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      中醫(yī)數(shù)據(jù)挖掘算法研究進(jìn)展*

      2015-04-14 11:17:30張鑫朱明峰杜建強(qiáng)郝竹林王國龍江西中醫(yī)藥大學(xué)計算機(jī)學(xué)院南昌330004
      關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)挖掘中醫(yī)藥算法

      ★ 張鑫 朱明峰 杜建強(qiáng)郝竹林 王國龍 (江西中醫(yī)藥大學(xué)計算機(jī)學(xué)院 南昌330004)

      中醫(yī)數(shù)據(jù)挖掘算法研究進(jìn)展*

      ★ 張鑫 朱明峰 杜建強(qiáng)**郝竹林 王國龍 (江西中醫(yī)藥大學(xué)計算機(jī)學(xué)院 南昌330004)

      伴隨大數(shù)據(jù)時代的到來和數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)的興起,中醫(yī)數(shù)據(jù)挖掘也逐步走向熱門。本文對數(shù)據(jù)挖掘進(jìn)行系統(tǒng)概述,著重對中醫(yī)數(shù)據(jù)挖掘的研究進(jìn)展進(jìn)行了具體的趨勢分析,對相關(guān)方法的研究進(jìn)行了梳理,以期為相關(guān)科研工作者進(jìn)行中醫(yī)領(lǐng)域數(shù)據(jù)挖掘的研究提供有價值的文獻(xiàn)參考。

      數(shù)據(jù)挖掘;中醫(yī);決策樹;隨機(jī)森林;深度學(xué)習(xí)

      千百年來累積的大量中醫(yī)數(shù)據(jù)資料是歷史傳承下來的寶貴財富,隨著數(shù)據(jù)庫技術(shù)的發(fā)展,基于數(shù)據(jù)庫的中醫(yī)信息管理變得越來越便利,且聚集其中的中醫(yī)藥數(shù)據(jù)也在持續(xù)激增,這些海量中醫(yī)藥數(shù)據(jù)背后必隱藏許多有價值的信息。通過對大規(guī)模中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的挖掘分析,能夠為中醫(yī)診斷提供決策支撐,探索中藥配伍規(guī)律,對中醫(yī)研究產(chǎn)生重大意義;也能促進(jìn)中醫(yī)文獻(xiàn)古籍研究,促進(jìn)中醫(yī)信息的數(shù)字化、自動化和智能化的全面快速發(fā)展。當(dāng)前,數(shù)據(jù)倉庫、人工智能、機(jī)器學(xué)習(xí)等數(shù)據(jù)挖掘相關(guān)學(xué)科帶動了數(shù)據(jù)挖掘的發(fā)展,因此也推動了數(shù)據(jù)挖掘在中醫(yī)領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用并迅速走向熱門。

      1 數(shù)據(jù)挖掘與中醫(yī)數(shù)據(jù)挖掘

      1.1 數(shù)據(jù)挖掘 所謂數(shù)據(jù)挖掘,是指從大量的、不完全的、有噪聲的、模糊的實(shí)際應(yīng)用數(shù)據(jù)中,提取隱含在其中的、人們事先未知的但是有潛在應(yīng)用價值的信息和知識的過程[1]。數(shù)據(jù)挖掘是一門涉及面很廣的交叉學(xué)科,包含機(jī)器學(xué)習(xí)、數(shù)理統(tǒng)計、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫、模式識別、粗糙集、模糊數(shù)學(xué)等相關(guān)技術(shù)。

      1.2 中醫(yī)數(shù)據(jù)挖掘 近十幾年,隨著數(shù)據(jù)庫技術(shù)的發(fā)展和中醫(yī)領(lǐng)域數(shù)據(jù)的暴漲,數(shù)據(jù)挖掘方法開始引入到中醫(yī)藥研究上,產(chǎn)生中醫(yī)數(shù)據(jù)挖掘。不同于傳統(tǒng)科學(xué)數(shù)據(jù),中醫(yī)藥數(shù)據(jù)有自己的特點(diǎn)。胡金亮[2]歸納其特點(diǎn)包括:癥狀的模糊性、證候的多態(tài)性、證候與癥狀間的非線性、中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的多維性,以及挖掘的復(fù)雜性?;诖祟愄攸c(diǎn),傳統(tǒng)簡單的統(tǒng)計分析工具已經(jīng)不能滿足中醫(yī)現(xiàn)代化、信息化發(fā)展的根本需求。而中醫(yī)數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)正適合于復(fù)雜多維的數(shù)據(jù)分析,運(yùn)用相應(yīng)的算法可以從海量的中醫(yī)藥數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)知識。

