沐宇 姬懷雪 胡書群 高杏 杜秀平 何偉平 吳如夢(mèng) 王艷
中圖分類號(hào) R968;R734.2 文獻(xiàn)標(biāo)志碼 A 文章編號(hào) 1001-0408(2018)12-1648-04
DOI 10.6039/j.issn.1001-0408.2018.12.15
摘 要 目的:探討DNA修復(fù)基因X線損傷修復(fù)交叉互補(bǔ)基因1(XRCC1)rs25487位點(diǎn)多態(tài)性與肺癌發(fā)生的相關(guān)性。方法:選取2015年9月-2016年7月于徐州醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院就診的蘇北地區(qū)漢族原發(fā)性肺癌患者208例,作為肺癌組;選擇同期于該院進(jìn)行體檢的健康志愿者214例,作為對(duì)照組。采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性法檢測各受試者XRCC1基因rs25487位點(diǎn)的基因型,采用Logistic回歸模型評(píng)價(jià)各基因型與肺癌發(fā)生的相關(guān)性。結(jié)果:兩組受試者的年齡及性別分布比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);而肺癌組吸煙者的比例顯著高于對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。共檢出XRCC1基因rs25487位點(diǎn)AA、AG、GG 3種基因型。其中,對(duì)照組受試者AA、AG、GG型頻率分別為43.5%、41.1%、15.4%,肺癌組患者上述基因型頻率分別為28.8%、48.6%、22.6%,兩組受試者各基因型頻率均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),但其基因型分布組間比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。與AA型個(gè)體比較,AG型個(gè)體發(fā)生肺癌的風(fēng)險(xiǎn)增加了2.265倍[比值比(OR)=2.265,95%置信區(qū)間(CI)(1.299,3.950),P=0.040;經(jīng)年齡、性別、吸煙史校正的OR=2.309,95%CI(1.274,4.185),P=0.006],差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;GG型個(gè)體發(fā)生肺癌的風(fēng)險(xiǎn)增加了1.310倍[OR=1.310,95%CI(0.771,2.228),P=0.318;經(jīng)校正的OR=1.429,95%CI(0.811,2.518),P=0.217],但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。結(jié)論:XRCC1基因rs25487位點(diǎn)突變雜合是我國蘇北地區(qū)漢族人群發(fā)生肺癌的危險(xiǎn)因素,且吸煙可以增加肺癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)。
關(guān)鍵詞 XRCC1基因;rs25487位點(diǎn);單核苷酸多態(tài)性;肺癌;發(fā)生;相關(guān)性
ABSTRACT OBJECTIVE: To investigate the correlation of XRCC1 rs25487 polymorphism with the occurrence of lung cancer. METHODS: A total of 208 patients with primary lung cancer of Han nationality in Northern Jiangsu selected from the Affiliated Hospital of Xuzhou Medical University during Sept. 2015-Jul. 2016 were included in lung cancer group. A total of 214 healthy volunteers of the hospital underwent physical examination were included in control group. PCR-RFLP was used to detect the genotypes at XRCC1 rs25487 locus, and Logistic regression model was used to evaluate the correlation of genotypes with the occurrence of lung cancer. RESULTS: There was no statistical significance in the distribution of age and gender between 2 groups (P>0.05). The proportion of smoker in lung cancer group was significantly higher than control group, with statistical significance (P<0.05). AA, AG and GG genotypes were detected at rs25487 locus of XRCC1 gene. The frequency of AA, AG and GG genotype were 43.5%, 41.1% and 15.4% in control group and 28.8%, 48.6% and 22.6% in lung cancer group, respectively. The frequencies of genotypes in 2 groups were in line with Hardy-Weinberg equilibrium (P>0.05), but there was statistical significance in genotype distribution between 2 groups(P<0.05). Compared with AA genotype, the risk of lung cancer in individuals carrying AG genotype increased by 2.265 fold [OR=2.265, 95%CI(1.299, 3.950),P=0.040; after corrected with gender, age and smoking history OR=2.309,95%CI(1.274,4.185),P=0.006], with statistical significance. The risk of lung cancer in individuals carrying GG genotype increased by 1.310 fold [OR=1.310,95%CI(0.771,2.228),P=0.318;after corrected OR=1.429,95%CI(0.811,2.518),P=0.217], without statistical significance. CONCLUSIONS:rs25487 locus mutant heterozy- gosity of XRCC1 gene is risk factor of lung cancer in Han nationality from Northern Jiangsu, and smoking can increase the risk of lung cancer.
