滑留帥,茹文秀,白獻(xiàn)曉,龔世平
(1.廣東省生物資源應(yīng)用研究所,廣東 廣州 510260;
2.河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;
3.西北農(nóng)林科技大學(xué)動物科技學(xué)院)
專論綜述
動物溫度依賴型性別決定中的表觀遺傳學(xué)機(jī)制
滑留帥1,2,茹文秀1,3,白獻(xiàn)曉2,龔世平1*
(1.廣東省生物資源應(yīng)用研究所,廣東 廣州 510260;
2.河南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;
3.西北農(nóng)林科技大學(xué)動物科技學(xué)院)
性別決定是生物學(xué)的一個核心問題,其中動物的溫度依賴型性別決定(TSD)是一個復(fù)雜而有趣的生物學(xué)現(xiàn)象。激素和性別決定相關(guān)基因在動物TSD中的調(diào)控作用已經(jīng)有較為全面的研究,但是激素水平和性別決定相關(guān)基因如何響應(yīng)環(huán)境溫度的變化仍不明確。最近的表觀遺傳學(xué)研究表明,環(huán)境溫度通過表觀遺傳修飾的方式改變性別決定相關(guān)基因的表達(dá)變化,可能是動物TSD的重要調(diào)控方式。例如,芳香化酶是合成雌激素的限速酶,而溫度誘導(dǎo)的芳香化酶基因啟動子區(qū)甲基化是黑鯛魚和紅耳龜?shù)萒SD動物性別決定的關(guān)鍵;除甲基化修飾外,ncRNAs和組蛋白修飾均被證明參與了GSD動物的性別決定過程,但是對于TSD動物來講,環(huán)境溫度如何影響機(jī)體的ncRNAs和組蛋白修飾水平仍缺乏足夠的研究。進(jìn)一步探討TSD中的表觀遺傳學(xué)機(jī)制,對于理解動物的性別決定生物學(xué)過程具有重要的意義。
溫度依賴型性別決定;表觀遺傳修飾;甲基化;ncRNAs;組蛋白修飾
性別決定是生物學(xué)的一個核心問題,性別決定過程不僅能夠影響個體的發(fā)育方向,而且能夠影響種群的結(jié)構(gòu)、動態(tài)和命運(yùn)[1]。動物的性別決定是由遺傳因子和外界環(huán)境共同決定的,基本上可以分為兩種類型:遺傳型性別決定(GSD)和環(huán)境型性別決定(ESD)。其中GSD類型的動物在受精時就已決定了個體的初始性別,主要包含的類型有:①XX/XY型,如哺乳動物,具有XX同型染色體為雌性,具有XY異型染色體為雄性;②ZZ/ZW型,如鳥類,具有ZZ同型染色體為雄性,具有ZW異型染色體為雌性。ESD類型動物的性別則由其受精后胚胎所處的環(huán)境條件決定,包括:溫度、pH值、鹽分含量等,甚至群體性比、病原體等。在脊椎動物中ESD的一種主要表現(xiàn)形式為溫度依賴型性別決定(TSD),即個體性別依賴于胚胎發(fā)育過程中的環(huán)境溫度,TSD在魚類和爬行類動物中最為常見。
1.1 TSD的分類
動物的TSD基本上可以分為三種類型[2]:①TSD Ia(MF)型:即低溫產(chǎn)雄性,高溫產(chǎn)雌性。TSD Ia是動物TSD的主要類型,例如常見的烏龜、紅耳龜、錦龜?shù)榷紝儆诖祟悇e;②TSD Ib(FM)型:即低溫產(chǎn)雌性,高溫產(chǎn)雄性。TSD Ib在部分蜥蜴、多種魚類中有過報道;③TSD II(FMF)型:即低溫和高溫均產(chǎn)雌性,中間溫度產(chǎn)雄性。在龜鱉類、蜥蜴類和鱷類中都存在有TSD II模式。
1.2 激素在TSD中的調(diào)控機(jī)制
