湄洲灣潮間帶底棲生物多樣性
黃雅琴,李榮冠,王建軍,等
生物學(xué)基礎(chǔ)學(xué)科
湄洲灣潮間帶底棲生物多樣性
黃雅琴,李榮冠,王建軍,等
為了了解福建省湄洲灣潮間帶底棲生物的物種多樣性、數(shù)量時(shí)空分布及群落結(jié)構(gòu)現(xiàn)狀,2005年11月和2006年4月在湄洲灣潮間帶選擇了靈川(Mch1)、蘇厝(Mch2)、郭厝(Mch3)、東吳(Mch4)和東橋(Mch5)5條斷面進(jìn)行了調(diào)查。共鑒定潮間帶底柄生物225種,其中多毛類、軟體動(dòng)物和甲殼動(dòng)物占總種數(shù)的88.00%,三者構(gòu)成潮間帶底棲生物的主要類群。斷面間比較,東橋斷面種數(shù)較多,蘇厝斷面較少。季節(jié)比較,春季各斷面種類較秋季多。平均生物量22.91 g/m2,以軟體動(dòng)物居第一位,甲殼動(dòng)物居第二位;平均棲息密度為388/m2,以多毛類居第一位,軟體動(dòng)物居第二位。生物量以中潮區(qū)>低潮區(qū)>高潮區(qū);棲息密度以低潮區(qū)>中潮區(qū)>高潮區(qū)。調(diào)查結(jié)果顯示湄洲灣潮間帶底棲生物物種多樣性較高,群落結(jié)構(gòu)相對(duì)穩(wěn)定。
濱海濕地;生態(tài);群落結(jié)構(gòu)
來(lái)源出版物:生物多樣性, 2010, 18(2): 156-161
入選年份:2012
甲醛誘導(dǎo)的磷酸化減弱Tau蛋白與DNA相互作用
盧靜,苗君葉,潘榮,等
異常磷酸化Tau蛋白是神經(jīng)纖維纏結(jié)的主要成分,也是老年癡呆的典型病理特征之一。本實(shí)驗(yàn)室前期報(bào)道了Tau蛋白具有保護(hù)DNA的作用,但磷酸化對(duì)Tau與DNA相互作用的影響需要進(jìn)行探索,這對(duì)于揭示 Tau蛋白異常磷酸化與神經(jīng)細(xì)胞死亡之間的關(guān)系具有一定的參考價(jià)值。本文采用甲醛孵育N2a細(xì)胞,引起了細(xì)胞內(nèi)Tau蛋白的過(guò)度磷酸化。實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)一步顯示,甲醛孵育組的細(xì)胞核內(nèi)磷酸化Tau蛋白與DNA非共定位存在,而對(duì)照組細(xì)胞核內(nèi)Tau蛋白與DNA存在一定程度的共定位現(xiàn)象。電泳遷移率實(shí)驗(yàn)檢測(cè)GSK-3β催化的磷酸化Tau蛋白與DNA的結(jié)合情況,可以觀察到磷酸化減弱了Tau蛋白與DNA的相互結(jié)合。這些結(jié)果表明,異常磷酸化可以使Tau蛋白喪失對(duì)DNA的保護(hù)作用,這可能是Tau蛋白異常磷酸化引起DNA損傷甚至細(xì)胞死亡的原因之一。
內(nèi)源甲醛;Tau蛋白;磷酸化;DNA;保護(hù)作用;細(xì)胞死亡;認(rèn)知功能損傷
來(lái)源出版物:生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展, 2011, 38(12): 1113-1120
入選年份:2013
小麥轉(zhuǎn)基因方法及其評(píng)述
葉興國(guó),陳明,杜麗璞,等
小麥?zhǔn)沁z傳轉(zhuǎn)化比較困難的作物之一。為了克服小麥基因工程育種和功能基因組學(xué)研究的障礙,人們分別嘗試?yán)没驑?、花粉管通道、超聲波、離子束注入,激光微柬穿刺、PEG(Polyethylene glycol)、電擊和農(nóng)桿菌等方法轉(zhuǎn)化小麥。涉及的受體材料包括幼胚、成熟胚、花藥愈傷組織、幼穗,芽尖和花器官。文章對(duì)小麥主要遺傳轉(zhuǎn)化方法及其應(yīng)用進(jìn)行了介紹、回顧和評(píng)述,分析、比較了獲得安全型轉(zhuǎn)基因小麥的幾種策略,以期增強(qiáng)讀者對(duì)小麥轉(zhuǎn)基因技術(shù)和進(jìn)展的了解,促進(jìn)小麥轉(zhuǎn)化技術(shù)的持續(xù)改進(jìn)和提高。
小麥;遺傳轉(zhuǎn)化
來(lái)源出版物:遺傳, 2011, 33(5): 422-430
入選年份:2013
飼料脂肪水平對(duì)吉富羅非魚生產(chǎn)性能、營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)消化及血液生化指標(biāo)的影響
王愛民,韓光明,封功能,等
為探討吉富羅非魚對(duì)脂肪的適宜需求量,將 630尾[(2.63±0.16)g]吉富羅非魚隨機(jī)分成6個(gè)脂肪組的飼料組(1.73%、3.71%、5.69%、7.67%、9.64%和16.55%),每組設(shè)置3個(gè)重復(fù),每個(gè)重復(fù)35尾,第1組為對(duì)照組,投喂基礎(chǔ)日糧(含脂肪1.73%),另外5組為試驗(yàn)組,在基礎(chǔ)日糧中分別添加2%、4%、6%、8%、15%的魚油,飼養(yǎng)90 d后測(cè)定生長(zhǎng)、餌料系數(shù)、營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)表觀消化率及血液常規(guī)生化指標(biāo)。結(jié)果顯示,隨著飼料脂肪水平提高,增重率和特定生長(zhǎng)率呈現(xiàn)一個(gè)先上升后下降的趨勢(shì)(P<0.05),蛋白質(zhì)效率極顯著地提高(P<0.01),餌料系數(shù)極顯著地下降(P<0.01)。增重率與飼料脂肪水平的二次多項(xiàng)式回歸分析顯示,吉富羅非魚獲得最高增長(zhǎng)所需飼料的最佳脂肪水平為9.34%。飼料脂肪水平對(duì)粗蛋白表觀消化率和飼料干物質(zhì)表觀消化率無(wú)顯著影響(P>0.05),飼料脂肪水平增加顯著提高了粗脂肪和磷的表觀消化率(P<0.05)。未添加魚油的 1.73%組血液中白蛋白和白球比均顯著高于其他組(P<0.05),隨著飼料脂肪水平的提高,膽固醇的濃度及堿性磷酸酶的活性極顯著地上升(P<0.01)。飼料脂肪水平對(duì)血糖濃度有顯著影響(P<0.05),對(duì)甘油三酯濃度、谷丙和谷草轉(zhuǎn)氨酶的活性無(wú)顯著影響(P>0.05)。結(jié)果表明,飼料中的脂肪水平可以促進(jìn)吉富羅非魚對(duì)脂肪和磷的表觀消化率,但是脂肪水平過(guò)高會(huì)對(duì)魚體增重及血液生化參數(shù)產(chǎn)生負(fù)作用,從生產(chǎn)上來(lái)說(shuō)吉富羅非魚魚種對(duì)脂肪的適宜需求量為7.67%~9.34%。
吉富羅非魚;脂肪水平;生產(chǎn)性能;表觀消化率;血液生化指標(biāo)
來(lái)源出版物:水生生物學(xué)報(bào), 2011, 35(1): 80-87
入選年份:2013
黃芪多糖對(duì)齊口裂腹魚生長(zhǎng)、體組成和免疫指標(biāo)的影響
向梟,陳建,周興華,等
試驗(yàn)研究黃芪多糖對(duì)齊口裂腹魚生長(zhǎng)性能、體組成及免疫指標(biāo)的影響。以450尾健康的齊口裂腹魚[體重(6.98±0.43)g;體長(zhǎng)(9.11±0.25)cm]為試驗(yàn)對(duì)象,隨機(jī)分為5組(C1、C2、C3、C4、C5),每組3個(gè)重復(fù),每重復(fù)30尾試驗(yàn)魚。C1、C2、C3、C4、C5組分別投喂在等氮等能(蛋白質(zhì)含量38.29%,能量15.73 nl/kg)的基礎(chǔ)料中分別添加 0、0.02、0.04、0.06、0.08%的黃芪多糖制成5種試驗(yàn)飼料,養(yǎng)殖齊口裂腹魚50d。結(jié)果表明:飼料中未添加黃芪多糖組的增重率(WGR)、特定生長(zhǎng)率(SGR)、飼料蛋白效率(PER)均顯著低于黃芪多糖添加組(P<0.05),而餌料系數(shù)(FCR)則顯著高于黃芪多糖添加組(P<0.05)。當(dāng)黃芪多糖添加水平為0.04%時(shí),試驗(yàn)魚的WGR、SGR、PER均達(dá)到最大(分別為110.31%、1.86%/d和182.07%),F(xiàn)CR最低(1.44),與其他各組差異顯著(P<0.05);以WGR、SGR、PER、FCR為指標(biāo),利用直線和拋物線回歸分析表明,齊口裂腹魚生長(zhǎng)性能最佳時(shí)黃芪多糖添加水平為 0.045%~0.074%;對(duì)齊口裂腹魚機(jī)體組成分析表明,黃芪多糖對(duì)魚體粗灰分和水分影響不顯著(P>0.05),黃芪多糖添加水平為0.06%時(shí)機(jī)體粗蛋白最高,但與黃芪多糖添加水平為 0.04%時(shí)無(wú)明顯差異(P>0.05);粗脂肪含量在黃芪多糖添加水平為0.04%時(shí)最高,與其他各組差異顯著(P<0.05);未添加黃芪多糖組血清免疫酶活性顯著低于黃芪多糖添加組,齊口裂腹魚血清免疫酶活性在一定范圍內(nèi)隨黃芪多糖的增加而增強(qiáng)。黃芪多糖添加水平為 0.04%時(shí),堿性磷酸酶(ALP)活性最高;酸性磷酸酶(ACP)活性在黃芪多糖添加水平 0.06%時(shí)最大;黃芪多糖添加水平應(yīng)在0.06~0.08%時(shí),溶菌酶(LSZ)、超氧化歧化酶(SOD活性趨于穩(wěn)定。這說(shuō)明黃芪多對(duì)齊口裂腹魚的生長(zhǎng)和免疫力有明顯的促進(jìn)作用。綜合考慮齊口裂腹魚生長(zhǎng)性能和免疫能力最佳時(shí)黃芪多糖添加水平為0.04~0.074%。
