曹 曦 謝榮榮 信 中 楊金奎*
(1.首都醫(yī)科大學附屬北京同仁醫(yī)院內(nèi)分泌科,北京100730;2.糖尿病防治研究北京市重點實驗室,北京100730)
特發(fā)性低促性腺激素型性腺功能減退綜合征又名Kallmann 綜合征(Kallmann syndrome,KS),其特點是性腺功能低下,部分患者合并嗅覺障礙,先天性瞼中線或肢體畸形,是一種罕見的先天性疾病,國內(nèi)報道較少。
該疾病有家族性和散發(fā)性2種類型,其中散發(fā)性占60%左右[1]。其遺傳方式可以是X染色體連鎖的隱性遺傳、常染色體顯性和隱性遺傳[2-3]。目前為止,6個不同的基因已被確定與KS相關(guān):Kallmann syndrome 1(KAL)[4],fibroblast growth factor receptor 1(FGFR1,也稱為 KAL2)[5],F(xiàn)GF8[6],prokineticin(PROK2)[7],prokineticin receptor 2(PROKR2)[8]和 WDR11[9]。
已有的研究[10]顯示KS絕大多數(shù)是X連鎖隱性遺傳。一些KAL1基因異常(錯義突變,剪接位點突變,部分基因片段缺失和完整的基因缺失)已經(jīng)在大約10%的散發(fā)性患者和14%~50%的家族性患者中找到。KAL1基因組全長210 000,含有14個外顯子,編碼一種680個氨基酸的細胞外基質(zhì)蛋白,名叫嗅因子(anosmin-1)。KAL1基因編碼蛋白具有調(diào)控神經(jīng)軸突向外生長和識別靶組織或靶細胞的功能[4],并且參與促性腺激素釋放激素(GnRH)分泌神經(jīng)元和嗅覺神經(jīng)元的遷移[10]。
PROK2是一個含81個氨基酸的分泌蛋白,而PROKR2是一個含384個氨基酸的G偶聯(lián)受體蛋白。這兩個基因敲除小鼠模型顯示,它們在嗅球的形態(tài)和性成熟方面發(fā)揮著重要的作用[7]。
本研究利用聚合酶鏈式反應(yīng)和直接測序技術(shù)對一個 13歲 KS患者家系進行 KAL1、PROK2和PROKR2 3個基因突變分析,同時對其突變位點進行功能預(yù)測。
本研究獲得首都醫(yī)科大學附屬北京同仁醫(yī)院倫理委員會批準,受試者充分了解研究內(nèi)容并簽署知情同意書。通過問卷調(diào)查獲得每個家庭成員一般基本情況和詳細的家族史。同時對內(nèi)分泌狀態(tài)、嗅覺功能和腎功能進行了臨床評估。
采用放射免疫分析法檢測激素水平,超聲掃描評估腹部結(jié)構(gòu),腦部磁共振成像檢測嗅球、腦溝和內(nèi)耳的結(jié)構(gòu)。
本研究分別利用 SIFT[11]、Polyphen[12]和 Mutation Taster[13]3種生物信息學平臺進行了錯義位點和多態(tài)性位點的功能分析。
抽取患者外周血2 mL,用血液基因組DNA提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司)提取基因組DNA。PCR擴增KAL1、PROK2和PROKR2 3個基因外顯子區(qū),引物見表1。
表1 PCR引物序列及擴增片段長度Tab.1 Primer sequences and amplified fragment length
PCR反應(yīng)體系為25 μL,含基因組DNA樣本200 ng、PCR mix 12.5 μL(北京天根生化科技有限公司)、10 μmol/L引物(北京諾賽基因合成)。在 PCR儀(BIO-RED)上完成擴增,PCR擴增循環(huán)條件如下:95℃預(yù)變性5 min;94℃變性45 s,55℃退火45 s,72℃延伸45 s,共35個循環(huán);最后于72℃延伸5 min,置于4℃保存。
擴增產(chǎn)物用1.2%瓊脂糖電泳檢測目的片段大小。PCR產(chǎn)物直接送北京諾賽基因測序,測序結(jié)果用NCBI數(shù)據(jù)庫中Blast軟件比對分析。每個突變點經(jīng)過兩端測序確認,同時做3次獨立的PCR擴增驗證突變結(jié)果。
患者為13歲的男孩,由于第二性征及外生殖器發(fā)育不良伴視力下降就診。與同齡人相比,患者身高和智力沒有明顯異常。11歲時,由于青春期發(fā)育不良進行了男性內(nèi)分泌功能評估,睪丸體積分別為0.65和0.56 mL。氣味測試揭示嗅覺減退。腹部超聲掃描顯示,膽囊、胰腺、脾、腎正常。MRI顯示嗅球、嗅束發(fā)育不良(圖1A)。