      1.3 常用中醫(yī)數(shù)據(jù)挖掘分析方法 中醫(yī)藥研究過程中針對不同子領(lǐng)域的分析模式可選用不同的數(shù)據(jù)挖掘方法,常用的有關(guān)聯(lián)規(guī)則、聚類分析、人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)、決策樹等方法,還有一些其他分析方法,包括遺傳算法、貝葉斯信念網(wǎng)絡(luò)、小波變換、主成分分析、時間序列分析和孤立點(diǎn)分析等。岳路[3]將決策樹算法應(yīng)用于小兒肺炎中醫(yī)辨證,構(gòu)建出一種小兒肺炎分類模型,該模型中小兒肺炎辨證分類的準(zhǔn)確率達(dá)到80%,可用于臨床輔助診斷。馬金剛[4]基于關(guān)聯(lián)規(guī)則研究方劑配伍的規(guī)律,所得到的分析結(jié)果與中醫(yī)理論和臨床經(jīng)驗總結(jié)總體相符,為進(jìn)一步研究提供了依據(jù)。郜巒[5]借助聚類分析技術(shù),初步揭示了新安醫(yī)家對于中風(fēng)病病因病機(jī)、辨證論治的獨(dú)特見解,挖掘出其臨床治療思路,為臨床防治中風(fēng)病提供了一定的借鑒作用。楊濤[6]在應(yīng)用人工神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)探討心系病位、病癥特性與基礎(chǔ)證的相關(guān)性研究中發(fā)現(xiàn),BP神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能較好地模擬心系病位、病癥特性與基礎(chǔ)證的非線性映射,此類研究成果可以進(jìn)一步應(yīng)用于五臟系統(tǒng)辨證體系中,為病癥規(guī)范化和診斷信息化提供參考。謝家宇[7]借助連續(xù)小波變換算法分析脈象信號,能較好地從人體的脈象信號中提取人體病變的特征信息。

      2 中醫(yī)數(shù)據(jù)挖掘的研究進(jìn)展

      近年來,為進(jìn)一步促進(jìn)中醫(yī)領(lǐng)域的信息化、智能化發(fā)展,數(shù)據(jù)挖掘在中醫(yī)藥相關(guān)研究上越來越深入。筆者著重對目前中醫(yī)數(shù)據(jù)挖掘的研究方向進(jìn)行了具體分析,其主要呈現(xiàn)以下三個趨勢。

      2.1 改進(jìn)傳統(tǒng)挖掘算法

      2.1.1 基于傳統(tǒng)經(jīng)典算法局部改進(jìn) 即改進(jìn)傳統(tǒng)經(jīng)典醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)挖掘算法,彌補(bǔ)算法的某些不足,以提高算法的效率和精度。馬建[8]針對傳統(tǒng)貝葉斯算法在訓(xùn)練數(shù)據(jù)方面未考慮數(shù)據(jù)屬性間的相關(guān)性而造成對數(shù)據(jù)分析的冗余、資源浪費(fèi)以及分析效率下降等不足進(jìn)行改進(jìn),并結(jié)合中醫(yī)醫(yī)案數(shù)據(jù)復(fù)雜、易缺失等特點(diǎn),應(yīng)用改進(jìn)的貝葉斯網(wǎng)絡(luò)算法對“內(nèi)生五邪”醫(yī)案進(jìn)行中醫(yī)規(guī)律的挖掘和分析,通過與傳統(tǒng)的貝葉斯網(wǎng)絡(luò)方法分類的結(jié)果相比較,發(fā)現(xiàn)前者具有更高的分析準(zhǔn)確率。趙丹丹[9]以治療糖尿病的中藥方劑數(shù)據(jù)為研究樣本,通過改進(jìn)的Apriori算法來發(fā)現(xiàn)中藥配伍規(guī)律,從而提取出使用中藥治療糖尿病的整體用藥規(guī)律。高麗君[10]針對缺失數(shù)據(jù)處理和決策樹分類對噪聲數(shù)據(jù)敏感的不足,提出了基于灰色關(guān)聯(lián)分析理論的填充算法,和基于尺度函數(shù)的變精度粗糙集屬性選擇標(biāo)準(zhǔn)的決策樹改進(jìn)算法,并將其嵌入冠心病的中醫(yī)輔助診療系統(tǒng),實(shí)現(xiàn)對冠心病數(shù)據(jù)集的中醫(yī)診斷證型分類。張志順[11]結(jié)合中醫(yī)舌象的特點(diǎn),利用可克服小波卷積濾波因非零軸對稱而導(dǎo)致邊緣重疊現(xiàn)象的改進(jìn)型小波算法,對舌象圖像邊緣進(jìn)行檢測,從而解決了傳統(tǒng)邊緣檢測算法對去除噪聲和獲取精細(xì)邊緣之間的矛盾,獲得比較理想的邊緣檢測效果。

