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      雷公山山區(qū)放牧山羊ACCI mRNA的組織分布

      2015-10-20 20:58楊家大陳祥龍威海馮文武丁玫
      江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2015年5期
      關(guān)鍵詞:基因表達(dá)

      楊家大 陳祥 龍威?!●T文武 丁玫

      摘要:為了揭示雷公山山區(qū)放牧山羊乙酰輔酶A羧化酶1(ACCl)mRNA表達(dá)的組織分布規(guī)律,使用TaqMan實(shí)時(shí)熒光定量技術(shù)對(duì)黔東南小香羊、貴州白山羊、貴州黑山羊、黔北麻羊和南江黃羊的肝、腎、心、肺、背最長(zhǎng)肌、半膜肌以及皮下脂肪組織中ACCl基因的mRNA表達(dá)水平進(jìn)行測(cè)定。結(jié)果表明,黔東南小香羊、黔北麻羊、南江黃羊ACCl mRNA均主要在皮下脂肪中表達(dá),其水平分別為3 919.545 6、900.556 8、1 550.559 2;貴州黑山羊ACCl mRNA主要在肝臟內(nèi)表達(dá),其水平為2 367.425 8;貴州白山羊ACCl mRNA主要在肌肉組織和肝臟中表達(dá),其水平分別為背最長(zhǎng)肌420.110 9,心351.436 l,半膜肌268.031 l,肝200.414 1。在皮下脂肪和肝臟,貴州白山羊ACCl mRNA的表達(dá)水平都明顯低于其他品種。由此可見(jiàn),雷公山山區(qū)放牧山羊ACCl mRNA主要在皮下脂肪和肝臟中表達(dá)。

      關(guān)鍵詞:雷公山山區(qū);放牧山羊;乙酰輔酶1;羧化酶1;ACCl;基因表達(dá)

      中圖分類號(hào):S827.2 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號(hào):1002-1302(2015)05-0025-04

      雷公山山區(qū)位于貴州省東南部,草場(chǎng)面積約1.3萬(wàn)hm2,牧草種類多,工業(yè)污染少,非常適合發(fā)展生態(tài)養(yǎng)羊業(yè)。目前,當(dāng)?shù)厝藗內(nèi)匝赜脗鹘y(tǒng)放牧的養(yǎng)羊方式,山羊生長(zhǎng)過(guò)程中沉淀的風(fēng)味物質(zhì)多,羊肉質(zhì)量好。乙酰輔酶A羧化酶(ace@一CoA carboxylase,ACC)是一類在脂肪代謝過(guò)程中起重要作用的生物素包含酶,催化乙酰輔酶A羧化生成丙二酸單酰輔酶A。該酶廣泛存在于植物、動(dòng)物、酵母、真菌、細(xì)菌、古細(xì)菌等生物體內(nèi)。在動(dòng)物體內(nèi),乙酰輔酶A羧化酶有乙酰輔酶A羧化酶α(acetyl-CoA carboxylase alpha,ACCα,別稱ACCl)和乙酰輔酶A羧化酶p(acetyl-CoA carboxylase beta,ACCp,別稱ACC2)2種類型,這2種酶由不同的基因編碼,分子量分別為265、280ku。ACCl主要存在于乳腺、脂肪組織和肝臟的細(xì)胞液內(nèi),由它催化產(chǎn)生的丙二酸單酰輔酶A主要用于合成脂肪酸,是脂肪酸合成時(shí)二碳單位的供體;而ACC2主要分布在心臟、肌肉組織和肝臟的線粒體外膜上,由它催化產(chǎn)生的丙二酸單酰輔酶A主要用于調(diào)節(jié)肉堿棕櫚酸穿梭體。有研究表明,敲除ACC2基因的小鼠體內(nèi)丙二酸單酰輔酶A的含量低,導(dǎo)致脂肪酸的合成減少,氧化分解加快,脂肪組織和肝臟中堆積的脂肪減少,肝糖原含量下降;因此,乙酰輔酶A羧化酶可調(diào)節(jié)脂肪酸的生物合成和“β-”氧化,影響機(jī)體脂肪的代謝、沉積,進(jìn)而影響背膘厚等肉質(zhì)性狀。然而,現(xiàn)有資料對(duì)家畜ACCl的研究多集中在基因多態(tài)性與泌乳性能的關(guān)聯(lián)以及基因啟動(dòng)子方面,鮮見(jiàn)ACCl基因表達(dá)及其與肉質(zhì)性狀關(guān)系的研究;因此,本研究主要對(duì)雷公山山區(qū)放牧山羊ACCl基因mRNA的組織分布進(jìn)行探討,以摸清其組織表達(dá)規(guī)律,為肉質(zhì)性狀的遺傳標(biāo)記輔助選擇積累基礎(chǔ)資料。

