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      板藍(lán)根新品系BLG2012-04與當(dāng)?shù)卦耘喾N的RAPD比較

      2015-12-25 12:21:42王興政陳紅剛劉效瑞王富勝
      甘肅農(nóng)業(yè)科技 2015年10期
      關(guān)鍵詞:板藍(lán)根大田品系

      王興政,楊 寧,陳紅剛,劉效瑞,王富勝

      (1.甘肅省定西市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院,甘肅 定西 743000;2.西北師范大學(xué),甘肅 蘭州 730070;3.甘肅中醫(yī)藥大學(xué),甘肅 蘭州 730010)

      我國中藥材資源豐富,是世界中藥材的主產(chǎn)國,對中藥材的研究有幾千年歷史。中藥材的品質(zhì)關(guān)系到臨床用藥的安全有效,發(fā)展道地藥材是實現(xiàn)中藥現(xiàn)代化的關(guān)鍵,也是占有市場、增強(qiáng)產(chǎn)品競爭力的基本保障。當(dāng)前,藥材道地性研究已經(jīng)成為中醫(yī)藥科研的重要課題。

      板藍(lán)根(Radix Isatidis)為2年生草本十字花科植物菘藍(lán)(Isatis factionindigotica Fort)的根,始載于《神農(nóng)本草經(jīng)》,為傳統(tǒng)抗病毒中藥之一。板藍(lán)根味苦、性寒,歸心、胃經(jīng),有清熱解毒、涼血利咽之功效[1-2]。近年來的研究表明,板藍(lán)根具有較強(qiáng)的抗菌、抗病毒和抗內(nèi)毒素的作用[3],廣泛用于治療流感、腮腺炎、溫病發(fā)熱、發(fā)斑、風(fēng)熱感冒、咽喉腫爛、流行性乙型腦炎和肝炎等多種疾病[4]。

      然而目前甘肅板藍(lán)根栽培中普遍使用傳統(tǒng)栽培育種方法,栽培品種為板藍(lán)根屬多種類型的混和體,田間表現(xiàn)良莠混雜,難于管理,且品系親緣關(guān)系不明確,缺乏品系鑒定的分子依據(jù),嚴(yán)重制約著當(dāng)?shù)匕逅{(lán)根的產(chǎn)量和品質(zhì),生產(chǎn)中迫切需要優(yōu)勢新品種的選育鑒定。另外,藥材的道地性一直是評價藥材品質(zhì)的綜合性標(biāo)準(zhǔn),而產(chǎn)生道地性的原因,除了與栽培方法、生態(tài)環(huán)境、加工方法有關(guān)外,還與物種居群的遺傳特異性有關(guān)。道地藥材與非道地藥材在形態(tài)和生藥性狀等特征上的差別并不明顯,這給應(yīng)用傳統(tǒng)方法鑒別道地藥材帶來了困難。

      隨機(jī)擴(kuò)增DNA多態(tài)性(Random Amplified Polymorphic DNA,RAPD)技術(shù)以其操作簡單、快速、花費(fèi)少、DNA用量少、無放射性等優(yōu)點,廣泛應(yīng)用于中草藥種質(zhì)資源親緣關(guān)系、遺傳多樣性及藥材道地性研究等方面[5-6]。本研究正是基于甘肅省板藍(lán)根生產(chǎn)及銷售實際中不能提供科學(xué)的藥材道地性鑒定等問題,利用RAPD技術(shù)對甘肅省定西市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院選育的板藍(lán)根新品系BLG2012-04與當(dāng)?shù)卮筇镌耘喾N進(jìn)行分析鑒定,考證其遺傳多樣性和親緣關(guān)系,為甘肅省板藍(lán)根的產(chǎn)業(yè)化發(fā)展提供部分分子生物學(xué)依據(jù)。

      1 材料和方法

      1.1 材料

      本研究所用2個板藍(lán)根樣品種子分別為培育品系BLG2012-04和當(dāng)?shù)卮筇镌耘喾N(CK),均由甘肅省定西市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院提供,種子采集于2014年9月,每個樣品均采集種子500粒。

