對(duì)晶體穩(wěn)定性的影響。

      2.1 構(gòu)象分析

      圖1給出了模擬前各水合物模型的初始構(gòu)型,對(duì)比8組模型結(jié)構(gòu)可看出,各模型除晶胞內(nèi)客體分子因方案設(shè)置不同外,其他結(jié)構(gòu)均一致,說(shuō)明各構(gòu)型初始時(shí)籠子骨架主體水分子之間相互作用相同,排除了主體水分子對(duì)模擬結(jié)果的影響。

      圖2、圖3分別給出了模擬溫度為273.15K、263.15K時(shí)模擬結(jié)束后各模型的最終構(gòu)型。據(jù)圖可看出,在溫度為273.15K時(shí),只有模型B的籠型結(jié)構(gòu)完好并且形變很小,說(shuō)明在晶穴占有率為100%、THF占據(jù)所有大孔穴、CH4占據(jù)所有小孔穴時(shí)最有利于晶體穩(wěn)定,水合物可以穩(wěn)定存在;其余模型均出現(xiàn)不同程度的晶格破裂,表明籠型結(jié)構(gòu)坍塌,晶胞瓦解,水合物不能穩(wěn)定存在。當(dāng)溫度降低為263.15K時(shí),各模型結(jié)構(gòu)變形均減小,說(shuō)明溫度越低,晶胞的穩(wěn)定性越好,這與水合物在低溫下更穩(wěn)定的性質(zhì)相吻合;除模型B外,模型A亦能夠保持籠型結(jié)構(gòu)完好且變形較小,表明此溫度下模型A可以穩(wěn)定存在。

      圖4為模擬溫度為283.15K時(shí)模型B的最終構(gòu)型,對(duì)比溫度在263.15K和273.15K時(shí)的最終構(gòu)型可以發(fā)現(xiàn),模型B依然保持完好的籠型結(jié)構(gòu)和較小的形變,表明在客體種類(lèi)適宜和水合物晶穴占有率較高的情況下,水合物晶體在較高溫度下仍可保持穩(wěn)定,為水合物在較高溫度下儲(chǔ)存運(yùn)輸提供了指導(dǎo)。

      圖1 模型初始構(gòu)型

      圖2 273.15K時(shí)各模型最終構(gòu)型

      圖3 263.15K時(shí)各模型最終構(gòu)型

      2.2 徑向分布函數(shù)(radial distribution function,RDF)

      徑向分布函數(shù)gα-β(r)表現(xiàn)的是距參考粒子α質(zhì)心r處出現(xiàn)粒子β的概率,可以解釋為系統(tǒng)的區(qū)域密度(local density)與平均密度(bulk density)的比,反映微觀結(jié)構(gòu)特征。參考分子的附近(r值?。﹨^(qū)域密度不同于系統(tǒng)的平均密度,但當(dāng)距參考分子遠(yuǎn)時(shí)區(qū)域密度應(yīng)該與平均密度相同,即當(dāng)r值大時(shí)RDF的值應(yīng)接近1。晶態(tài)、非晶態(tài)和液態(tài)都有自己的特征徑向分布函數(shù)。液態(tài)水中每個(gè)氧原子與周?chē)钹徑踉又g的距離為r=2.78×10-10m,氧原子的RDF曲線在此處形成一個(gè)峰;當(dāng)r>2.78×10-10m時(shí),由于水中分子是均勻分布的,RDF曲線值應(yīng)該逐漸趨于1。穩(wěn)定的水合物晶體中水分子的排列具有周期性,氧原子RDF曲線有多個(gè)峰,各個(gè)峰高隨分子間距離的增加逐漸降低,且按晶體中水分子間隔距離規(guī)律分布。圖5和圖6為溫度為273.15K和263.15K時(shí)模擬結(jié)束后模型內(nèi)水分子中氧原子的徑向分布函數(shù)曲線,其中M和W分別為穩(wěn)定水合物晶體和液態(tài)水的氧原子徑向分布函數(shù)曲線。