黃芪多糖;生長(zhǎng);機(jī)體組成;免疫;齊口裂腹魚
來(lái)源出版物:水生生物學(xué)報(bào), 2011, 35(2): 291-299
入選年份:2013
建鯉GHR基因多態(tài)性及與增重相關(guān)的SNP位點(diǎn)的篩選
陶文靜,馬龍俊,阮瑞霞,等
生長(zhǎng)激素是調(diào)控動(dòng)物生長(zhǎng)的關(guān)鍵因子,它通過(guò)與膜蛋白生長(zhǎng)激素受體結(jié)合后發(fā)揮作用,因此生長(zhǎng)激素受體基因的變異對(duì)動(dòng)物生長(zhǎng)有著重要的影響。實(shí)驗(yàn)根據(jù)已分離的4個(gè)建鯉jlGHRs基因,通過(guò)測(cè)定來(lái)自6尾建鯉的序列,共找到38個(gè)SNP位點(diǎn)。使用PCR-RFLP方法檢測(cè)了353尾建鯉在其中5個(gè)SNP位點(diǎn)(1a內(nèi)含子3 A43G、1a外顯子8 A361G、1b外顯子8 C12T、2a外顯子8 A555G和2b外顯子8 A315G)的基因型,分析了不同基因型與生長(zhǎng)性狀的相關(guān)性。結(jié)果表明5個(gè)位點(diǎn)均與增重顯性相關(guān);1a內(nèi)含子3 A43G還與體高/體長(zhǎng)和體厚/體長(zhǎng)顯性相關(guān);1b外顯子8 C12T與體高/體長(zhǎng)和尾柄高/尾柄長(zhǎng)顯性相關(guān);1a外顯子8 A361G和2a外顯子8A555G也與尾柄高/尾柄長(zhǎng)顯性相關(guān)。數(shù)據(jù)分析還顯示增重標(biāo)記個(gè)數(shù)富集4個(gè)以上的個(gè)體明顯比標(biāo)記少的個(gè)體生長(zhǎng)快,在選育群中增重標(biāo)記數(shù)有 2個(gè)的個(gè)體最多占30%,而增重標(biāo)記數(shù)4個(gè)以上的只占14%,說(shuō)明存在著較大的選育空間。實(shí)驗(yàn)篩選的5個(gè)位點(diǎn)可以作為建鯉分子育種的有效標(biāo)記。
建鯉;GHR;多態(tài)性;增重;體型;相關(guān)性
來(lái)源出版物:水生生物學(xué)報(bào), 2011, 35(4): 622-629
入選年份:2013
一株草魚呼腸孤病毒弱毒株的分離、鑒定及免疫原性初步分析
曾偉偉,王慶,劉永奎,等
從江西南昌患出血病草魚體內(nèi)分離出的草魚病毒(暫命名為JX09-01)能使草魚腎臟細(xì)胞(CIK)、草魚肝細(xì)胞(L8824)、草魚吻端成纖維細(xì)胞(PSF)產(chǎn)生明顯的細(xì)胞病變效應(yīng)(CPE)。感染 CIK細(xì)胞固定后經(jīng)電鏡觀察,發(fā)現(xiàn)細(xì)胞質(zhì)內(nèi)有大量病毒聚集,形態(tài)和排列方式與已報(bào)道的草魚呼腸孤病毒(Grass carp reovirus,GCRV)相似。針對(duì)GCRV 873株S6基因設(shè)計(jì)的簡(jiǎn)并引物可以從病料組織和感染細(xì)胞中擴(kuò)增出目的條帶,而針對(duì)GCRVHZ08株S6基因設(shè)計(jì)特異性引物未能擴(kuò)增出目的條帶。對(duì)JX09-01株的S6全基因進(jìn)行序列分析表明,其核苷酸序列同GCRV 873株和HZ08株的同源性分別是 99.3%和 30.4%,推導(dǎo)出的氨基酸序列同源性分別是98.6%和30%,說(shuō)明草魚病毒JX09-01株為草魚呼腸孤病毒。用JX09-0l株接種當(dāng)年8~10 cm左右的草魚,沒有明顯的臨床癥狀,不能致草魚死亡。用傳代至 15代的CIK細(xì)胞病毒液進(jìn)行免疫保護(hù)試驗(yàn),結(jié)果顯示其對(duì)強(qiáng)毒株的免疫保護(hù)率達(dá)到86.7%。實(shí)驗(yàn)結(jié)果初步顯示,新分離到的JX09-01為草魚呼腸孤病毒弱毒株,可作為弱毒疫苗的候選毒株。
草魚呼腸孤病毒;分離;鑒定;序列分析;免疫原性
來(lái)源出版物:水生生物學(xué)報(bào), 2011, 35(5): 790-795
入選年份:2013
太湖大型底棲動(dòng)物群落結(jié)構(gòu)及多樣性
蔡永久,龔志軍,秦伯強(qiáng)
為揭示現(xiàn)階段太湖大型底棲動(dòng)物群落現(xiàn)狀及其對(duì)生態(tài)環(huán)境變化的響應(yīng)。于2007年2月—2008年11月對(duì)太湖大型底棲動(dòng)物進(jìn)行為期兩周年的季度調(diào)查。30個(gè)采樣點(diǎn)共記錄底棲動(dòng)物3門7綱19科40種,底柄動(dòng)物平均密度和生物量空間差異較大,平均密度高值出現(xiàn)在梅梁灣、竺山灣及河口,主要為寡毛綱顫蚓類;平均生物量高值出現(xiàn)在貢湖灣、西湖區(qū)、東太湖和東部湖灣,主要為軟體動(dòng)物?;舾λz蚓(Limnodrilus hoffmeisteri)、中華河吲(Rhyacodrilus sinicus)、河蜆(Corbicula fluminea)、銅銹環(huán)棱螺(Bellamya aeruginosa)、中國(guó)長(zhǎng)足搖蚊(Tanypus chinensis)和鉤蝦屬一種(Gammarus sp.)是現(xiàn)階段太湖大型底棲動(dòng)物的優(yōu)勢(shì)種。聚類分析將30個(gè)采樣點(diǎn)分成3組,相似性分析檢驗(yàn)表明各聚類組大型底棲動(dòng)物群落具有顯著差異(P<0.05)。多樣性分析結(jié)果表明,東太湖和東部湖灣物種多樣性、豐富度和均勻度最高,優(yōu)勢(shì)種為腹足綱螺類;梅梁灣、竺山灣及河口多樣性最低、密度最高,霍甫水絲蚓和中華河蚓在該區(qū)占據(jù)絕對(duì)優(yōu)勢(shì);貢湖灣、湖心和西湖區(qū)多樣性處于中等水平,其優(yōu)勢(shì)種為河蜆。研究結(jié)果表明營(yíng)養(yǎng)水平、底質(zhì)類型以及水生植被的分布是決定太湖大型底棲動(dòng)物群落結(jié)構(gòu)及多樣性的關(guān)鍵因子。
顫蚓科;軟體動(dòng)物;功能攝食類群;空間分布格局;富營(yíng)養(yǎng)化
來(lái)源出版物:生物多樣性, 2010, 18(1): 50-59
入選年份:2013
中華絨螯蟹微衛(wèi)星標(biāo)記與生長(zhǎng)性狀相關(guān)性的初步分析
吳滟,付春鵬,蔣速飛,等
研究采用 30個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記分析同池養(yǎng)殖的長(zhǎng)江水系中華絨螯蟹群體,以篩選生長(zhǎng)性狀(體重、體長(zhǎng)和體寬)相關(guān)的分子標(biāo)記。結(jié)果表明,位點(diǎn)ESIN33、ESC29和ESC57與體重、體寬和體高呈極顯著相關(guān)(P<0.01);位點(diǎn)ESC65與體高、體寬呈極顯著相關(guān)(P<0.01),與體重呈顯著相關(guān)(P<0.05)。不同基因型間的多重比較表明,ESIN33位點(diǎn)的AC基因型、ESC29位點(diǎn)的DD基因型、ESC65位點(diǎn)的BB基因型的平均體重、體寬和體高均高于其他基因型,且差異顯著,是生長(zhǎng)性狀的優(yōu)勢(shì)基因型。研究結(jié)果可為中華絨螯蟹的分子標(biāo)記輔助選育提供參考。
