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      甜瓜霜霉病抗性基因的SSR標(biāo)記

      2014-09-02 20:05:33賀玉花徐永陽徐志紅等
      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年7期
      關(guān)鍵詞:霜霉病甜瓜

      賀玉花 徐永陽 徐志紅等

      摘要:為了研究與甜瓜抗霜霉病基因緊密連鎖的SSR分子標(biāo)記,以甜瓜抗病品種PI414723和感病品種DF4的雜交F2群體156個(gè)單株為試驗(yàn)材料,利用人工鑒定方法,根據(jù)F2抗、感病單株分離比例組建抗感池,用SSR技術(shù)尋找與抗病基因連鎖的分子標(biāo)記。從211個(gè)SSR引物組合中篩選出3個(gè)與抗病基因緊密連鎖的標(biāo)記DE1887、DE1320、DM0854,遺傳距離分別為26、26、13.69 cM。

      關(guān)鍵詞:甜瓜;霜霉??;SSR;遺傳距離;抗性基因

      中圖分類號: S436.5 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A 文章編號:1002-1302(2014)07-0054-02

      收稿日期:2014-03-09

      基金項(xiàng)目:現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專項(xiàng)(編號:CARS-26-01);國家科技支撐計(jì)劃(編號:2012BAD02B03)。

      作者簡介:賀玉花(1989—),女,河南焦作人,碩士研究生,主要從事蔬菜遺傳育種研究。E-mail:heyuhua2007@126.com。

      通信作者:徐永陽,研究員,碩士生導(dǎo)師,主要從事蔬菜遺傳育種等方面的研究。Tel:(0371)65330930;E-mail:xuyongyang@caas.cn。霜霉?。≒sedoperonospora cubensis)是甜瓜、黃瓜和南瓜等葫蘆科作物上廣泛發(fā)生的一種世界性病害。該病害在溫室種植的瓜類上全年發(fā)生,在露地條件適宜時(shí)也不斷發(fā)生。此病一旦發(fā)生,病情擴(kuò)展很快,通??刂撇蛔?,成片病葉迅速枯焦,導(dǎo)致果實(shí)不能成熟,嚴(yán)重影響甜瓜的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。為了減輕病害的發(fā)生,長期施用農(nóng)藥不僅污染環(huán)境,威脅到人們的身體健康,而且還會導(dǎo)致病原菌產(chǎn)生抗藥性,因此培育抗霜霉病的優(yōu)良品種是防治瓜類霜霉病的根本途徑;但傳統(tǒng)的育種方法所需時(shí)間較長,不能滿足甜瓜生產(chǎn)對新品種的需求。隨著分子生物學(xué)的日益發(fā)展,利用 RFLP、AFLP、RAPD和SSR等分子標(biāo)記技術(shù)尋找與抗病基因緊密連鎖的分子標(biāo)記,從而進(jìn)行抗性鑒定和標(biāo)記輔助選擇育種。在印度發(fā)現(xiàn)了很多抗霜霉病的優(yōu)良材料,例如PI124111、PI124112和PI414723。PI124111和PI124112成為了美國抗霜霉病育種的背景材料,許多學(xué)者對這2個(gè)材料的抗病遺傳規(guī)律和抗霜霉病相關(guān)基因進(jìn)行了相關(guān)研究[1-4]。2005年,Perchepied等構(gòu)建了第一張也是目前為止唯一一張關(guān)于甜瓜霜霉病的遺傳圖譜,他們利用PI124112×Védrantais獲得的120個(gè)RIL株系為材料,構(gòu)建的圖譜長度為1 150 cM,包含465個(gè)AFLP標(biāo)記、17個(gè)SSR標(biāo)記、26個(gè)IMA標(biāo)記和2個(gè)重要的形態(tài)標(biāo)記(雌雄同株和抗番木瓜環(huán)斑?。?,分36個(gè)連鎖群,平均標(biāo)記間距4.2 cM,標(biāo)記最大間距26.5 cM,該圖譜定位了11個(gè)與霜霉病抗性基因相關(guān)的QTL[4]。2012年,楊柳燕等利用抗病品系DM3×感病品系DF4獲得的F2和BC群體為材料,利用軟件對田間調(diào)查和分子標(biāo)記結(jié)果進(jìn)行連鎖分析,結(jié)果顯示1個(gè)SRAP標(biāo)記me8em11與甜瓜霜霉病抗性基因的連鎖距離為9.8 cM[5-6]。本研究以抗性品系PI414723為材料,利用BSA方法篩選與甜瓜抗霜霉病緊密連鎖的SSR分子標(biāo)記,為甜瓜抗霜霉病的分子輔助育種提供理論基礎(chǔ)。