      圖4 283.15K時(shí)模型B的最終構(gòu)型

      圖5 273.15K時(shí)水合物中氧原子徑向分布函數(shù)曲線

      在溫度為273.15K和263.15K時(shí),對(duì)比兩圖可發(fā)現(xiàn):模型B與模型M的氧原子徑向分布函數(shù)函數(shù)曲線幾乎重合,表明在模擬結(jié)束后模型B的籠型結(jié)構(gòu)骨架氧原子的位置并未發(fā)生變化,水晶體未發(fā)生坍塌或者變形,模型B可以在此模擬溫度下保持穩(wěn)定;模型C、D、E、F、G和H第一個(gè)峰高小于M,第二、第三等峰高消失,且曲線與液態(tài)水W趨于一致,表明模擬結(jié)束后,模型中水分子的有序排列減小,氧原子分布無(wú)序程度增大,可判斷水合物籠型結(jié)構(gòu)被破壞,水合物晶體逐漸分解;在溫度為273.15K時(shí),模型A的第二、第三等峰消失,水合物晶體不能穩(wěn)定存在,當(dāng)溫度降低為263.15K時(shí),模型A、M的氧原子徑向分布函數(shù)函數(shù)曲線幾乎重合,表明在溫度降低時(shí),晶穴占有率為100%的模型最容易從不穩(wěn)定狀態(tài)轉(zhuǎn)變?yōu)榉€(wěn)定狀態(tài)。

      圖6 263.15K時(shí)氧原子徑向分布函數(shù)曲線

      2.3 均方位移

      分子動(dòng)力學(xué)系統(tǒng)中的原子由起始位置不停移動(dòng),每一瞬間各個(gè)原子的位置皆不相同。粒子位移平方的平均值稱(chēng)為均方位移(mean squared displacement,MSD),見(jiàn)式(2)。

      式中,括號(hào)表示平均值,Ri(t)和Ri(0)分別表示分子i在時(shí)間為0、t時(shí)的位置,N為體系中的分子總數(shù)。根據(jù)統(tǒng)計(jì)原理,只要分子數(shù)目夠多,計(jì)算時(shí)間夠長(zhǎng),系統(tǒng)的任一瞬間均可當(dāng)作時(shí)間的零點(diǎn),所計(jì)算的平均值應(yīng)該相同。

      均方位移反映了系統(tǒng)中分子的空間位置與其初始位置的偏離程度,根據(jù)其大小可以判斷體系是處于固態(tài)還是液態(tài)。對(duì)于穩(wěn)定的水合物晶體,所有水分子均處于相對(duì)固定的晶格點(diǎn)上,氧原子的均方位移應(yīng)該在一個(gè)略大于0的值附近波動(dòng),對(duì)于液態(tài)水,其均方位移隨模擬時(shí)間的延長(zhǎng)而增大。圖7和圖8給出了模擬溫度分別為273.15K和263.15K時(shí)液態(tài)水和各個(gè)模型水分子中氧原子的均方位移。

