胡清彪,李曉東,周 波,孫 娜,劉 胥
(1.四川省農(nóng)業(yè)科學(xué)院水產(chǎn)研究所,四川 成都 610000;2.盤錦光合蟹業(yè)有限公司,遼寧 盤錦 124200)
【研究意義】中華絨螯蟹肉質(zhì)鮮美,營(yíng)養(yǎng)價(jià)值高,深受消費(fèi)者喜愛,具有很高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。隨著人們生活水平的不斷提高,河蟹的消費(fèi)量不斷增加,從而促進(jìn)了養(yǎng)殖業(yè)的快速發(fā)展[1-2],逐漸形成了規(guī)?;B(yǎng)殖。但大規(guī)模養(yǎng)殖過程中為了減少環(huán)境差異同時(shí)不占用過多的養(yǎng)殖水體,往往需要將不同的家系混養(yǎng)在一起,導(dǎo)致家系之間個(gè)體不易區(qū)分,對(duì)未來選育過程中選擇親本并防止近親交配造成了一定的困難。因此嘗試對(duì)不同家系幼蟹做行之有效的鑒別方法對(duì)中華絨螯蟹養(yǎng)殖業(yè)及種質(zhì)資源保護(hù)有重要作用?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】河蟹形態(tài)差異的研究主要集中于成蟹階段且主要在區(qū)分不同地理群體間的差異。徐興川[3-4]對(duì)長(zhǎng)江蟹、甌江蟹與遼河蟹在外部形態(tài)、大小及體色等方面的差別進(jìn)行了相應(yīng)的研究;許家武等[5]對(duì)長(zhǎng)江、遼河、甌江中華絨螯蟹種群的形態(tài)進(jìn)行了比較與判別分析;李勇等[6]建立了遼河、長(zhǎng)江及甌江三水系中華絨螯蟹幼蟹形態(tài)判別程序;盧義等[7]對(duì)長(zhǎng)江、黃河、遼河水系中華絨螯蟹野生扣蟹的形態(tài)學(xué)進(jìn)行了研究分析,并分別對(duì)雌雄扣蟹建立了判別方程?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】目前還未有人嘗試通過形態(tài)判別來進(jìn)行區(qū)分中華絨螯蟹的不同家系。本研究以中華絨螯蟹新品種‘光合1號(hào)’后代扣蟹為研究對(duì)象,采用聚類分析和逐步判別分析試圖區(qū)分扣蟹不同家系。【擬解決的關(guān)鍵問題】對(duì)未來中華絨螯蟹的選育工作有一定的理論指導(dǎo)意義。
表1 不同家系幼蟹的采樣時(shí)間、樣本數(shù)及平均體重Table 1 Sampling time, sample size and average body weight of juvenile crab from different families
本實(shí)驗(yàn)所用中華絨螯蟹為盤錦光合蟹業(yè)有限公司選育的親緣關(guān)系明確的‘光合1號(hào)’后代,經(jīng)過人工育苗后將不同家系大眼幼體分別于室外不同稻田圍隔中飼養(yǎng),待其生長(zhǎng)發(fā)育為扣蟹,于10月初捕回并測(cè)量記錄。測(cè)定樣本大小如表1所示(所有樣本附肢齊全)。
a:頭胸甲背部,共9個(gè)參數(shù);b:頭胸甲右側(cè)面,共2個(gè)參數(shù);c:腹甲測(cè),共3個(gè)參數(shù);d:第2~4步足,共4個(gè)參數(shù)a: The back of carapace with 9 parameters; b: The right part of carapace with 2 parameters; c: The shell of abdomen with 3 parameters; d: The 2-4th ambulatory legs with 4 parameters圖1 中華絨螯蟹測(cè)量部位Fig.1 Sketch diagram of measuring points of E. sinensis