中華絨螯蟹;微衛(wèi)星;生長(zhǎng)性狀;相關(guān)性分析
來(lái)源出版物:水生生物學(xué)報(bào), 2011, 35(2): 197-202
入選年份:2014
南極磷蝦種群生物學(xué)研究進(jìn)展Ⅰ:年齡、生長(zhǎng)與死亡
朱國(guó)平
南極磷蝦通常是指南極大磷蝦(Euphausia superba Dana,1852),它隸屬于節(jié)肢動(dòng)物門(Arthropoda)、甲殼綱(Crustacea)、磷蝦目(Euphausiacea)、磷蝦科(Euphausiidae)、磷蝦屬(Euphausia),個(gè)體最大體長(zhǎng)可達(dá)65 mm,體重2 g,漁業(yè)捕撈的主要磷蝦群體為體長(zhǎng)介于40~65 mm的較大成體。南極磷蝦是南極海域磷蝦類中數(shù)量最多,個(gè)體最大種類,是漁業(yè)的捕撈對(duì)象,最大密度分布在大西洋區(qū)。
南極磷蝦;種群生物學(xué);年齡;生長(zhǎng);死亡
來(lái)源出版物:水生生物學(xué)報(bào), 2011, 35(5): 862-868
入選年份:2014
三疣梭子蟹蛻皮周期中MIH基因mRNA水平與蛻皮激素濃度變化
汪春建,朱冬發(fā),亓一舟,等
甲殼動(dòng)物的蛻皮過(guò)程被認(rèn)為是由位于眼柄的 X器-竇腺?gòu)?fù)合體(XO-SG)分泌蛻皮抑制激素(MIH)通過(guò)調(diào)節(jié)Y器(YO)合成蛻皮激素而調(diào)控的。通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qRT-PCR)發(fā)現(xiàn)MIH基因在三疣梭子蟹眼柄X器-竇腺?gòu)?fù)合體中表達(dá)最強(qiáng)。采用qRT-PCR分析了MIH基因在三疣梭子蟹蛻皮周期中的表達(dá)變化,結(jié)果表明;A期為(0.42±0.08)倍,B期為(1.09±0.09)倍,C期為(1.35±0.16)倍,D0亞期為(1.00±0.10)倍,D1亞期(0.78±0.07)倍,D2亞期為(0.27±0.08)倍,D3/4亞期為(0.20±0.04)倍。采用高效液相色譜-電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)法完成了三疣梭子蟹蛻皮周期中蛻皮激素(20E)濃度變化的測(cè)定。A/B期蛻皮激素的濃度較低,低于儀器檢測(cè)限0.33 pg,C期為(1.666±0.762)ng/mL,D0亞期為(4.047±1.5133)ng/mL,D1亞期為(6.756±4.928)ng/mL,D2亞期為(8.609±3.827)ng/mL,D3亞期為(19.534±4.799)ng/mL,D4亞期為 11.616 ng/mL。在三疣梭子蟹蛻皮周期中,MIH基因表達(dá)量與血淋巴中蛻皮激素濃度呈現(xiàn)一定拮抗性,揭示MIH抑制Y器合成蛻皮激素而調(diào)控著三疣梭子蟹蛻皮的發(fā)生和進(jìn)行。
三疣梭子蟹;蛻皮周期;蛻皮抑制激素;實(shí)時(shí)熒光定量PCR;高效液相色譜-電噴霧串聯(lián)質(zhì)譜
來(lái)源出版物:水生生物學(xué)報(bào), 2013, 37(1): 22-28
入選年份:2014
細(xì)胞自噬的研究方法
馬泰,孫國(guó)平,李家斌
細(xì)胞自噬的研究是目前生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域熱點(diǎn)之一,廣泛參與各種生理和病理過(guò)程。目前普遍采用的自噬檢測(cè)方法包括電鏡、免疫熒光、蛋白質(zhì)印跡等方法檢測(cè)自噬體及其標(biāo)志蛋白。研究的深入對(duì)自噬的檢測(cè)方法也提出了更高的要求,自噬功能障礙包括自噬體形成和降解障礙,因此,準(zhǔn)確全面地評(píng)估自噬不僅包括自噬體的檢測(cè),還包括動(dòng)態(tài)觀察整個(gè)自噬性降解的過(guò)程是否順暢(即自噬潮分析)。另外,通過(guò)藥物或基因干預(yù)技術(shù)來(lái)人為地調(diào)控自噬以觀察其在體內(nèi)體外模型中的作用也是自噬分析的重要內(nèi)容。需要注意的是,任何一種方法單獨(dú)應(yīng)用均不能作為自噬的依據(jù),對(duì)任何方法得到的結(jié)果進(jìn)行解釋時(shí)必須慎重,特別是不能將自噬體的增多減少或自噬相關(guān)蛋白表達(dá)的高低等同于自噬的增強(qiáng)或減弱。
細(xì)胞自噬;自噬體;微管相關(guān)蛋白1輕鏈3;自噬潮;檢測(cè)方法
來(lái)源出版物:生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展, 2012, 39(3): 204-209
入選年份:2014
中藥治療阿爾茨海默病的作用特點(diǎn)
李林,張?zhí)m
阿爾茨海默病(AD)是一種多因素相關(guān)的復(fù)雜性疾病,目前臨床治療效果不佳。僅針對(duì)單靶點(diǎn)或單致病途徑的藥物不易取得好的療效。另一個(gè)重要原因是干預(yù)時(shí)機(jī)太晚,當(dāng)診斷出癡呆時(shí)患者腦內(nèi)已有大量神經(jīng)元死亡。因此,應(yīng)當(dāng)針對(duì)多靶點(diǎn)、多途徑治療,同時(shí)將治療時(shí)機(jī)提前到癡呆發(fā)生前,才有可能在AD的藥物干預(yù)領(lǐng)域?qū)崿F(xiàn)新的突破。本文綜述了作者近十多年來(lái)在中藥治療AD方面的研究工作,包括中藥新復(fù)方參烏膠囊、中藥提取物何首烏二苯乙烯苷、山茱萸環(huán)烯醚萜苷、淫羊藿黃酮和淫羊藿苷對(duì)多種擬AD動(dòng)物模型和細(xì)胞模型的影響及其作用機(jī)制。這些中藥的特點(diǎn)是作用在AD復(fù)雜發(fā)病機(jī)制的多靶點(diǎn)和多途徑,尤其是具有神經(jīng)保護(hù)和神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)/再生作用,且對(duì)線粒體和突觸具有明顯的保護(hù)作用,可望用于AD的早期干預(yù)或輕度認(rèn)知障礙期(MCD的治療,從而阻止或延緩癡呆的發(fā)生與進(jìn)程。
阿爾茨海默病;治療;中藥;參烏膠囊;何首烏二苯乙烯苷;山茱萸環(huán)烯醚萜苷;淫羊藿黃酮;淫羊藿苷;動(dòng)物模型;細(xì)胞模型
來(lái)源出版物:生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展, 2012, 39(8): 816-828
入選年份:2014
長(zhǎng)鏈非編碼RNA的作用機(jī)制及其研究方法
夏天,肖丙秀,郭俊明
長(zhǎng)鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)通過(guò)多種機(jī)制發(fā)揮其生物學(xué)功能,這些機(jī)制包括基因印記、染色質(zhì)重塑、細(xì)胞周期調(diào)控、剪接調(diào)控、mRNA降解和翻譯調(diào)控等。lncRNA通過(guò)這些作用機(jī)制在不同水平進(jìn)行基因表達(dá)調(diào)控。在研究lncRNA功能的過(guò)程中,研究方法的建立和應(yīng)用起著非常重要的作用。目前用于lncRNA研究的主要方法有:微陣列、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、Northern印跡、實(shí)時(shí)熒光定量逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)、熒光原位雜交、RNA干擾和RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀等。文章著重介紹了3種前沿方法,即:在線快速預(yù)測(cè)RNA與蛋白質(zhì)相互作用的catRAPID、RNA純化的染色質(zhì)分離(Chromatin isolation by RNA purification,ChIRP)以及非編碼 RNA沉默與定位分析技術(shù)(Combined knockdown and localization analysis of non-coding RNAs,c-KLAN)。
長(zhǎng)鏈非編碼RNA;作用機(jī)制;基因表達(dá)調(diào)控;研究方法