KEYWORDS XRCC1 gene; rs25487; Single nucleotide polymorphism; Lung cancer; Occurrence; Relationship
肺癌是我國惡性腫瘤致死的首要原因,暴露環(huán)境危險(xiǎn)因素與肺癌的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[1]。但暴露在相同環(huán)境中,不同個(gè)體發(fā)生肺癌的概率仍存在很大差異[2]。相關(guān)研究表明,遺傳因素是增加肺癌易感性的重要原因之一[2]。其中,單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)是最常見的遺傳學(xué)改變,DNA修復(fù)基因的SNP可影響個(gè)體對(duì)肺癌的易感性[3]。肺癌的發(fā)生與內(nèi)、外源性致癌因子引起的DNA損傷密不可分,DNA修復(fù)基因的SNP作為個(gè)體DNA修復(fù)能力(DNA repair capacity,DRC)差異的分子遺傳學(xué)基礎(chǔ),可能是影響肺癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的重要遺傳因素[4]。X射線損傷修復(fù)交叉互補(bǔ)基因1(X-ray repair cross complementing gene 1,XRCC1)是堿基切除修復(fù)(Base excision repair,BER)途徑上的關(guān)鍵基因,其編碼的蛋白與DNA聚合酶β、DNA連接酶Ⅲ一起參與BER過程[5]。盡管XRCC1基因rs25487位點(diǎn)是目前研究的熱點(diǎn),但因研究群體、種族等差異,結(jié)論尚存在很大分歧[6-9]。為此,本研究以我國蘇北地區(qū)漢族人群為研究對(duì)象,探討其XRCC1基因rs25487位點(diǎn)多態(tài)性與肺癌發(fā)生的相關(guān)性,以期為肺癌的預(yù)防和早期診斷尋找新的標(biāo)志物。
1 資料與方法
1.1 納入與排除標(biāo)準(zhǔn)
1.1.1 肺癌組 選取2015年9月-2016年7月于徐州醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院就診并經(jīng)病理學(xué)檢查確診為原發(fā)性肺癌的蘇北地區(qū)患者作為肺癌組。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)年齡>18歲;(2)漢族;(3)無血緣關(guān)系;(4)經(jīng)細(xì)胞學(xué)或組織學(xué)檢查確診為肺癌,包括小細(xì)胞肺癌與非小細(xì)胞肺癌(如肺腺癌、肺鱗癌等)。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)既往有腫瘤史者;(2)曾接受過手術(shù)或放化療者;(3)伴有其他嚴(yán)重疾?。ㄈ缣悄虿?、無法控制的高血壓以及最近6個(gè)月內(nèi)出現(xiàn)過心力衰竭或心肌梗死等)者。
1.1.2 對(duì)照組 選取同期于該院進(jìn)行體檢的健康志愿者作為對(duì)照組。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)體檢結(jié)果報(bào)告為健康;(2)與肺癌組患者無血緣關(guān)系;(3)無腫瘤尤其是肺癌家族史;(4)無明確職業(yè)性致癌因素接觸史;(5)年齡、性別與肺癌組患者匹配。
本研究方案經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)審核通過,所有受試者均知情同意并簽署了知情同意書。
1.2 資料收集
收集兩組受試者的人口學(xué)資料,包括年齡、性別、個(gè)人疾病史、家族史、吸煙史等;采集肺癌組患者的病理學(xué)信息,包括病理類型、TNM分期、分化、轉(zhuǎn)移等。
1.3 XRCC1基因rs25487位點(diǎn)多態(tài)性分析
