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      過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)OsILP基因水稻株系的構(gòu)建

      2014-11-22 19:55:27孫偉清張昌輪袁茜梁建生
      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年10期
      關(guān)鍵詞:水稻

      孫偉清++張昌輪++袁茜++梁建生++呂冰

      摘要:采用RT-PCR和TA克隆技術(shù),從水稻品種日本晴中擴(kuò)增出類整合素候選基因(integrin-like protein,ILP)OsILP的cDNA片段。經(jīng)測(cè)序鑒定,克隆獲得的目的片段長(zhǎng)為1 167 bp,包含完整的CDS,編碼388個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)分子量43 ku。進(jìn)而將該片段連接至表達(dá)載體pTCK303中,通過(guò)PCR鑒定與酶切驗(yàn)證,結(jié)果表明成功構(gòu)建了pTCK303-OsILP過(guò)表達(dá)載體。并將表達(dá)載體質(zhì)粒轉(zhuǎn)化為農(nóng)桿菌EHA105,再通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)將其導(dǎo)入水稻日本晴的愈傷中,經(jīng)遺傳轉(zhuǎn)化,陽(yáng)性鑒定,獲得了過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)OsILP基因水稻株系。

      關(guān)鍵詞:水稻;類整合素蛋白;過(guò)表達(dá);轉(zhuǎn)基因株系

      中圖分類號(hào): Q785;S336文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A文章編號(hào):1002-1302(2014)10-0017-04

      收稿日期:2013-11-11

      基金項(xiàng)目:江蘇省自然科學(xué)基金(編號(hào):BK2009185)。

      作者簡(jiǎn)介:孫偉清(1987—),男,山東臨沂人,碩士,主要從事植物逆境生理研究。E-mail:qdswqlzc@163.com。

      通信作者:呂冰,博士,副教授,主要從事植物生理生化與分子生物學(xué)研究。E-mail:lubing@yzu.edu.cn。水稻OsILP即Os03g0199100、LOC_Os03g10240,別稱UPF0496 protein 1,是由1 167個(gè)核苷酸序列編碼388個(gè)氨基酸組成的未知功能蛋白,預(yù)測(cè)分子量43 ku,屬于DUF677家族(domain of unknown function 677)。DUFs為具有保守結(jié)構(gòu)域。但在Pfam等蛋白家族數(shù)據(jù)庫(kù)中信息較少、功能尚待明確的一系列蛋白家族[1]。其中,DUF677 (PF05055)家族是植物中存在的一個(gè)功能未知的蛋白家族。該家族中,除OsILP外,擬南芥AT14A也是其中之一。AT14A是一個(gè)與動(dòng)物整合素蛋白具有部分相似序列和功能的膜蛋白[2-3],被命名為類整合素蛋白(integrin like protein,ILP)。

      整合素是動(dòng)物細(xì)胞黏附分子的重要成員,屬于一類跨膜蛋白的超家族,是由2個(gè)跨膜糖蛋白亞基(α亞基、β亞基)通過(guò)非共價(jià)鍵連接而成的異二聚體[4]。從結(jié)構(gòu)上看,α亞基、β亞基都是由1個(gè)大的N-胞外結(jié)構(gòu)域、1個(gè)短的跨膜結(jié)構(gòu)域、1個(gè)短的C-胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域組成[5]。構(gòu)成胞外結(jié)構(gòu)域的氨基酸通過(guò)折疊和纏繞形成一個(gè)結(jié)合 “口袋”,能識(shí)別并結(jié)合各種含有RGD(Arg-Gly-Asp)短肽序列的胞外基質(zhì)分子,并調(diào)節(jié)其與配體結(jié)合的特異性??缒そY(jié)構(gòu)域相對(duì)較小,但在進(jìn)化上屬高度保守的區(qū)域。在胞質(zhì)一側(cè),整合素直接與包括α-輔肌動(dòng)蛋白在內(nèi)的多種肌動(dòng)蛋白結(jié)合蛋白相連[6]。當(dāng)細(xì)胞外因素刺激或細(xì)胞本身的生理功能發(fā)生變化時(shí),α-輔肌動(dòng)蛋白可通過(guò)其酪氨酸磷酸化、結(jié)合Ca2+或其他信號(hào)分子而影響細(xì)胞骨架形態(tài),調(diào)節(jié)細(xì)胞運(yùn)動(dòng)。整合素作為黏附受體的生物學(xué)功能是傳導(dǎo)生化信號(hào)并改變細(xì)胞骨架的機(jī)械結(jié)構(gòu),從而構(gòu)成了胞外基質(zhì)(extracellular matrix,ECM)-質(zhì)膜-細(xì)胞骨架連續(xù)體,成為動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)外信號(hào)雙向轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程中的關(guān)鍵分子之一,在細(xì)胞的運(yùn)動(dòng)、增殖、分化、凋亡等方面起重要作用[7-9]。

