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      牛DAZL基因序列分析、克隆及表達(dá)載體構(gòu)建

      2015-04-17 21:00:47鄭鵬鄭曉萌于磊
      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年1期
      關(guān)鍵詞:克隆

      鄭鵬 鄭曉萌 于磊 等

      摘要:利用生物信息學(xué)方法對牛DAZL基因的一級結(jié)構(gòu)和同源性進行分析,并根據(jù)牛DAZL基因序列設(shè)計引物來克隆該基因,通過酶切、連接、轉(zhuǎn)化構(gòu)建該基因的表達(dá)載體,成功克隆到了DAZL基因。生物信息學(xué)分析結(jié)果顯示,哺乳動物的DAZL基因同源性很高。此外,構(gòu)建了牛DAZL基因的帶綠色熒光蛋白的真核表達(dá)質(zhì)粒pEGFP-N3-DAZL。

      關(guān)鍵詞:DAZL基因;序列;克??;表達(dá)載體

      中圖分類號: S823.3文獻標(biāo)志碼: A文章編號:1002-1302(2015)01-0034-03

      收稿日期:2014-03-21

      基金項目:黑龍江省普通高等學(xué)校動物遺傳育種與繁殖重點實驗室開放課題(編號:GXZDSYS-2012-07);東北農(nóng)業(yè)大學(xué)博士啟動基金(編號:2012RCB27)。

      作者簡介:鄭鵬(1979—),男,黑龍江蘭西人,博士,講師,主要從事動物繁殖生理與繁殖技術(shù)研究。E-mail:zh-96128@163.com。

      通信作者:張貴學(xué),博士,教授,博士生導(dǎo)師,主要從事動物繁殖生理與繁殖技術(shù)研究。E-mail: gxzhang@neau.edu.cn。Deleted in azoospermia like (DAZL)基因是DAZ基因家族中的一員,最早克隆于蠅類的睪丸組織,是一個在進化上高度保守的基因,在脊椎動物的生殖細(xì)胞中特異表達(dá),是生殖細(xì)胞形成所必須的調(diào)控因子。DAZL通過RNA識別基序與mRNA結(jié)合,并以多聚體的方式在翻譯水平發(fā)揮作用[1]。DAZL基因是BOULE基因通過基因修飾、倍增而來,廣泛分布于人類、鼠、爪蟾、蠑螈、斑馬魚、青魚等物種中[2]。許多物種的DAZL同系物對生殖細(xì)胞的分化都是非常重要的。DAZL基因的突變、微缺失以及表達(dá)下調(diào)均可引起生精障礙,導(dǎo)致雄性不育[3]。Ruggiu等發(fā)現(xiàn),與正常鼠相比,雜合DAZL基因缺陷鼠的畸形精子率增高,但仍有正常生育力,而純合鼠表現(xiàn)為嚴(yán)重的生殖細(xì)胞減少,成熟阻滯,睪丸體積減小,不能生育[4]。此外,Schrans-Stassen等研究證實,DAZL基因敲除鼠表現(xiàn)出雙睪丸干細(xì)胞數(shù)目減少、以及減數(shù)分裂早期精原細(xì)胞分化失敗,從而導(dǎo)致不育[5]。因此,研究DAZL基因及其編碼蛋白對探索配子發(fā)生和成體生殖缺陷及修復(fù)具有重要意義。本試驗主要對DAZL基因進行克隆和開展生物信息學(xué)分析,并構(gòu)建牛DAZL基因真核表達(dá)載體pEGFP-N3-DAZL,以期為探索DAZL基因的功能和在精子發(fā)生過程中的作用提供前期基礎(chǔ)和試驗依據(jù)。

      1材料與方法

      1.1試驗材料

      成年牛(約40月齡)睪丸組織,取自哈爾濱成高子屠宰場;Trizol Reagent和lipofectamine2000購自Invitrogen公司,反轉(zhuǎn)錄試劑盒購自ABI公司,pEASY-T1 Simple Cloning Kit購自北京全式金生物技術(shù)有限公司,T4 DNA連接酶購自NEB公司 DMEM/F12、胎牛血清購自Gibco公司,PrimeSTAR HS DNA聚合酶、限制性內(nèi)切酶EcoRⅠ、BamHⅠ及其他常規(guī)試劑均購自大連寶生物公司。

      1.2試驗方法

      1.2.1牛DAZL基因的生物信息學(xué)分析利用DNAStra軟件分析DAZL的一級結(jié)構(gòu);采用Clustal X進行DAZL基因同源性多重比對;采用MEGA4程序構(gòu)建分子進化樹。