動物的性別決定包括兩個方面:一是性腺的決定和發(fā)育,稱為初級性別決定,主要包括原始性別的決定、性腺的發(fā)育;二是附屬性器官、特征及性行為的建立稱為次級性別決定,主要包括在動物體內(nèi)睪丸或卵巢形成后,由各自的性腺或者生殖腺分泌性激素來促使相關(guān)組織、附屬組織和器官的發(fā)育以及性行為的形成和建立。對于TSD動物來講,激素在初級性別決定和次級性別決定過程中都起了關(guān)鍵的作用,在產(chǎn)生雄性的孵化溫度下,睪酮(T)由5α-還原酶作用轉(zhuǎn)化為雙氫睪酮(DHT),然后經(jīng)過級聯(lián)反應(yīng)最終誘導(dǎo)胚胎發(fā)育成雄性幼體;在產(chǎn)生雌性的孵化溫度下,睪酮由芳香化酶作用轉(zhuǎn)化為雌二醇(E2),然后經(jīng)過一系列反應(yīng)最終誘導(dǎo)胚胎發(fā)育成雌性幼體。在卵孵化過程中,使用外源雌激素處理,可以誘導(dǎo)處于雄性孵化溫度中的胚胎發(fā)育成雌性。但是,使用外源雄激素處理卻不能誘導(dǎo)雌性孵化溫度中的胚胎發(fā)育成雄性??赡芤?yàn)椴G酮被芳香化酶催化后轉(zhuǎn)換成了雌激素;如果利用芳香化酶抑制劑抑制其作用,則可在雌性溫度條件下產(chǎn)生雄性胚胎。激素在TSD中的調(diào)控作用已經(jīng)基本明確,但是激素水平響應(yīng)環(huán)境溫度的具體分子機(jī)制仍不確定。
1.3 性別決定相關(guān)基因與TSD
早期研究認(rèn)為動物的TSD和GSD為2種獨(dú)立的性別決定系統(tǒng),新的研究表明兩者并非完全獨(dú)立,而是具有一定的關(guān)聯(lián)性。比較基因組分析表明,許多在GSD動物中調(diào)控性腺分化的基因在TSD動物中都是保守的,且進(jìn)一步的功能驗(yàn)證表明,它們在TSD動物的性別決定中大多還擁有類似的調(diào)控功能,提示TSD和GSD在分子水平可能采用了相同的調(diào)控通路。目前已經(jīng)驗(yàn)證的性別決定相關(guān)基因包括:Sox9、Sf-1、Dmrt1、Wt1、Wt4、Dax1、FoxL2、Cyp19a1、Mis等[3]。這些基因在GSD和TSD動物中都是性別決定的關(guān)鍵調(diào)控因子,但對于TSD動物來講,比較特別的地方在于,環(huán)境變化對部分性別決定基因的表達(dá)水平具有決定性的作用,從而能夠決定胚胎的性別。與激素調(diào)控TSD的研究類似,這些性別決定相關(guān)基因在TSD動物中如何響應(yīng)環(huán)境溫度變化仍不明確。
表觀遺傳是指DNA序列不發(fā)生變化,但基因表達(dá)卻發(fā)生了可遺傳的改變。表觀遺傳修飾很大程度上介導(dǎo)了機(jī)體對環(huán)境變化的響應(yīng),同時也整合了環(huán)境與基因組信息來產(chǎn)生特定的表型。近期的研究表明,環(huán)境溫度通過表觀遺傳修飾的方式改變性別決定相關(guān)基因的表達(dá)變化,可能是TSD的重要調(diào)控方式。表觀遺傳修飾主要包括三種方式:DNA甲基化、非編碼RNA和組蛋白修飾調(diào)控。通常情況下,表觀遺傳修飾都不是單獨(dú)發(fā)生的,這三種機(jī)制往往存在交互作用,共同調(diào)控目的基因的表達(dá),進(jìn)而參與了植物、無脊椎動物或脊椎動物的性別決定和性腺分化。
2.1 DNA甲基化在TSD中的調(diào)控作用
DNA甲基化往往發(fā)生在基因的啟動子區(qū)或調(diào)控區(qū)域,DNA甲基化能夠通過抑制基因的轉(zhuǎn)錄來調(diào)節(jié)基因的功能。環(huán)境變化可能通過改變ESD動物性別決定相關(guān)基因的甲基化修飾模式來決定后代的性別。近期我國的學(xué)者對半滑舌鰨的全基因組進(jìn)行了測序,并分析了全基因組的甲基化修飾與性別決定的關(guān)系。半滑舌鰨屬于ZZ/ZW性別決定類型,正常雌魚在溫度控制之下能夠發(fā)生性逆轉(zhuǎn)而變?yōu)閭涡埕~。性逆轉(zhuǎn)后偽雄魚全基因組的DNA甲基化模式變得跟正常雄魚幾乎一模一樣,而且,DNA的甲基化主要富集在與性別決定通路有關(guān)的基因上。半滑舌鰨的證據(jù)進(jìn)一步從基因組水平證明了甲基化修飾在性別決定調(diào)控中的重要性。