      序列比對(duì)結(jié)果表明,OsILP蛋白與擬南芥類整合素蛋白AT14A有22.87%的同源性,并且疏水氨基酸主要集中在 220~280 位氨基酸。預(yù)測(cè)蛋白結(jié)構(gòu)(圖1)顯示,其與動(dòng)物整合素亞基的構(gòu)成更類似,即含有胞外結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域、胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域各1個(gè),且具有不同物種間較保守的同源序列,因此推測(cè)其為水稻中的類整合素(OsILP),參與了細(xì)胞內(nèi)外信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)過(guò)程的調(diào)控。

      本研究采用分子生物學(xué)技術(shù)克隆出OsILP,并構(gòu)建過(guò)表達(dá)載體,再通過(guò)農(nóng)桿菌介導(dǎo)法轉(zhuǎn)化水稻植株,獲得過(guò)表達(dá)的轉(zhuǎn)OsILP基因水稻株系,旨在為研究OsILP編碼蛋白的表達(dá)、定位及生理功能,最終判斷OsILP蛋白是否為水稻中的類整合素,以及研究其在細(xì)胞內(nèi)外信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中的作用奠定基礎(chǔ)。

      1材料與方法

      1.1供試材料

      供試材料為粳稻品種日本晴(Oryza sativa subsp. japonica cv. Nipponbare)??寺≥d體pMD19-T購(gòu)自TaKaRa公司。pTCK303雙元載體由中國(guó)科學(xué)院種康實(shí)驗(yàn)室惠贈(zèng)。大腸桿菌(E.coli)DH5α、農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumefaciens)EHA105等分子生物學(xué)試驗(yàn)常用菌種由筆者所在實(shí)驗(yàn)室保存。

      1.2OsILP基因擴(kuò)增與T-A克隆

      1.2.1引物設(shè)計(jì)根據(jù)GenBank公布的水稻基因及其登錄號(hào)NM_001055818在NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)中搜索OsILP基因的編碼序列,并結(jié)合表達(dá)載體(pTCK303)的多克隆酶切位點(diǎn)[10](圖2)設(shè)計(jì)特異引物 (表1)。引物由上海捷瑞生物工程有限公司合成,同時(shí)合成潮霉素(Hyg)抗性基因的引物。

      1.2.2OsILP基因的PCR擴(kuò)增提取日本晴水稻14 d幼苗的總RNA,以甲醛變性瓊脂糖凝膠電泳和NanoDrop 2000 微量分光光度計(jì)檢測(cè)RNA 質(zhì)量,參照TaKaRa公司的cDNA第一鏈合成試劑盒說(shuō)明書,采用20 μL反應(yīng)體系反轉(zhuǎn)錄合成水稻cDNA第一鏈。

      以第一鏈cDNA為模板進(jìn)行PCR 擴(kuò)增,擴(kuò)增條件:95 ℃預(yù)變性4 min;95 ℃變性30 s,63 ℃退火30 s,72 ℃延伸90 s,30次循環(huán);72 ℃后延伸10 min。