      2.1.2 組合傳統(tǒng)經(jīng)典挖掘算法 即撿取兩種或兩種以上數(shù)據(jù)挖掘算法,吸收其算法優(yōu)點(diǎn),彌補(bǔ)某種算法的不足,以取得更好的挖掘效果。為了提高神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的學(xué)習(xí)速度和泛化能力,謝錚桂[12]構(gòu)建的中醫(yī)舌診智能診斷系統(tǒng)采用了一種改進(jìn)的基于免疫聚類的RBF神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)算法,可以通過學(xué)習(xí)訓(xùn)練集樣本中每個病例的舌象特征參數(shù),從而得出相應(yīng)的病證。吳嘉瑞[13]采用關(guān)聯(lián)規(guī)則Apriori算法和復(fù)雜系統(tǒng)熵聚類等無監(jiān)督數(shù)據(jù)挖掘算法,分析處方中藥物使用頻次及藥物之間的關(guān)聯(lián)規(guī)則、處方規(guī)律,探討顏正華教授治療氣滯證的用藥經(jīng)驗,驗證了其學(xué)術(shù)思想。吳蕓[14]同樣將組合算法用于舌診研究,考慮到神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)優(yōu)化程度受到訓(xùn)練樣本種類和數(shù)量的限制,其利用遺傳算法尋優(yōu)的特點(diǎn)對神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)權(quán)值和結(jié)構(gòu)等多方面進(jìn)行優(yōu)化,使中醫(yī)舌診神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)能夠在滿足封閉性的同時也具有良好的開放性,提高其臨床實(shí)用能力。

      2.2 引進(jìn)新的挖掘算法和技術(shù) 引入中醫(yī)領(lǐng)域的傳統(tǒng)數(shù)據(jù)挖掘方法多是基于分類、聚類以及關(guān)聯(lián)分析等思想,近年除分類聚類之外,一些新型的數(shù)據(jù)挖掘算法也被運(yùn)用到此領(lǐng)域,包括隨機(jī)森林和深度學(xué)習(xí)等當(dāng)前熱門算法,以及數(shù)據(jù)挖掘可視化技術(shù)等熱門技術(shù),這也是中醫(yī)領(lǐng)域數(shù)據(jù)挖掘發(fā)展的第二個方向。

      2.2.1 隨機(jī)森林 隨機(jī)森林(RF)是Breiman提出基于統(tǒng)計學(xué)習(xí)理論的組合分類器算法,此方法是利用bootsrap重抽樣法從原始樣本中隨機(jī)抽取自助樣本集,對每個自助樣本集構(gòu)建決策樹模型,然后組合多棵樹的預(yù)測,通過投票輸出最終預(yù)測結(jié)果[15]。大量實(shí)踐證明,隨機(jī)森林都有比較好的預(yù)測精度及良好的魯棒性,因此隨機(jī)森林在中醫(yī)領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用。洪燕珠[16]利用隨機(jī)森林方法對慢性疲勞(CF)進(jìn)行中醫(yī)癥候要素特征癥狀的提取,得到CF的4個癥候要素癥狀集的模型均達(dá)到94%以上,此結(jié)果表明隨機(jī)森林對CF癥候要素具有良好的分類性能。李雨[17]以中藥藥性為響應(yīng)變量,基原性狀為預(yù)測變量,分別用Logistic回歸、支持向量機(jī)、決策樹、隨機(jī)森林、主成分-線性判別和偏最小二乘等六種方法建立判別模型,對植物性中藥進(jìn)行藥性判別,并比較各種模型的判別效果,發(fā)現(xiàn)隨機(jī)森林判別分析的準(zhǔn)確率和預(yù)測準(zhǔn)確率均最高。