在非哺乳類的脊椎動物中,芳香化酶(Cyp19a1)是將雄激素轉(zhuǎn)化為雌激素的關(guān)鍵酶,從而參與調(diào)控雌性的卵巢發(fā)生。在許多魚類和爬行動物中,溫度誘導(dǎo)的雄性化都與Cyp19a1的表達(dá)抑制相關(guān)聯(lián),而最近的研究表明Cyp19a1基因啟動子區(qū)的甲基化可能是連接溫度變化和性別決定的橋梁。例如歐洲鱸魚的性別是由環(huán)境和遺傳共同調(diào)控的,其性別決定的溫度敏感期(TSP)位于幼體期,溫度誘導(dǎo)的雄性化被證明與Cyp19a1基因啟動子區(qū)的甲基化水平上升相關(guān)聯(lián),但是溫度變化伴隨的Cyp19a1基因啟動子區(qū)的甲基化只能在性腺中檢測到,而在大腦中檢測不到,說明該甲基化對溫度的響應(yīng)還具有組織特異性。溫度誘導(dǎo)的Cyp19a1基因啟動子區(qū)甲基化模式還存在一定的物種間保守性,例如在黑鯛魚和紅耳龜?shù)男詣e決定過程中,Cyp19a1基因啟動子區(qū)甲基化修飾也起到關(guān)鍵的調(diào)控作用。相對于Cyp19a1基因,Sry基因是哺乳動物睪丸發(fā)育的關(guān)鍵調(diào)控基因,小鼠上的研究表明DNA甲基化對Sry的時空表達(dá)具有重要的調(diào)控作用。烏龜是典型的TSD Ia型爬行動物,烏龜?shù)腟ox9基因(爬行動物的Sry同源基因)在雄性孵化溫度下存在顯著高表達(dá)[4],但是爬行動物Sox9基因的表達(dá)是否接受DNA甲基化調(diào)控需要進(jìn)一步的試驗(yàn)驗(yàn)證。對其余TSD動物來講,筆者推測甲基化修飾可能是其溫度依賴型性別決定的重要調(diào)控機(jī)制之一,通過改變啟動子區(qū)的甲基化修飾水平,性別決定基因能夠響應(yīng)孵化溫度的變化,改變其表達(dá)水平,進(jìn)而決定了性腺的發(fā)育方向,但這樣的推測需要進(jìn)一步的試驗(yàn)驗(yàn)證。
2.2 ncRNAs在TSD中的調(diào)控作用
除了甲基化修飾外,ncRNAs也是動物性別決定的重要調(diào)控方式。ncRNAs是指不翻譯為蛋白質(zhì)的有功能的RNA分子,被認(rèn)為是表觀遺傳修飾的重要組成方式。參與表觀遺傳調(diào)控的ncRNAs主要有兩類:長非編碼RNAs(lncRNAs;>200 nt)和小RNAs(miRNAs;19-25 nt)。ncRNAs通過招募表觀遺傳沉默復(fù)合體進(jìn)而結(jié)合在基因組或轉(zhuǎn)錄組的同源位點(diǎn)來實(shí)現(xiàn)對目標(biāo)基因的表達(dá)調(diào)控。ncRNAs在植物、昆蟲、魚類、鳥類、哺乳動物中均被證明參與了性別決定的過程。例如在大西洋大比目魚中多個miRNAs的表達(dá)水平存在性別差異,且當(dāng)使用芳香化酶抑制劑誘導(dǎo)動物雄性化后,部分miRNAs的表達(dá)水平也相應(yīng)地發(fā)生了改變,提示部分miRNA參與了激素調(diào)控的信號通路。在雞的性別決定過程中,miR-202*在雄性中高表達(dá),從而推測其與雞的睪丸發(fā)育相關(guān)。給發(fā)育至4.5 d的雄性胚胎(ZZ)注射雌激素(E2)誘導(dǎo)其雌性化時,能夠觀測到miR-202*的表達(dá)顯著降低,同時還能觀測到睪丸生成調(diào)控基因Dmrt1和Sox9的表達(dá)下調(diào),而卵巢生成調(diào)控基因FoxL2和Cyp19a1的表達(dá)則顯著上調(diào)。相反的,用芳香化酶抑制劑處理3.5 d的雌性胚胎(ZW)時,能夠觀測到miR-202*的表達(dá)顯著上調(diào),同時伴隨的還有Dmrt1和Sox9的上調(diào)以及FoxL2和Cyp19a1的下調(diào)。雖然目前已經(jīng)證明ncRNAs參與了動物的性別決定過程,并已經(jīng)鑒定了許多雌雄間差異表達(dá)的ncRNAs,但是這些結(jié)果多是在GSD動物中被發(fā)現(xiàn)。關(guān)于TSD動物中的ncRNAs的研究尚未見報道,有哪些ncRNAs尤其是miRNAs參與了TSD的調(diào)控過程,這些ncRNAs的表達(dá)如何響應(yīng)孵化溫度的變化,以及這些ncRNAs如何與已知的性別決定基因互作都是未知的,闡明這些問題有助于進(jìn)一步深入理解動物TSD的分子調(diào)控機(jī)制。