      1.2.2牛DAZL基因真核表達(dá)載體的構(gòu)建參照GenBank牛DAZL基因序列(NM_001081725)設(shè)計其編碼區(qū)特異性克隆引物F:CGGAATTCTATGTCTGCTGCAAATCCTGAGACTC和R:CGGATCCAACAGACTTAAGCACTGCCCGACTT(上、下游分別引入EcoRⅠ和BamHⅠ酶切位點),引物由華大基因公司合成。利用Trizol法提取成牛睪丸組織總RNA,并反轉(zhuǎn)錄成cDNA,以其為模板,利用高保真Prime-STAR HS DNA聚合酶對牛DAZL基因全長編碼區(qū)進行RT-PCR擴增,目的片段經(jīng)凝膠回收加A后連接到pEASY-T1 simple載體上,進一步亞克隆到pEGFP-N3載體上。構(gòu)建好的質(zhì)粒經(jīng)EcoRⅠ和BamHⅠ雙酶切鑒定后,送往北京華大公司測序。

      2結(jié)果

      2.1DAZL基因的生物信息學(xué)分析

      2.1.1DAZL基因一級結(jié)構(gòu)分析牛DAZL基因的CDS全長為888 bp,由264個腺嘌呤(A)、194個胞嘧啶(C)、187個鳥嘌呤(G)和243個胸腺嘧啶(T)組成,4種堿基的含量依次為29.73%、21.85%、21.06%、27.36%。該基因ORF位于 1 888 bp,編碼295個氨基酸,含29個強堿性氨基酸殘基(K,R),24個強酸性氨基酸(D,E),82個疏水性氨基酸殘基(A、I、L、F、W、V),103個極性氨基酸殘基(N、C、Q、S、T、Y),分子量為33.02 Ku,等電點為8.78,脯氨酸、絲氨酸、纈氨酸所占比例較高。

      2.1.2DAZL基因同源性分析從NCBI的GenBank數(shù)據(jù)庫中選取人(Homo sapiens)、大鼠(Rattus norvegicus)、小鼠(Mus musculus)、牛(Bos taurus)、中國牦牛(domestic yak)、豬(Sus scrofa)、狨猴(Callithrix jacchus)、松鼠猴(Saimiri sciureus)、小黑猩猩(Pan paniscus)、獠狨(Saguinus oedipus)、原雞(Gallus gallus)共11個物種的DAZL基因,采用Clustal X進行多重比對,結(jié)果顯示牛與中國牦牛的同源性最高,為99%,與小鼠、人、狨猴、小黑猩猩、豬、獠狨、松鼠猴、大鼠、原雞的同源性分別為98%、97%、97%、97%、97%、96%、96%、92%、80%(圖1)。

      2.1.3分子進化樹構(gòu)建使用MEGA4程序,采用 Neighbor-Joining 算法,Bootstrap設(shè)為1 000,構(gòu)建分子進化樹,從樹的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)上來看,牛的DAZL基因與中國牦牛的關(guān)系最近,與大鼠和小鼠一同構(gòu)成了一個小群,同人、獠狨、豬共同構(gòu)成一個亞類群(圖2)。

      2.2DAZL基因編碼區(qū)的克隆

      提取的RNA進行反轉(zhuǎn)錄合成cDNA,檢測內(nèi)參基因和DAZL基因的表達(dá)情況,結(jié)果發(fā)現(xiàn)成年牛睪丸中有DAZL基因的表達(dá)。

      以成年牛睪丸組織cDNA為模板進行PCR擴增,擴增出1條與預(yù)期長度相符的片段,得到了DAZL基因的全部編碼區(qū)(圖3-A)。將擴增出與預(yù)期長度相符的片段進行膠回收,與PMD18-T載體連接、轉(zhuǎn)化,對構(gòu)建的載體進行PCR鑒定和EcoRⅠ、BamHⅠ雙酶切鑒定,結(jié)果顯示在902 bp處出現(xiàn)特異條帶(圖3-B、圖3-C),與預(yù)期的插入片段大小相符。

      2.3表達(dá)載體的制備與鑒定

      將DAZL-PMD18-T和PEGFP-N3進行EcoRⅠ和BamHⅠ雙酶切、膠回收,然后按摩爾比1 ∶1的量,用T4 DNA連接酶進行連接,得到構(gòu)建的載體,然后將構(gòu)建好的DAZL表達(dá)載體進行EcoRⅠ和BamHⅠ雙酶切及PCR鑒定,瓊脂糖凝膠檢測為所要片段大?。▓D4)。轉(zhuǎn)化,挑菌陽性克隆進行序列測定,測序正確的質(zhì)粒用于下一步的試驗。