      1.材料與方法

      1.1山羊組織樣品來(lái)源

      5~7月齡黔東南小香羊、貴州白山羊、貴州黑山羊、黔北麻羊、南江黃羊各取4只(雌、雄各2只),體質(zhì)量14~17kg,均購(gòu)自貴州省雷公山山區(qū)養(yǎng)羊戶處。將山羊放血處死后,迅速提取心、肝、肺、腎、背最長(zhǎng)股、半膜肌、皮下脂肪組織,用錫箔紙包裹后投入液氮中。山羊處死前自由進(jìn)食和飲水。

      1.2引物及探針

      PCR引物及TaqMan探針根據(jù)山羊ACCl及β-actm基因mRNA序列設(shè)計(jì)(表1),并由上海捷瑞生物工程有限公司合成及修飾。探針的5'、3'一分別由FAM(6一羧基熒光素)和TAMRA(6一羧四甲基羅丹明)修飾。

      1.3總RNA提取

      總RNA提取采用Invitrogen Trizol RNA試劑盒進(jìn)行。操作簡(jiǎn)述如下:在約50 mg經(jīng)液氮速凍的組織樣品中加入1mLTrizol溶液,混勻,裂解5min;加入200uL三氯甲烷,劇烈振蕩混勻,靜置2min;4℃、12000r/min條件下離心15min,吸取上層水相至另一個(gè)新的RNase—flee EP管中;加入等體積的異丙醇,輕柔地充分混勻,室溫靜置10min;4℃、12000r/min條件下離心10min,收集RNA沉淀;用75%乙醇洗滌2次,超凈臺(tái)風(fēng)干;加入15~60uLRNase-flee水溶解沉淀。

      1.4逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)

      逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)采用TOYOBO ReverTra Ace qPCR RT Kit進(jìn)行(20uL體系),具體步驟如下:取總量為0.1~2.Oug的總RNA,加RNase—flee H20混勻至14uL,置于65℃下變性5min,冷卻;再加5×RTbuffer4uL、逆轉(zhuǎn)錄酶1uL、RT引物1uL,于42℃下逆轉(zhuǎn)錄18min,然后于98℃下滅活逆轉(zhuǎn)錄酶5min;RT完畢岳將cDNA于一20℃下保存,按所需用量稀釋備用。

      1.5實(shí)時(shí)熒光定量標(biāo)準(zhǔn)品的制備

      PCR反應(yīng)采用GeneSolution 2×Taq Master Mix(上海碩盟生物科技有限公司)進(jìn)行,反應(yīng)體系總體積為20uL,具體操作如下:向O.2 mL PCR管中依次加入RNase—flee H2O7.2uL、2×Taq Master Mix 10uL、10 t~mol/LS—F0.4uL、10umol/Ls—R0.4uL、cDNA 2uL,混勻。熱循環(huán)參數(shù)為:94℃預(yù)變性90s;94℃變性30s,55~60℃退火30s,72℃延伸60s,40個(gè)循環(huán);72℃延伸5min。

      PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠回收試劑盒[天根生化科技(北京)有限公司]回收純化后,計(jì)算目的基因的拷貝數(shù)濃度,式中:Ⅳ為目的基因的拷貝數(shù)濃度(copies/uL),C為質(zhì)量濃度(ng/uL),M為擴(kuò)增片段的堿基對(duì)數(shù)。經(jīng)計(jì)算,ACCl基因、β-actm基因的拷貝數(shù)濃度為1.39×10111、3.53×107copies/uL。