表2 中華絨螯蟹幼蟹家系間的歐式距離Table 2 Euclidean distance of families of juvenile E. sinensis
所有參數(shù)均使用游標(biāo)卡尺測(cè)量,精確到0.1 mm,所測(cè)參數(shù)參考文獻(xiàn)[6]并做了相應(yīng)的改進(jìn),每只幼蟹逐一測(cè)量點(diǎn)間距離,獲得共3240個(gè)形態(tài)數(shù)據(jù),每個(gè)個(gè)體測(cè)量點(diǎn)如圖1,每個(gè)個(gè)體統(tǒng)計(jì)如下數(shù)據(jù):X1=AB, X2=BC, X3=CC, X4=DD, X5=EE, X6= FF, X7=OE, X8=OF, X9=IP, X10=JJ, X11=KK, X12=NQ (第三步足), X13=LM (第二步足), X14=MQ (第二步足), X15=LM (第四步足),X16=RS (體高:背甲最凸點(diǎn)到腹甲的垂直距離), X17=GG(頭胸甲寬) 及 X18=HP (頭胸甲長(zhǎng))。
為了消除幼蟹規(guī)格大小差異對(duì)參數(shù)的影響,分析獲得的形態(tài)學(xué)測(cè)量數(shù)據(jù)時(shí),參照文獻(xiàn)[8],將每只幼蟹的所有值均除以它的頭胸甲長(zhǎng)(X18)進(jìn)行校正,X1~X18對(duì)應(yīng)校正值為V1~V18。對(duì)所有校正后的形態(tài)參數(shù)使用聚類分析以及逐步判別分析2種多元分析方法,均采用SPSS 20.0軟件進(jìn)行分析處理。
1.3.1 聚類分析 采用歐式距離(Euclidean距離)的最短距離系統(tǒng)聚類法[9]。
1.3.2 逐步判別分析 根據(jù)聚類分析結(jié)果,采用逐步判別方法進(jìn)行分析,選取默認(rèn)臨界F值 (選取進(jìn)入模型的F值為3.84,從模型中剔除變量的F值為2.71),并對(duì)判別貢獻(xiàn)大的參數(shù)建立相應(yīng)的判別公式,繪制個(gè)體散布圖。
圖2 6個(gè)中華絨螯蟹幼蟹家系的聚類分析圖Fig.2 Clustering dendrogram of Chinese mitten crab from six families of juvenile E. sinensis
家系間歐式距離如表2,樹狀圖如圖2,結(jié)果顯示c 家系、f 家系趨異程度較高,f家系趨異程度最大,a家系、b家系、d家系、e家系形態(tài)差異不大。
由于聚類分析尚不能夠判別樣本的家系所屬,因此進(jìn)一步進(jìn)行判別分析。為了建立簡(jiǎn)便實(shí)用的判別公式,在確保一定的判別準(zhǔn)確率的前提下,篩選出貢獻(xiàn)較大的特征值。運(yùn)用SPSS 20.0 對(duì)校正后的18個(gè)參數(shù)進(jìn)行逐步判別分析,篩選出10個(gè)形態(tài)參數(shù),入選的先后順序?yàn)閂3、V5、V6、V7、V8、V9、V10、V11、V12、V15。用篩選出的10個(gè)形態(tài)參數(shù)做為自變量分別建立a、b、c、d、e、f 6個(gè)家系的形態(tài)判別公式,如下:
Pa= 889.995V3- 353.589V5+ …… + 553.628V12- 244.759V15- 542.102
Pb= 890.401V3- 229.401V5+ …… +549.753V12- 238.621V15-531.479
……
Pf= 531.272V3- 469.763V5+ …… + 485.842V12- 206.531V15-480.773
所得公式中各項(xiàng)系數(shù)值以及常數(shù)項(xiàng)詳見表3。
根據(jù)上述公式,對(duì)某一幼蟹的10個(gè)參數(shù)值進(jìn)行收集,并經(jīng)過校正,代入上述各項(xiàng)公式中,計(jì)算結(jié)果,所得結(jié)果值(P)哪個(gè)最大即屬于哪個(gè)家系(如:所有值中Pa值最大,則判定該蟹屬于a家系)。
