2009 年起，中國中醫(yī)科學(xué)院中國醫(yī)史文獻(xiàn)研究所、中國科學(xué)院大學(xué)、北京中醫(yī)藥大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院三家單位的研究人員開展合作，對中醫(yī)藥起源問題進(jìn)行多學(xué)科綜合研究。中醫(yī)藥起源是一個漫長的進(jìn)化過程，早期的醫(yī)學(xué)古籍中有“神農(nóng)嘗百草”、“藥食同源”等記載，但至今仍缺少實物證據(jù)，無法真正揭示中醫(yī)藥的起源和發(fā)展過程。

20 世紀(jì)20 年代起，以田野調(diào)查發(fā)掘工作為基礎(chǔ)的考古學(xué)在中國出現(xiàn)，之后隨著考古學(xué)尤其是史前考古學(xué)的發(fā)展，為中醫(yī)藥起源研究提供了新的資料與證據(jù)。通過對近百年的考古發(fā)掘報告進(jìn)行研究，研究小組認(rèn)為中醫(yī)藥起源不是偶然的，它既非源于動物本能，也不是起源于圣人或是巫術(shù)，它是中華民族先民數(shù)十萬年甚至上百萬年生命意識的積累所成。研究結(jié)果顯示，在距今5000 年或更早的新石器時代，黃河及長江中下游流域先民們已經(jīng)有了醫(yī)療實踐活動?？脊艑W(xué)家在新石器時代遺址中發(fā)現(xiàn)了大量與醫(yī)療有關(guān)的用具以及植物遺存，其中有些見于古籍，有些則為至今沿用的中藥，特別是1990 年杭州蕭山跨湖橋遺址(距今約8000～7000 年間)出土的稍有殘缺的繩紋小陶釜，被認(rèn)為有可能是煎藥罐，成為早期人類使用藥材及煎藥的物證。

除頗具意義的煎藥罐外，大量的植物遺存也提供了有力的證據(jù)。如在河姆渡和良渚文化時期的各遺址文化堆積中，多發(fā)現(xiàn)有屬于人工栽培的稻谷遺存。除水稻外，先民們還從事蔬菜、瓜果及一些油料作物的種植，如湖州錢山漾遺址出土了葫蘆、花生、芝麻、蠶豆、甜瓜子、兩角菱、毛桃核、酸棗核等遺物，有些是野生植物的果實，有些可能是人工種植的。農(nóng)作物品種的增多與農(nóng)業(yè)生產(chǎn)范圍的擴(kuò)大說明了先民們在這一時期存在發(fā)現(xiàn)、栽種、利用中藥材的可能性，而中醫(yī)藥學(xué)界也普遍認(rèn)為藥食同源。河姆渡文化和良渚文化時期的地理環(huán)境、社會經(jīng)濟(jì)生產(chǎn)情況以及現(xiàn)存的遺物均為此提供了最有價值的依據(jù)。