番林古麗·熱哈提 焦 麗 岳 城
(新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院,烏魯木齊 830052)
額爾齊斯河白斑狗魚假尾復(fù)口吸蟲的分子鑒定
番林古麗·熱哈提焦麗岳城
(新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)學(xué)院,烏魯木齊 830052)
利用分子生物學(xué)方法對采自額爾齊斯河(中國段)的白斑狗魚(Esox lucius Linnaeus)晶狀體內(nèi)寄生的復(fù)口吸蟲(Diplostomum)進(jìn)行了種類鑒定,結(jié)果顯示其種類為假尾復(fù)口吸蟲(D. paracaudum),為中國新記錄種。通過PCR擴(kuò)增待鑒定種的部分18S-ITS1-5.8S序列,測序后與GenBank中假尾復(fù)口吸蟲的序列進(jìn)行比對,發(fā)現(xiàn)其相似度達(dá)到99.6%。將該序列與7種復(fù)口吸蟲的ITS1序列進(jìn)行比對后構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,進(jìn)化樹以單殖吸蟲Gyrodactylus parvae為外類群,結(jié)果顯示:待鑒定種與假尾復(fù)口吸蟲(D. paracaudum)聚為一支,其支持率達(dá)到了50%以上,支持它們?yōu)橥幌x種。
額爾齊斯河;白斑狗魚;假尾復(fù)口吸蟲;分子鑒定
額爾齊斯河(Irtysh River)發(fā)源于中蒙邊境,地處歐亞大陸腹地,上游在我國境內(nèi),位于新疆阿爾泰地區(qū)東北部,該河以東西走向流出國境,進(jìn)入齋桑泊(布赫塔爾馬水庫),匯入鄂畢河,最終流入北冰洋,是新疆重要的生態(tài)屏障和社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展支撐之一[1,2]。額爾齊斯河水資源豐富,水系繁雜極具特殊性,使該河有了較多獨(dú)特的魚類,主要有白斑狗魚(Esox lucius)、哲羅鮭(Hucho taimen)、細(xì)鱗魚(Brachymystax lenok)、高體雅羅魚(Leuciscus idus)等名貴獨(dú)特的魚類。白斑狗魚隸屬于鮭形目(Salmoniformes)、狗魚科(Esocidae),狗魚屬(Esox),具有肉質(zhì)鮮美、生長快、營養(yǎng)豐富等特點(diǎn),自然分布見于亞洲、歐洲及北美洲北部的冷水水域,在我國僅分布于新疆額爾齊斯河水系,是一種較大型的名貴經(jīng)濟(jì)型魚類[3,4]。郝翠蘭等[5]對額爾齊斯河(中國段)白斑狗魚的寄生蟲種類及感染情況進(jìn)行了研究,結(jié)果顯示白斑狗魚被5種寄生蟲感染,分別為復(fù)口吸蟲后囊蚴、單腸四鉤蟲、絳蟲幼蟲、新疆鳋、白鮭鲺,其中復(fù)口吸蟲是白斑狗魚寄生蟲群落的優(yōu)勢種。
復(fù)口吸蟲(Diplostomum)的囊蚴階段寄生在魚類的眼球中,導(dǎo)致晶體混濁成乳白色,故又稱“白內(nèi)障病”,嚴(yán)重感染時(shí)可致宿主失明,由于運(yùn)動(dòng)和索餌障礙,易被終末宿主鳥類捕捉,也可直接引起魚類大量死亡,特別是池塘養(yǎng)殖的魚類[6]。復(fù)口吸蟲病在世界上有著廣泛的分布。最早的研究是在19世紀(jì)初葉,Nordmann(1832)在幾種淡水魚的眼球和皮膚內(nèi)發(fā)現(xiàn)了復(fù)口吸蟲的囊蚴,并定名為Diplostomum volen。Braun(1894)用Nordmann發(fā)現(xiàn)的后囊蚴,進(jìn)行人工感染紅嘴鷗(Larusridibundus)獲得了成蟲,并定名為匙形復(fù)口吸蟲(Diplostomum spathaceum)。Diesing(1850)從鳥類中獲得的此類型的成蟲,定名為Diplostomum grande。此后,有不少國家的學(xué)者陸續(xù)在一些鷗鳥和魚類中,發(fā)現(xiàn)了超過41種復(fù)口吸蟲的成蟲和幼蟲,并對它們的形態(tài)、生活史和分類學(xué)等諸方面做了大量的研究[7—9]。目前,我國僅描述了3種即倪氏復(fù)口吸蟲(D. niedashui)、湖北復(fù)口吸蟲(D. hupehensis) 和山西復(fù)口吸蟲(D. shanxinensis)[10,11]。2009年4月至2014年7月我們對額爾齊斯河白斑狗魚(Esox lucius)進(jìn)行采樣,發(fā)現(xiàn)其晶狀體內(nèi)寄生1種復(fù)口吸蟲囊蚴,通過提取不同蟲體基因組,針對18S-ITS1-5.8S rDNA 序列進(jìn)行PCR擴(kuò)增后測序然后構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。研究結(jié)果顯示:該復(fù)口吸蟲隸屬于吸蟲綱(Trematoda)復(fù)殖吸蟲亞綱(Digenea)鶚形目(Strigeiformes)雙穴科(Diplostomidae)復(fù)口吸蟲屬(Diplostomum) 的假尾復(fù)口吸蟲(Diplostomum paracaudum)。
1.1材料來源
2009年4月至2014年7月,從額爾齊斯河流域的北屯、福海、布爾津、哈巴河、185 團(tuán)等采樣點(diǎn)捕獲或采購白斑狗魚樣本,在實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行編號記錄后,測量體長并進(jìn)行解剖檢查,采集晶狀體內(nèi)的復(fù)口吸蟲,分別固定于95%的乙醇溶液中。