      圖7 273.15K時(shí)氧原子均方位移曲線

      圖8 263.15K時(shí)氧原子均方位移曲線

      從圖7、圖8可以看出,當(dāng)模擬溫度相同時(shí),各模型氧原子均方位移大小關(guān)系相同,均為B<A<H<E<C<F<G<D,表明客體分子的存在可以提高晶體的穩(wěn)定性,晶穴占有率越高,晶體越穩(wěn)定。進(jìn)一步分析可發(fā)現(xiàn)以下幾點(diǎn)。①晶穴占有率為0時(shí),模型D的均方位移均大于液態(tài)水的氧原子均方位移,表明氧原子移動(dòng)劇烈程度大于液態(tài)水,水合物籠型結(jié)構(gòu)迅速坍塌,說(shuō)明晶穴占有率為0時(shí)的水合物晶體極易分解,水合物不能穩(wěn)定存在。②晶穴占有率為33.3%時(shí),均方位移C<F<G,對(duì)比3個(gè)模型的結(jié)構(gòu)可發(fā)現(xiàn):客體分子為T(mén)HF的晶體比客體分子為CH4的晶體更容易保持穩(wěn)定,客體分子種類(lèi)對(duì)晶體穩(wěn)定性有影響,CH4占據(jù)小孔穴的晶體比CH4占據(jù)大孔穴的晶體更容易保持晶體穩(wěn)定,客體分子占據(jù)的孔穴尺寸對(duì)晶體穩(wěn)定性有影響。③晶穴占有率為66.7%時(shí),模型H的均方位移始終小于模型E,但當(dāng)溫度降低時(shí),兩者之間的差距減小,表明在此溫度范圍內(nèi),客體分子為CH4的晶體相對(duì)于客體分子為T(mén)HF的晶體的穩(wěn)定性更易受溫度的影響。④晶穴占有率為100%、溫度為273.15K時(shí),模型B可以穩(wěn)定存在而模型A難以穩(wěn)定存在,溫度降為263.15K后兩模型均可穩(wěn)定存在,由于模型A、B不同之處僅在于占據(jù)大孔穴的客體分子不同,因此可以判斷,溫度是通過(guò)影響模型A中大孔穴與CH4分子之間的相互作用進(jìn)而影響模型A的穩(wěn)定性的。

      對(duì)比兩圖還可發(fā)現(xiàn),模擬溫度由273.15K降低為263.15K時(shí),各模型的氧原子均方位移均減小,表明溫度的降低抑制了水分子的運(yùn)動(dòng),增強(qiáng)了籠型結(jié)構(gòu)的穩(wěn)固,有利于晶體結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性;模型B的氧原子均方位移變化很小,說(shuō)明對(duì)于已經(jīng)可以穩(wěn)定存在的晶體,溫度的降低對(duì)其穩(wěn)定性的影響不大。

      2.4 相互作用能

      圖9 相互作用能曲線

      從圖9可以看出,相互作用能從小到大依次為B、A、H、C、E、G、F,進(jìn)一步分析可以發(fā)現(xiàn):模型B的相互作用能最小,說(shuō)明模型B最穩(wěn)定,這與前面分析所得結(jié)論是一致的;模型C、H的相互作用能小于模型E、F、G,說(shuō)明THF比CH4更容易保持水合物晶體穩(wěn)定性;模型E的相互作用能小于模型F、G及模型H的相互作用能小于模型C,說(shuō)明對(duì)于CH4,客體分子晶穴占有率越高,相互作用能越小;模型A的相互作用能比模型C、E、F、G、H小,說(shuō)明100%的晶穴占有率對(duì)相互作用能的降低有較大促進(jìn)作用,該作用大于不同客體分子種類(lèi)對(duì)相互作用能的影響。

      對(duì)比不同溫度下的Ebinding可發(fā)現(xiàn),當(dāng)溫度降低時(shí),各個(gè)模型的Ebinding均減小,說(shuō)明溫度的降低可以減小晶體內(nèi)主客體分子間的相互作用能,提高晶體的穩(wěn)定性的:模型A的Ebinding降低最大,說(shuō)明溫度的降低對(duì)其影響最大;模型B的Ebinding受溫度影響較小,進(jìn)一步證實(shí)了當(dāng)水合物處于穩(wěn)定狀態(tài)時(shí),降低溫度對(duì)其穩(wěn)定性的影響并不大。

      3 結(jié) 論

      采用NVT系綜分子動(dòng)力學(xué)模擬方法研究了不同客體、晶穴占有率以及溫度對(duì)Ⅱ型水合物晶體結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性的影響,通過(guò)對(duì)最終構(gòu)象、RDF、MSD和相互作用能的分析,得到以下結(jié)論。

