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      人長鏈非編碼RNA基因SPRY4-IT1對肺癌細胞A549侵襲和遷移能力的影響

      2015-09-06 11:02:10柴松安文婷郭麗麗姜樂高志嵩李書軍
      中國肺癌雜志 2015年8期
      關(guān)鍵詞:劃痕質(zhì)粒測序

      柴松 安文婷 郭麗麗 姜樂 高志嵩 李書軍

      長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, lnc RNA)是一類長度大于200個核苷酸的非編碼RNA,在人類全基因組中有20萬-40萬種不同的lnc RNA。研究[1]表明lnc RNA可以通過多種方式影響編碼基因的表達,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程中起調(diào)控作用。SPRY4內(nèi)含子轉(zhuǎn)錄本1(SPRY4 intronic transcript 1, SPRY4-IT1)(基因號AK024556)是轉(zhuǎn)錄自SPRY4基因的第二個內(nèi)含子的長度為687個核苷酸的未剪接的、多聚腺苷酸化的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,最初在脂肪組織中得以鑒定,且過表達SPRY4-IT1在黑色素瘤中具有促進細胞生長、遷移和侵襲的作用[2],然而其在肺癌細胞中的作用尚未報道。本研究擬探討SPRY4-IT1對肺癌細胞A549侵襲和遷移能力的影響,并初步探索可能的作用機制。

      1 材料和方法

      1.1 材料 人肺癌細胞系A(chǔ)549、95C、95D、Calu-3、H125、H1299、H1975、SPC-A1由河北醫(yī)科大學(xué)第二醫(yī)院腫瘤中心提供;抗基質(zhì)金屬蛋白酶(matrix metalloproteinase, MMP)-2抗體、抗MMP-9抗體均購自武漢博士德生物有限公司;Transwell(8 μm孔徑)小室及Matrigel膠購自北京樂博生物科技有限公司,實驗中所用引物由廣州銳博生物有限公司設(shè)計并合成,檢測SPRY4-IT1在肺癌A549細胞中的表達,RT-PCR上游引物為5'-AGCCACATAAATTCAGCAGA-3',下游引物為5'-CGATGTAGTAGGATTCCTTT-CA-3',GAPDH上游引物為: 5'-GACTCATGACCACAGTCCATGC-3',GAPDH下游引物為: 5'-AGAGGCA-GGGATGATGTTCTG-3'。

      1.2 基因全長序列克隆 根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫SPRY4-IT1標準序列NR-002196.1設(shè)計引物,上游引物5'-TAAGCTTGTAGAGATGGGGGTTTCATCCTGTTGG-3',下游引物5'-ACTCGAGAAAGACTCCCTTTCCTTAAGCAGATTCAC-3’,循環(huán)條件:93oC預(yù)變性1 min,93oC變性30 s,65oC退火30 s,72oC延伸2 min,25個循環(huán),72oC終末延伸5 min,產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳分離擴增產(chǎn)物并進行產(chǎn)物純化回收,將產(chǎn)物連接T載體后,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細胞,通過藍白斑篩選,挑取白色克隆,擴增后進行酶切鑒定,同時送測序分析證實擴增片段的正確性。

      1.3 構(gòu)建真核表達載體 雙酶切pcDNA3.1載體和插入正確片段的T質(zhì)粒,分別純化回收目的片段。連接線性化pcDNA3.1載體和目的片段,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細胞,進行菌液PCR鑒定,并通過測序分析得到插入片段陽性克隆,命名為pcDNA3.1-SPRY4-IT1表達載體。用無內(nèi)毒素試劑盒大量制備質(zhì)粒。

      1.4 細胞培養(yǎng)和細胞轉(zhuǎn)染[3]使用含10%小牛血清的RPMI-1640培養(yǎng)液,在37oC、含5%CO2的培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)實驗中用到的肺癌細胞系。細胞生長融合度達到50%時,用Lipo 2000進行細胞轉(zhuǎn)染,分為轉(zhuǎn)染空載體pcDNA3.1組和轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1表達載體組。

      1.5 RT-PCR檢測肺癌細胞中SPRY4-IT1的表達 培養(yǎng)肺癌細胞,細胞生長融合度打70%時收集細胞,通過Trizol法提取細胞總RNA,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA,應(yīng)用上述RT-PCR引物擴增SPRY4-IT1,ABI7300檢測并分析各細胞中SPRY4-IT1的水平。

      1.6 細胞劃痕遷移實驗 將A549細胞以每孔5×105個接種于6孔板中,按照上述實驗分組轉(zhuǎn)染48 h后,細胞融合度達到90%以上,用無菌移液槍頭部劃線,置于37oC、5%CO2的細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h后光學(xué)顯微鏡下拍照,隨即取5個視野,測量劃痕兩側(cè)細胞間距取平均值,每組實驗設(shè)3個復(fù)孔,實驗重復(fù)3次。

