文/張 曄

人體全基因測序有望只需1000美元在1天時間內(nèi)完成

文/張 曄

在人體的基因中，有30億個堿基對，每個人的不同，就是由堿基對排列差異造成的。要想測出它的全部序列，現(xiàn)在的技術(shù)最少需要兩三個星期，500萬美元。由東南大學(xué)擔(dān)綱的第三代人類基因測序關(guān)鍵技術(shù)研究取得重要進(jìn)展，人體全基因測序有望只需1000美元、在1天時間內(nèi)完成。這是記者5月24日從在南京舉行的“第十一屆設(shè)計與制造前沿國際會議”上獲悉的。

“人類基因組計劃在2003年完成人體全序列的基因測定，但第一代測序方法高昂的時間和經(jīng)濟(jì)成本均令人望而生畏?！苯K省微納生物醫(yī)療器械設(shè)計與制造重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任、東南大學(xué)機(jī)械工程學(xué)院副院長陳云飛介紹，第一代基因測序方法歷時12年、耗資數(shù)十億美元，近兩年迅猛發(fā)展的第二代測序儀讓人類基因組重測序的費(fèi)用降低到10萬美元以下，測序時間也縮短到6個月。但是，這樣的價格和時間，對于個人用戶來說仍然太高，因而極大地限制了臨床應(yīng)用和基礎(chǔ)理論研究。

2004年，美國國家人類基因組研究所啟動了“千元基因組測序研究項(xiàng)目”，目的是讓人類基因組測序費(fèi)用降至1000美元以下。2006年，依托東南大學(xué)的江蘇省微納生物醫(yī)療器械設(shè)計與制造重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，開展了“基于微納制造的第三代基因測序系統(tǒng)”研究。

“第一代、第二代基因測序使用的都是化學(xué)方法，我們采取的是物理方法，重點(diǎn)之一是研制能做納米孔的樣機(jī)?！标愒骑w舉了個例子，“DNA在人體細(xì)胞里，就像頭發(fā)絲一樣團(tuán)成一團(tuán)，如果能把它們拉直，就能清楚地看到基因序列是如何排列的?！?/p>

關(guān)鍵問題是，怎么把DNA序列拉直？陳云飛說，科研人員想到一個辦法，那就是做一個非常小的孔，就像穿針眼一樣，讓基因從這個小孔里一一穿過。

多小的孔才合適呢？陳云飛說，一根頭發(fā)絲的直徑有7萬納米，而這個小孔的直徑，目標(biāo)是1納米。

從2000年開始，課題組的科研人員經(jīng)過反復(fù)實(shí)驗(yàn)，選擇了氮化硼和石墨烯作為原材料進(jìn)行加工?！澳壳耙呀?jīng)做出2納米直徑的小孔了，可以開始測量短序列基因的測定。”陳云飛說。

科研人員將納米孔貼在一個膜上，將這個膜插入溶液中，隔開溶液池，通上電極之后，DNA在溶液里是帶負(fù)電的，它就會向正電極一側(cè)游，因?yàn)榭缀苄?，堿基對只能一個一個地從這個孔內(nèi)過去，通過測定堿基對經(jīng)過納米孔時的電流，來確定堿基對的大小、類型等，完成基因測序。

陳云飛說，這就像一個人要經(jīng)過一道門，胖子過去時帶動的風(fēng)大，瘦子過去時帶動的風(fēng)就小，人們可以通過測量風(fēng)的大小來判斷這個人的體型。

據(jù)介紹，這項(xiàng)技術(shù)的難點(diǎn)在于“針眼”材料的選擇，以及堿基對通過“針眼”時電流大小的測定。目前，這兩道坎均已被突破，下一步，他們將繼續(xù)研究縮小“洞”的大小，提高測序精度、縮短測序時間，爭取在一到兩年內(nèi)實(shí)現(xiàn)“一滴血一天測出人體全基因序列”的目標(biāo)，縮短找到治療疾病方法的時間。

來源：《中國科技網(wǎng)-科技日報》