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      五個天祝白牦牛群體近交程度分析

      2014-08-30 13:56張浩
      湖北畜牧獸醫(yī) 2014年5期
      關鍵詞:牦牛

      張浩

      摘要:為了研究天祝白牦牛群體的近交程度,以5個天祝白牦牛群體共計598頭牦牛為研究對象,借助FAO推薦的17個微衛(wèi)星座位對群體的近交程度做了評估,結果在JDL、LZH兩個群體檢測到了一定程度的近交,但差異不顯著(P>0.05),而在其他群體顯著(0.01

      關鍵詞:牦牛;微衛(wèi)星DNA;近交分析

      中圖分類號:S814.8文獻標識碼:A 文章編號:1007-273X(2014)05-0007-03

      微衛(wèi)星DNA廣泛分布在各種真核生物基因組中,多態(tài)性豐富[1,2],其遵循孟德爾遺傳規(guī)律,呈共顯性遺傳[3],廣泛應用于動植物群體遺傳多樣性的檢測、群體遺傳結構的評估以及群體內個體的識別、親權關系的鑒定,也可應用于分析動物群體內近交程度,用于群體內近交系數(shù)的計算。天祝白牦牛是中國稀有而珍貴的地方類群。天祝白牦牛保種采用活體保種的方式,公母羊混養(yǎng),自然交配,無交配記錄,為了分析群體內部遺傳的多樣化水平,同時也為了搞清其內部是否存在近交,對天祝白牦牛的種質資源進行合理評估,本研究借助FAO推薦的17個微衛(wèi)星座位來研究5個天祝白牦牛群體內的近交程度,以期為白牦牛資源的保護和利用提供理論依據(jù)。

      1材料與方法

      1.1材料

      以甘肅省天祝縣5個白牦牛群體JDL、JDW、JZMJ、LZH、WYCH為研究對象,樣本容量分別為97、111、134、122、134頭,共計598頭,來研究天祝白牦牛群體近交程度。牦牛經(jīng)頸靜脈采血,-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.2方法

      1.2.1基因組DNA提取及檢測酚氯仿抽提法[4]提取全基因組DNA,用滅過菌的雙蒸水溶解DNA后,通過ND-1000型紫外分光光度計檢測DNA的濃度和純度,0.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測提取的DNA是否降解。檢驗合格-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.2.2引物信息采用FAO(http://dad.fao.org/)推薦的17個牦牛微衛(wèi)星位點,微衛(wèi)星位點盡量分布在不同的染色體上。引物在生物工程(北京)有限公司合成,采用PAGE方法純化。微衛(wèi)星引物信息見表1。

      1.2.3PCR擴增及產物檢測PCR擴增反應采用15 μl體系:10×Taq Buffer 1.5 μL,dNTP Mixture(10 mmol/L)1.0 μL,上下游引物(10 pmol/mL)各0.2 μL,DNA模板(25 ng/μL)1.0 μL,Taq Polymerase(5 U/μL)0.3 μL,ddH2O補足至15 μL。Taq Buffer、dNTP Mixture以及Taq Polymerase 等購自天根生化科技(北京)有限公司。

      PCR擴增程序:95 ℃預變性5 min;95 ℃變性30 s,退火30 s,72 ℃延伸30 s,35個循環(huán);72 ℃復性10 min。PCR產物用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測。

      PCR產物經(jīng)2% 瓊脂糖凝膠檢測,以天根生化科技有限公司產DNA Marker Ⅰ為分子量標準,150 V電泳10 min,通過UV-1000型凝膠成像系統(tǒng)查看PCR擴增效果及條帶大小,照相保存。

      1.2.5統(tǒng)計分析Fstat 2.9.3軟件[5]用以計算群體內的近交系數(shù)。

      2結果與分析

      摘要:為了研究天祝白牦牛群體的近交程度,以5個天祝白牦牛群體共計598頭牦牛為研究對象,借助FAO推薦的17個微衛(wèi)星座位對群體的近交程度做了評估,結果在JDL、LZH兩個群體檢測到了一定程度的近交,但差異不顯著(P>0.05),而在其他群體顯著(0.01

      關鍵詞:牦牛;微衛(wèi)星DNA;近交分析

      中圖分類號:S814.8文獻標識碼:A 文章編號:1007-273X(2014)05-0007-03

      微衛(wèi)星DNA廣泛分布在各種真核生物基因組中,多態(tài)性豐富[1,2],其遵循孟德爾遺傳規(guī)律,呈共顯性遺傳[3],廣泛應用于動植物群體遺傳多樣性的檢測、群體遺傳結構的評估以及群體內個體的識別、親權關系的鑒定,也可應用于分析動物群體內近交程度,用于群體內近交系數(shù)的計算。天祝白牦牛是中國稀有而珍貴的地方類群。天祝白牦牛保種采用活體保種的方式,公母羊混養(yǎng),自然交配,無交配記錄,為了分析群體內部遺傳的多樣化水平,同時也為了搞清其內部是否存在近交,對天祝白牦牛的種質資源進行合理評估,本研究借助FAO推薦的17個微衛(wèi)星座位來研究5個天祝白牦牛群體內的近交程度,以期為白牦牛資源的保護和利用提供理論依據(jù)。

      1材料與方法

      1.1材料

      以甘肅省天??h5個白牦牛群體JDL、JDW、JZMJ、LZH、WYCH為研究對象,樣本容量分別為97、111、134、122、134頭,共計598頭,來研究天祝白牦牛群體近交程度。牦牛經(jīng)頸靜脈采血,-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.2方法