判別結(jié)果表明:6個(gè)家系中每個(gè)家系分別有30只幼蟹,a 家系運(yùn)用判別函數(shù)進(jìn)行回代分類,分類結(jié)果與實(shí)際情況相符的共25只,錯(cuò)分了5只,判別準(zhǔn)確率為83.8 %;b 家系運(yùn)用判別函數(shù)回代分類,分類結(jié)果與實(shí)際相符28只,錯(cuò)分2只,判別準(zhǔn)確率為93.3 %;c 家系運(yùn)用判別函數(shù)回代分類,分類結(jié)果與實(shí)際相符29只,錯(cuò)分1只,判別準(zhǔn)確率為96.7 %;d 家系運(yùn)用判別函數(shù)回代分類,分類結(jié)果與實(shí)際相符28只,錯(cuò)分2只,判別準(zhǔn)確率為93.3 %;e 家系運(yùn)用判別函數(shù)回代分類,分類結(jié)果與實(shí)際相符0只,錯(cuò)分30只,主要錯(cuò)分為a家系(25只),判別準(zhǔn)確率為0 %;f 家系運(yùn)用判別函數(shù)回代分類,分類結(jié)果與實(shí)際相符30只,錯(cuò)分0只,判別準(zhǔn)確率100 %,平均擬合概率為77.8 % (圖3,表4)。
表3 6個(gè)中華絨螯蟹幼蟹家系判別公式各項(xiàng)系數(shù)及常數(shù)Table 3 The coefficients of linear discriminant functions and constant terms for six families of juvenile E. sinensis
經(jīng)交叉驗(yàn)證,a、b、c、d、e、f 6個(gè)家系分類準(zhǔn)確率分別為0 %、93.3 %、86.7 %、90.0 %、0 %、96.7 %,其中a家系幼蟹主要誤判為e家系(25只),e家系幼蟹主要誤判為a家系(25只),平均擬合概率為61.1 %。
圖3 6個(gè)家系中華絨螯蟹幼蟹的形態(tài)判別分析散點(diǎn)圖Fig.3 Canonical plot scores from discriminant analysis on morphological measurement of juvenile E. sinensis from six families
為了檢驗(yàn)上述判別公式的適用性,對(duì)飼養(yǎng)于盤錦光合蟹業(yè)公司育種車間的6個(gè)家系的幼蟹重新隨機(jī)取樣(每個(gè)家系15只),這些樣品均為參加建立判別公式模型,測(cè)得10個(gè)參數(shù)后,所有參數(shù)均除以體長(zhǎng)校正后,代入判別函數(shù)得出:a家系有12只幼蟹同時(shí)被判入了a家系和e家系,b家系判別準(zhǔn)確率為53.3 %,c家系判別準(zhǔn)確率為80 %,d家系判別準(zhǔn)確率為0 %,有12只同時(shí)判入了a家系和e家系;e家系有11只同時(shí)判入了a和e家系,f家系判別準(zhǔn)確率為60 %。由此可見,通過判別分析對(duì)于家系水平來說,部分家系可以有很好的判別,但部分家系判別上存在一定的困難。
在魚類分類學(xué)上,形態(tài)度量的性狀是一個(gè)很重要的分類指標(biāo)[10-11],用于新物種的發(fā)現(xiàn)和確認(rèn)[12],地理種群間的變異問題[13]。大多數(shù)通過統(tǒng)計(jì)方法對(duì)中華絨螯蟹進(jìn)行不同地理種群間的差異分析均是對(duì)中華絨螯蟹成蟹進(jìn)行形態(tài)學(xué)的研究分析[5,14],僅少量對(duì)幼蟹進(jìn)行研究[6-7]。但尚未有過對(duì)中華絨螯蟹不同家系的幼蟹進(jìn)行形態(tài)學(xué)區(qū)分的報(bào)道。家系在動(dòng)物育種學(xué)上是指共同祖先繁殖的后代。本文通過統(tǒng)計(jì)學(xué)方法嘗試對(duì)中華絨螯蟹新品種‘光合1號(hào)’后代不同家系幼蟹進(jìn)行形態(tài)鑒別區(qū)分。如果家系可以通過形態(tài)學(xué)鑒定而區(qū)分的話,將會(huì)對(duì)遺傳育種起到巨大的推動(dòng)作用。