來(lái)源出版物:遺傳, 2013, 35(3): 269-280
入選年份:2014
植物miRNA的進(jìn)化
魏強(qiáng),梁永宏,李廣林
鑒于miRNA在植物基因表達(dá)調(diào)控中的重要作用,人們已經(jīng)開展對(duì)植物miRNA的預(yù)測(cè)、鑒定、功能和進(jìn)化等方面的研究。隨著許多模式植物基因組測(cè)序的完成,miRNA的基因組學(xué)和進(jìn)化信息的整合為miRNA的起源和進(jìn)化研究提供了越來(lái)越多的證據(jù)和假說(shuō),然而尚未見關(guān)于植物 miRNA進(jìn)化方面的系統(tǒng)報(bào)道。文章從miRNA的起源以及相應(yīng)的幾種假說(shuō)、miRNA的產(chǎn)生和消亡、miRNA的功能進(jìn)化等幾方面來(lái)分析和綜述植物miRNA進(jìn)化的研究進(jìn)展。
miRNA;進(jìn)化;產(chǎn)生和消亡;起源假說(shuō)
來(lái)源出版物:遺傳, 2013, 35(3): 315-323
入選年份:2014
對(duì)家蠶第18連鎖群隱性基因elp、ch-2和mln測(cè)交系的分子定位分析
劉先方,馬曉,侯成香,等
家蠶長(zhǎng)形卵(elp)、第二隱性赤蟻(ch-2)、暗化型(mln)均為第18染色體上的隱性突變,在經(jīng)典連鎖圖譜上的順序和遺傳距離已經(jīng)排定。文章采用正常卵、正常黑蟻及正常白蛾品種P50與包含此3個(gè)隱性突變的三隱性測(cè)交系W18組配正反交群體,F(xiàn)1回交W18后獲得回交群體(P50×W18)♀×W18♂和W18♀×(P50×W18)♂,分別記作 BC1F和 BC1M,利用已構(gòu)建的家蠶SSR分子連鎖圖譜和根據(jù)家蠶基因組精細(xì)圖設(shè)計(jì)的 STS標(biāo)記,對(duì)這3個(gè)突變基因elp、ch-2、mln進(jìn)行了分子定位研究,并根據(jù)家蠶基因組精細(xì)圖,將第18連鎖群的經(jīng)典遺傳圖、分子連鎖圖和基因組物理圖進(jìn)行了對(duì)應(yīng)。整合后的圖譜遺傳距離為 94.2 cm,突變基因和分子標(biāo)記的排列順序分別與形態(tài)標(biāo)記連鎖圖和基因組精細(xì)圖相一致,研究結(jié)果對(duì)家蠶第18染色體上其他突變的定位與克隆有重要的借鑒作用。
家蠶;第 18連鎖群;突變;分子標(biāo)記;基因定位
來(lái)源出版物:遺傳, 2013, 35(3): 373-378
入選年份:2014
山羊GOLA-DQA2基因多態(tài)性與血液免疫性狀的相關(guān)分析
邢鳳,秦孜娟,王桂芝,等
文章采用PCR-RFLP技術(shù)對(duì)萊蕪黑山羊、波爾山羊、魯波山羊3個(gè)山羊種群的GOLA-DQA2基因外顯子2進(jìn)行遺傳多態(tài)性研究,并對(duì)其血液免疫指標(biāo)的效應(yīng)進(jìn)行分析。結(jié)果表明,3個(gè)山羊種群共檢測(cè)到4種基因型,由3個(gè)等位基因控制;GOLA-DQA2基因外顯子2的第77、79、80和169位的堿基表現(xiàn)出多態(tài)性;多數(shù)血液免疫指標(biāo)品種效應(yīng)是主要效應(yīng);魯波山羊中,AB基因型的紅細(xì)胞計(jì)數(shù)、白細(xì)胞計(jì)數(shù)分別顯著高于BB基因型、BC基因型(P<0.05);AB基因型的紅細(xì)胞壓積顯著高于BB、BC基因型(P<0.05);BC基因型的噬中性粒細(xì)胞比率顯著高于 BB基因型(P<0.05);波爾山羊和萊蕪黑山羊中,基因型與血液免疫指標(biāo)之間也有一定的相關(guān)性,但沒有達(dá)到顯著水平。由上述結(jié)果初步推測(cè),在魯波山羊中,AB、BC基因型是影響紅細(xì)胞計(jì)數(shù)、白細(xì)胞總數(shù)、噬中性粒細(xì)胞比率等血液免疫指標(biāo)的重要因素。研究結(jié)果揭示GOLA-DQA2基因與血液免疫指標(biāo)之間有一定的相關(guān)性,可為山羊的抗病育種提供一定的參考。
山羊;MHC-DQA2;PCR-RFLP;多態(tài)性;免疫性狀
來(lái)源出版物:遺傳, 2013, 35(2): 185-191
入選年份:2014
Beta多樣性研究進(jìn)展
陳圣賓,歐陽(yáng)志云,徐衛(wèi)華,等
Beta多樣性度量時(shí)空尺度上物種組成的變化,是生物多樣性的重要組成部分,與許多生態(tài)學(xué)和進(jìn)化生物學(xué)問(wèn)題密切相關(guān),并且其信息可用于保護(hù)區(qū)選址和布局規(guī)劃,因此在最近10 a間成為生物多樣性研究的熱點(diǎn)問(wèn)題之一。多年來(lái),學(xué)者們利用各種度量方式和分析方法,在不同地理區(qū)域,對(duì)許多生物類群beta多樣性的時(shí)空格局和形成機(jī)制進(jìn)行了大量研究。本文主要從beta多樣性的度量方法、時(shí)空格局、形成機(jī)制及其在生物多樣性保護(hù)中的應(yīng)用等幾個(gè)方面,總結(jié)了最近 10 a來(lái)相關(guān)研究的進(jìn)展。Whittaker(1960)最初提出beta多樣性概念時(shí)就缺乏嚴(yán)格的定義,隨著概念的不斷演化,度量方法也同樣呈現(xiàn)出多樣化,而度量手段的多樣化非常不利于不同研究之間的比較。目前應(yīng)用最普遍的度量方法是采用相似性指數(shù),如Jaccard和Sorensen指數(shù)。最近幾年,新的度量方法還在不斷出現(xiàn)。其中一些方法非常值得注意。Beta多樣性具有時(shí)空尺度和分類尺度依賴性,一般隨分析粒度(grain)的增加而降低。雖然有些研究表明beta多樣性隨緯度增加而降低,但學(xué)者們并沒有達(dá)成共識(shí)。山區(qū)和生物地理區(qū)的交界處beta多樣性都比較高,因而需要在這些地區(qū)增加保護(hù)區(qū)的面積或者數(shù)量以囊括物種變化梯度。對(duì)時(shí)間尺度上beta多樣性的研究表明,氣候變化確實(shí)導(dǎo)致了物種組成在時(shí)間上的變化,并且物種在不同大陸和地區(qū)間的遷移導(dǎo)致了生物同質(zhì)化。擴(kuò)散過(guò)程和生態(tài)位過(guò)程共同決定了beta多樣性,只是這兩個(gè)過(guò)程的相對(duì)重要性依尺度、地理區(qū)域和物種類群的不同而有所差異。綜上所述,我們認(rèn)為未來(lái)beta多樣性研究的熱點(diǎn)問(wèn)題是:1)不同生物類群的進(jìn)化歷史和生物學(xué)特征對(duì) beta多樣性的影響;2)不同的時(shí)空尺度對(duì) beta多樣性及其維持機(jī)制的影響;3)人類活動(dòng)對(duì)beta多樣性的影響。
beta多樣性;擴(kuò)散限制;生態(tài)位限制;時(shí)空格局
來(lái)源出版物:生物多樣性, 2010, 18(4): 323-335
入選年份:2014
植物DNA條形碼促進(jìn)系統(tǒng)發(fā)育群落生態(tài)學(xué)發(fā)展
裴男才,張金龍,米湘成,等
系統(tǒng)發(fā)育群落生態(tài)學(xué)是近年興起的一個(gè)重要牛態(tài)學(xué)研究分支,它以群落生態(tài)學(xué)為基礎(chǔ)并引入了系統(tǒng)發(fā)育的分析方法,全面動(dòng)態(tài)地反映了群落中物種內(nèi)和物種間的相互作用關(guān)系,揭示了群落格局形成的生態(tài)學(xué)過(guò)程,研究了生物多樣性的形成及維持機(jī)制。巴拿馬 BCI(Barro Colorado Island)樣地的成功例子說(shuō)明,在固定樣地進(jìn)行長(zhǎng)期的群落生態(tài)與系統(tǒng)發(fā)育研究切實(shí)可行且極具意義;DNA條形碼的快速興起對(duì)這一研究發(fā)揮著重要作用。本文先列舉了群落生態(tài)與系統(tǒng)發(fā)育綜合分析能解決的群落系統(tǒng)發(fā)育結(jié)構(gòu)、群落生態(tài)位結(jié)構(gòu)、生物地理學(xué)和性狀進(jìn)化等生態(tài)學(xué)問(wèn)題;接著介紹了標(biāo)準(zhǔn)植物DNA條形碼以及利用片段組合(rbcL+matK+trnH-psbA)進(jìn)行快速物種識(shí)別和近緣種區(qū)分、精確群落系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的構(gòu)建以及群落生態(tài)學(xué)研究;隨后提出DNA條形碼研究在類群水平上需注意兩片段的條形碼組合(matK+rbcL)在同屬種鑒別能力上的不足,而在較大尺度群落水平上需對(duì)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)進(jìn)行優(yōu)化。DNA條形碼將為探討物種多樣性及其維持機(jī)理、系統(tǒng)發(fā)育beta多樣性以及群落水平上功能性狀進(jìn)化研究提供新的思路。