      膠回收產(chǎn)物按4倍比例進(jìn)行5次梯度稀釋。稀釋后再次測(cè)定質(zhì)量濃度、換算拷貝數(shù)濃度,最終得到拷貝數(shù)濃度為1.39×10111、3.64×10l10、9.56×109、2.39×109、5.98×108、1.49×108eopies/p=L的ACCl基因連續(xù)梯度定量標(biāo)準(zhǔn)品,以及3.53×107、8.82×106、2.21×106、5.51×105、1.38×105、3.45×104copies/uL的β-actm基因連續(xù)梯度定量標(biāo)準(zhǔn)品。

      1.6TaqMan PCR

      反應(yīng)在Funglyn FTC-3000實(shí)時(shí)熒光定量PCR系統(tǒng)(Funglyn Bioteeh,INC,Canada)上進(jìn)行,每個(gè)樣品設(shè)置3個(gè)重復(fù),同時(shí)對(duì)空白對(duì)照及4倍連續(xù)梯度標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行定量PCR擴(kuò)增。TaqMan PCR反應(yīng)體系為20 p=L,其中含2×Realtime PCRMaster Mix 10.0uL、10umol/L前弓l物0.8uL、10umol/L反引物0.8uL、10umol/L TaqMan探針0.4uL、RNase-fleeH20 6.0uL、cDNA模板2.0uL。熱循環(huán)參數(shù)為:95℃預(yù)變性10min;每個(gè)循環(huán)包括95℃變性15 s,63℃退火及延伸60s,40個(gè)循環(huán)。

      1.7統(tǒng)計(jì)分析

      根據(jù)ACCl及β-actut基因連續(xù)梯度標(biāo)準(zhǔn)品的拷貝數(shù)的對(duì)數(shù)(以4為底)對(duì)相應(yīng)Ct值作圖,得到對(duì)應(yīng)基因的定量標(biāo)準(zhǔn)曲線及回歸方程。再根據(jù)回歸方程與樣品檢測(cè)得到的Ct值即可計(jì)算出待測(cè)樣品中ACCl基因及β-actm基因的拷貝數(shù)。ACCl mRNA的個(gè)體表達(dá)水平以ACCl基因的拷貝數(shù)與β-actm基因的拷貝數(shù)之比值表示,平均表達(dá)水平以“中位數(shù)”表示。

      2.結(jié)果與分析

      雷公山山區(qū)放牧的黔東南小香羊、貴州白山羊、貴州黑山羊、黔北麻羊、南江黃羊等山羊品種肝、腎、心、肺、背最長(zhǎng)肌、半膜肌、皮下脂肪組織中ACCl基因的mRNA表達(dá)水平見(jiàn)表2。

      從表2可以看出,黔東南小香羊ACCl mRNA的表達(dá)水平以皮下脂肪最高,為3919.545 6,是心(573.7526)、肝(812.0987)、肺(691.6713)、腎(286.0498)、背最長(zhǎng)?。?98.7109)和半膜?。?64.938 8)等組織的4.8倍以上;而肝、腎、心、肺、背最長(zhǎng)肌、半膜肌中ACCl mRNA的表達(dá)水平較接近。黔北麻羊ACCl mRNA的表達(dá)水平以皮下脂肪和肺較高,分別為900.5568和900.1608,是心(542.6041)、肝(288.7994)、腎(579.7442)、背最長(zhǎng)?。?18.3583)、半膜?。?72.1422)等組織的1.5倍以上。南江黃羊ACCl mRNA的表達(dá)水平以皮下脂肪最高,為1550.5592,是心(806.7845)、肝(803.6431)、肺(729.9683)、腎(519.4120)、背最長(zhǎng)?。?13.832 6)、半膜?。?60.483 3)等組織的1.9倍以上。貴州黑山羊ACCl mRNA的表達(dá)水平在肝臟中最高,為2367.4258,是心(592.7209)、肺(762.8970)、腎(321.6677)、背最長(zhǎng)?。?40.0147)、半膜?。?74.9263)、皮下脂肪(328.2781)等組織的3.1倍以上。貴州白山羊ACClmRNA的表達(dá)水平以背最長(zhǎng)?。?20.11109)、心(351.4361)、半膜肌(268.0311)、肝(200.4141)、肺(110.6160)較高,皮下脂肪(77.4306)和腎(22.8188)較低。