所有受試者均抽取外周靜脈血2 mL,采用Ezup柱式血液基因組DNA抽提試劑盒[生工生物工程(上海)有限公司]提取DNA,操作方法參照說明書,產(chǎn)物置于-20 ℃冰箱中保存。采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性法(Polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)檢測受試者XRCC1基因rs25487位點(diǎn)的基因型。引物由生工生物工程(上海)有限公司設(shè)計(jì)并合成,上游引物:5′ -CCAACACCCCCAAGTACAGC-3′ ,下游引物:5′ -TGGAGGAGCAGTTTGTGCAA-3′ 。反應(yīng)體系:Dream Taq PCR Master Mix 12.5 μL,上、下游引物各2 μL(1 μmol/L),DNA模板5 μL,加去離子水至25 μL。反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性5 min,94 ℃變性30 s,60.5 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,共30個(gè)循環(huán);72 ℃再延伸5 min。酶切反應(yīng)體系:MspⅠ內(nèi)切酶1 μL(10 U/μL)、10×T Buffer 2 μL、0.1%牛血清蛋白2 μL、PCR產(chǎn)物10.0 μL,加去離子水至20 μL,于37 ℃下消化12 h。取酶切產(chǎn)物10 μg置于2.0%瓊脂糖凝膠中電泳,電泳結(jié)果于1600R型凝膠成像系統(tǒng)(上海天能科技有限公司)上觀察,確定各基因型。
1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法
采用SPSS 19.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。采用擬合優(yōu)度χ2檢驗(yàn)分析受試者基因型頻率是否符合Hardy-Weinberg平衡。計(jì)量資料以x±s表示,組間比較采用t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料以例數(shù)或率表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)。建立Logistic回歸模型評(píng)價(jià)XRCC1基因rs25487位點(diǎn)基因型與肺癌發(fā)生的相關(guān)性,以經(jīng)患者年齡、性別、吸煙史校正后的比值比(Odds ratio,OR)和95%置信區(qū)間(Confidence interval,CI)表示相對(duì)危險(xiǎn)度。所有統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn)均為雙側(cè)概率檢驗(yàn),P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2 結(jié)果
2.1 兩組受試者一般資料比較
肺癌組共納入患者208例,其中男性129例,女性79例;平均年齡(60.51±8.32)歲;吸煙者116例,非吸煙者92例;腺癌96例,鱗癌86例,診斷不明確的26例;TNM分期Ⅰ~Ⅱ期75例,Ⅲ~Ⅳ期118例,分期不明確的15例。對(duì)照組共納入健康志愿者214例,其中男性132例,女性82例;平均年齡(60.01±8.85)歲;吸煙者84例,非吸煙者130例。兩組受試者的年齡及性別分布比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);而肺癌組吸煙者的比例顯著高于對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),詳見表1。
2.2 基因型分析
2.2.1 酶切結(jié)果 按“1.3”項(xiàng)下條件進(jìn)行試驗(yàn),得XRCC1基因rs25487位點(diǎn)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的大小為408 bp。經(jīng)MspⅠ酶切后,AA型的酶切片段大小為408 bp,AG型的酶切片段大小為408、258、150 bp,GG型的酶切片段大小為258、150 bp,詳見圖1。
2.2.2 XRCC1基因型分布情況 共檢出XRCC1基因rs25487位點(diǎn)3種基因型:AA、AG、GG型。其中,對(duì)照組受試者AA、AG、GG型頻率分別為43.5%、41.1%、15.4%,肺癌組患者AA、AG、GG型頻率分別為28.8%、48.6%、22.6%。兩組受試者各基因型頻率均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);但其基因型分布組間比較差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。
2.3 XRCC1基因rs25487位點(diǎn)多態(tài)性與肺癌發(fā)生的相關(guān)性