群落系統(tǒng)發(fā)育重建;群落生態(tài)學(xué);rbcL,matK,trnH-psbA;大型固定樣地;APG分類系統(tǒng)
來(lái)源出版物:生物多樣性, 2011, 19(3): 284-294
入選年份:2014
《名古屋議定書》的主要內(nèi)容及其潛在影響
薛達(dá)元
《生物多樣性公約》第10次締約方大會(huì)(2010年10月,日本名古屋)通過(guò)了《名古屋議定書》,這為全面實(shí)現(xiàn)《生物多樣性公約》的三大目標(biāo),特別是第三項(xiàng)目標(biāo)(公平公正地分享因利用遺傳資源所產(chǎn)生的惠益)邁出了關(guān)鍵一步。建立遺傳資源及相關(guān)傳統(tǒng)知識(shí)獲取與惠益分享(ABS)國(guó)際制度是《生物多樣性公約》過(guò)去10年來(lái)的一項(xiàng)主要任務(wù),《公約》締約方大會(huì)于2000年專門建立了“ABS工作組”,致力于該ABS國(guó)際制度的談判。自2001年在德國(guó)波恩召開ABS工作組第1次會(huì)議到《名古屋議定書》達(dá)成,一共召開了9次工作組會(huì)議,其中第9次工作組會(huì)議召開了3次續(xù)會(huì)?!睹盼葑h定書》的主要內(nèi)容包括:議定書目標(biāo);適用范圍;獲取遺傳資源及相關(guān)傳統(tǒng)知識(shí)的要求(事先知情同意程序);“共同商定條件”下公平分享因利用遺傳資源和相關(guān)傳統(tǒng)知識(shí)所產(chǎn)生的惠益;確保遵約的措施,包括披露遺傳資源來(lái)源與原產(chǎn)地,遺傳資源合法來(lái)源證書和監(jiān)測(cè)遵約的檢查點(diǎn);能力建設(shè)等。談判中最為核心的問(wèn)題是遺傳資源的定義是否包括衍生物,以及采取何種措施監(jiān)測(cè)遺傳資源的利用。因分歧太大,議定書文本未能規(guī)定在申請(qǐng)專利時(shí)強(qiáng)制性披露遺傳資源來(lái)源及原產(chǎn)地,對(duì)建立遵約的監(jiān)測(cè)檢查點(diǎn)也未嚴(yán)格要求,在處理收集保存庫(kù)中遺傳資源的獲取與惠益分享方面也不太明確。中國(guó)是全球生物多樣性最為豐富的國(guó)家之一,是遺傳資源重要提供國(guó)?!睹盼葑h定書》的通過(guò)和實(shí)施將對(duì)加強(qiáng)中國(guó)生物遺傳資源的保護(hù)及促進(jìn)其公平惠益分享具有重要意義。中國(guó)需要加強(qiáng)國(guó)家層次的立法,以配合議定書的實(shí)施。
生物多樣性公約;獲取與惠益分享;遺傳資源;傳統(tǒng)知識(shí);潛在影響;ABS;CBD
來(lái)源出版物:生物多樣性, 2011, 19(1): 113-119
入選年份:2014
馬鞍列島巖礁生境魚類群落生態(tài)學(xué).Ⅰ.種類組成和多樣性
汪振華,章守宇,陳清滿,等
為了解潮下帶巖礁生境的魚類區(qū)系特征,于2009年對(duì)馬鞍列島巖礁生境進(jìn)行了12個(gè)月的多網(wǎng)目組合刺網(wǎng)采樣,從分類學(xué)和生態(tài)型組成等方面,結(jié)合多樣性和相對(duì)重要性指數(shù),對(duì)該生境的魚類組成和多樣性特征進(jìn)行了分析。全年共采集魚類87種,隸屬2綱14目50科73屬。其中鱸形目魚類51種,占58.6%;趨礁性魚類49種,占56.3%;放流魚類7種,占8%。所有魚類個(gè)體中,幼魚的總比例為67.4%。暖水種、暖溫種和冷溫種分別為50、36和1種;底層、近底層和中上層魚類各為 19、46和 22種,其中褐菖鲉(Sebastiscus marmoratus)、黃姑魚(Nibea albitflora)和赤鼻棱鯤(Thryssa kammalensis)分別為各水層的絕對(duì)優(yōu)勢(shì)種;定居種、季節(jié)性洄游種和偶見種各為32、55和11種。巖礁生境魚類多樣性呈現(xiàn)明顯的季節(jié)變化特征,2月份最低,9月份最高。研究結(jié)果表明,馬鞍列島巖礁生境是以趨礁魚類為特征群體、暖水性和暖溫性魚類共同主導(dǎo)、各個(gè)類型的幼魚在夏秋季集群出現(xiàn)、同時(shí)也分布了一定量放流種的高魚類多樣性棲息地,它為各種魚類提供了優(yōu)良的攝食、避敵和繁殖場(chǎng)所,是近岸海洋生態(tài)系統(tǒng)中相當(dāng)重要的生境。然而相比過(guò)去,該生境的魚類多樣性已經(jīng)大大降低,因此需對(duì)其保護(hù)工作予以更多關(guān)注。
巖礁生境;魚類群落;放流種;生態(tài)類型;馬鞍列島
來(lái)源出版物:生物多樣性, 2012, 20(1): 41-50
入選年份:2014
DNA條形碼技術(shù)在青海海東地區(qū)小型獸類鑒定中的應(yīng)用
馬英,李海龍,魯亮,等
為彌補(bǔ)傳統(tǒng)形態(tài)分類方法的不足,探究應(yīng)用DNA條形碼技術(shù)進(jìn)行分子生物學(xué)鑒定的可行性,本研究用DNA條形碼技術(shù)檢測(cè)了青海省海東地區(qū)3目6科14屬18種110只小型獸類的COI基因部分序列。分析所測(cè)COI基因序列可知:種內(nèi)遺傳距離≤3%,種間遺傳距離5%~10%,屬間遺傳距離12%~19%,種間遺傳距離顯著大于種內(nèi)遺傳距離。NJ樹顯示同種個(gè)體聚為有很高支持度的單一分支。有6個(gè)個(gè)體(4只黃胸鼠、2只小家鼠)在現(xiàn)場(chǎng)鑒定中被誤定為其他種類。研究結(jié)果表明使用條形碼技術(shù)能糾正形態(tài)學(xué)鑒定中的錯(cuò)誤,也說(shuō)明動(dòng)物線粒體COI基因是一個(gè)有效的DNA條形碼標(biāo)準(zhǔn)基因。
DNA條形碼;小獸;COI基因
來(lái)源出版物:生物多樣性, 2012, 20(2): 193-198
入選年份:2014
近十年中國(guó)生物入侵研究進(jìn)展
鞠瑞亭,李慧,石正人,等
生物入侵已對(duì)入侵區(qū)的生態(tài)環(huán)境、社會(huì)經(jīng)濟(jì)和人類健康造成了嚴(yán)重的威脅,成為了21世紀(jì)5大全球性環(huán)境問(wèn)題之一。本文回顧了2000年以來(lái),中國(guó)生物入侵研究領(lǐng)域尤其是入侵種的多樣性與格局、入侵機(jī)制及生態(tài)學(xué)效應(yīng)、管理與控制等方面所取得的重要進(jìn)展,討論了需進(jìn)一步加強(qiáng)研究的領(lǐng)域,以期為進(jìn)一步拓展該領(lǐng)域研究的廣度和深度、為我國(guó)的生物入侵預(yù)警預(yù)防和科學(xué)治理提供參考。據(jù)初步研究,中國(guó)的入侵種數(shù)量已達(dá)529種,其中陸生植物、陸生無(wú)脊椎動(dòng)物和微生物為主要入侵類群;原產(chǎn)地以北美洲和南美洲為主;經(jīng)濟(jì)發(fā)達(dá)和氣候溫暖濕潤(rùn)的東部和南部省份入侵態(tài)勢(shì)明顯較西部和北部省份嚴(yán)重;隨著中國(guó)經(jīng)濟(jì)的進(jìn)一步發(fā)展,生物入侵問(wèn)題將可能更加嚴(yán)峻。外來(lái)種的成功入侵是其內(nèi)稟優(yōu)勢(shì)、資源機(jī)遇和人為干擾共同作用的結(jié)果;其中,表型可塑性、適應(yīng)性進(jìn)化、天敵釋放、種間互利或偏利共生和新化感作用等因素對(duì)入侵起到了關(guān)鍵作用。生物入侵已對(duì)中國(guó)土著生態(tài)系統(tǒng)的生物多樣性和生態(tài)系統(tǒng)服務(wù)功能造成了嚴(yán)重影響,打破了生態(tài)系統(tǒng)的固有平衡,危害或威脅到中國(guó)的農(nóng)林牧漁業(yè)生產(chǎn)、交通航運(yùn)、環(huán)境、人類健康和公共設(shè)施安全。針對(duì)生物入侵的管理與控制,中國(guó)加強(qiáng)了包括檢測(cè)監(jiān)測(cè)、風(fēng)險(xiǎn)分析、生物防治、擴(kuò)散阻斷、根治滅除和生態(tài)恢復(fù)等技術(shù)體系的研究和實(shí)施,并初步控制了一些重要入侵種的擴(kuò)張。中國(guó)生物入侵需要在全境性科學(xué)考察、生物入侵的遺傳學(xué)、基因組學(xué)、生態(tài)系統(tǒng)影響、全球變化和管理與控制技術(shù)創(chuàng)新等領(lǐng)域進(jìn)一步加強(qiáng)跨領(lǐng)域的交叉合作和系統(tǒng)研究。
