2017年8月21日,上海辰山植物園(中科院上海辰山植物科學(xué)研究中心)和中科院上海植物生理生態(tài)研究所聯(lián)合德國馬克斯普朗克分子遺傳研究所和分子植物生理研究所的科研團(tuán)隊在國際著名學(xué)術(shù)期刊《Nature Plants》上共同發(fā)表了揭示甘薯起源的重要論文。
中國以世界總種植面積50%的土地生產(chǎn)了全球80%以上的甘薯,年產(chǎn)量近億噸。但是復(fù)雜的遺傳背景一直以來是制約甘薯研究的瓶頸,甘薯起源問題懸而未決?,F(xiàn)在中德科學(xué)家繪制了甘薯基因組圖譜,揭示了這一重要作物的物種起源歷史。
國際甘薯基因組計劃始于2014年,由上海辰山植物園(中科院上海辰山植物科學(xué)研究中心)和中科院上海植物生理生態(tài)研究所張鵬課題組共同發(fā)起,聯(lián)合德國馬克斯普朗克分子遺傳研究所和分子植物生理研究所共同完成。該研究不僅將絕大部分基因組序列定位到對應(yīng)染色體上,還通過全新生物信息學(xué)方法,將六倍體的6組染色體分開,從而揭示在甘薯的90條染色體中,有30條染色體來源于其二倍體祖先種,另外60條染色體來源于其四倍體祖先種;約50萬年前,二倍體祖先種和四倍體祖先種之間的一次種間雜交孕育了今天的重要作物。該研究采用了Illumina測序技術(shù),自主開發(fā)了一套全新的多倍體單倍型化分析軟件,成功地繪制了甘薯基因組的精細(xì)圖。這為其他復(fù)雜多倍體基因組測序提供了完善可靠的策略與技術(shù),將大力推動資源植物功能基因組學(xué)研究的進(jìn)程。