      1.2.3OsILP基因的T-A克隆與測(cè)序純化的目的基因片段與pMD19-T載體連接,并轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α 感受態(tài)細(xì)

      表1目標(biāo)基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物

      基因引物序列(5′→3′)產(chǎn)物大?。╞p)OsILPF:GGATCCATGGGGAACAGCAGCA;R:ACTAGTTCAGCTAGGATGCCGGATGA1 167HygF:CTTCTGCGGGCGATTTGTG;R:TGACTGGAGCGAGGCGATG300

      胞。對(duì)所獲得的白斑菌落通過(guò)菌液PCR 擴(kuò)增驗(yàn)證后,按照上海捷瑞生物工程有限公司質(zhì)粒小提試劑盒說(shuō)明書提取質(zhì)粒,并送至南京金斯瑞生物科技有限公司測(cè)序,以確定其是否為重組克隆載體pMD19-T-OsILP。

      1.3過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)OsILP基因載體的構(gòu)建與農(nóng)桿菌的獲得

      1.3.1OsILP基因過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建將上述重組克隆載體(pMD19-T-OsILP)質(zhì)粒和空載體pTCK303 質(zhì)粒用限制性內(nèi)切酶BamHⅠ和SpeⅠ 雙酶切,分別回收目標(biāo)區(qū)域(1 200 bp 左右)片段和空載體酶切產(chǎn)物(約14 kb) 片段,用T4-DNA 連接酶過(guò)夜連接后轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞。

      用2種方法分別驗(yàn)證重組質(zhì)粒:一是進(jìn)行菌落PCR驗(yàn)證;二是采用酶切驗(yàn)證。PCR產(chǎn)物和酶切產(chǎn)物均用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。

      1.3.2過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)OsILP基因農(nóng)桿菌的獲得采用凍融法將重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化到農(nóng)桿菌EHA105感受態(tài)細(xì)胞中,對(duì)抗生素篩選出的陽(yáng)性菌落以目的基因OsILP為目標(biāo)產(chǎn)物進(jìn)行PCR鑒定。

      1.4過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)OsILP基因水稻株系的獲得與鑒定

      水稻轉(zhuǎn)基因操作步驟參考劉巧泉等的方法[11],略作改動(dòng)。提取T0代轉(zhuǎn)化苗的葉片DNA,以潮霉素抗性基因?yàn)槟繕?biāo)產(chǎn)物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增條件:95 ℃預(yù)變性4 min;95 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸40 s,30次循環(huán);72 ℃后延伸10 min。

      2結(jié)果與分析

      2.1OsILP基因的克隆

      將從日本晴水稻中提取的總RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA第一鏈后,進(jìn)行OsILP基因的PCR擴(kuò)增。瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物的結(jié)果如圖3-A所示,擴(kuò)增產(chǎn)物大小為1 200 bp左右,符合目的片段1 167 bp預(yù)期。將回收并純化后的目標(biāo)片段進(jìn)行T-A克隆,菌液PCR驗(yàn)證結(jié)果(圖3-B)表明,目的片段已轉(zhuǎn)入pMD19-T載體。陽(yáng)性菌液測(cè)序結(jié)果經(jīng)NCBI序列比對(duì),與NCBI上報(bào)道的OsILP基因序列99%匹配,只有第1 040位上的堿基由 “T”變成“C”,即由“GAT”變成“GAC”,密碼子由“CUA”變成“CUG”,編碼同一種氨基酸(亮氨酸),此為同義改變。上述結(jié)果表明重組克隆載體 pMD19-T-OsILP 已構(gòu)建成功。