生物入侵;中國(guó);管理與控制;多樣性;生態(tài)學(xué)效應(yīng);入侵機(jī)制
來(lái)源出版物:生物多樣性, 2012, 20(5): 581-611
入選年份:2014
中國(guó)微生物物種多樣性研究進(jìn)展
郭良棟
微生物是分布最為廣泛的生命形式,幾乎分布到地球上的所有生境,具有豐富的物種多樣性。我國(guó)地域遼闊,跨越熱帶至寒溫帶,氣候條件多樣,地理環(huán)境與生態(tài)系統(tǒng)類型復(fù)雜,是世界上生物多樣性最豐富的國(guó)家之一。我國(guó)已開展了大量微生物多樣性研究,并證實(shí)我國(guó)多樣的生境蘊(yùn)藏著豐富的微生物物種多樣性。目前我國(guó)已報(bào)道真核微生物(菌物)約14700種,其中包括真菌約14060種、卵菌約300種、黏菌約340種,而真菌中有藥用菌473種、食用菌966個(gè)分類單元。特別是近年來(lái)通過(guò)免培養(yǎng)的分子生物學(xué)技術(shù)發(fā)現(xiàn)我國(guó)存在豐富的原核微生物多樣性。本文概述了傳統(tǒng)方法和現(xiàn)代分子生物學(xué)技術(shù)在我國(guó)原核微生物(古菌、細(xì)菌)和真核微生物(真菌、卵菌、黏菌)物種多樣性研究的最新進(jìn)展。
真核微生物;原核微生物;物種多樣性;培養(yǎng)方法;分子技術(shù)
來(lái)源出版物:生物多樣性, 2012, 20(5): 572-580
入選年份:2014
REDD+活動(dòng)對(duì)生物多樣性保護(hù)的潛在影響
雪明,安麗丹,武曙紅,等
基于《聯(lián)合國(guó)氣候變化框架公約》(UNFCCC)對(duì)減少毀林和森林退化引起的碳排放活動(dòng)類型(REDD+)的規(guī)定和《生物多樣性公約》(CBD)對(duì)生物多樣性保障措施的要求,分析了避免毀林和森林退化、可持續(xù)森林管理、森林保護(hù)以及造林等減少森林碳排放和增加森林碳儲(chǔ)量的 REDD+活動(dòng)類型對(duì)生物多樣性可能產(chǎn)生的正面和負(fù)面影響,并就確保 REDD+各種活動(dòng)對(duì)生物多樣性發(fā)揮積極影響提出了相應(yīng)的方法和措施。REDD+活動(dòng)對(duì)生物多樣性的影響將取決于REDD+活動(dòng)的規(guī)模、類型以及生物多樣性安全保障措施的實(shí)施。設(shè)計(jì) REDD+活動(dòng)時(shí)應(yīng)充分考慮其對(duì)生物多樣性及其他多重效益的利弊,執(zhí)行 REDD+活動(dòng)時(shí)應(yīng)采取適當(dāng)?shù)恼吆痛胧﹣?lái)保護(hù)和提高生物多樣性,國(guó)家政府和當(dāng)?shù)厣鐓^(qū)等利益相關(guān)者共同協(xié)商和進(jìn)行密切的合作是確保 REDD+活動(dòng)成功實(shí)施的關(guān)鍵。為確保我國(guó)將來(lái)可能實(shí)施的 REDD+活動(dòng)有利于生物多樣性的保護(hù),國(guó)家在構(gòu)建國(guó)家方案、政策措施、機(jī)構(gòu)設(shè)置和監(jiān)測(cè)體系時(shí),應(yīng)從保護(hù)目標(biāo)、機(jī)構(gòu)責(zé)任、利益相關(guān)群體、實(shí)施方案和監(jiān)測(cè)計(jì)劃等方面制定相應(yīng)的保障措施。
REDD;氣候變化;生物多樣性保障措施;國(guó)際公約
來(lái)源出版物:生物多樣性, 2013, 21(2): 238-244
入選年份:2014
利用TALENs和手工克隆技術(shù)高效獲得GHR基因敲除巴馬豬
李飛達(dá),李勇,劉歡,等
DNA編輯技術(shù)是基因靶向修飾技術(shù)的研究熱點(diǎn),已廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)學(xué)和農(nóng)業(yè)研究。然而,傳統(tǒng)基因打靶技術(shù)存在效率低、成本高、工作量大等缺點(diǎn),其應(yīng)用受到了極大的限制。文章利用最近發(fā)展起來(lái)的新型人工核酸酶-轉(zhuǎn)錄激活因子樣效應(yīng)物核酸酶(transcription activator-like effector nuclease,TALENs)介導(dǎo)的基因組定點(diǎn)修飾技術(shù),通過(guò)構(gòu)建特異識(shí)別豬生長(zhǎng)激素受體(GHR)基因的TALENs表達(dá)載體,共轉(zhuǎn)染巴馬胎豬成纖維細(xì)胞系,酶切鑒定G418抗性克隆細(xì)胞株的基因修飾效率為46.2%,其中2個(gè)為雙等位基因敲除的克隆細(xì)胞株。以雙等位基因敲除的克隆細(xì)胞株為核供體,利用手工克隆技術(shù)制備GHR-KO巴馬豬克隆胚,第6 d囊胚率為43.5%,654枚體外發(fā)育的囊胚移植6頭受體母豬,共獲得10頭存活的GHR-KO巴馬仔豬,其中7頭為雙等位基因敲除。體重檢測(cè)結(jié)果顯示,第 20周齡的GHR-KO巴馬豬體重僅為對(duì)照巴馬豬的50%。研究結(jié)果表明,TALENs和手工克隆技術(shù)能夠高效制備出基因敲除大動(dòng)物。GHR-KO巴馬豬的成功制備為研究豬 GHR基因生理功能以及人類侏儒癥分子機(jī)理提供了重要模型,也證明該技術(shù)比傳統(tǒng)基因打靶和克隆技術(shù)具備更簡(jiǎn)捷、快速、高效,更易于在生物醫(yī)學(xué)和農(nóng)業(yè)基因靶向修飾研究中推廣。
基因敲除;TALENs;手工克?。籊HR-KO
來(lái)源出版物:遺傳, 2014, 36(9): 903-911
入選年份:2014
馬鈴薯Y病毒福建分離物P1基因的分子變異和結(jié)構(gòu)特征
史鳳陽(yáng),高芳鑾,沈建國(guó),等
為揭示馬鈴薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)P1基因的分子變異及結(jié)構(gòu)特征,并查明福建分離物 P1基因的變異來(lái)源。文章設(shè)計(jì)一對(duì)簡(jiǎn)并引物從感染 PVY的馬鈴薯病葉擴(kuò)增、克隆獲得福建分離物P1基因的cDNA全長(zhǎng)序列,分析其核苷酸序列和氨基酸序列的特征,并采用貝葉斯法重建P1基因的系統(tǒng)發(fā)育樹。結(jié)果顯示,12個(gè)福建分離物均成功擴(kuò)增出預(yù)期大?。s915 bp)的特異性片段,P1基因的核苷酸序列與已報(bào)道的 PVY不同株系的核苷酸序列一致性為73%~99%;QK44,XT02,XT08,LH05分離物的309 nt位置均檢測(cè)到一個(gè)強(qiáng)烈的重組信號(hào)。12個(gè)PVY分離物中,P1蛋白有85個(gè)變異的氨基酸位點(diǎn),表明其高度變異;P1蛋白的第41~275位是一個(gè)高度保守的結(jié)構(gòu)功能域,含有3個(gè)保守的活性位點(diǎn)(H192、D201、V235);系統(tǒng)發(fā)育分析顯示,福建分離物形聚為 3種不同的簇,其對(duì)應(yīng)的卷曲結(jié)構(gòu)(Coiled-coil domain)和空間結(jié)構(gòu)也不相同,表明不同株系型的 P1基因在系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系上分化較大。該研究結(jié)果表明PVY P1基因在核苷酸序列、氨基酸序列以及空間結(jié)構(gòu)具有高度變異性,但行使 P1蛋白功能的活性位點(diǎn)所在的氨基酸(H192、D201和V235)均高度保守;福建分離物 P1基因的變異源主要來(lái)自堿基突變和基因重組。