如表2所示,患者基礎(chǔ)血清雌激素(estradiol,E2)濃度,卵泡刺激素(follicle-stimulating hormone,F(xiàn)SH),黃體生成素(luteinizing hormone,LH),睪酮(testosterone,Testo)、皮質(zhì)醇(cortisol,F(xiàn))濃度顯著低于正常參考值。催乳素(prolactin,PRL)和孕酮(progesterone,PROG)濃度正常。
患者的母親有正常的青春期發(fā)育和月經(jīng)周期規(guī)律,血清促性腺激素和雌二醇的濃度正常,同時MRI結(jié)果顯示嗅球發(fā)育正常(圖1B)。其父親男性化特征明顯,血清促性腺激素和睪酮的濃度正常。
圖1 患者及其母親磁共振結(jié)果Fig.1 MRI findings of the patient and his mother
表2 患者內(nèi)分泌檢測結(jié)果Tab.2 Endocrine test results of the patient
如表3所示,患者KAL1基因測序存在2個新突變,這2個突變處于KAL1第12個外顯子上(I565T和S570T)(圖2B,C),位于KAL1蛋白的第4個Ⅲ型纖連素樣(fibronectin typeⅢ domain,F(xiàn)nⅢ)重復序列結(jié)構(gòu)域(圖2A)。此外,測序還找到了5個KAL1基因單核苷酸多態(tài)性位點:V534I、V560F、G567S、K666M 和R668H。
值得一提的是,PROKR2基因測序發(fā)現(xiàn)核苷酸337位置T突變?yōu)镃,導致113位氨基酸位點由酪氨酸轉(zhuǎn)變?yōu)榻M氨酸(p.Y113H)(圖2D)。同時在患者父母基因組中也找到該位點的雜合突變形式(圖2E)。
圖2 KAL1和PROKR2突變位點突變及測序圖Fig.2 Mutation map and partial nucleotide sequence of KAL1 and PROKR2 gene
3種分析方法都顯示 KAL1的 I565T位點和PROKR2的Y113H位點可能是對蛋白功能產(chǎn)生危害的突變位點(表3)。
表3 KAL1和PROKR2基因突變分析Tab.3 Summary of molecular analysis of the KAL1 and PROKR2 gene
此外,兩兩分析發(fā)現(xiàn),Polyphen和Mutation Taster分析顯示G567S和S570T 2個位點也可能是對蛋白功能產(chǎn)生危害的突變位點??紤]到G567S是一個SNP位點,S570T作為一個可能的致病位點的可能性比較大。最后總結(jié)3種分析方法和兩兩分析結(jié)果,I565T、S570T和Y113H(PROKR2)3個位點可能是該患者的致病基因位點。
本研究在一個13歲KS患者KAL1基因中找到2個新的突變位點(I565T和S570T)和5個SNP位點(V534I、V560F、G567S、K666M 和 R668H),同時在PROKR2基因中找到一個純合的錯義突變位點(Y113H)。這是在中國人群中發(fā)現(xiàn)的第1例KAL1和PROKR2 2個基因同時突變的KS患者。
已有的研究[14]顯示KAL1基因突變位點大多數(shù)位于第4個FnⅢ重復序列結(jié)構(gòu)域。本研究的2個新突變位點就位于KAL1蛋白第4個FnⅢ結(jié)構(gòu)域。FnⅢ結(jié)構(gòu)域與細胞黏附分子(CAM)家族成員:纖連蛋白、神經(jīng)細胞黏附分子(NCAM)、L1和tenasin有著顯著的同源性[14]。這些分子通常與神經(jīng)元發(fā)育過程中細胞外和細胞間的相互黏附、增生和遷移作用相關(guān),這表明anosmin-1也與這些細胞活動有關(guān)。此外,已有研究[14]顯示anosmin-1通過FnⅢ結(jié)構(gòu)域直接與FGFR1蛋白結(jié)合。綜合上述分析,KAL1的I565T和S570T 2個突變位點很可能是致病位點。
此外,患者KAL1基因中的5個SNP位點也值得注意。正如在2型糖尿病、遺傳性橢圓形紅細胞增多癥、克雅病和類風濕性關(guān)節(jié)炎等研究[15-16]中已經(jīng)證實,多個SNP位點增加了這些疾病的發(fā)病風險。KAL1多個SNP位點在患者基因組中的同時存在,也有可能是增加其患病概率的一個重要因素。