      1.7 Transwell侵襲實驗 將A549細胞以每孔5×105個接種于6孔板中,細胞生長融合度為60%時按照上述實驗分組轉(zhuǎn)染空載體和pcDNA3.1-SPRY4-IT1過表達質(zhì)粒,轉(zhuǎn)染24 h后收集轉(zhuǎn)染后的各組細胞,重懸于無血清RPMI-1640培養(yǎng)液,以每孔5×104個細胞加入預(yù)鋪好Matrigel的Transwell小室上室內(nèi),下室加入500 μL完全培養(yǎng)液,置于37oC、5%CO2細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h 后多聚甲醛固定,0.05%結(jié)晶紫染色,400倍光學(xué)顯微鏡下計數(shù)穿膜細胞數(shù),隨即取10個視野,取平均值,每組實驗設(shè)3個復(fù)孔,實驗重復(fù)3次。

      1.8 免疫印跡實驗[4]收集細胞劃痕實驗后的各組細胞,用胰酶消化并收集,用含有蛋白酶抑制劑的RIPA裂解細胞,置于冰上,每5分鐘震搖細胞1次,共裂解30 min,15,000 rpm在4oC離心機上離心15 min,取上清,即為提取的細胞蛋白質(zhì)。通過BCA法檢測蛋白濃度,水浴變性蛋白,加入5×SDS-PAGE上樣緩沖液,加樣等量蛋白的蛋白裂解液,用10%的SDS-PAGE膠進行電泳分離,電轉(zhuǎn)印到尼龍膜上,用5%脫脂牛奶的PBS緩沖液室溫封閉1 h,一抗用1:1,000稀釋的抗人MMP-2、MMP-9單克隆抗體4oC過夜孵育,用PBS-Tween洗膜,室溫每次15 min,共3次;印跡膜用1:3,000的抗鼠IgG偶聯(lián)的辣根過氧化物酶作為二抗,室溫孵育1 h,用PBS-Tween洗膜,室溫每次15 min,共3次。用增強型化學(xué)發(fā)光液檢測試劑盒化學(xué)發(fā)光顯色。檢測細胞中MMP-2、MMP-9的表達,以β-actin作為內(nèi)參照,結(jié)果進行灰度值分析并通過統(tǒng)計學(xué)檢驗,實驗重復(fù)3次。

      1.9 統(tǒng)計學(xué)處理 采用SPSS 13.0統(tǒng)計分析軟件,計量資料采用均數(shù)±標準差(Mean±SD)表示,組間比較采用t檢驗,以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

      2 結(jié)果

      2.1 pcDNA3.1-SPRY4-IT1真核表達載體構(gòu)建 以cDNA為模板,用引物擴增目的片段,得到與預(yù)期片段大小相符的特異性片段(圖1A)。切膠純化回收目的片段,并與pGEMTeasy載體連接,插入目的片段后,通過酶切鑒定和測序分析證實插入片段的正確性(圖1B,圖1C)。將目的片段SPRY4-IT1與pGEM-Teasy載體連接后的重組體經(jīng)BamH I+Hind III雙酶切,與相同雙酶切線性化的pcDNA3.1載體連接,得到完整的pcDNA3.1-SPRY4-IT1表達載體,通過BamH I+Hind III酶切鑒定和測序分析(圖1D,圖1E),確認載體構(gòu)建成功。將重組質(zhì)粒pcDNA3.1-SPRY4-IT1和空質(zhì)粒pcDNA3.1轉(zhuǎn)染A549細胞后,檢測細胞中SPRY4-IT1表達,結(jié)果提示轉(zhuǎn)染重組質(zhì)粒pcDNA3.1-SPRY4-IT1的細胞中SPRY4-IT1表達量是轉(zhuǎn)染空質(zhì)粒的32.7倍(圖2)。

      圖1 pcDNA3.1-SPRY4-IT1真核表達載體構(gòu)建情況。A:目的片段擴增產(chǎn)物;B:目的片段與T載體連接后酶切鑒定結(jié)果;C:目的片段與T載體連接后測序結(jié)果;D:目的片段與pcDNA3.1載體連接后酶切鑒定結(jié)果;E:目的片段與pcDNA3.1載體連接后測序結(jié)果。Fig 1 pcDNA3.1-SPRY4-IT1 eukaryotic expression vector construction. A: Amplification products of target fragment; B: Enzyme digestion identification results of target fragment and T vector; C: Sequencing results of target fragment and T vector; D: Enzyme digestion identification results of target fragment and pcDNA3.1 vector; E: Sequencing results of target fragment and pcDNA3.1 vector.

      圖2 將重組質(zhì)粒pcDNA3.1-SPRY4-IT1和空質(zhì)粒pcDNA3.1轉(zhuǎn)染A549細胞后,檢測細胞中SPRY4-IT1表達。A:目的基因溶解曲線;B:目的基因擴增曲線;C:SPRY4-IT1在細胞中表達水平比較。Fig 2 The expression of SPRY4-IT1 in pcDNA3.1-SPRY4-IT1 and pcDNA3.1 A549 cells. A:Dissolution curve of target gene; B: Amplification curve of target gene; C: The expression of SPRY4-IT1 in different cells.