馬鈴薯Y病毒;P1基因;變異;重組
來(lái)源出版物:遺傳, 2014, 36(7): 713-722
入選年份:2014
用于目標(biāo)序列染色體定位的鏡鯉BAC-FISH體系構(gòu)建
鄧海霞,趙紫霞,徐鵬,等
為了構(gòu)建用于鏡鯉(Cyprinus carpio var. specularis)特定基因組序列染色體定位的實(shí)驗(yàn)體系,在細(xì)菌人工染色體(Bacterial Artificial Chromosome,BAC)文庫(kù)篩選池中對(duì)已知短序列基因組片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增,篩選出包含目標(biāo)序列的BAC克隆,提取BAC質(zhì)粒進(jìn)行缺刻平移標(biāo)記制備探針,開展熒光原位雜交(Fluorescence in situ hybridization,F(xiàn)ISH)實(shí)驗(yàn)。通過(guò)對(duì)染色體片前處理、BAC質(zhì)粒探針制備、C0t-1 DNA封閉基因組重復(fù)序列、預(yù)雜交、熒光染料選擇、信號(hào)放大等一系列實(shí)驗(yàn)條件和方法的探索優(yōu)化,成功實(shí)現(xiàn)了目標(biāo)序列在鏡鯉有絲分裂中期染色體上的定位。定位對(duì)象既包括在染色體上有單一位點(diǎn)的序列,如斑馬魚微衛(wèi)星標(biāo)記Z6884和Z4268,也包括在染色體上有多個(gè)位點(diǎn)的重復(fù)序列,如黃河鯉性別相關(guān)標(biāo)記 CCmf1。來(lái)自斑馬魚同一條染色體上的兩個(gè)微衛(wèi)星標(biāo)記被分別定位于鏡鯉不同染色體上,為鯉魚染色體數(shù)目加倍的進(jìn)化假設(shè)提供了一項(xiàng)直接實(shí)驗(yàn)證據(jù),同時(shí)將現(xiàn)有遺傳連鎖圖譜與染色體對(duì)應(yīng)起來(lái),可作為染色體識(shí)別和細(xì)胞遺傳學(xué)圖譜構(gòu)建的依據(jù)。黃河鯉性別相關(guān)重復(fù)序列被定位于不少于四條染色體上,為性別決定相關(guān)基因的篩查提供了研究線索。這一 BAC-FISH實(shí)驗(yàn)體系將成為鯉細(xì)胞遺傳學(xué)圖譜構(gòu)建、基因組進(jìn)化和比較基因組學(xué)研究中的重要研究工具。
鏡鯉;細(xì)菌人工染色體;熒光原位雜交;染色體定位
來(lái)源出版物:水生生物學(xué)報(bào), 2013, 37(3): 467-472
入選年份:2013
擬南芥YUAN1基因調(diào)控器官形狀和大小
張海瑞,徐冉,高玉梅,等
器官形狀和大小的控制是一個(gè)基本的發(fā)育生物學(xué)過(guò)程,受細(xì)胞分裂和細(xì)胞擴(kuò)展的影響。到目前為止,人們對(duì)植物器官形狀和大小的調(diào)控機(jī)制知之甚少。本實(shí)驗(yàn)室前期研究發(fā)現(xiàn)了一個(gè)種子和器官大小的調(diào)控基因DA1,其編碼一個(gè)泛素受體。在擬南芥(Arabidopsis thaliana)中,DA1通過(guò)抑制細(xì)胞的分裂來(lái)限制種子和器官的大小。本研究通過(guò)激活標(biāo)簽的方法在da1-1突變體背景下篩選到一個(gè)葉子形狀發(fā)生改變的半顯性突變體(yuan1-1D)。yuan1-1D形成短而圓的葉片和短的葉柄,細(xì)胞學(xué)分析顯示,葉片和葉柄變短的主要原因是細(xì)胞的長(zhǎng)向擴(kuò)展降低導(dǎo)致的。YUAN1編碼一個(gè)含有PHD鋅指結(jié)構(gòu)域的蛋白。GFP-YUAN1融合蛋白定位在細(xì)胞核內(nèi)。過(guò)量表達(dá) YUAN1基因?qū)е氯~片和葉柄變短。遺傳學(xué)分析顯示,YUAN1和DA1、ROT3以及ROT4在控制葉片形狀和大小方面作用于不同的遺傳途徑中。因此,本研究鑒定了一個(gè)新的控制器官形狀和大小的基因YUAN1,為闡明植物器官形狀和大小調(diào)控的分子機(jī)制提供了重要線索。
YUAN1;PHD鋅指結(jié)構(gòu)域;器官形狀和大?。患?xì)胞伸長(zhǎng)
來(lái)源出版物:遺傳, 2013, 35(9): 1106―1116
入選年份:2013
1977—2008年中國(guó)森林生物量碳匯的時(shí)空變化
郭兆迪,胡會(huì)峰,李品,等
森林在區(qū)域和全球碳循環(huán)中起著關(guān)鍵作用。研究中國(guó)森林生物量碳源匯變化對(duì)于估算區(qū)域碳收支和制定應(yīng)對(duì)氣候變化的森林管理政策有重要意義。利用1977—2008年間6期的森林資源清查資料,通過(guò)評(píng)估生物量碳庫(kù)變化來(lái)估算中國(guó)森林生物量碳匯大小及其變化。森林按其用途和形態(tài)特征,分為林分、經(jīng)濟(jì)林和竹林三大類別。采用連續(xù)生物量轉(zhuǎn)換因子法估算林分生物量碳庫(kù),平均生物量法估算經(jīng)濟(jì)林和竹林生物量碳庫(kù)。結(jié)果顯示,在1977—2008年間,中國(guó)森林生物量碳庫(kù)累計(jì)增加(即生物量碳匯)1896 TgC(1 Tg=1012 g),其中,林分、經(jīng)濟(jì)林和竹林分別增加1710、108和78 TgC;年均生物量碳匯為70.2 TgC/a,相當(dāng)于抵消中國(guó)同期化石燃料排放CO2的7.8%。研究還表明,中國(guó)人工林的生物量碳庫(kù)持續(xù)增加,生物量碳匯為818 TgC,占林分總碳匯的47.8%;各齡級(jí)林分的生物量碳匯都有不同程度的增加:老齡林、中齡林和幼齡林分別增加 930、391和388 TgC。由于現(xiàn)階段中國(guó)森林具有林齡小、平均碳密度低和人工林面積大的特點(diǎn),因此未來(lái)中國(guó)森林生物量增匯潛力巨大。
森林;生物量碳庫(kù);碳匯;森林資源清查;中國(guó)
來(lái)源出版物:中國(guó)科學(xué):生命科學(xué), 2013, 43(5): 421-431
入選年份:2013
中國(guó)草地生態(tài)系統(tǒng)碳庫(kù)及其變化
方精云,楊元合,馬文紅,等
準(zhǔn)確評(píng)估草地生態(tài)系統(tǒng)碳庫(kù)及其年際變化,對(duì)揭示草地在中國(guó)陸地生態(tài)系統(tǒng)碳循環(huán)中的作用以及合理利用有限的草地資源有著極為重要的意義。雖然中國(guó)學(xué)者在研究草地碳庫(kù)及其動(dòng)態(tài)變化方面已開展了很多工作,但目前仍缺乏對(duì)中國(guó)草地生態(tài)系統(tǒng)碳庫(kù)及其動(dòng)態(tài)變化特征的全面認(rèn)識(shí)。通過(guò)綜述當(dāng)前中國(guó)草地碳循環(huán)研究的最新進(jìn)展,結(jié)合本研究組的工作,試圖全面評(píng)價(jià)中國(guó)草地生態(tài)系統(tǒng)碳庫(kù)(植被生物量碳庫(kù)和土壤有機(jī)碳庫(kù))及其動(dòng)態(tài)變化。結(jié)果顯示:1)不同研究得到的中國(guó)草地生物量碳密度(單位面積生物量)存在較大差異,為215.8~348.1 g C/m2,平均值為300.2 g C/m2。同樣,對(duì)中國(guó)草地土壤有機(jī)碳密度(單位面積土壤碳庫(kù))的估算也存在顯著差異,在8.5~15.1 kg C/m2之間變動(dòng),但考慮到 8.5 kg/m2的估算值是基于近千個(gè)土壤剖面的實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)計(jì)算得到,全國(guó)平均水平的土壤碳密度一般不會(huì)超過(guò)此值。因此,若采用目前最廣泛使用的草地面積(331×104 km2),那么中國(guó)草地生態(tài)系統(tǒng)碳庫(kù)約為29.1 Pg C(1 Pg=1×1015g),其中96.6%的碳儲(chǔ)存于土壤有機(jī)質(zhì)中。2)文獻(xiàn)報(bào)道的近20 a中國(guó)草地生物量和土壤有機(jī)碳庫(kù)的變化方向和變化量均存在差異。按照最新的估算,中國(guó)草地生物量和土壤有機(jī)碳庫(kù)在過(guò)去20 a里沒有發(fā)生顯著變化,即中國(guó)草地生態(tài)系統(tǒng)處于中性碳匯狀態(tài)。3)中國(guó)草地生物量的時(shí)空變異與降水量的變化關(guān)系密切。土壤有機(jī)碳庫(kù)的空間變異主要受與降水量密切相關(guān)的土壤水分的影響,但土壤質(zhì)地等因素也起一定作用。此外,放牧與圍封等人類活動(dòng)將對(duì)草地生物量和土壤碳庫(kù)及其動(dòng)態(tài)變化產(chǎn)生強(qiáng)烈影響。