      1材料與方法

      1.1試驗(yàn)材料

      以中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所西甜瓜資源課題組提供的甜瓜抗霜霉病品種PI414723為母本,甜瓜育種課題組提供的感病自交系DF4(在田間和人工接種鑒定時(shí)表現(xiàn)為高感甚至死亡)為父本,及其F2代的156個(gè)單株為試驗(yàn)材料。2012年11月,將試驗(yàn)材料在三亞基地種植:PI414723為10株,DF4為10株,F(xiàn)2代為156株。

      1.2抗病鑒定方法

      病原菌由三亞基地田間感病黃瓜病葉上采集得到,接種方法借鑒楊柳燕的方法[5]。在傍晚,于植株下部隨機(jī)選擇3張葉片,將準(zhǔn)備好的霜霉菌懸浮液噴灑在葉片背面,直到菌液在葉片上可以成股流下。接種3 d后進(jìn)行病情鑒定,參照翁祖信等的分級標(biāo)準(zhǔn)[7],以葉片背面霉層的覆蓋面積為統(tǒng)計(jì)標(biāo)準(zhǔn),最終以單株上的3張葉片病情的平均值作為這個(gè)單株的病情級數(shù)。

      1.4DNA提取方法

      DNA提取采用改良的CTAB法,并用核酸蛋白質(zhì)檢測儀進(jìn)行檢測。取D280 nm/D260 nm比值和D260 nm/D230 nm比值在 1.80~2.00 之間( 雜質(zhì)較少) 的DNA稀釋至50 ng/μL。

      1.5建立抗感池

      從F2代群體中選取6株病害級別為0的單株和6株病害級別為5的單株,提取DNA檢測后進(jìn)行等量混合,建立高抗池和高感池。

      2結(jié)果與分析

      2.1DNA提取與多態(tài)性引物鑒定

      所提取的DNA經(jīng)過核酸蛋白儀檢測,D280 nm/D260 nm比值和D260 nm/D230 nm比值均在1.80~2.00之間。經(jīng)凝膠電泳檢測(圖1),帶型整齊一致,無降解現(xiàn)象,滿足PCR反應(yīng)的要求。

      本試驗(yàn)用211個(gè)SSR引物分別對抗、感親本進(jìn)行篩選,其中136個(gè)引物在抗、感親本之間顯示出多態(tài)性。用在親本中篩選出多態(tài)性的136對引物分別在抗、感池中進(jìn)行篩選,發(fā)現(xiàn)了6個(gè)引物在抗感池中表現(xiàn)出多態(tài)性。圖2為9對在親本中具有多態(tài)性的引物在抗感池間的擴(kuò)增電泳圖,其中斜箭頭所指引物為DE1320,抗病池帶型與抗病親本一致,感病池與感病親本的帶型一致,表示該引物在抗感池中有差異的引物。

      2.2甜瓜抗霜霉病基因與SSR標(biāo)記的連鎖分析

      用篩選出的6個(gè)引物對PI414723×DF4的F2代群體的156個(gè)單株進(jìn)行SSR擴(kuò)增,通過QTL IciMapping軟件對分離群體單株的抗病性和分子標(biāo)記的分離數(shù)據(jù)進(jìn)行連鎖分析,結(jié)果表明:DE1887、DE1320、DM0854與抗霜霉病基因的遺傳距離分別 26、26、13.69cM。