      2.2pTCK303-OsILP過(guò)表達(dá)載體的構(gòu)建

      利用位于載體pMD19-T-OsILP和表達(dá)載體pTCK303內(nèi)含子兩端的BamHⅠ和SpeⅠ酶切位點(diǎn),分別對(duì)提取的2個(gè)載體質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切,回收各自目的片段(1 167、14 kb),將兩者用T4-DNA連接酶連接后轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α。對(duì)菌液進(jìn)行PCR鑒定,結(jié)果見(jiàn)圖4-A。除陰性對(duì)照外,陽(yáng)性對(duì)照和檢測(cè)菌液均可以擴(kuò)增出1 167 bp長(zhǎng)的目的片段。進(jìn)而提取質(zhì)粒,對(duì)重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切鑒定(圖4-B),1號(hào)泳道為空載體的酶切結(jié)果,在400 bp處可看到1條帶,為內(nèi)含子片段;2號(hào)泳道為重組載體的酶切結(jié)果,在1 200 bp左右處出現(xiàn)1條帶,說(shuō)明目標(biāo)片段(1 167 bp)已正確連接到pTCK303載體中。

      將所構(gòu)建的過(guò)表達(dá)載體pTCK303-OsILP導(dǎo)入農(nóng)桿菌EHA105中,農(nóng)桿菌菌液PCR檢測(cè)如圖4-C所示,1號(hào)泳道為空載體陰性對(duì)照,2號(hào)泳道為陽(yáng)性對(duì)照,3~5號(hào)泳道為不同的單克隆菌株,2~5號(hào)泳道均擴(kuò)增出目的片段,說(shuō)明過(guò)表達(dá)載體pTCK303-OsILP已成功導(dǎo)入農(nóng)桿菌EHA105,可以進(jìn)行下一步的愈傷轉(zhuǎn)化。

      2.3農(nóng)桿菌介導(dǎo)的水稻遺傳轉(zhuǎn)化

      以成熟胚愈傷組織為材料,與轉(zhuǎn)過(guò)表達(dá)載體pTCK303-OsILP的農(nóng)桿菌菌液共培養(yǎng)后,用含潮霉素、頭孢霉素的培養(yǎng)基進(jìn)行抗性篩選,得到抗性愈傷(圖5-A),并對(duì)篩選出的抗性愈傷誘導(dǎo)生芽(圖5-B),再將生芽植株轉(zhuǎn)移至生根培養(yǎng)基培養(yǎng)生根(圖5-C),獲得再生抗性苗,然后移栽到盆缽(圖5-D)。

      2.4T0代過(guò)表達(dá)轉(zhuǎn)OsILP基因水稻植株的潮霉素抗性基因檢測(cè)

      提取再生苗葉片基因組DNA,以潮霉素抗性基因?yàn)樘禺悢U(kuò)增對(duì)象進(jìn)行PCR擴(kuò)增。由圖6可見(jiàn),在檢測(cè)的9株再生苗中有6株能擴(kuò)增出預(yù)期長(zhǎng)度的目標(biāo)條帶,即檢測(cè)出了潮霉素抗性基因,證實(shí)帶有嵌合基因的T-DNA區(qū)域已融合到水稻植株的基因組中,獲得了陽(yáng)性轉(zhuǎn)基因植株。

      3結(jié)論與討論

      采用反向遺傳學(xué)技術(shù),首先從水稻cDNA文庫(kù)中擴(kuò)增出了OsILP基因編碼區(qū)全長(zhǎng)序列。由于OsILP基因序列GC含量高達(dá)60%以上,使得引物的退火溫度變高,普通Taq酶無(wú)法擴(kuò)增出完整的目的基因全長(zhǎng),只能得到500~800 bp的片段。本研究采用TaKaRa公司的 LA Taq with GC Buffer Ⅰ(編碼RR02AG),應(yīng)用LA PCR原理研制出具有3′→5′Exonuclease活性 (Proof reading活性) 的耐熱性DNA聚合酶。無(wú)論是擴(kuò)增短鏈DNA還是長(zhǎng)鏈DNA,其效率都優(yōu)于其他同類產(chǎn)品,尤其是在擴(kuò)增大于10 kb的DNA片段上,其優(yōu)勢(shì)更加明顯,而且保真性能強(qiáng)。當(dāng)擴(kuò)增具有復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu) (GC rich等) 的模板或重復(fù)序列的模板時(shí),使用GC Buffer進(jìn)行PCR擴(kuò)增將非常有效。然而該酶雖能完整擴(kuò)增出目的片段,但并不能保證測(cè)序結(jié)果與目的片段完全一致,多次試驗(yàn)結(jié)果均不理想,最好的試驗(yàn)結(jié)果是本研究中達(dá)到的99%匹配率,因是同義突變,沒(méi)有改變氨基酸序列,編碼蛋白與目標(biāo)蛋白完全一致。

