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      飼喂生物發(fā)酵飼料對延邊黃牛背最長肌FABP4、CAPN1基因表達的影響

      2017-01-08 13:28:30李英花耿春銀嚴昌國
      飼料工業(yè) 2017年8期
      關鍵詞:發(fā)酵飼料延邊黃牛

      ■馮 健 李英花 耿春銀 嚴昌國

      (延邊大學農學院,吉林延吉133002)

      1 試驗材料

      1.1 試驗動物

      選擇12頭平均體重(545.55±27.00)kg的體健無病延邊黃牛閹牛,隨機分成試驗組和對照組,每組6頭,試驗組每頭牛飼喂生物發(fā)酵飼料2 kg/d,對照組不飼喂生物發(fā)酵飼料,試驗組和對照組的基礎日糧營養(yǎng)水平基本相同。預飼期10 d,正式期90 d。屠宰后,分別從試驗組與對照組各隨機選取3頭牛,在第14肋骨處采取背最長肌一小塊,迅速放于事先處理好的凍存管中并置于液氮中速凍,-80℃保存待用。

      1.2 試驗日糧

      生物發(fā)酵飼料是利用玉米粉40%、啤酒糟40%、糖蜜5%、酵母菌4%(微生物實驗室培養(yǎng))和水。混合均勻后在30℃下厭氧發(fā)酵3 d,制成具有酒香味,酒精度為7~9°的新型飼料。其日糧組成及營養(yǎng)水平見表1。

      表1 供試牛日糧組成及營養(yǎng)水平

      2 試驗方法

      2.1 引物設計與合成

      根據(jù)GenBank中(牛)的FABP4基因序列(序列號:NM_174314.2)、CAPN1基因序列(序列號:NM_174259.2)和β-actin基因序列(序列號:AB098930.1),按照實時熒光定量PCR引物設計原則,用Oligo6.0軟件設計特異性引物。內參基因是β-actin基因,表2為引物信息(引物由上海生工生物技術有限公司合成)。

      表2 實時熒光定量PCR引物

      2.2 背最長肌組織總RNA提取

      利用TaKaRa公司的總RNA提取試劑盒提取供試牛背最長肌中的總RNA,整個操作過程在超凈工作臺中進行,不能有RNA酶的污染。

      2.3 總RNA的檢驗

      提取總RNA樣品4 μl,用DEPC處理水稀釋250倍,混合均勻后,測定260、280 nm吸光度(利用紫外分光光度計),確定溶液的OD260/OD280值是否在1.8~2.0區(qū)間之內,然后計算總RNA的濃度。

      總RNA的濃度(ng/ml)=OD260×稀釋倍數(shù)×50/1 000。

      取總RNA樣品5 μl(約6~8 μg的RNA),進行凝膠電泳分離,利用凝膠成像儀觀察總RNA條帶數(shù)量、清晰度和有無拖尾現(xiàn)象,其中18S和28S的條帶亮度比約為2∶1。

      全市每年都有因城市(鎮(zhèn))開發(fā)、工業(yè)園區(qū)、房地產、交通、水工程等建設項目開挖擾動地表、開挖自然山體,不嚴格執(zhí)行水土保持方案和“三同時制度”,沒有實施生態(tài)修復和水保設施建設,甚至有的建設單位不按規(guī)定傾倒或者向河道偷倒廢棄建筑渣(土)等。據(jù)監(jiān)測和調查,全市各類生產建設項目年造成新的水土流失面積10km2,有的地方破壞面積已接近甚至大于當年治理面積,城市生態(tài)環(huán)境嚴峻形勢不容樂觀。

      2.4 反轉錄反應(RT-PCR)

      總RNA提取后,利用TaKaRa公司的Prime Scriptò RT-PCR試劑盒進行反轉錄操作,向RNase free PCR反應管(200 μl)中加入表3中的溶液或試劑,整個過程全部在冰上完成,根據(jù)反轉錄試劑盒使用說明書,建立20.0 μl反轉錄體系。其條件和方法均按照反轉錄試劑盒使用說明書進行操作。

      表3 反轉錄反應體系

      2.5 PCR的擴增反應(見表4)

      表4 PCR擴增反應體系

      PCR的擴增起反應體系的混合是在冰上進行,反應體系為20.0 μl。

      PCR反應程序為:預變性93℃ 5 min,變性93℃15 s,退火在54~60 ℃持續(xù)32 s,72 ℃延伸32 s,循環(huán)數(shù)為42個,72℃延伸16 min,4℃保存。