分析PROKR2的蛋白結(jié)構(gòu),Y113H突變位點位于其第一個細胞外環(huán)狀結(jié)構(gòu)區(qū)。本研究的功能預(yù)測分析顯示Y113H突變位點很可能為患者的致病位點。而已有研究[17]也證實,含有Y113H突變位點的PROKR2蛋白,在Egr1-LUC基因轉(zhuǎn)錄分析和基于水母的Ca2+流分析實驗中,其活性嚴重受損。這表明Y113H突變是PROKR2蛋白一個重要的功能缺失突變。
KS最初被認為是單基因遺傳性疾病,但是后來陸續(xù)被證實有多個基因起作用[18-19]。目前為止,報道有3例雙基因遺傳的KS患者,1例是FGFR1和NELF基因突變,另2例是KAL1和 PROKR2基因突變[20],本研究是第4例。KAL1編碼的anosmin-1蛋白被證實不僅能通過FGFR1提高了成纖維細胞生長因子信號[21],而且能通過 PROKR2在 prokineticin信號傳導過程中發(fā)揮作用。鑒于上述觀點,本研究假設(shè)KAL1和PROKR2這2個突變體蛋白可在不同層次進行同樣的細胞內(nèi)活動,并且這一過程可能有助于其漸進性功能障礙,最終導致病變[20]。
通常,一些主要的發(fā)育型疾病在純合體狀態(tài)下表現(xiàn)得更加嚴重。在本研究中,患者癥狀表現(xiàn)為青春期發(fā)育不良和嗅覺減退/嗅覺缺失。另一方面,患者父母都攜帶PROKR2基因相同位點的雜合突變,但是沒有任何臨床癥狀。這一結(jié)果與以前的研究數(shù)據(jù)[22]的一致性,同時也進一步證實了之前其他幾項研究[23-25]的結(jié)果,即雙基因突變是一種全新的模式。
本研究存在3點潛在的不足之處,首先,本研究只對KAL1、PROK2和PROKR2 3個基因進行了測序,不能排除其他基因的突變情況,比如FGFR1。其次,只對基因的編碼區(qū)進行了測序,在其他一些調(diào)控區(qū),比如啟動子和內(nèi)含子區(qū)域,這些區(qū)域都有可能產(chǎn)生新的剪接位點。因此,需要進一步研究排除以上的可能性。再次,3個預(yù)測結(jié)果顯示I565T(KAL1)和Y113H(PROKR2)可能為致病的突變位點,但是只有2個預(yù)測結(jié)果顯示S570T(KAL1)為可能的致病位點,筆者考慮到S570T為目前為止首次發(fā)現(xiàn)的一個突變位點,且Polyphen和Mutation Taster這兩種預(yù)測方法準確性都比較高,因此筆者推測S570T也很可能是一個致病位點。然而功能缺失分析都只是建立在生物信息學預(yù)測的基礎(chǔ)上,尚需要進一步的基礎(chǔ)實驗確認驗證。
綜上所述,本研究擴展了KAL1與PROKR2基因在KS患者中突變的多樣性,進一步證實了這兩個基因在嗅球發(fā)育中的作用。此外,本研究進一步證實了KS患者雙基因遺傳的可能性,為KS遺傳傳遞的復雜性提供了新的數(shù)據(jù)。
[1] Hu Y,Tanriverdi F,MacColl G S,et al.Kallmann's syndrome:molecular pathogenesis[J].Int J Biochem Cell Biol,2003,35(8):1157-1162.
[2] Fechner A,F(xiàn)ong S,McGovern P.A review of Kallmann syndrome:genetics,pathophysiology,and clinical management[J].Obstet Gynecol Surv,2008,63(3):189-194.
[3] Ribeiro R S,Vieira T C,Abucham J.Reversible Kallmann syndrome:report of the first case with a KAL1 mutation and literature review[J].Eur J Endocrinol,2007,156(3):285-290.
[4] Franco B,Guioli S,Pragliola A,et al.A gene deleted in Kallmann's syndrome shares homology with neural cell adhesion and axonal path-finding molecules[J].Nature,1991,353(6344):529-536.
[5] Dode C,Levilliers J,Dupont J M,et al.Loss-of-function mutations in FGFR1 cause autosomal dominant Kallmann syndrome[J].Nat Genet,2003,33(4):463-465.