      pTCK303雙元表達(dá)載體是構(gòu)建RNA干擾載體,使基因沉默的常用載體[10]。因其在內(nèi)含子兩端各自反向連入了1段目的基因,使之在轉(zhuǎn)錄后能形成雙鏈RNA(dsRNA)。dsRNA 首先與Dicer酶的dsRNA結(jié)合區(qū)結(jié)合,并降解成為21~23個(gè)核苷酸的小分子干擾RNA(siRNA)。siRNA在解旋酶的作用下解鏈形成的反義鏈RNA可指導(dǎo)生成一種核蛋白體復(fù)合物,也叫誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RISC),在解旋酶作用下,雙鏈RNA解鏈形成單鏈,RISC的內(nèi)切酶及外切酶活性被激活,在 siRNA序列的引導(dǎo)下,對(duì)靶mRNA進(jìn)行剪切,從而降解特定mRNA,從而使目標(biāo)基因沉默[12-15]。而本研究直接利用目的基因全長(zhǎng)替換掉載體上的內(nèi)含子片段,使之成為過(guò)表達(dá)載體。

      將構(gòu)建的過(guò)表達(dá)載體導(dǎo)入農(nóng)桿菌EHA105,再通過(guò)根癌

      農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法轉(zhuǎn)化水稻愈傷。具體操作時(shí)鑒于農(nóng)桿菌生長(zhǎng)不容易控制,建議浸染后的愈傷組織一定要盡量吹干再移到共培養(yǎng)基,并且一定要在培養(yǎng)基里墊1層無(wú)菌濾紙,即使這樣,在后面篩選培養(yǎng)基中仍須加一定濃度的頭孢霉素,以防止農(nóng)桿菌過(guò)度繁殖。初步篩選僅有小部分能正常生長(zhǎng)出嫩黃色的新生愈傷組織。第2步篩選時(shí),潮霉素濃度加倍,而頭孢霉素的濃度相應(yīng)降低,此時(shí)大部分愈傷組織都能正常生長(zhǎng),只是極個(gè)別愈傷仍會(huì)大量繁殖農(nóng)桿菌,最后獲得9株轉(zhuǎn)基因再生苗。

      T0代轉(zhuǎn)基因植株的鑒定主要是以載體上的潮霉素基因?yàn)閿U(kuò)增對(duì)象,初步鑒定獲得了6個(gè)過(guò)表達(dá)的轉(zhuǎn)基因水稻植株,這為研究OsILP蛋白的表達(dá)、定位及生理功能,最終判斷其是否即為水稻中的類整合素,以及研究OsILP在細(xì)胞內(nèi)外信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中的作用奠定了基礎(chǔ)。

      4研究展望

      生物信息學(xué)研究表明,OsILP的表達(dá)情況與生物脅迫、非生物脅迫、種子萌發(fā)均有關(guān)系。不僅如此,基因芯片數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)果還顯示,OsILP在水稻不同器官組織中的表達(dá)情況也各不相同,尤其在胚乳等貯藏器官中OsILP的表達(dá)量相對(duì)較高,而在葉片等營(yíng)養(yǎng)器官中表達(dá)量相對(duì)較低。因此,OsILP的功能可能與水稻抗逆、種子萌發(fā)、籽粒胚乳發(fā)育密切相關(guān)。