      3結(jié)語

      世界上對甜瓜霜霉病的抗病遺傳研究較早,迄今為止,已報(bào)道的甜瓜霜霉病抗性基因有Pc-1、Pc-2、Pc-3、Pc-4、Pc-5[1-3,8]。其中,本試驗(yàn)中所用的抗性親本材料PI414723的抗霜霉病性狀由單顯性基因控制,命名為Pc-3[8]。本研究發(fā)現(xiàn)了3對SSR引物與PI414723中抗霜霉病基因連鎖,期望通過這些引物獲得更多的關(guān)于基因Pc-3的信息,為以后的甜瓜抗霜霉病遺傳育種提供理論基礎(chǔ)。

      參考文獻(xiàn):

      [1]Thomas C E,Cohen Y,Mccreight J D,et al. Inheritance of resistance to downy mildew in Cucumis melo[J]. Plant Disease,1988,72:33-35.

      [2]Kenigsbuch D,Cohen Y. Inheritance of resistance to downy mildew in Cucumis melo PI124112 and commonality of resistance genes with PI124111F[J]. Plant Disease,1992,76(6):615-617.

      [3]Cohen Y,Cohen S,Eyal H,et al. Inheritance of resistance to downy mildew in Cucumis melo PI124111[J]. Cucurbit Genet Coop Rep,1985,8:36-38.

      [4]Perchepied L,Bardin M,Dogimont C,et al. Relationship between loci conferring downy mildew and powdery mildew resistance in melon assessed by quantitative trait loci mapping[J]. Phytopathology,2005,95(5):556-565.

      [5]楊柳燕.甜瓜霜霉?。≒seudoperonospora cubensis)抗性遺傳研究及SRAP分子標(biāo)記[D]. 北京:中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院,2012.

      [6]楊柳燕,徐永陽,徐志紅,等. 甜瓜霜霉病抗性遺傳及SRAP分子標(biāo)記[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2012,28(5):1200-1202.

      [7]翁祖信,馮東昕,李寶棟. 黃瓜霜霉病抗病性鑒定技術(shù)研究初報(bào)[J]. 中國蔬菜,1991(4):7-9.

      [8]Epinat C,Pitrat M. Inheritance of resistance of three lines of muskmelon(Cucumis melo) to downy mildew (Pseudoperonospora cubensis)[C]. Proceedings of Cucurbitaceae,1989:133-135.

      3結(jié)語

      世界上對甜瓜霜霉病的抗病遺傳研究較早,迄今為止,已報(bào)道的甜瓜霜霉病抗性基因有Pc-1、Pc-2、Pc-3、Pc-4、Pc-5[1-3,8]。其中,本試驗(yàn)中所用的抗性親本材料PI414723的抗霜霉病性狀由單顯性基因控制,命名為Pc-3[8]。本研究發(fā)現(xiàn)了3對SSR引物與PI414723中抗霜霉病基因連鎖,期望通過這些引物獲得更多的關(guān)于基因Pc-3的信息,為以后的甜瓜抗霜霉病遺傳育種提供理論基礎(chǔ)。

      參考文獻(xiàn):

      [1]Thomas C E,Cohen Y,Mccreight J D,et al. Inheritance of resistance to downy mildew in Cucumis melo[J]. Plant Disease,1988,72:33-35.

      [2]Kenigsbuch D,Cohen Y. Inheritance of resistance to downy mildew in Cucumis melo PI124112 and commonality of resistance genes with PI124111F[J]. Plant Disease,1992,76(6):615-617.

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      3結(jié)語

      世界上對甜瓜霜霉病的抗病遺傳研究較早,迄今為止,已報(bào)道的甜瓜霜霉病抗性基因有Pc-1、Pc-2、Pc-3、Pc-4、Pc-5[1-3,8]。其中,本試驗(yàn)中所用的抗性親本材料PI414723的抗霜霉病性狀由單顯性基因控制,命名為Pc-3[8]。本研究發(fā)現(xiàn)了3對SSR引物與PI414723中抗霜霉病基因連鎖,期望通過這些引物獲得更多的關(guān)于基因Pc-3的信息,為以后的甜瓜抗霜霉病遺傳育種提供理論基礎(chǔ)。

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