[6] Falardeau J,Chung W C,Beenken A,et al.Decreased FGF8 signaling causes deficiency of gonadotropin-releasing hormone in humans and mice[J].J Clin Invest,2008,118(8):2822-2831.
[7] Pitteloud N,Zhang C,Pignatelli D,et al.Loss-of-function mutation in the prokineticin 2 gene causes Kallmann syndrome and normosmic idiopathic hypogonadotropic hypogonadism[J].Proc Natl Acad Sci U S A,2007,104(44):17447-17452.
[8] Dode C,Teixeira L,Levilliers J,et al.Kallmann syndrome:mutations in the genes encoding prokineticin-2 and prokineticin receptor-2[J].PLoS Genet,2006,2(10):e175.
[9] Kim H G,Ahn J W,Kurth I,et al.WDR11,a WD protein that interacts with transcription factor EMX1,is mutated in idiopathic hypogonadotropic hypogonadism and Kallmann syndrome[J].Am J Hum Genet,2010,87(4):465-479.
[10] Tsai P S,Gill J C.Mechanisms of disease:Insights into X-linked and autosomal-dominant Kallmann syndrome[J].Nat Clin Pract Endocrinol Metab,2006,2(3):160-171.
[11] Ng P C,Henikoff S.SIFT:Predicting amino acid changes that affect protein function[J].Nucleic Acids Res,2003,31(13):3812-3814.
[12] Adzhubei I A,Schmidt S,Peshkin L,et al.A method and server for predicting damaging missense mutations[J].Nat Methods,2010,7(4):248-249.
[13]Schwarz J M,Rodelsperger C,Schuelke M,et al.MutationTaster evaluates disease-causing potential of sequence alterations[J].Nat Methods,2010,7(8):575-576.
[14]Kim S H,Hu Y,Cadman S,et al.Diversity in fibroblast growth factor receptor 1 regulation:learning from the investigation of Kallmann syndrome[J].J Neuroendocrinol,2008,20(2):141-163.
[15] Tsuge T,Shimokawa T,Horikoshi S,et al.Polymorphism in promoter region of Fcalpha receptor gene in patients with IgA nephropathy[J].Hum Genet,2001,108(2):128-133.
[16] Yamada R,Tanaka T,Unoki M,et al.Association between a single-nucleotide polymorphism in the promoter of the human interleukin-3 gene and rheumatoid arthritis in Japanese patients,and maximum-likelihood estimation of combinatorial effect that two genetic loci have on susceptibility to the disease[J].Am J Hum Genet,2001,68(3):674-685.
[17]Cole L W,Sidis Y,Zhang C,et al.Mutations in prokineticin 2 and prokineticin receptor 2 genes in human gonadotrophin-releasing hormone deficiency:molecular genetics and clinical spectrum[J].J Clin Endocrinol Metab,2008,93(9):3551-3559.
[18] Badano J L,Katsanis N.Beyond Mendel:an evolving view of human genetic disease transmission[J].Nat Rev Genet,2002,3(10):779-789.
[19] Carlton V E,Harris B Z,Puffenberger E G,et al.Complex inheritance of familial hypercholanemia with associated mutations in TJP2 and BAAT[J].Nat Genet,2003,34(1):91-96.
[20] Pitteloud N,Quinton R,Pearce S,et al.Digenic mutations account for variable phenotypes in idiopathic hypogonadotropic hypogonadism[J].J Clin Invest,2007,117(2):457-463.
[21]Gonzalez-Martinez D,Kim S H,Hu Y,et al.Anosmin-1 modulates fibroblast growth factor receptor 1 signaling in human gonadotropin-releasing hormone olfactory neuroblasts through a heparan sulfate-dependent mechanism[J].J Neurosci,2004,24(46):10384-10392.
[22] Dode C,Hardelin J P.Kallmann syndrome:fibroblast growth factor signaling insufficiency?[J].J Mol Med(Berl),2004,82(11):725-734.
[23]Gao Y Q,Danciger M,Ozgul R K,et al.Association of the Asn306Ser variant of the SP4 transcription factor and an intronic variant in the beta-subunit of transducin with digenic disease[J].Mol Vis,2007,13:287-292.
[24]Muntoni F,Bonne G,Goldfarb L G,et al.Disease severity in dominant Emery Dreifuss is increased by mutations in both emerin and desmin proteins[J].Brain,2006,129(Pt 5):1260-1268.
[25]Tosch V,Rohde H M,Tronchere H,et al.A novel PtdIns3P and PtdIns(3,5)P2 phosphatase with an inactivating variant in centronuclear myopathy[J].Hum Mol Genet,2006,15(21):3098-3106.