Logistic回歸模型分析結(jié)果顯示,與XRCC1基因AA型個(gè)體比較,AG型個(gè)體發(fā)生肺癌的風(fēng)險(xiǎn)增加了2.265倍[OR=2.265,95%CI(1.299,3.950),P=0.040;經(jīng)校正的OR=2.309,95%CI(1.274,4.185),P=0.006],差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義;GG型個(gè)體發(fā)生肺癌的風(fēng)險(xiǎn)增加了1.310倍[OR=1.310,95%CI(0.771,2.228),P=0.318;經(jīng)校正的OR=1.429,95%CI(0.811,2.518),P=0.217],但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,詳見表3。
3 討論
DNA修復(fù)基因的SNP影響DNA的修復(fù)能力,是肺癌遺傳易感性的重要因素[3]。XRCC1基因定位于人類染色體19q13.2~13.3,包含17個(gè)外顯子,大小為33 kb。該基因編碼的XRCC1蛋白包含633個(gè)氨基酸,沒有已知的酶活性,但作為腳手架蛋白,可與DNA聚合酶β、DNA連接酶Ⅲ一起參與DNA修復(fù)[5]。若個(gè)體XRCC1基因突變,可能會(huì)導(dǎo)致DNA修復(fù)功能的喪失[8-10]。目前,已發(fā)現(xiàn)與肺癌易感性相關(guān)的3個(gè)XRCC1基因SNP位點(diǎn),分別為密碼子194(C26304T,第6外顯子,Arg194Trp)、密碼子280(G27466A,第9外顯子,Arg280His)和密碼子399(G28152A,第10外顯子,Arg399Gln,rs25487),且多集中在rs25487位點(diǎn)[8,10-11]。盡管國內(nèi)外有很多研究表明,XRCC1基因rs25487位點(diǎn)多態(tài)性與肺癌易感性相關(guān),但結(jié)果并不一致:Du Y等[8]的研究結(jié)果顯示,XRCC1基因rs25487位點(diǎn)堿基突變可增加個(gè)體罹患肺癌的風(fēng)險(xiǎn)(P<0.05);Natukula K等[11]報(bào)道,在印度人群中,攜帶XRCC1基因突變雜合型和突變純合型的個(gè)體罹患肺癌的概率顯著增加(P<0.05);然而,Qian B等[12]在我國天津地區(qū)受試人群中并未發(fā)現(xiàn)XRCC1基因rs25487位點(diǎn)多態(tài)性與肺癌易感性相關(guān)(P>0.05)。這提示,受試人群所在區(qū)域、環(huán)境及種族的差異均有可能對(duì)研究結(jié)果造成影響,故尋找本地區(qū)肺癌易感人群遺傳標(biāo)志物至關(guān)重要。
本研究結(jié)果顯示,XRCC1基因rs25487位點(diǎn)突變雜合(AG)型是肺癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)基因型,攜帶該基因型的個(gè)體發(fā)生肺癌的風(fēng)險(xiǎn)顯著升高。上述結(jié)果提示,XRCC1基因突變與肺癌發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn)密切相關(guān)。XRCC1基因突變可導(dǎo)致基因序列的改變,從而影響其編碼蛋白的合成,在一定程度上抑制了BER過程,最終致使個(gè)體罹患肺癌的概率增加[13-14]。但本研究尚未發(fā)現(xiàn)GG(突變純合)型與肺癌易感性相關(guān),這可能與XRCC1基因rs25487位點(diǎn)GG型在該地區(qū)人群中的分布偏少,且本研究樣本總量也偏小等因素有關(guān),故此結(jié)論有待擴(kuò)大樣本量進(jìn)一步予以驗(yàn)證。此外,研究過程中還發(fā)現(xiàn),肺癌組吸煙者的比例顯著高于對(duì)照組,提示吸煙是誘發(fā)肺癌的重要危險(xiǎn)因素。
綜上,XRCC1基因rs25487位點(diǎn)突變雜合與我國蘇北地區(qū)漢族人群肺癌的發(fā)生密切相關(guān),此基因可作為肺癌預(yù)防和早期診斷的標(biāo)志物。此外,吸煙亦可增加個(gè)體罹患肺癌的風(fēng)險(xiǎn),環(huán)境-基因交互作用對(duì)肺癌的影響不能忽視。但鑒于本研究樣本量偏小,本課題組將擴(kuò)大樣本量對(duì)上述結(jié)果進(jìn)行證實(shí),并進(jìn)一步在細(xì)胞水平揭示XRCC1基因突變對(duì)其編碼蛋白功能的影響及其機(jī)制。
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(收稿日期:2017-07-26 修回日期:2018-04-10)
(編輯:張?jiān)拢?/p>