溫帶草地;高寒草地;生物量;土壤有機(jī)碳庫(kù);氣候變化;碳匯;土壤質(zhì)地
來(lái)源出版物:中國(guó)科學(xué):生命科學(xué), 2010, 40(7): 566-576
入選年份:2013
下一代測(cè)序技術(shù):技術(shù)回顧與展望
周曉光,任魯風(fēng),李運(yùn)濤,等
在過(guò)去的30年中,作為最重要的生物醫(yī)學(xué)研究手段之一,DNA測(cè)序技術(shù)的數(shù)據(jù)產(chǎn)出能力呈指數(shù)增長(zhǎng),而且這一技術(shù)本身也演變成為一個(gè)面向工程學(xué)和物理學(xué)的新技術(shù)領(lǐng)域。本文分析了下一代測(cè)序儀的技術(shù)特點(diǎn),并對(duì)其未來(lái)的發(fā)展以及應(yīng)用進(jìn)行了前瞻性的展望。預(yù)期在剛剛出現(xiàn)的技術(shù)中,有些技術(shù)假以時(shí)日能夠發(fā)展成熟,實(shí)現(xiàn)1000美元基因組和100美元基因組的目標(biāo)。同時(shí)建議中國(guó)科學(xué)家在這場(chǎng)對(duì)科學(xué)研究以及社會(huì)醫(yī)療保健體系都將產(chǎn)生深遠(yuǎn)影響的運(yùn)動(dòng)中發(fā)揮積極的作用。
基因組學(xué);DNA測(cè)序;下一代測(cè)序技術(shù);測(cè)序儀
來(lái)源出版物:中國(guó)科學(xué):生命科學(xué), 2010, 40(1): 23-37
入選年份:2013
斑點(diǎn)叉尾鮰和雜交鱘幼魚晝夜攝食節(jié)律和胃腸排空時(shí)間的研究
董桂芳,楊嚴(yán)鷗,陳路,等
采用一次飽食投喂(將一晝夜分為8個(gè)時(shí)間段,每個(gè)時(shí)間段作為一個(gè)處理組,每天每個(gè)處理組飽食投喂一次)和分段式連續(xù)投喂(將一晝夜分為8個(gè)時(shí)間段,每天每個(gè)實(shí)驗(yàn)缸連續(xù)投喂8次)兩種方法研究斑點(diǎn)叉尾和雜交鱘幼魚的晝夜攝食節(jié)律,同時(shí)研究它們?cè)跀z食后24 h內(nèi)胃和全腸的排空時(shí)間。結(jié)果顯示,在兩種投喂方式下,斑點(diǎn)叉尾均表現(xiàn)出24 h一周期的攝食節(jié)律,兩個(gè)日攝食率高峰值均出現(xiàn)在06︰00和18︰00(P<0.05)。雜交鱘在一次飽食投喂下表現(xiàn)出 24 h一周期的攝食節(jié)律,高峰值分別出現(xiàn)在11︰00、17︰00和05︰00,在分段式連續(xù)投喂時(shí)表現(xiàn)出48 h一周期的攝食節(jié)律,高峰值分別出現(xiàn)在11︰00、17︰00和36︰00。在攝食后1~9 h內(nèi),斑點(diǎn)叉尾的胃內(nèi)含物比率急劇降低(P<0.05),并在24 h時(shí)出現(xiàn)極低值(P<0.05),而1~9 h內(nèi)全腸內(nèi)含物比率迅速升高(P<0.05),在9 h時(shí)達(dá)到最大(P<0.05),在24 h出現(xiàn)極低值(P<0.05)。在攝食后1~7 h內(nèi),雜交鱘的胃內(nèi)含物比率迅速下降(P<0.05),在24 h時(shí)出現(xiàn)極低值(P<0.05),1~7 h內(nèi)腸內(nèi)含物比率迅速升高(P<0.05),24 h時(shí)呈現(xiàn)極低值(P<0.05)。結(jié)果表明,兩種實(shí)驗(yàn)魚表現(xiàn)出不同的晝夜攝食節(jié)律,該節(jié)律受各自胃腸排空時(shí)間的影響,也受投喂時(shí)間的影響。研究建議,在斑點(diǎn)叉尾和雜交鱘幼魚的養(yǎng)殖中宜在光線較弱的清晨(05︰00~06︰00)和黃昏(17︰00~18︰00)進(jìn)行投喂。
晝夜攝食節(jié)律;胃腸排空時(shí)間;一次飽食投喂;分段式連續(xù)投喂;斑點(diǎn)叉尾;雜交鱘
來(lái)源出版物:水生生物學(xué)報(bào), 2013, 37(5): 876-884
入選年份:2013
成年斑馬魚脊髓損傷修復(fù)中腦gdnf和nos基因的表達(dá)
謝琳,房萍,林金飛,等
成年斑馬魚(Danio rerio)具有很強(qiáng)的脊髓損傷后自主修復(fù)的能力,但目前其機(jī)制不明。為了研究斑馬魚中腦組織對(duì)脊髓再生的影響,文章應(yīng)用成年斑馬魚脊髓損傷模型,采用實(shí)時(shí)定量 PCR方法和原位雜交技術(shù),檢測(cè)了斑馬魚腦中膠質(zhì)細(xì)胞源性神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子(gdnf)和一氧化氮合酶(nos)基因在脊髓損傷后4 h、12 h、6 d、11 d的表達(dá)情況,展示了這兩種基因在斑馬魚腦內(nèi)不同核團(tuán)的動(dòng)態(tài)表達(dá)變化。結(jié)果顯示,成年斑馬魚脊髓損傷后,神經(jīng)營(yíng)養(yǎng)因子gdnf基因在損傷急性期(4 h、12 h)和神經(jīng)修復(fù)期(6 d、11 d)于斑馬魚腦內(nèi)呈現(xiàn)顯著性升高(P<0.05),而一氧化氮合酶基因nos的表達(dá)于損傷急性期顯著性升高(P<0.05),隨后下降,并在修復(fù)期(11 d)顯著降低(P<0.05)。這表明,脊髓損傷后,高表達(dá)gdnf基因同時(shí)低表達(dá)nos基因的腦環(huán)境給脊髓損傷提供了良好的神經(jīng)再生微環(huán)境,從而可能促進(jìn)軸突的再生長(zhǎng)及運(yùn)動(dòng)能力的恢復(fù)。
脊髓損傷;神經(jīng)修復(fù);斑馬魚;gdnf;nos
來(lái)源出版物:遺傳, 2013, 35(4): 495―501
入選年份:2013
線粒體全基因組測(cè)序探尋高原環(huán)境對(duì)Artemia tibetiana和A. urmiana鹵蟲種線粒體基因的影響
張航曉,羅奇斌,孫婧,等
鹵蟲(Artemia)屬甲殼綱無(wú)背甲目,生活于高鹽環(huán)境中,低海拔和高海拔地區(qū)均有分布,在適應(yīng)不同環(huán)境需求的過(guò)程中形成了遺傳的多樣性。為研究鹵蟲表型的可塑性,本研究對(duì)2個(gè)來(lái)自青藏高原的A. tibetiana和1個(gè)來(lái)自伊朗烏爾米耶湖的A. urmiana的線粒體進(jìn)行了全基因組測(cè)序,將獲得的3個(gè)序列信息與另一低海拔平原上的鹵蟲種A. franciscana進(jìn)行比較分析。在線粒體蛋白編碼基因的序列比對(duì)中發(fā)現(xiàn):A. franciscana和 A. tibetiana/A. urmiana組間atp8基因的Ka/Ks值最高,而A. tibetiana和A. urmiana組間,atp6基因的Ka/Ks值最高。鑒于A. tibetiana和A. urmiana遺傳距離較近,但分別分布于高海拔和低海拔,環(huán)境差異顯著,提示在高原環(huán)境適應(yīng)過(guò)程中 atp6基因可能受到強(qiáng)的選擇壓力。在D-loop區(qū)鑒別到2個(gè)延長(zhǎng)終止相關(guān)的序列(ETASs)和3個(gè)保守序列塊(CSBs),猜測(cè)D-loop或者呼吸鏈亞基的序列變化,可單獨(dú)或共作用促進(jìn)鹵蟲適應(yīng)不同海拔環(huán)境。
線粒體基因組;Artemia tibetiana;序列變化;高原物種
來(lái)源出版物:中國(guó)科學(xué):生命科學(xué), 2013, 43(4): 319-331
入選年份:2013