      1.2.1基因組DNA提取及檢測酚氯仿抽提法[4]提取全基因組DNA,用滅過菌的雙蒸水溶解DNA后,通過ND-1000型紫外分光光度計檢測DNA的濃度和純度,0.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測提取的DNA是否降解。檢驗合格-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.2.2引物信息采用FAO(http://dad.fao.org/)推薦的17個牦牛微衛(wèi)星位點,微衛(wèi)星位點盡量分布在不同的染色體上。引物在生物工程(北京)有限公司合成,采用PAGE方法純化。微衛(wèi)星引物信息見表1。

      1.2.3PCR擴增及產物檢測PCR擴增反應采用15 μl體系:10×Taq Buffer 1.5 μL,dNTP Mixture(10 mmol/L)1.0 μL,上下游引物(10 pmol/mL)各0.2 μL,DNA模板(25 ng/μL)1.0 μL,Taq Polymerase(5 U/μL)0.3 μL,ddH2O補足至15 μL。Taq Buffer、dNTP Mixture以及Taq Polymerase 等購自天根生化科技(北京)有限公司。

      PCR擴增程序:95 ℃預變性5 min;95 ℃變性30 s,退火30 s,72 ℃延伸30 s,35個循環(huán);72 ℃復性10 min。PCR產物用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測。

      PCR產物經(jīng)2% 瓊脂糖凝膠檢測,以天根生化科技有限公司產DNA Marker Ⅰ為分子量標準,150 V電泳10 min,通過UV-1000型凝膠成像系統(tǒng)查看PCR擴增效果及條帶大小,照相保存。

      1.2.5統(tǒng)計分析Fstat 2.9.3軟件[5]用以計算群體內的近交系數(shù)。

      2結果與分析

      摘要:為了研究天祝白牦牛群體的近交程度,以5個天祝白牦牛群體共計598頭牦牛為研究對象,借助FAO推薦的17個微衛(wèi)星座位對群體的近交程度做了評估,結果在JDL、LZH兩個群體檢測到了一定程度的近交,但差異不顯著(P>0.05),而在其他群體顯著(0.01

      關鍵詞:牦牛;微衛(wèi)星DNA;近交分析

      中圖分類號:S814.8文獻標識碼:A 文章編號:1007-273X(2014)05-0007-03

      微衛(wèi)星DNA廣泛分布在各種真核生物基因組中,多態(tài)性豐富[1,2],其遵循孟德爾遺傳規(guī)律,呈共顯性遺傳[3],廣泛應用于動植物群體遺傳多樣性的檢測、群體遺傳結構的評估以及群體內個體的識別、親權關系的鑒定,也可應用于分析動物群體內近交程度,用于群體內近交系數(shù)的計算。天祝白牦牛是中國稀有而珍貴的地方類群。天祝白牦牛保種采用活體保種的方式,公母羊混養(yǎng),自然交配,無交配記錄,為了分析群體內部遺傳的多樣化水平,同時也為了搞清其內部是否存在近交,對天祝白牦牛的種質資源進行合理評估,本研究借助FAO推薦的17個微衛(wèi)星座位來研究5個天祝白牦牛群體內的近交程度,以期為白牦牛資源的保護和利用提供理論依據(jù)。

      1材料與方法

      1.1材料

      以甘肅省天??h5個白牦牛群體JDL、JDW、JZMJ、LZH、WYCH為研究對象,樣本容量分別為97、111、134、122、134頭,共計598頭,來研究天祝白牦牛群體近交程度。牦牛經(jīng)頸靜脈采血,-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.2方法

      1.2.1基因組DNA提取及檢測酚氯仿抽提法[4]提取全基因組DNA,用滅過菌的雙蒸水溶解DNA后,通過ND-1000型紫外分光光度計檢測DNA的濃度和純度,0.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測提取的DNA是否降解。檢驗合格-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.2.2引物信息采用FAO(http://dad.fao.org/)推薦的17個牦牛微衛(wèi)星位點,微衛(wèi)星位點盡量分布在不同的染色體上。引物在生物工程(北京)有限公司合成,采用PAGE方法純化。微衛(wèi)星引物信息見表1。

      1.2.3PCR擴增及產物檢測PCR擴增反應采用15 μl體系:10×Taq Buffer 1.5 μL,dNTP Mixture(10 mmol/L)1.0 μL,上下游引物(10 pmol/mL)各0.2 μL,DNA模板(25 ng/μL)1.0 μL,Taq Polymerase(5 U/μL)0.3 μL,ddH2O補足至15 μL。Taq Buffer、dNTP Mixture以及Taq Polymerase 等購自天根生化科技(北京)有限公司。

      PCR擴增程序:95 ℃預變性5 min;95 ℃變性30 s,退火30 s,72 ℃延伸30 s,35個循環(huán);72 ℃復性10 min。PCR產物用2%瓊脂糖凝膠電泳檢測。

      PCR產物經(jīng)2% 瓊脂糖凝膠檢測,以天根生化科技有限公司產DNA Marker Ⅰ為分子量標準,150 V電泳10 min,通過UV-1000型凝膠成像系統(tǒng)查看PCR擴增效果及條帶大小,照相保存。

      1.2.5統(tǒng)計分析Fstat 2.9.3軟件[5]用以計算群體內的近交系數(shù)。

      2結果與分析

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