2.3 組蛋白修飾在TSD中的作用機(jī)制
核小體是染色質(zhì)的基本組成單位,由一個組蛋白八聚體(由4種組蛋白H2A、H2B、H3和H4組成,每一種組蛋白各二個分子)、一個H1組蛋白和一段DNA構(gòu)成。組蛋白修飾在轉(zhuǎn)錄水平對基因表達(dá)存在調(diào)控作用,例如,H3K9me(組蛋白H3第9位賴氨酸甲基化)是H3的重要修飾方式,其能夠參與異染色質(zhì)的形成和轉(zhuǎn)錄沉默過程。許多參與組蛋白修飾的酶對于外界環(huán)境變化都很敏感,因此能夠介導(dǎo)環(huán)境變化對基因表達(dá)的影響。缺乏H3K9去甲基化酶的XY小鼠,常常表現(xiàn)出性逆轉(zhuǎn)特征或徹底發(fā)育為不育的雌性小鼠?;虮磉_(dá)分析表明,H3K9去甲基化酶的缺失顯著下調(diào)了胚胎發(fā)育期Sry基因的表達(dá)水平。而在野生型的XY小鼠中,體細(xì)胞的Sry位點(diǎn)有大量的H3K9去甲基化酶聚集,進(jìn)而導(dǎo)致H3K9me2的升高和H3K4me3的降低。這些證據(jù)均證明組蛋白修飾在動物性別決定中可能有的重要作用。PcG蛋白是一組通過染色質(zhì)修飾調(diào)控靶基因的轉(zhuǎn)錄抑制子,在小鼠上的同源基因?yàn)镃BX2,CBX2突變型小鼠有一半會在斷奶前死掉,而剩余的則表現(xiàn)出性腺發(fā)育不全和雄性到雌性的性逆轉(zhuǎn)。性腺生長缺陷出現(xiàn)的時間與Sry表達(dá)的時間相一致,說明CBX2缺陷引起的性逆轉(zhuǎn)可能與Sry的表達(dá)有關(guān)。進(jìn)一步通過蛋白質(zhì)組和免疫組化分析表明,一系列的轉(zhuǎn)錄因子,包括Sry、Sox9、Lhx9、Ad4BP/SF-1、Dax-1、Gata4、Arx和Dmrt1的表達(dá)均受到CBX2基因敲除的影響。在CBX2基因敲除小鼠中過表達(dá)Sry或Sox9基因,能夠挽救雄性到雌性的性逆轉(zhuǎn),這說明CBX2通過Sry基因表達(dá)參與了睪丸的發(fā)育。對于TSD動物來講,進(jìn)一步分析環(huán)境溫度如何參與組蛋白的修飾過程,或者參與組蛋白修飾的酶的表達(dá)量、活性和結(jié)合位點(diǎn)如何響應(yīng)孵化溫度的變化,可能是研究組蛋白修飾參與TSD調(diào)控的關(guān)鍵。
綜上所述,動物的溫度依賴型性別決定(TSD)是一個復(fù)雜而有趣的生物學(xué)現(xiàn)象,但其具體的生物學(xué)機(jī)制仍不明確。表觀遺傳修飾很大程度上介導(dǎo)了機(jī)體對環(huán)境變化的響應(yīng),環(huán)境溫度通過表觀遺傳修飾的方式改變性別決定相關(guān)基因的表達(dá)變化,可能是動物TSD的一種重要調(diào)控方式。進(jìn)一步分析DNA甲基化、ncRNAs表達(dá)和組蛋白修飾如何響應(yīng)孵化溫度的變化;DNA甲基化、ncRNAs和組蛋白修飾之間如何互作;DNA甲基化、ncRNAs和組蛋白修飾如何調(diào)控性別決定相關(guān)基因和性激素的表達(dá)變化,對于理解動物性別決定的生物學(xué)過程具有重要的意義。
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S81
B
1004-5090(2016)09-0011-03
2016-08-16)