1.2目的基因的提取及PCR擴(kuò)增
取酒精固定的蟲體樣本置于TE緩沖液(pH 8.0)中浸泡過夜,吸去TE緩沖液,用Omega軟體動(dòng)物DNA小量提取試劑盒提取蟲體DNA,并在-20℃保存。
由上海生工合成的,以18S-ITS1-5.8S序列為擴(kuò)增引物。上游引物:18S-ITS1(5′-CCGTCGCTACT ACCGATTGAA-3′),下游引物:ITS1-5.8S(5′-CGCAATGTGCGTTCAAGATGTC-3′)[12]。PCR反映體系為50 μL,各物質(zhì)及其體積如下:10×Taq MasterMix 25 μL,上游引物(10 mmol/L) 1 μL,下游引物(10 mmol/L) 1 μL,DNA模板2 μL,雙蒸水21 μL。反應(yīng)條件經(jīng)優(yōu)化后為94℃預(yù)變性10min; 94℃變性30s,60℃退火30s,72℃延伸50s,30個(gè)循環(huán); 72℃延伸10min,4℃∞。
1.3目的DNA序列的測定
將擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖電泳分析,得到目的條帶切膠后用OMEGA公司的膠回收試劑盒進(jìn)行純化,純化產(chǎn)物連接到 pEASY-T1載體進(jìn)行TA克隆,經(jīng)DH5α感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化后,用Transgen公司的EasyPure Plasmid MiniPrep Kit提取質(zhì)粒DNA,選取陽性質(zhì)粒送上海生工測序。
1.4分子系統(tǒng)發(fā)育學(xué)分析
從GenBank下載具有18S-ITS1-5.8S核酸序列的復(fù)口吸蟲屬(Diplostomum)7種,總計(jì)13個(gè)樣本及一外類群Gyrodactylus parvae,其核酸序列見表1。利用計(jì)算機(jī)MEGA5.1軟件構(gòu)建鄰接法(Neighborjoining)、最大簡約法(Maximum parsimony)系統(tǒng)進(jìn)化樹。
表1 來自GenBank的復(fù)口吸蟲18S-ITS1-5.8S基因序列Tab. 1 18S-ITS1-5.8S sequences of Diplostomum from GenBank
2.1基于18S-ITS1-5.8S rDNA基因的遺傳距離分析
利用計(jì)算機(jī)MEGA5.1軟件建立基于18S-ITS1-5.8S基因序列的7種復(fù)口吸蟲(13個(gè)樣本)與本實(shí)驗(yàn)待測種B1的遺傳矩陣見表2。矩陣顯示B1與D. paracaudum Dip01的遺傳距離較短,為0.003。
2.2基于18S-ITS1-5.8S rDNA基因的系統(tǒng)發(fā)育分析
基于所得到的數(shù)據(jù),以G. parvae為外類群進(jìn)行分子系統(tǒng)發(fā)育分析。利用計(jì)算機(jī)MEGA5.1軟件構(gòu)建鄰接法(Neighbor-joining)(圖1)分子系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系樹,樹上各分支上的數(shù)字用1000次Bootstrap來檢測分子系統(tǒng)發(fā)育樹各分支的置信度。待鑒定種B1與D. paracaudum Dip01聚為一支,其Bootstrap支持率為58%。
應(yīng)用最大簡約法(Maximum parsimony)構(gòu)建分子系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系樹(MP樹,圖2)。MP樹與NJ系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示結(jié)果一致:待鑒定蟲種B1與D. paracaudum Dip01在進(jìn)化樹中均聚為一支。
表2 18S-ITS1-5.8S rDNA序列區(qū)域的遺傳距離Tab. 2 The distance of 18S-ITS1-5.8S rDNA genetic region
圖1 基于18S-ITS1-5.8S基因系統(tǒng)進(jìn)化樹(NJ樹)Fig. 1 Phylogenetic analysis of 18S-ITS1-5.8S gene(NJ tree)
圖2 基于18S-ITS1-5.8S基因系統(tǒng)進(jìn)化樹(MP樹)Fig. 2 Phylogenetic analysis of18S-ITS1-5.8S gene(MP tree)
復(fù)口吸蟲的種類在世界各地都有,主要原因是其宿主范圍廣,可隨著終末宿主鳥類的遷移,使蟲卵得到廣泛散布。此外,第二中間宿主魚類的洄游也可帶來復(fù)口吸蟲在地理區(qū)域上的擴(kuò)散和流行[13,14]。早期對復(fù)口吸蟲的種類鑒定主要是通過囊蚴的焰細(xì)胞形態(tài)、數(shù)量和排列方式進(jìn)行的,但不同種類的復(fù)口吸蟲囊蚴階段的形態(tài)特征非常相似,所以觀察十分困難,而且受采樣時(shí)間及不同研究者的認(rèn)知水平等限制,極易導(dǎo)致人為的差異。因此,僅靠其形態(tài)特點(diǎn)鑒定是不足的。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的進(jìn)步,為我們提供了除利用形態(tài)學(xué)以外的另一種寄生蟲鑒定方法。DNA序列分析可用于鑒定所有發(fā)育階段的蟲體,這是研究對具有復(fù)雜生活史寄生蟲的優(yōu)勢手段[15]。特別是對像復(fù)口吸蟲這樣難以獲得成蟲的物種,這樣的技術(shù)更有意義。選取容易采集,而且具有不同形態(tài)的復(fù)口吸蟲囊蚴,通過分析比較其rDNA內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)序列的差異,可以用來檢測未定種。