      此外,在皮下脂肪中,黔東南小香羊和南江黃羊ACClmRNA的表達(dá)水平很高,分別為3 919.5456和1 550.5592;其次是黔北麻羊,為900.5568;貴州黑山羊和貴州白山羊則相對(duì)較低,分別為328.2781和77.4306。在肝臟中,貴州黑山羊ACCl mRNA的表達(dá)水平最高,為2367.4258;黔東南小香羊和南江黃羊較高,分別為812.098 7和803.6431;黔北麻羊和貴州白山羊相對(duì)較低,分別為288.7994和200.4141。

      3.結(jié)論與討論

      3.1雷公山山區(qū)放牧山羊ACCl mRNA主要在皮下脂肪和肝臟中表達(dá)

      肉質(zhì)性狀作為數(shù)量性狀,受多基因控制,目前發(fā)現(xiàn)的候選基因至少有十幾個(gè)。ACCl是體內(nèi)脂肪合成的關(guān)鍵酶之一,參與長(zhǎng)鏈脂肪酸從頭合成的第1步反應(yīng),對(duì)調(diào)控肝組織的脂肪代謝活動(dòng)具有重要作用,是豬屠宰及生產(chǎn)性能的標(biāo)志。ACCl抑制劑能夠抑制小鼠體質(zhì)量增加,減少小鼠的肥胖程度。因此,檢測(cè)ACCl mRNA水平能夠在轉(zhuǎn)錄水平上反映體內(nèi)脂肪合成能力。本研究對(duì)5個(gè)品種山羊7種組織ACCl基因的表達(dá)進(jìn)行測(cè)試,結(jié)果表明,有3個(gè)品種(黔東南小香羊、黔北麻羊和南江黃羊)_4CCl基因最主要在皮下脂肪組織中表達(dá),1個(gè)品種(貴州黑山羊)主要分布于肝臟,另一品種(貴州白山羊)的優(yōu)勢(shì)表達(dá)組織器官不明確。這與Barber等的報(bào)道較相似:他們認(rèn)為,哺乳動(dòng)物中ACCl在所有細(xì)胞中表達(dá),但主要在肝臟、脂肪組織以及泌乳期乳腺等脂肪生成組織中表達(dá)。本研究結(jié)果還顯示,在皮下脂肪組織中,黔東南小香羊、黔北麻羊和南江黃羊ACCl mRNA的表達(dá)水平個(gè)體差異較大,這可能是由于皮下脂肪是ACCl基因表達(dá)的最主要組織,外界環(huán)境和山羊自身?xiàng)l件的微小變化都能引起ACClmRNA表達(dá)水平的較大改變,日糧中的氨基酸、中草藥、維生素、金屬離子等成分以及飽餓狀態(tài)等因素都能影響ACCl基因的表達(dá)。雷公山山區(qū)生態(tài)環(huán)境優(yōu)美,氣候溫和濕潤(rùn),水質(zhì)好,植物種類繁多,有“天然藥園”之稱。該區(qū)放牧山羊長(zhǎng)期攝食這些植物和草藥,不僅為其肌肉生長(zhǎng)沉淀豐富的風(fēng)味物質(zhì),而且可以通過(guò)影響ACCl基因的轉(zhuǎn)錄、翻譯而最終影響屠宰性能,最終影響山羊的肉品質(zhì)量。

      3.2ACCl mRNA的表達(dá)存在品種差異

      就品種分布而言,無(wú)論是在表達(dá)水平最高的皮下脂肪中,還是在表達(dá)水平較高的肝臟中,貴州白山羊ACCl mRNA的表達(dá)水平都明顯低于其他山羊品種,這從轉(zhuǎn)錄層面說(shuō)明貴州白山羊的肝臟和皮下脂肪組織中丙二酸單酰輔酶A的合成能力較弱,生成的丙二酸單酰輔酶A較少,合成脂肪酸的原料不足,脂肪的合成速率降低,分解加快。Solaiman等也發(fā)現(xiàn),ACCl基因的表達(dá)具有品種差異,波爾山羊顯著高于Kiko山羊。

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