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      采用通用引物PCR技術(shù)檢測(cè)不同類型人乳頭瘤病毒的研究

      2018-04-15 09:48郭蕊
      健康必讀 2018年8期
      關(guān)鍵詞:人乳頭瘤病毒

      郭蕊

      【摘 要】人乳頭瘤病毒(human papillomavirus, HPV)在人群中感染率較高,并且宮頸癌等多種腫瘤的發(fā)生密切相關(guān),但目前仍缺乏一種簡(jiǎn)單快捷的檢測(cè)方法。本研究選取中國(guó)境內(nèi)常見高毒力HPV病毒,根據(jù)其相對(duì)保守序列設(shè)計(jì)通用引物GP5和GP6,采用PCR法檢測(cè)各種HPV。研究結(jié)果表明,通用引物GP5和GP6可以檢出HPV-16、18、11、6、52型,但HPV-58、51、31和33型未能檢出。本研究建立的通用引物GP5和GP6已基本涵蓋我國(guó)境內(nèi)高毒力型HPV,具有極高的臨床應(yīng)用價(jià)值。

      【關(guān)鍵詞】人乳頭瘤病毒;通用引物;PCR

      【中圖分類號(hào)】R730 【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】A 【文章編號(hào)】1672-3783(2018)08-0118-01

      人乳頭瘤病毒(human papillomavirus, HPV)與許多常見病有關(guān),該病毒的研究在人群傳播廣泛。大量研究發(fā)現(xiàn),宮頸癌以及其他腫瘤(包括胃癌、肺癌和食道癌等)均與HPV的感染直接相關(guān)[1]。由于HPV種類繁多,目前確認(rèn)的種類已達(dá)到60余種,其中可以感染人的有6型、11型、16型、18型和33型等十余種型別[2]。

      核酸雜交技術(shù)和聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)(polymerase chain reaction, PCR)是目前檢測(cè)HPV的主要方法,但由于HPV型別復(fù)雜,現(xiàn)有的PCR-反向點(diǎn)雜交法檢測(cè)成本高昂,難以在臨床大規(guī)格推廣。我們借鑒國(guó)外報(bào)道,使用通用引物檢測(cè)HPV感染,取得了較好的效果,現(xiàn)將結(jié)果報(bào)告如下:

      1 材料和方法

      1.1 標(biāo)本

      6份不同類型HPV標(biāo)本,采集自本院宮頸糜爛患者宮頸脫落細(xì)胞,采用亞能生物技術(shù)公司HPV分型檢測(cè)試劑盒檢測(cè)并確定HPV型別。選取攜帶HPV-11、16、18、31、33、51、52和58型樣本用于本研究。

      1.2 試劑和儀器

      HPV分型檢測(cè)試劑盒購(gòu)自亞能生物技術(shù)(深圳)有限公司;分子雜交儀(YH-H16)購(gòu)自深圳亞能生物技術(shù)有限公司;2×PCR Master Mix預(yù)混液購(gòu)自南京諾唯贊公司;DNA Marker 2000 bp購(gòu)自上海捷瑞公司;PCR擴(kuò)增儀和凝膠電泳成像分析系統(tǒng)均購(gòu)自美國(guó)Bio-Rad公司;水平電泳套件購(gòu)自上海天能生物公司。

      1.3 通用引物合成

      根據(jù)HPV基因組高度保守L1序列設(shè)計(jì)通用引物,其序列為:HPV-GP5: TTTGTTACTGTGGTAGATAC和HPV-GP6: GAAAAATAAACTGTAAA TCA。其PCR產(chǎn)物預(yù)測(cè)長(zhǎng)度約150 bp。引物由蘇州泓訊生物技術(shù)有限公司合成。

      1.4 PCR檢測(cè)

      PCR反應(yīng)體系為25 μL,包括宮頸脫落細(xì)胞DNA模板4 μL,PCR反應(yīng)上下游引物為1 μL。PCR反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性5 min;94℃ 30 s,55℃ 30 s,72℃ 45 s,共40個(gè)循環(huán),最后72℃延伸10 min。5μL PCR產(chǎn)物于2%瓊脂糖凝膠電泳觀察結(jié)果。

      2 結(jié)果

      2.1 PCR產(chǎn)物檢測(cè)結(jié)果

      采用通用引物進(jìn)行不同類型HPV檢測(cè)后,其產(chǎn)物長(zhǎng)度約150 bp。產(chǎn)物條帶清晰易辨,無(wú)非特異性擴(kuò)增,陰性對(duì)照無(wú)擴(kuò)增產(chǎn)物(見圖1)。

      2.2 通用引物檢測(cè)效果

      6種HPV標(biāo)本中,GP5/GP6通用引物可以檢出HPV-16、18、11、6、52型,HPV-58、51、31和33型未能檢出(見圖1)。

      3 討論

      HPV感染與宮頸癌等腫瘤關(guān)系密切,但目前缺乏HPV病毒的體外培養(yǎng)系統(tǒng),HPV-DNA檢測(cè)代替病原學(xué)診斷方法,成為HPV感染診斷的“金標(biāo)準(zhǔn)”。PCR法簡(jiǎn)單方便,成本低廉,是檢測(cè)HPV感染的理想方法。但由于HPV型別眾多,難以尋找到一段保守序列用于引物的設(shè)計(jì),因此開發(fā)PCR通用引物是檢測(cè)不同型別HPV的唯一方法。

      本研究根據(jù)我國(guó)境內(nèi)常見HPV型別,包括HPV-11、16、18、31、33、51、52和58型L1基因序列[3],選取相對(duì)保守一段序列設(shè)計(jì)通用引物GP5和GP6。并且在PCR擴(kuò)增時(shí),采用較低的退火溫度以降低PCR反應(yīng)嚴(yán)謹(jǐn)性,允許引物和目的基因之間存在一定程度錯(cuò)配,以提高擴(kuò)增成功率[4]。我們的檢測(cè)結(jié)果表明,GP5和GP6通用引物可以檢出HPV-16、18、11、6和52型,已基本涵蓋我國(guó)境內(nèi)高毒力型HPV,具有極高的臨床應(yīng)用價(jià)值[5]。

      在后續(xù)研究中,如需要進(jìn)行HPV型別鑒定時(shí),可以將陽(yáng)性PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,通過(guò)BALST比對(duì)后即可知道HPV類型。該方法可以節(jié)省大量檢測(cè)費(fèi)用,操作簡(jiǎn)單,更適合于在臨床推廣使用。

      參考文獻(xiàn)

      [1]Juan C,F(xiàn)eoli-Fonseca JC,Luc L.Human papillomavirus study of 691 pathological specimens from Quebec by PCR-direct sequencing approach [J].J Med Virol,2001,63(4): 284-292.

      [2]Takeshima E,Tomimori K,Kawakami H,etal.NF-κB activation by Helicobacter pylori requires Akt-mediated phosphorylation of p65 [J].BMC Microbiol,2009,9(1): 36-44.

      [3]Chansaenroj J,Theamboonlers A,Junyangdikul P,etal.Whole genome analysis of human papillomavirus type 16 multiple infection in cervical cancer patients[J]. Asian Pacific J Cancer Prev,2012,13(2):599-606.

      [4]Hildesheim A,Schiffman M,Bromley C,etal.Human papillomavirus type 16 variants and risk of cervical cancer[J].J Natl Cancer Inst, 2001, 93: 315-318.

      [5]Cornet I,Gheit T,F(xiàn)ranceschi S,etal.The IARC HPV variant study group:human papillomavirus type 16 genetic variants: phylogeny and classification based on E6 and LCR[J].J Virol,2013,86(12):6855-6861.

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