      2.6 目的片段的回收

      用瓊脂糖凝膠電泳將上述產物分離,利用DNA回收試劑盒將目的片段回收。

      2.7 序列分析

      通過Blast程序和DNAman軟件分析發(fā)現(xiàn)測序結果與Genbank中發(fā)表的相應序列相同。

      2.8 實時熒光定量PCR

      ①反應溫度的篩選。根據(jù)引物的退火溫度,在實時熒光定量PCR儀上設置54~60℃,5個溫度梯度,觀察其溶解曲線及擴增曲線,找出適宜3個基因的反應溫度。

      ②標準曲線的建立。將目的基因稀釋,按照10倍梯度方法,然后對FABP4、CAPN1和β-actin三個基因進行擴增反應,按說明書的步驟進行操作,其反應體系為25 μl,最后得出每個目的基因的標準曲線。

      ③熒光定量PCR。采用SYBRò Premix Ex TaqTMⅡ(TaKaRa)試劑盒對β-actin、FABP4和CAPN1基因進行擴增。反應條件參考試劑盒進行(見表5)。

      表5 熒光定量PCR反應體系

      2.9 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析

      根據(jù)熒光定量PCR檢測出的內參基因和目的基因,利用2-ΔΔCt方法分析基因的相對表達差異量,試驗數(shù)據(jù)一律采用統(tǒng)計軟件SAS(V8.0)中的一般線性模型(GLM)模塊來進行單因素方差分析。表中結果表示為“平均數(shù)±標準差”,P<0.05為結果差異顯著。

      3 結果與分析

      3.1 RNA及目的基因片段檢測結果(見圖1)

      如圖1可見,將提取的試驗組與對照組牛背最長肌的總RNA進行電泳,將試驗組3個個體和對照組3個個體的總RNA分別經紫外分光光度計分析,所有樣本的D260/D280均在1.8~2.0。電泳結果表明,RNA分子保持完整RNA質量符合實時熒光定量PCR試驗的要求。

      圖1 總RNA提取的電泳結果

      常規(guī)PCR產物檢測結果如圖2。泳道1為CAPN1基因,泳道2為FABP4基因,泳道3為β-actin基因,從圖中可以看出三個基因的條帶均清晰明亮、無雜帶,而且其片段的大小也都在預先設計的范圍內,說明引物的特異性很高,測序結果與目的序列一致,確定為目的基因片段。

      圖2 目的基因的PCR檢測結果

      3.2 實時熒光定量結果與分析

      3.2.1 內參基因與目的基因的標準曲線及溶解曲線

      β-actin、FABP4和CAPN1基因的標準曲線均在100~10-3模板濃度范圍內建立。β-actin、FABP4 和CAPN1基因的標準曲線如圖3~圖5,從圖中我們可以看出,目的基因的Ct值與起始模板濃度的線性相關系數(shù)分別為0.998、1.000和0.999,線性關系很好,作為本試驗的一個重要參數(shù),對于采用Ct值基因進行準確的定量很有利。β-actin、FABP4和CAPN1基因的溶解曲線如圖6~圖8,從圖中可以看出,目的基因的溶解曲線上未見雜峰,內參基因(β-actin基因)有雜峰信號出現(xiàn),可能是引物二聚體或者是非特異性擴增產物,但它們的量與擴增子相比顯得非常少,所以對定量結果影響不大。CAPN1、β-actin和FABP4基因的擴增曲線如圖9~圖11所示,橫坐標為待測樣品循環(huán)數(shù)Ct,縱坐標為熒光強度。Ct是熒光強度在被檢測時所得到的對應的循環(huán)數(shù)。擴增曲線圖反映了循環(huán)過程中熒光值的變化,即每個循環(huán)Ct值與起始模板濃度的對數(shù)成反比。