      OsILP是用擬南芥類整合素基因AT14A序列在水稻數(shù)據(jù)庫(kù)中BLAST尋找的基因,兩者的編碼蛋白同屬DUF677家族。筆者所在實(shí)驗(yàn)室已有研究表明,AT14A作為擬南芥中的類整合素,介導(dǎo)了細(xì)胞壁-質(zhì)膜-細(xì)胞骨架連續(xù)體,在細(xì)胞的內(nèi)外信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)方面起著重要作用[3]。從結(jié)構(gòu)上來(lái)看,水稻OsILP含有胞外結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域、胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域各1個(gè),其分子結(jié)構(gòu)與動(dòng)物整合素更為類似。結(jié)構(gòu)相似提示功能可能一致,OsILP是否為水稻中的類整合素及其與水稻種子發(fā)育、萌發(fā)及響應(yīng)逆境脅迫的關(guān)系,還須進(jìn)一步驗(yàn)證。

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      [15]Zamore P D. RNA interference:listening to the sound of silence[J]. Nature Structural Biology,2001,8(9):746-750.

      將構(gòu)建的過(guò)表達(dá)載體導(dǎo)入農(nóng)桿菌EHA105,再通過(guò)根癌

      農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法轉(zhuǎn)化水稻愈傷。具體操作時(shí)鑒于農(nóng)桿菌生長(zhǎng)不容易控制,建議浸染后的愈傷組織一定要盡量吹干再移到共培養(yǎng)基,并且一定要在培養(yǎng)基里墊1層無(wú)菌濾紙,即使這樣,在后面篩選培養(yǎng)基中仍須加一定濃度的頭孢霉素,以防止農(nóng)桿菌過(guò)度繁殖。初步篩選僅有小部分能正常生長(zhǎng)出嫩黃色的新生愈傷組織。第2步篩選時(shí),潮霉素濃度加倍,而頭孢霉素的濃度相應(yīng)降低,此時(shí)大部分愈傷組織都能正常生長(zhǎng),只是極個(gè)別愈傷仍會(huì)大量繁殖農(nóng)桿菌,最后獲得9株轉(zhuǎn)基因再生苗。

      T0代轉(zhuǎn)基因植株的鑒定主要是以載體上的潮霉素基因?yàn)閿U(kuò)增對(duì)象,初步鑒定獲得了6個(gè)過(guò)表達(dá)的轉(zhuǎn)基因水稻植株,這為研究OsILP蛋白的表達(dá)、定位及生理功能,最終判斷其是否即為水稻中的類整合素,以及研究OsILP在細(xì)胞內(nèi)外信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中的作用奠定了基礎(chǔ)。

      4研究展望

      生物信息學(xué)研究表明,OsILP的表達(dá)情況與生物脅迫、非生物脅迫、種子萌發(fā)均有關(guān)系。不僅如此,基因芯片數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)果還顯示,OsILP在水稻不同器官組織中的表達(dá)情況也各不相同,尤其在胚乳等貯藏器官中OsILP的表達(dá)量相對(duì)較高,而在葉片等營(yíng)養(yǎng)器官中表達(dá)量相對(duì)較低。因此,OsILP的功能可能與水稻抗逆、種子萌發(fā)、籽粒胚乳發(fā)育密切相關(guān)。

      OsILP是用擬南芥類整合素基因AT14A序列在水稻數(shù)據(jù)庫(kù)中BLAST尋找的基因,兩者的編碼蛋白同屬DUF677家族。筆者所在實(shí)驗(yàn)室已有研究表明,AT14A作為擬南芥中的類整合素,介導(dǎo)了細(xì)胞壁-質(zhì)膜-細(xì)胞骨架連續(xù)體,在細(xì)胞的內(nèi)外信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)方面起著重要作用[3]。從結(jié)構(gòu)上來(lái)看,水稻OsILP含有胞外結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域、胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域各1個(gè),其分子結(jié)構(gòu)與動(dòng)物整合素更為類似。結(jié)構(gòu)相似提示功能可能一致,OsILP是否為水稻中的類整合素及其與水稻種子發(fā)育、萌發(fā)及響應(yīng)逆境脅迫的關(guān)系,還須進(jìn)一步驗(yàn)證。

      參考文獻(xiàn):

      [1]Bateman A,Coggill P,F(xiàn)inn R D. DUFs:families in search of function[J]. Acta Crystallographica Section F-Structural Biology and Crystallization Communications,2010,66(10):1148-1152.