      圖3 細胞劃痕實驗結(jié)果。A:培養(yǎng)24 h后兩組細胞遷移結(jié)果的比較(×400);B:24 h后兩組細胞遷移距離比較。Fig 3 Cell scratch test results. A: Cell migration results of two groups (×400); B: Cell migration spaces of two groups.

      圖 4 細胞Transwell小室結(jié)果。A:顯微鏡下兩組細胞穿過Transwell小室基底膜結(jié)果(×400);B:兩組細胞穿過基底膜細胞數(shù)目比較。Fig 4 Transwell assay results. A: Cells through the basement membrane results of two groups (×400); B: The numbers of transmembrane A549 cells of two groups.

      2.2 SPRY4-IT1對細胞遷移能力的影響 將A549細胞接種于6孔板,轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1和空載體pcDNA3.1,24 h后結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1細胞劃痕兩側(cè)細胞間距較轉(zhuǎn)染pcDNA3.1細胞明顯變窄(圖3),提示A549細胞轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1后細胞的遷移能力增強。

      2.3 SPRY4-IT1對細胞侵襲能力的影響 A549細胞轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1后其穿膜細胞數(shù)為(207±34)個/視野,對照組為(83±15)個/視野,組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)(圖4)。表明A549細胞轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1后細胞的侵襲能力增強。

      2.4 SPRY4-IT1對MMP-2和MMP-9蛋白的影響 轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1細胞中的MMP-2及MMP-9蛋白表達較轉(zhuǎn)染空質(zhì)粒組均有升高(圖5)。

      圖 5 過表達SPRY4-IT1對MMP-2和MMP-9的影響Fig 5 Effect of overexpression of SPRY4-IT1 on matrix metalloproteinase (MMP)-2 and MMP-9

      3 討論

      在人類基因組中除了編碼基因外,同時包含大量的非編碼RNAs(non-coding RNAs, ncRNAs)[5]。ncRNAs雖不具備編碼蛋白質(zhì)功能,但能通過不同方式調(diào)控編碼基因的表達和功能,lncRNA與多種類型的腫瘤發(fā)生發(fā)展有著密切聯(lián)系,已成為近年來的研究熱點之一[1]。這類ncRNAs既可以通過影響蛋白翻譯發(fā)揮轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,也可以通過影響基因的轉(zhuǎn)錄活性及蛋白降解等多種途徑發(fā)揮功能。

      SPRY4-IT1是由SPRY4基因的一個內(nèi)含子轉(zhuǎn)錄而來,其內(nèi)部含有多個二級發(fā)卡結(jié)構(gòu),已有研究表明SPRY4-IT1在黑色素瘤細胞中過表達,并且參與調(diào)控黑色素瘤細胞的凋亡與遷移[2]。有關(guān)SPRY4-IT1在肺癌中的研究尚未見報道,為了更深入地探討SPRY4-IT1基因在肺癌細胞中的作用,本研究克隆了SPRY4-IT1基因,并構(gòu)建了SPRY4-IT1真核表達載體,用脂質(zhì)體介導(dǎo)轉(zhuǎn)染A549細胞,發(fā)現(xiàn)原本在A549細胞中表達量很低的SPRY4-IT1,在轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1后,表達量升高了25倍(與轉(zhuǎn)染空載體相比較),能夠滿足進一步的實驗需要。

      肺癌細胞最重要的惡性行為即具有高度的侵襲轉(zhuǎn)移能力[6-8],因此我們在肺癌A549細胞中轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1重組質(zhì)粒,觀察SPRY4-IT1對肺癌細胞遷移、侵襲能力的影響。我們的研究發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1細胞劃痕兩側(cè)細胞間距較轉(zhuǎn)染pcDNA3.1細胞明顯變窄,A549細胞轉(zhuǎn)染pcDNA3.1-SPRY4-IT1后其穿膜細胞數(shù)為(207±34)個/視野,對照組為(83±15)個/視野,組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),可見通過細胞劃痕運動實驗和Transwell侵襲實驗均證實過表達SPRY4-IT1后可以明顯增加A549細胞的侵襲、遷移能力,提示SPRY4-IT1有可能與肺癌細胞的侵襲遷移相關(guān)。MMP-2和MMP-9是目前公認的調(diào)控腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵因子[9-11],為了進一步研究SPRY4-IT1對肺癌A549細胞侵襲遷移能力改變的作用機制,我們通過Western blot檢測其中MMP-2及MMP-9的表達,發(fā)現(xiàn)在肺癌A549細胞中過表達SPRY4-IT1可以顯著增加MMP-2和MMP-9蛋白的表達。

      綜上所述,在肺癌A549細胞中過表達SPRY4-IT1可增強細胞的侵襲、遷移能力;同時過表達SPRY4-IT1后MMP-2及MMP-9呈升高趨勢,提示SPRY4-IT1可能通過對調(diào)控MMP影響肺癌的侵襲轉(zhuǎn)移能力??梢奡PRY4-IT1在肺癌的侵襲轉(zhuǎn)移中發(fā)揮重要作用,為肺癌的臨床治療提供了新的藥物靶點及監(jiān)測指標。

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