      1.2 方法

      1.2.1 板藍(lán)根種子的萌發(fā) 挑選顆粒飽滿均勻的板藍(lán)根種子,用1 g/kg次氯酸鈉溶液表面消毒10 min,用蒸餾水少量多次沖洗若干次,至無次氯酸鈉味道為止。消毒過程中輕搖數(shù)次,以提高消毒效果[7]。取10個花盆,分為BLG2012-04和CK兩組,每組5盆。每盆中均勻撒播30粒種子,覆土2 cm。培養(yǎng)條件為溫度25℃,光照強(qiáng)度1 000~2 000 Lx、每天連續(xù)光照12 h,每隔48 h澆水1次。

      1.2.2 DNA的提取 采用CTAB(十六烷基三甲基溴化銨)法提取植物基因組DNA,所用試劑盒購自北京百泰克生物技術(shù)有限公司。提取后的DNA在4℃保存待用,對提取的2個供試材料的DNA進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測,以確保為后期PCR擴(kuò)增提供良好的模板。

      1.2.3 PCR擴(kuò)增 PCR擴(kuò)增反應(yīng)在BIO-RAD普通型PCR儀上進(jìn)行,RAPD引物由北京奧科生物技術(shù)公司生產(chǎn),所用Taq酶購自天根生化科技(北京)有限公司。

      RAPD反應(yīng)體系:模板DNA 1μL,隨機(jī)引物2μL,Taq酶10μL,加ddH2O至20μL。

      擴(kuò)增程序:94℃預(yù)變性5 min后,94℃1 min,30℃1 min,72℃1 min,共計35個循環(huán),最后72℃延伸10 min。

      采用1%的瓊脂糖凝膠電泳,溴化乙錠(EB)染色,UVI凝膠圖像分析系統(tǒng)觀察照相。每實驗重復(fù)3次。

      1.3 數(shù)據(jù)處理

      參照Williams等的方法[8]。電泳擴(kuò)增圖譜中的每條帶(DNA片段)均為1個分子標(biāo)記(Marker),并代表1個引物結(jié)合位點。根據(jù)各分子標(biāo)記在相同電泳遷移率下(相同分子量片段)的有無,統(tǒng)計得到所有位點的二元數(shù)據(jù),有DNA擴(kuò)增帶(顯性)為1,無帶(隱性)記為0,強(qiáng)帶和弱帶賦值為1。對于多態(tài)性位點,采用在重復(fù)試驗中能穩(wěn)定出現(xiàn)的差異帶用于數(shù)據(jù)分析。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 不同引物擴(kuò)增品系BLG2012-04和當(dāng)?shù)卮筇镌耘喾N的結(jié)果

      通過引物篩選,對2個品系挑選出譜帶清晰、重復(fù)性好、多態(tài)性較豐富的11條隨機(jī)引物用于PCR擴(kuò)增反應(yīng)。引物分別為P1、P2、P4、P5、P7-P13。所用引物及擴(kuò)增條帶數(shù)見表1。對于BLG2012-04品系,11條引物共擴(kuò)增出119個位點,不同引物的擴(kuò)增位點變幅為8~13個,平均每條引物能擴(kuò)增出10.8個位點;對于CK,11條引物共擴(kuò)增出119個位點,不同引物的擴(kuò)增位點變幅為8~14個,平均每條引物能擴(kuò)增出10.8個位點。

      2.2 相同引物擴(kuò)增品系BLG2012-04和當(dāng)?shù)卮筇镌耘喾N的結(jié)果

      利用11條引物,分別擴(kuò)增兩品系,從而在分子水平上反映兩品系間的遺傳差異性。篩選出的11 條引物分別為 P1、P2、P4、P5、P7、P8、P9、P10、P11、P12、P13(引物及其擴(kuò)增條帶數(shù)見表1)。結(jié)果顯示,BLG2012-04和CK的主譜帶基本一致,說明它們的遺傳背景具有很大的相似性,但是兩者間的次譜帶存在一定差異。相同引物擴(kuò)增2個品系產(chǎn)生的總位點數(shù)的范圍為16~27個,其中多態(tài)性位點的差異變幅為1~2個。這說明2個品系之間存在遺傳學(xué)差異,表現(xiàn)出具有遺傳多態(tài)性位點(圖1)。