本研究對(duì)6個(gè)家系幼蟹形態(tài)參數(shù)進(jìn)行聚類分析表明c 家系和f 家系趨異程度高。逐步判別是對(duì)大量入選因子進(jìn)行篩選的一個(gè)過程,篩選過程中不僅考慮到單個(gè)入選因子的重要性,還要考慮入選后對(duì)其他已經(jīng)入選因子的影響作用,最終做出是否入選的決定,這樣就篩選出了最佳組合因子,從而建立相應(yīng)的判別函數(shù)[6],因此沒有必要比較各個(gè)因子在不同家系之間的差異的顯著性。許加武等[5]對(duì)遼河、長(zhǎng)江、甌江中華絨螯蟹的成蟹種群進(jìn)行了逐步判別分析,最終判別效果比較理想;李勇等[6]對(duì)長(zhǎng)江、甌江及遼河三水系中華絨螯蟹幼蟹種群進(jìn)行了逐步判別分析,區(qū)分結(jié)果比較理想。本研究通過逐步判別分析對(duì)6個(gè)家系共180個(gè)個(gè)體進(jìn)行分析,從18個(gè)參數(shù)中篩選出10個(gè)參數(shù)用于判別函數(shù)的建立,將不同家系之間的差異通過函數(shù)形式體現(xiàn),運(yùn)用判別函數(shù)回代分類得到平均擬合概率為77.8 %,而交叉驗(yàn)證的擬合概率為61.1 %,這說明已經(jīng)建立的判別公式對(duì)于相應(yīng)的家系的判別在理論上存在一定的可行性,但是當(dāng)重新隨機(jī)選取未參加建立判別公式的樣品進(jìn)行后驗(yàn)時(shí),結(jié)果更加不理想:b家系的判別準(zhǔn)確率為53.3 %,c家系的判別準(zhǔn)確率理想,達(dá)到80 %,f家系的判別準(zhǔn)確率達(dá)到了60 %其余均不理想,甚至為0,且a、d、e家系大部分同時(shí)判入了a與e家系,這從側(cè)面反映a家系、d家系與e家系之間尚未達(dá)到較大的區(qū)分度。分析原因可能是家系間尚未形成穩(wěn)定差異,只有少部分家系之間差異比較明顯,同時(shí)不同人工育種家系在選擇育種過程中側(cè)重點(diǎn)不同,本育種群體并未將形態(tài)差異這一性狀作為育種過程中的一個(gè)側(cè)重點(diǎn),這可能占很大一部分原因。且生長(zhǎng)環(huán)境對(duì)中華絨螯蟹的形態(tài)學(xué)特征存在一定的影響,而本實(shí)驗(yàn)的所有家系幼蟹之間的生長(zhǎng)環(huán)境差異性不大,故其形態(tài)差異較小。家系是比種群更進(jìn)一步的分類,種群因?yàn)橥ㄟ^長(zhǎng)期的地理隔離以及生殖隔離,可以形成穩(wěn)定的遺傳差異,從而形成了穩(wěn)定的形態(tài)差異,而家系之間尚未達(dá)到這一水平。因此,本研究中,形態(tài)差異很難作為本育種家系鑒別的依據(jù),還需進(jìn)行更深入的研究并且結(jié)合其他生物學(xué)手段才能達(dá)到更準(zhǔn)確的鑒別目的。
表4 判別分析統(tǒng)計(jì)Table 4 The statistic of discriminant analysis
選取18個(gè)形態(tài)參數(shù),對(duì)中華絨螯蟹6個(gè)家系共180個(gè)個(gè)體進(jìn)行聚類分析,結(jié)果顯示:c家系、f 家系趨異程度較高;通過逐步判別分析,從18個(gè)形態(tài)參數(shù)中篩選出10個(gè)貢獻(xiàn)率大的參數(shù)建立判別函數(shù),平均擬合概率為77.8 %,交叉驗(yàn)證平均擬合概率為61.1 %,表明通過逐步判別分析進(jìn)行家系間的區(qū)分理論上可行,但是當(dāng)重新隨機(jī)選取未參加建立判別公式的樣品進(jìn)行后驗(yàn)時(shí),結(jié)果不甚理想,表明形態(tài)差異很難作為本育種家系鑒別的依據(jù),后續(xù)還需做更深入的研究。