      2.2.2 深度學(xué)習(xí) 深度學(xué)習(xí)是一種新興的多層神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)算法,又被稱為無監(jiān)督的特征學(xué)習(xí)。深度學(xué)習(xí)結(jié)構(gòu)特征是含多隱含層的多層感知器,通過組合低層特征形成更加抽象的高層表示(屬性類別或特征),以發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)的分布式特征[18]。通過深度學(xué)習(xí),可實(shí)現(xiàn)復(fù)雜函數(shù)的逼近,能夠從少數(shù)樣本集中學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)集本質(zhì)特征。王立文[19]以慢性胃炎患者中醫(yī)問診數(shù)據(jù)為研究樣本,從挖掘樣本特征之間關(guān)系和挖掘類別標(biāo)簽之間關(guān)系兩個角度出發(fā),采用二類相關(guān)和深度置信網(wǎng)絡(luò),或深度玻爾茲曼機(jī)模型的基于深度學(xué)習(xí)的多標(biāo)記學(xué)習(xí)法,分別建立深度學(xué)習(xí)和條件隨機(jī)場模型,對中醫(yī)慢性胃炎患者問診數(shù)據(jù)進(jìn)行訓(xùn)練和預(yù)測,得到五個常見指標(biāo)下的實(shí)驗結(jié)果符合中醫(yī)理論,明顯優(yōu)于其他常見方法。

      2.2.3 數(shù)據(jù)挖掘可視化 可視化數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)是可視化技術(shù)和數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)的有機(jī)結(jié)合,是應(yīng)用計算機(jī)圖形學(xué)、圖像處理技術(shù)等,將數(shù)據(jù)挖掘的源數(shù)據(jù)、中間結(jié)果和最終結(jié)果轉(zhuǎn)換成直觀、易于理解的圖形或圖像的方式,并進(jìn)行交互處理的理論、方法和技術(shù)[20]??梢暬瘮?shù)據(jù)挖掘技術(shù)通過觀察數(shù)據(jù)在多重維數(shù)和圖形窗體中的存在狀態(tài),可以直觀、迅速揭示數(shù)據(jù)趨勢和相互聯(lián)系的特點(diǎn),使其應(yīng)用頗為廣泛。王玫[21]將可視化數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)應(yīng)用于HIS中的電子病歷信息,可以幫助醫(yī)生更直觀更方便地分析和獲得隱藏在病歷數(shù)據(jù)中的信息和規(guī)律。支雅男[22]運(yùn)用數(shù)據(jù)挖掘方法將中醫(yī)古籍中的龐大數(shù)據(jù)信息進(jìn)行可視化,以FCA理論為基礎(chǔ),借助概念格為可視化工具,為《傷寒論》中7個方劑集合構(gòu)建屬性偏序結(jié)構(gòu)圖,通過此圖可以直觀顯示配伍研究與量效關(guān)系研究之間緊密的聯(lián)系。