本研究選取ITS基因?yàn)榉肿訕?biāo)記,對額爾齊斯河魚類復(fù)口吸蟲進(jìn)行測序比對,經(jīng)鑒定分析發(fā)現(xiàn)該吸蟲為D. paracaudum。D. paracaudum的尾蚴和囊蚴在波蘭、德國、芬蘭和英國,成蟲在芬蘭的小黑背鷗(Larvsfuscus)體內(nèi)發(fā)現(xiàn)的,并獲得了尾蚴、囊蚴、成蟲的部分ITS1序列及尾蚴的部分COⅠ序列,完成了整個(gè)生活史的分子鑒定工作[16,17]。在中國大陸,尚未發(fā)現(xiàn)D. paracaudum方面的研究報(bào)道,本實(shí)驗(yàn)是對中國境內(nèi)D. paracaudum的首次報(bào)道。目前D. paracaudum已確定的分布地有波蘭、德國、芬蘭和英國,從地理分布上可以看出此種復(fù)口吸蟲多分布于歐洲。在額爾齊斯河發(fā)現(xiàn)該種復(fù)口吸蟲,證實(shí)了額爾齊斯河這一橫跨歐亞大陸的河流特性,即其寄生蟲區(qū)系與歐洲相近,而不同于國內(nèi)其他地區(qū)的寄生蟲區(qū)系。
目前,國內(nèi)外關(guān)于復(fù)口吸蟲的研究主要還是集中在第二中間宿主魚類感染的囊蚴方面,包括感染率、感染強(qiáng)度、感染豐度、魚類宿主的種類等流行病學(xué)層面上,但對這些蟲體的分類學(xué)方面的研究較少。本次發(fā)現(xiàn)的復(fù)口吸蟲為中國新記錄-D. paracaudum,鑒于額爾齊斯河獨(dú)特的地理位置,對該地區(qū)的寄生蟲分類鑒定方面的研究對我國寄生蟲區(qū)系研究意義重大,本文發(fā)現(xiàn)的新記錄種為我國不同地域魚類寄生蟲的區(qū)系組成、病原分布、種群生態(tài)等方面提供科學(xué)資料。
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MOLECULAR IDENTIFICATION OF DIPLOSTOMUM PARACAUDUM ON ESOX LUCIUS IN IRTYSH RIVER
Parengul · Rahat,JIAO Li and YUE Cheng
(College of Veterinary Medicine,Xinjiang Agricultural University,Urumqi 830052,China)
The current study identified a species of Diplostomum from the lens of Esox lucius in Irtysh River(China section) using molecular biology techniques. These results showed that this species was Diplostomum paracaudum,a new record of this kind of species in China. The similarity of partial 18S-ITS1-5.8S sequence between this sample and another D. paracaudum from GenBank was 99.6%. A phylogenetic tree analysis based on the partial 18S-ITS1-5.8S of 7 species in the genus of Diplostomum identified an out group species Gyrodactylus parvae,and supported our sample was closely related to D. paracaudum with a more than 50% bootstrap.
Irtysh River; Esox lucius Linnaeus; Diplostomum paracaudum; Molecular identification
Q959.15
A
1000-3207(2016)05-0992-05
10.7541/2016.128
2016-02-19;
2016-04-15
國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31360644)資助 [Supported by the National Natural Science Foundation of China(No. 31360644)]作者簡介:番林古麗·熱哈提(1989—),女,哈薩克族,新疆阿勒泰人; 碩士研究生; 研究方向?yàn)轭A(yù)防獸醫(yī)學(xué)。E-mail:1002497734@qq.com通信作者:岳城(1958—),男,陜西城固人; 教授,博士研究生導(dǎo)師; 研究方向?yàn)樗鷦?dòng)物保護(hù)學(xué)。E-mail:yuechengxnd@aliyun.com