      圖3 β-actin基因標準曲線

      圖4 FABP4基因標準曲線

      圖5 CAPN1基因標準曲線圖

      圖6 CAPN1基因溶解曲線

      圖7 FABP4基因溶解曲線

      圖8 β-actin基因溶解曲線

      圖9 CAPN1基因擴增曲線

      圖10 β-actin基因擴增曲線

      圖11 FABP4基因擴增曲線

      3.2.2 FABP4、CAPN1基因mRNA在延邊黃牛背最長肌組織中表達的差異

      飼喂生物發(fā)酵飼料對延邊黃牛牛背最長肌中FABP4、CAPN1基因表達的相對定量結果見表6。

      表6 飼喂生物發(fā)酵飼料對黃牛背最長肌FABP4、CAPN1 mRNA相對表達量的影響

      由表6可以看出,延邊黃牛日糧中飼喂發(fā)酵飼料對牛背最長肌中FABP4具有極顯著影響(P<0.01),當延邊黃牛日糧中飼喂發(fā)酵飼料后,F(xiàn)ABP4基因mRNA的表達量顯著高于對照組,試驗組中FABP4 mRNA的表達量是對照組的2.27倍。CAPN1 mRNA的表達量受日糧影響差異顯著(P<0.05),當延邊黃牛飼飼喂發(fā)酵飼料后,黃牛背最長肌中CAPN1 mRNA的表達量顯著高于對照組(P<0.05)。

      4 討論

      4.1 飼喂生物發(fā)酵飼料對延邊黃牛背最長肌FABP4基因表達的影響

      肌間脂肪(IMF)作為影響牛肉品質的一個主要因素,其含量與牛肉的嫩度和風味有著十分密切關系。Michal等[2]研究表明,F(xiàn)ABP4基因在脂肪沉積中發(fā)揮重要的作用,與牛大理石花紋、皮下脂肪厚度呈顯著相關。Cho等[5]的研究結果表明該FABP4基因與背膘厚相關。Shogo等[6]研究顯示,F(xiàn)ABP4基因與日本黑牛牛肉中脂肪酸的組成成分呈顯著相關。Barendse等[7]發(fā)現(xiàn),F(xiàn)ABP4基因位于第3外顯子和第3內含子之間存在一個剪接位點突變,該SNP與澳大利亞牛肌間脂肪沉積顯著相關。

      本試驗采用熒光定量RT-PCR方法檢測飼喂發(fā)酵飼料的延邊黃牛和正常飼喂的延邊黃牛FABP4基因mRNA表達進行研究,結果表明,F(xiàn)ABP4基因在試驗組和對照組牛背最長肌組織中均有表達,且試驗組和對照組FABP4基因表達量相比,試驗組顯著高于對照組,說明飼喂發(fā)酵飼料可以增加肌間脂肪的沉積,改善牛肉的風味。

      4.2 飼喂生物發(fā)酵飼料對延邊黃牛背最長肌CAPN1基因表達的影響

      嫩度作為衡量牛肉品質重要的指標。在不同品種和不同部位中差異很大,在不同部位中以背最長肌最具代表性。鈣蛋白酶是影響肌肉嫩度的重要基因,它控制著肌纖維蛋白的降解,與宰后的嫩度變化有著非常密切關系[8]。作為最早發(fā)現(xiàn)的鈣蛋白酶之一,鈣蛋白酶Ⅰ即CAPN1基因,是由21個內含子和22個外顯子組成[9]。Koohmaraie等[3]研究報道,半胱氨酸蛋白酶在肉質嫩化過程中起著非常重要的作用,而半胱氨酸蛋白酶就是由CAPN1基因編碼所產生的,因此,CAPN1基因可作為研究肉質嫩度的主要候選基因。Koohmaraie等[3]的研究也發(fā)現(xiàn)CAPN1基因在肉質嫩化的過程中起著非常重要作用。Page等(2004)[4]研究中發(fā)現(xiàn)CAPN1基因是一個影響肉質嫩度的非常重要的遺傳標記。Pinto等[10]研究表明,CAPN1基因對牛的肉質嫩度具有顯著影響。

      本試驗采用熒光定量RT-PCR方法檢測飼喂生物發(fā)酵飼料的延邊黃牛和正常飼喂的延邊黃牛CAPN1基因mRNA表達進行研究,結果表明,CAPN1基因在試驗組和對照組牛背最長肌組織中均有表達,且試驗組和對照組CAPN1基因表達量相比,試驗組顯著高于對照組,說明飼喂生物發(fā)酵飼料可提高延邊黃牛牛肉嫩度。

      5 結論

      飼喂生物發(fā)酵飼料可顯著提高FABP4、CAPN1基因在延邊黃牛背最長肌中的表達量。

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