      2.3 拓展中醫(yī)藥數(shù)據(jù)挖掘的應(yīng)用領(lǐng)域 第三個趨勢是擴(kuò)展經(jīng)典算法在中醫(yī)藥數(shù)據(jù)領(lǐng)域的應(yīng)用。中醫(yī)領(lǐng)域頗廣,數(shù)據(jù)挖掘可應(yīng)用的方向很多,也有很多學(xué)者將經(jīng)典且研究很深的挖掘算法引入到中醫(yī)數(shù)據(jù)研究的各個領(lǐng)域。主要有四大方向:一是在中醫(yī)診斷領(lǐng)域,體現(xiàn)在中醫(yī)四診客觀化、中醫(yī)癥候規(guī)范化和中醫(yī)辨證智能化;二是在中藥領(lǐng)域的研究,主要包括方劑藥對和中藥配伍規(guī)律探索、中藥藥性分類判斷、中藥藥效量效分析等;三是中醫(yī)信息學(xué)領(lǐng)域,包括中醫(yī)信息處理,中醫(yī)文獻(xiàn)古籍、中醫(yī)醫(yī)案及名老中醫(yī)診療經(jīng)驗研究;四是中醫(yī)系統(tǒng)平臺研究,包括中醫(yī)輔助診斷系統(tǒng)、中醫(yī)診斷效果評估系統(tǒng),以及基于檢索的中醫(yī)文獻(xiàn)查詢系統(tǒng)研究。關(guān)聯(lián)分析在中醫(yī)領(lǐng)域的應(yīng)用極其廣泛,代治國[23]將關(guān)聯(lián)分析中的頻繁模式增長算法(FP-Growth算法)用于中醫(yī)辨證診斷中經(jīng)驗數(shù)據(jù)挖掘,即從病癥與辨證之間、辨證與處方之間、病癥與處方之間挖掘歸納中醫(yī)專家的辨證規(guī)律并模擬其診斷過程,其結(jié)果符合傳統(tǒng)典型的中醫(yī)理論。張潤順[24]通過名老中醫(yī)肝脾不調(diào)醫(yī)案,應(yīng)用關(guān)聯(lián)規(guī)則對其治療肝脾不調(diào)證的用藥規(guī)律進(jìn)行分析。李文林[25]將關(guān)聯(lián)規(guī)則用于分析明清古籍中疫病文獻(xiàn)的藥-證關(guān)系,其結(jié)果與中醫(yī)疫病的治法及用藥基本相符,能初步揭示明清醫(yī)家對疫病診療的學(xué)術(shù)思想和治疫經(jīng)驗。

      3 結(jié)束語

      中醫(yī)的現(xiàn)代化、信息化、智能化是中醫(yī)迅速發(fā)展并走向世界的必行之路。數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)在中醫(yī)領(lǐng)域的應(yīng)用,極大地推動了中醫(yī)藥研究的規(guī)范化進(jìn)程。目前,由于中醫(yī)藥數(shù)據(jù)自身的特殊性,基于此領(lǐng)域的數(shù)據(jù)挖掘研究比較有限,因此中醫(yī)數(shù)據(jù)挖掘有廣闊的研究空間。如何結(jié)合中醫(yī)藥數(shù)據(jù)的特點(diǎn),在算法和技術(shù)上有更多突破,以提高挖掘的效率和準(zhǔn)確性,同時也將更多熱門算法引入到中醫(yī)相關(guān)領(lǐng)域,也是未來研究的關(guān)鍵點(diǎn)。

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      Research Progress of Data M ining A lgorithm in Traditional Chinese M edicine

      ZHANG Xin,ZHU M ing-feng,DU Jian-qiang,HAO Zhu-lin,WANG Guo-long
      School of Computer Science,JiangxiUniversity of Traditional Chinese Medicine,Nanchang 330004,China.

      With the arrival of the era of big data and the rise of data mining techniques,traditional Chinese medicine data mining gradually becomes popular.This articlemade a system summary of the datamining,putemphasis on the detailed trend analysis of the research progress of traditional Chinesemedicine datamining,and sorted the relevantmethods,which provided an important reference value of literature for the relevant research workers on traditional Chinesemedicine datamining.

      Datamining;Traditional Chinese Medicine;Decision tree;Random forest;Deep learning

      R2-03

      A

      2014-03-11)編輯:萬崇毅

      江西省教育廳青年基金項目(GJJ12539);江西省衛(wèi)生廳中醫(yī)藥科研計劃項目(2013A060);江西中醫(yī)藥大學(xué)重點(diǎn)學(xué)科青年教師培養(yǎng)資助計劃項目(2013jzzdxk019)。

      **通信作者:杜建強(qiáng)。E-mail:jianqiang_du@163.com。

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