      3討論

      不同物種DAZL基因具有高度的同源相似性,參與調(diào)控生殖細(xì)胞的發(fā)育和分化。有研究表明,DAZL基因的缺失或突變會引起精子發(fā)生過程中減數(shù)分裂阻滯,導(dǎo)致精子缺乏和男性不育[3]。小鼠DAZL基因突變可影響兩性生殖細(xì)胞的功能,DAZL基因敲除鼠表現(xiàn)出不育[5]。DAZL和BOULE都是DAZ家族的重要成員,二者都具有典型的RNA識別基序(RNA recognition motifs,RRM)和DAZ重復(fù)序列[6],能夠與一系列影響精子發(fā)生基因的mRNA結(jié)合,如CDC25A、TPX1、DDX4和TSSK3等[7],并以多聚體的方式在翻譯水平發(fā)揮作用。

      將目的基因超表達(dá)是研究基因功能的主要手段之一[8-9],即將目標(biāo)基因與合適的載體相連接,使其在體外或體內(nèi)過量表達(dá),觀察該基因超量表達(dá)后細(xì)胞或組織或機體所發(fā)生的表型變化,從而對該基因的功能作出評價。Yu等利用DAZL基因的超表達(dá)技術(shù),將胚胎干細(xì)胞誘導(dǎo)分化成精子樣細(xì)胞[10-11],可見DAZL基因是精子發(fā)生的一個主要基因。本試驗擴增牛DAZL基因的編碼區(qū),構(gòu)建了PEGFP-N3-DAZL表達(dá)載體,為進一步探討DAZL基因超表達(dá)的體細(xì)胞能否向精細(xì)胞方向分化、DAZL基因超表達(dá)的生殖干細(xì)胞能否加速分化形成精子奠定基礎(chǔ)。

      4結(jié)論

      本試驗成功構(gòu)建了牛DAZL基因的帶綠色熒光蛋白的真核表達(dá)質(zhì)粒pEGFP-N3-DAZL,為闡明DAZL基因調(diào)控精子發(fā)生的機制奠定基礎(chǔ)。

      參考文獻:

      [1]Moore F L,Jaruzelska J,Dorfman D M,et al. Identification of a novel gene,DZIP (DAZ-interacting protein),that encodes a protein that interacts with DAZ (deleted in azoospermia) and is expressed in embryonic stem cells and germ cells[J]. Genomics,2004,83(5): 834-843.

      [2]Saxena R,Brown L G,Hawkins T,et al. The DAZ gene cluster on the human Y chromosome arose from an autosomal gene that was transposed,repeatedly amplified and pruned[J]. Nature Genetics,1996,14(3):292-299.

      [3]Reynolds N,Cooke H J. Role of the DAZ genes in male fertility[J]. Reproductive BioMedicine Online,2005,10(1):72-80.

      [4]Ruggiu M,Saunders P T,Cooke H J. Dynamic subcellular distribution of the DAZL protein is confined to primate male germ cells[J]. Journal of Andrology,2000,21(3):470-477.

      [5]Schrans-Stassen B H,Saunders P T,Cooke H J,et al. Nature of the spermatogenic arrest in Dazl—/- mice[J]. Biology of Reproduction,2001,65(3):771-776.

      [6]Eberhart C G,Maines J Z,Wasserman S A. Meiotic cell cycle requirement for a fly homologue of human deleted in azoospermia[J]. Nature,1996,381(6585):783-785.

      [7]Liu Z,Li Q,Pan Z,et al. Comparative analysis on mRNA expression level and methylation status of DAZL gene between cattle-yaks and their parents[J]. Animal Reproduction Science,2011,126(3/4):258-264.

      [8]束婧婷,宋衛(wèi)濤,朱文奇,等. PGC-la基因在兩種類型雞骨骼肌間的表達(dá)差異[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報,2013,29(1):121-125.

      [9]蔣香菊,吳陽升,林嘉鵬,等. 綿羊AMH基因的克隆、序列分析與原核表達(dá)[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報,2013,29(6):1386-1392.

      [10]Yu Z,Ji P,Cao J,et al. Dazl promotes germ cell differentiation from embryonic stem cells[J]. Journal of Molecular Cell Biology,2009,1(2):93-103.

      [11]Kee K,Angeles V T,F(xiàn)lores M,et al. Human DAZL,DAZ and BOULE genes modulate primordial germ-cell and haploid gamete formation[J]. Nature,2009,462(7270):222-225.

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