      (1)尺寸較大的THF與大晶穴的相互作用能小于尺寸較小的CH4與大晶穴的相互作用能,更有利于提高水合物晶體的穩(wěn)定性。在晶穴占有率相同時(shí),客體分子類(lèi)型對(duì)水合物晶體穩(wěn)定性有較大影響,THF比CH4更容易保持水合物晶體的穩(wěn)定性。

      (2)晶穴中客體分子的存在可以降低主客體分子間的相互作用能,減小水分子的均方位移,提高晶體穩(wěn)定性。

      (3)對(duì)于不穩(wěn)定晶體,溫度的降低可以將水分子的均方位移降低到0附近,減小籠型結(jié)構(gòu)的變形,水合物晶體的分解速率降低,穩(wěn)定性提高;對(duì)于已經(jīng)穩(wěn)定的晶體,溫度的降低對(duì)已經(jīng)接近為0的均方位移影響不大,對(duì)水合物穩(wěn)定性的影響不明顯。

      由于晶穴占有率為100%的CH4水合物模型的穩(wěn)定性高于晶穴占有率較低的水合物模型,因此在實(shí)際生產(chǎn)中,應(yīng)該盡可能地提高水合物晶穴占有率以增大水合物的穩(wěn)定性及儲(chǔ)氣量,添加適量THF占據(jù)大晶穴以提高水合物的穩(wěn)定性,并在保證水合物穩(wěn)定性的基礎(chǔ)上,盡量提高水合物的儲(chǔ)存溫度以降低儲(chǔ)存成本。

      在魚(yú)類(lèi)分類(lèi)學(xué)上,鱖魚(yú)屬鱸形目鮨科鱖亞科鱖屬,其中鱖屬有兩個(gè)種,一個(gè)是翹嘴鱖,該魚(yú)生長(zhǎng)速度快,個(gè)體大,常見(jiàn)為2~2.5kg,最大個(gè)體重可達(dá)50kg,是人工養(yǎng)殖的主要品種;另一個(gè)是大眼鱖,該魚(yú)生長(zhǎng)緩慢,個(gè)體較小,最大個(gè)體能長(zhǎng)至重2kg。鱖魚(yú)最為突出的生物學(xué)特性是該魚(yú)屬典型的兇猛肉食性魚(yú)類(lèi),對(duì)餌料有較強(qiáng)的分辨能力,終生主要以活魚(yú)蝦為食,即使是剛開(kāi)口的魚(yú)苗,也要攝食其他魚(yú)類(lèi)的幼苗。長(zhǎng)大后,除食活魚(yú)外,還兼食蝦類(lèi)以及蝌蚪等。

      符號(hào)說(shuō)明

      A——晶格參數(shù),m

      Ebinding——相互作用能,J/mol

      Ecage——空胞腔能量,J/mol

      Eguest——客體分子自身的能量,J/mol

      Etotal——模型總能量,J/mol

      e——基本電荷,C

      gα-β(r)——徑向分布函數(shù),量綱為1

      MSD——氧原子的均方位移,m2

      N——體系中的分子總數(shù),個(gè)

      qH——?dú)湓拥碾姾闪颗c基本電荷的比值,量綱為1

      qO——氧原子的電荷量與基本電荷的值,量綱為1

      Rcutoff——截?cái)喟霃?,m

      Ri(0)——分子在時(shí)間為0時(shí)的位置,m

      Ri(t)——分子在時(shí)間為t時(shí)的位置,m

      rHH——不同水分子中氫原子間的距離,m

      rOH——不同水分子中氧原子與氫原子間的距離,mrOO——氧原子間的距離,m

      T——溫度,K

      t——時(shí)間,s

      UHH(rHH)——不同水分子中氫原子間的相互作用勢(shì)能,J

      UOH(rOH)——不同水分子中氧原子與氫原子間的相互作用勢(shì)能,J

      UOO(rOO)——不同水分子中氧原子間的相互作用勢(shì)能,J

      ε——Lennard-Jones勢(shì)能參數(shù),J/mol

      δ——Lennard-Jones勢(shì)能參數(shù),m

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