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      新型豬圓環(huán)病毒(PCV3)在患有心臟和多系統(tǒng)性炎癥病豬中的首次鑒定

      2017-01-19 00:19:03張愛瓊梁海英曾智勇
      豬業(yè)科學 2017年11期
      關(guān)鍵詞:圓環(huán)基因組測序

      張愛瓊,梁海英,曾智勇

      (貴州大學動物科學學院,貴州 貴陽 550025)

      新型豬圓環(huán)病毒(PCV3)在患有心臟和多系統(tǒng)性炎癥病豬中的首次鑒定

      張愛瓊,梁海英,曾智勇*

      (貴州大學動物科學學院,貴州 貴陽 550025)

      豬圓環(huán)病毒可分為豬圓環(huán)病毒1型和2型(PCV1和PCV2),僅PCV2可感染致病。然而,2016年P(guān)lan等利用宏基因組測序技術(shù),對3例伴有不明原因的心臟和多器官炎癥的豬組織樣品進行研究時,首次發(fā)現(xiàn)并獲得了3株新型豬圓環(huán)病毒(PCV3)的全基因序列。

      第1例樣品系美國密蘇里州患有厭食癥、體重下降和關(guān)節(jié)腫脹的仔豬,其中兩頭的病因得以查明,而另一頭有心肌炎病變的仔豬(3周齡)的病因無法解釋被用來作進一步研究。2015年5月,將該豬的新鮮組織樣品送到明尼蘇達大學獸醫(yī)診斷實驗室,進行細菌學和病毒學診斷處理。由于引起心臟病變的病因仍無法闡明,故利用病毒宏基因組測序?qū)π呐K和肺組織勻漿樣品進行分析。將勻漿液通過15 000×g離心10 min,取上清經(jīng)0.45 μm濾膜過濾后,用核酸酶對上清中的核酸進行降解,然后提取病毒核酸進行隨機RTPCR,并用Klenow DNA聚合酶和具有簡并3`端的引物(GCCGACTAATGCGTAGTCNNNNNNNN)進行擴增測序。所得序列經(jīng)生物信息學相關(guān)軟件比較分析后,篩選出50個與豬圓環(huán)病毒SFBeef及PorkNW2/USA/2009病毒極為相似的序列。之后,使用短序列片段設(shè)計的特異性引物擴增圓環(huán)病毒的完整DNA基因組,測序得到PCV3-US/MO2015(GenBank KX778720)。為了進一步研究PCV3在感染豬心臟和肺組織中的存在情況,使用靶向PCV3探針進行原位雜交,在心肌細胞中檢測出有大量PCV3的mRNA存在,在肺組織中未檢測到有PCV3的mRNA。

      第2例樣品系2016年5月由美國明尼蘇達州送檢的9~10周齡且曾患有呼吸疾病和直腸脫垂的病死豬,將死豬心、肝、脾、肺作病例1同樣的處理后,進行宏基因組測序分析。其中篩選出1 646個與圓環(huán)病毒SFBeef及PorkNW2/USA/2009病毒相似的序列,且已組裝成和PCV3-US/MO2015相似性達98.5%的核苷酸序列(2 000 bp錯配21對)。應(yīng)用相關(guān)引物擴增測序得到了PCV3-US/MN2016的完整基因組序列(GenBank KX898030)。

      第3例樣品系2016年8月由南達科他州送檢的曾患有嚴重呼吸和神經(jīng)疾病的一頭19日齡豬的經(jīng)福爾馬林固定和未經(jīng)固定的組織樣品,相關(guān)樣品作病例1同樣的處理后,進行宏基因組測序分析。所得序列經(jīng)相關(guān)軟件比較分析獲得了大小為1 783 bp的與PCV3基因組相同的拼接序列,空缺部分經(jīng)PCR擴增測序進行了補充完善,最終獲得了大小為2 000 bp的PCV3-US/SD2016完整基因組序列(GenBank KX966193)。

      上述PCV3感染豬的日齡在2~3周和9~10周之間,這表明仔豬在出生后不久就可能被感染,且不排除有垂直感染的可能。上述檢測樣品,通過特殊檢測首先排除了可引起小動脈炎、血管炎和非化膿性心肌炎的常見致病因子(如PCV2和PRRSV)和一些潛在致病因子。同時,宏基因組分析產(chǎn)生的結(jié)果與我們稱為PCV3的新型圓環(huán)病毒感染一致,所述PCV3的mRNA在發(fā)炎的心臟小動脈,分散的心肌細胞和炎癥細胞浸潤的相鄰心肌中被檢測到,其結(jié)果表明PCV3病毒mRNA的轉(zhuǎn)錄與病例1的心臟病變之間可能存在一定的聯(lián)系。

      三例樣品中既檢測到了PCV3的感染,也檢測到了其與豬星狀病毒(PAstV4)的共感染。因此,PAstV4可能單獨致病,但也可能與PCV3共感染致病。PAstV4,在2011年首次在匈牙利的豬糞中測出,是一組多樣的相關(guān)病毒,可以在70%的歐洲腹瀉豬的糞便中檢測到,并且可能與來自明尼蘇達州的豬的腹瀉有關(guān)。此外,在來自克羅地亞的健康豬血液中也檢測到PAstV4;最近在美國患有急性呼吸道疾病的豬鼻拭子中也發(fā)現(xiàn)了類似的星狀病毒(75%的核苷酸序列相似)。雖然PAstV4在健康和腹瀉豬中是高度普遍的腸道感染,但PAstV4作為全身血液感染并與其他感染因子如PCV3混合感染,就如同上述3例樣品一樣,也是與臨床特征吻合可信的病原體。

      深度測序結(jié)果表明PCV3在心臟組織中是存在病毒復(fù)制現(xiàn)象的。盡管病例1中的心肌炎和小動脈炎的病因仍不清楚,并且在心臟組織中也檢測到其他病毒的核酸,但在病變附近復(fù)制的新型圓環(huán)病毒的發(fā)現(xiàn),提高了PCV3病毒可能在臨床致病過程發(fā)揮作用的可能性。PCV3在其他2個具有心臟和多系統(tǒng)炎癥的特征的樣品中的檢出,進一步表明PAstV4可能加劇與其協(xié)同致病的作用。根據(jù)最近報道的中國馬蹄蝠圓環(huán)病毒基因組(GenBank KJ641723)來看,蝙蝠可能被認為是PCV3的原始來源。

      為了更好地了解PCV3在豬群中的分布和流行以及其在疾病中的作用,需要進一步開展更為廣泛的研究。

      國家自然科學基金項目“豬圓環(huán)病毒iDNA標記疫苗及其免疫應(yīng)答效果的研究”

      張愛瓊(1990—)女,研究方向:動物傳染病病原分子生物學。E-mail:1147415844@qq.com

      *通訊作者: 曾智勇(1978—),男,教授,從事動物傳染病病原分子生物學研究:E-mail:zyzeng@gzu.edu.cn

      2017-05-17)

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