      [2]Nagpal P,Quatrano R S. Isolation and characterization of a cDNA clone from Arabidopsis thaliana with partial sequence similarity to integrins[J]. Gene,1999,230(1):33-40.

      [3]Lu B,Wang J,Zhang Y,et al. AT14A mediates the cell wall-plasma membrane-cytoskeleton continuum in Arabidopsis thaliana cells[J]. Journal of Experimental Botany,2012,63(11):4061-4069.

      [4]Hynes R O. Integrins:bidirectional,allosteric signaling machines[J]. Cell,2002,110(6):673-687.

      [5]Wegener K L,Partridge A W,Han J,et al. Structural basis of integrin activation by talin[J]. Cell,2007,128(1):171-182.

      [6]Triplett J W,Pavalko F M. Disruption of alpha-actinin-integrin interactions at focal adhesions renders osteoblasts susceptible to apoptosis[J]. American Journal of Physiology-Cell Physiology,2006,291(5):C909-C921.

      [7]Qin J,Vinogradova O,Plow E F. Integrin bidirectional signaling:a molecular view[J]. PLOS Biology,2004,2(6):726-729.

      [8]Harburger D S,Calderwood D A. Integrin signalling at a glance[J]. Journal of Cell Science,2009,122(2):159-163.

      [9]Legate K R,Wickstrm S A,F(xiàn)ssler R. Genetic and cell biological analysis of integrin outside-in signaling[J]. Genes & Development,2009,23(4):397-418.

      [10]Wang Z,Chen C B,Xu Y Y,et al. A practical vector for efficient knockdown of gene expression in rice(Oryza sativa L.)[J]. Plant Molecular Biology Reporter,2004,22(4):409-417.

      [11]劉巧泉,張景六,王宗陽(yáng),等. 根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的水稻高效轉(zhuǎn)化系統(tǒng)的建立[J]. 植物生理學(xué)報(bào),1998,24(3):259-271.

      [12]Fire A,Xu S Q,Montgomery M K,et al. Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans[J]. Nature,1998,391(6669):806-811.

      [13]Bernstein E,Caudy A A,Hammond S M,et al. Role for a bidentate ribonuclease in the initiation step of RNA interference[J]. Nature,2001,409(6818):363-366.

      [14]Sontheimer E J. Assembly and function of RNA silencing complexes[J]. Nature Reviews Molecular Cell Biology,2005,6(2):127-138.

      [15]Zamore P D. RNA interference:listening to the sound of silence[J]. Nature Structural Biology,2001,8(9):746-750.

      將構(gòu)建的過(guò)表達(dá)載體導(dǎo)入農(nóng)桿菌EHA105,再通過(guò)根癌

      農(nóng)桿菌介導(dǎo)的方法轉(zhuǎn)化水稻愈傷。具體操作時(shí)鑒于農(nóng)桿菌生長(zhǎng)不容易控制,建議浸染后的愈傷組織一定要盡量吹干再移到共培養(yǎng)基,并且一定要在培養(yǎng)基里墊1層無(wú)菌濾紙,即使這樣,在后面篩選培養(yǎng)基中仍須加一定濃度的頭孢霉素,以防止農(nóng)桿菌過(guò)度繁殖。初步篩選僅有小部分能正常生長(zhǎng)出嫩黃色的新生愈傷組織。第2步篩選時(shí),潮霉素濃度加倍,而頭孢霉素的濃度相應(yīng)降低,此時(shí)大部分愈傷組織都能正常生長(zhǎng),只是極個(gè)別愈傷仍會(huì)大量繁殖農(nóng)桿菌,最后獲得9株轉(zhuǎn)基因再生苗。