      表1 引物序列和對BLG2012-04及CK的擴(kuò)增結(jié)果

      圖1 BLG2012-04和CK的RAPD電泳圖譜

      3 結(jié)論與討論

      1)影響PCR擴(kuò)增條帶的因素有模板DNA、引物、dNTPs量、Taq酶、退火溫度、電泳中的瓊脂糖濃度、電泳時間等。本研究對退火溫度和電泳時間這兩個因素進(jìn)行了優(yōu)化分析,最終確定了板藍(lán)根材料的最適RAPD-PCR擴(kuò)增反應(yīng)體系為模板DNA 1μL,隨機(jī)引物 2μL,Taq酶 10μL,ddH2O 7 μL;RAPD引物最佳退火溫度為30℃,最適瓊脂糖濃度為1%。此體系的建立可以為其他板藍(lán)根品系的RAPD擴(kuò)增提供參照依據(jù)。

      2)RAPD是一種顯性標(biāo)記,能從分子水平上揭示材料間存在的遺傳差異[9-11]。從RAPD的結(jié)果可以看出,2個不同的供試材料的主譜帶基本一致,說明它們的遺傳背景具有很大的相似性。表明甘肅省新選育的板藍(lán)根品系BLG2012-04和當(dāng)?shù)卮筇镌耘喾N之間的遺傳關(guān)系較近。這種情況可能是由于在板藍(lán)根種植過程中,兩個品系之間的地理分布近,并且板藍(lán)根是自交不親和的異花授粉植物,從而使不同板藍(lán)根品系間相互授粉的幾率大大提高,造成品系間的遺傳關(guān)系較近。次譜帶存在不同程度的差異,多態(tài)性位點的差異變幅為1~2個。這在分子水平上說明板藍(lán)根品系BLG2012-04與當(dāng)?shù)卮筇镌耘喾N具有一定的遺傳差異性。

      [1] 王興政,劉效瑞,楊薇靖.6個板藍(lán)根新品系在定西市的品比試驗報[J].甘肅農(nóng)業(yè)科技,2014(5):14-16.

      [2] 楊薇靖,王興政.定西半干旱區(qū)板藍(lán)根栽培技術(shù)[J].甘肅農(nóng)業(yè)科技,2013(5):66-67.

      [3] 陳 慶.板藍(lán)根藥理作用與臨床應(yīng)用[J].中國藥事,2009,23(6):607-608.

      [4] 安益強(qiáng),賈曉斌,袁海建,等.板藍(lán)根抗病毒物質(zhì)基礎(chǔ)研究思路[J]. 中草藥,2008,39(4):616-619.

      [5] 鄭學(xué)項,馮素萍,李維國.DNA分子標(biāo)記研究進(jìn)展[J]. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué),2009,37(26):12 420-12 422.

      [6] 任愛農(nóng),秦民堅.基于RAPD分子標(biāo)記技術(shù)的中藥材鑒定研究進(jìn)展[J]. 中南藥學(xué),2008,6(3):338-341.

      [7] 吾拉爾古麗,王建華,李先恩.板藍(lán)根種子發(fā)芽試驗標(biāo)準(zhǔn)化研究[J]. 種子,2005,24(6):34-36.

      [8] WILLIAMS J G,KUBELIK A R,LIBAK K J,et al.DNA polymorphisms amplified by arbitrary primers are useful as genetic markers[J].Nuc Aci Res,1990,18(22):6 531-6 535.

      [9] 梁慧敏.不同居群狗牙根RAPD分析[J].草業(yè)學(xué)報,2010,19(1):258-262.

      [10] 劉 歡,慕 平,趙桂琴.基于AFLP燕麥遺傳多樣性研究[J]. 草業(yè)學(xué)報,2008,17(6):121-127.

      [11] 解新明,盧小良.利用RAPD標(biāo)記分析狼尾草屬牧草品種間的遺傳關(guān)系[J]. 草業(yè)學(xué)報,2005,14(2):52-56.

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