氣功是中國傳統(tǒng)醫(yī)藥學(xué)的一個(gè)重要組成部分。在2000多年前成書的我國現(xiàn)存最早的醫(yī)學(xué)經(jīng)典著作《黃帝內(nèi)經(jīng)》中，對(duì)氣功鍛煉的方法、理論和治療效果等內(nèi)容，都有記載。在《素問》的八十一篇中，就有十幾篇直接或間接地談到有關(guān)氣功方面的內(nèi)容。可見，在春秋戰(zhàn)國時(shí)期以前，氣功已成為一種重要的醫(yī)療保健方法。

氣功作為中醫(yī)學(xué)的一個(gè)分支，在理論上主要以中醫(yī)理論為基礎(chǔ)，在創(chuàng)編功法和氣功鍛煉中也應(yīng)用陰陽、五行、臟腑、經(jīng)絡(luò)、精氣神等學(xué)說作指導(dǎo)；對(duì)氣功鍛煉產(chǎn)生的效應(yīng)及氣功作用機(jī)制等認(rèn)識(shí)，到目前為止，也主要以中醫(yī)理論來闡述。當(dāng)然，由于自古以來，氣功實(shí)踐不只為醫(yī)家獨(dú)有，儒、道、佛、武等各家在各自不同的實(shí)踐中，分別對(duì)氣功形成了自己的認(rèn)識(shí)，也構(gòu)成了氣功理論的一部分。

氣功實(shí)踐的結(jié)果也為中醫(yī)學(xué)提供了新的內(nèi)容，如明代醫(yī)學(xué)家李時(shí)珍、張景岳等分別對(duì)奇經(jīng)八脈和丹田命門理論的系統(tǒng)闡發(fā)，在很大程度上是建立在氣功實(shí)踐的基礎(chǔ)上的。氣功強(qiáng)調(diào)對(duì)意念的運(yùn)用，是對(duì)中醫(yī)調(diào)神理論和情志學(xué)說的補(bǔ)充和發(fā)展。掌握了氣功心身同練的特點(diǎn)，有助于深入理解中醫(yī)“形神合一”、“天人合一”的整體觀，而氣功作用機(jī)制的探討，亦有益于對(duì)中醫(yī)“氣化論”、“精氣神”理論和臟腑心理相關(guān)性等的深入認(rèn)識(shí)。發(fā)掘整理氣功與藥物配合應(yīng)用，氣功針灸、氣功按摩等傳統(tǒng)治療方法也可提高臨床療效、開拓新的治療途徑。