      T0代轉(zhuǎn)基因植株的鑒定主要是以載體上的潮霉素基因?yàn)閿U(kuò)增對(duì)象,初步鑒定獲得了6個(gè)過(guò)表達(dá)的轉(zhuǎn)基因水稻植株,這為研究OsILP蛋白的表達(dá)、定位及生理功能,最終判斷其是否即為水稻中的類整合素,以及研究OsILP在細(xì)胞內(nèi)外信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)中的作用奠定了基礎(chǔ)。

      4研究展望

      生物信息學(xué)研究表明,OsILP的表達(dá)情況與生物脅迫、非生物脅迫、種子萌發(fā)均有關(guān)系。不僅如此,基因芯片數(shù)據(jù)庫(kù)結(jié)果還顯示,OsILP在水稻不同器官組織中的表達(dá)情況也各不相同,尤其在胚乳等貯藏器官中OsILP的表達(dá)量相對(duì)較高,而在葉片等營(yíng)養(yǎng)器官中表達(dá)量相對(duì)較低。因此,OsILP的功能可能與水稻抗逆、種子萌發(fā)、籽粒胚乳發(fā)育密切相關(guān)。

      OsILP是用擬南芥類整合素基因AT14A序列在水稻數(shù)據(jù)庫(kù)中BLAST尋找的基因,兩者的編碼蛋白同屬DUF677家族。筆者所在實(shí)驗(yàn)室已有研究表明,AT14A作為擬南芥中的類整合素,介導(dǎo)了細(xì)胞壁-質(zhì)膜-細(xì)胞骨架連續(xù)體,在細(xì)胞的內(nèi)外信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)方面起著重要作用[3]。從結(jié)構(gòu)上來(lái)看,水稻OsILP含有胞外結(jié)構(gòu)域、跨膜結(jié)構(gòu)域、胞內(nèi)結(jié)構(gòu)域各1個(gè),其分子結(jié)構(gòu)與動(dòng)物整合素更為類似。結(jié)構(gòu)相似提示功能可能一致,OsILP是否為水稻中的類整合素及其與水稻種子發(fā)育、萌發(fā)及響應(yīng)逆境脅迫的關(guān)系,還須進(jìn)一步驗(yàn)證。

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      [6]Triplett J W,Pavalko F M. Disruption of alpha-actinin-integrin interactions at focal adhesions renders osteoblasts susceptible to apoptosis[J]. American Journal of Physiology-Cell Physiology,2006,291(5):C909-C921.

      [7]Qin J,Vinogradova O,Plow E F. Integrin bidirectional signaling:a molecular view[J]. PLOS Biology,2004,2(6):726-729.

      [8]Harburger D S,Calderwood D A. Integrin signalling at a glance[J]. Journal of Cell Science,2009,122(2):159-163.

      [9]Legate K R,Wickstrm S A,F(xiàn)ssler R. Genetic and cell biological analysis of integrin outside-in signaling[J]. Genes & Development,2009,23(4):397-418.

      [10]Wang Z,Chen C B,Xu Y Y,et al. A practical vector for efficient knockdown of gene expression in rice(Oryza sativa L.)[J]. Plant Molecular Biology Reporter,2004,22(4):409-417.

      [11]劉巧泉,張景六,王宗陽(yáng),等. 根癌農(nóng)桿菌介導(dǎo)的水稻高效轉(zhuǎn)化系統(tǒng)的建立[J]. 植物生理學(xué)報(bào),1998,24(3):259-271.

      [12]Fire A,Xu S Q,Montgomery M K,et al. Potent and specific genetic interference by double-stranded RNA in Caenorhabditis elegans[J]. Nature,1998,391(6669):806-811.

      [13]Bernstein E,Caudy A A,Hammond S M,et al. Role for a bidentate ribonuclease in the initiation step of RNA interference[J]. Nature,2001,409(6818):363-366.

      [14]Sontheimer E J. Assembly and function of RNA silencing complexes[J]. Nature Reviews Molecular Cell Biology,2005,6(2):127-138.

      [15]Zamore P D. RNA interference:listening to the sound of silence[J]. Nature Structural Biology,2001,8(9):746-750.

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