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      雄黃連木遺傳多樣性

      2019-03-03 02:43李琬婷黃曉霞程小毛
      江蘇農業(yè)科學 2019年23期
      關鍵詞:黃連木遺傳變異

      李琬婷 黃曉霞 程小毛

      摘要:選取雄黃連木(Pistacia chinensis Bunge)為研究材料,利用10對擴增片段長度多態(tài)性(AFLP)引物對來自河南省的6個不同種群總計136份雄黃連木個體進行遺傳多樣性分析,從不同層次揭示其變異規(guī)律以及為后期黃連木雌雄鑒定和合理利用提供理論依據(jù)。結果表明,物種水平上,Shannon信息指數(shù)Ⅰ(0.49)和基因多樣性指數(shù)(0.33)均反映出雄黃連木種群具有中等遺傳多樣性水平。分子方差分析(AMOVA)結果表明,雄黃連木種群內的遺傳變異占93.35%,種群間的變異占6.65%,二者都說明該地區(qū)黃連木的遺傳變異主要發(fā)生在種群內部。6個黃連木群體間的遺傳距離范圍在0.035 3~0.149 5之間,遺傳相似性的范圍在0.861 1~0.965 3之間,基因流Nm為2.612 6,說明黃連木不同群體間相似程度較高,遺傳分化較低,基因交流較充分。

      關鍵詞:黃連木;AFLP;遺傳變異;遺傳分化

      中圖分類號: S792.990.4 文獻標志碼: A 文章編號:1002-1302(2019)23-0133-04

      黃連木(Pistacia chinensis Bunge)系漆樹科(Anacardiaceae)黃連木屬(Pistacia)落葉喬木,雌雄異株,是廣泛分布于我國的生物能源樹種之一[1]。在能源危機日益加劇的今天,對生物柴油能源植物進行利用研究具有極其重要的價值與意義,黃連木作為一種優(yōu)良的木本油料樹種,顯示出其廣闊的開發(fā)利用前景,受到廣泛的關注[2-3]。對于雌雄異株植物而言,一般雄株生長得更快且有更好的適應性[4],通過對雌雄黃連木的合理搭配,來滿足當前對黃連木種群大面積繁育的需要,雌雄植株黃連木性別發(fā)育很難通過形態(tài)學特征來進行鑒別,故對雄黃連木進行遺傳多樣性研究具有極高價值。由于過去對黃連木的研究相對落后,主要集中于栽培管養(yǎng)[5]、病蟲害防治[6]、生理特性[7]以及資源分布[8]等方面,有關其雌雄植株遺傳多樣性或遺傳改良的研究國內尚未見報道,李琬婷等利用9對AFLP引物對河南省4個不同種群黃連木材料進行遺傳多樣性分析,研究結果表明黃連木4個不同種群遺傳多樣性均處于中等水平,黃連木總的遺傳分化主要來自居群內部,較低遺傳分化則在其居群間存在[9]。

      在隨機擴增多態(tài)性標記(RAPD)和限制性片段長度多態(tài)性(RFLP)基礎上不斷完善發(fā)展的分子技術-擴增片段長度多態(tài)性(AFLP)標記技術,兼?zhèn)銻APD與RFLP技術雙重優(yōu)點,可在不預知基因組序列情況下,對基因組多態(tài)性進行檢測,不僅易于標準化,且所檢出的多態(tài)位點同RAPD標記一樣可覆蓋整個基因組,也具RFLP同樣的可靠性及穩(wěn)定性[10]。該項技術發(fā)展至今已成功用于多種植物遺傳多樣性、高密度遺傳圖譜構建以及分子標記篩選的研究。隨著分子技術的不斷進步完善,AFLP技術已廣泛應用于植物種質資源鑒定、遺傳多態(tài)性檢測、遺傳圖譜構建以及群體遺傳結構分析等諸多方面,不僅應用在小麥、水稻、玉米等主要農作物上,在林木、果樹及蔬菜等植物上也得到廣泛利用[11-14]。程小毛等應用AFLP技術對6個居群的滇西北玉龍雪山不同海拔川滇高山櫟進行遺傳多樣性分析,結果表明,6個居群的遺傳多樣性水平隨海拔梯度的變化而呈現(xiàn)相同的變化規(guī)律[15]。魏朔南等通過8對引物組合將陜西漆樹8個品種和6個野生居群的14個樣品完全區(qū)分開[16]。本研究通過采用AFLP技術對河南省不同地域雄黃連木進行遺傳多樣性分析,從而為了解不同地理地域對雄黃連木遺傳多樣性和親緣關系的影響,揭示其變異規(guī)律以及后期雌雄黃連木鑒定和合理利用奠定基礎。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      試驗材料為雄黃連木植株,于2015年3月在我國河南省長葛市和安陽市南溝村(西溝北坡)、南溝、南溝(東后凹)、南溝村(陳家溝)以及安陽監(jiān)獄共6個地點進行采集,采集數(shù)分別為23、32、12、18、17、34株,共計136株。每株采其嫩梢 1~5個嫩枝,且取樣點間距≥30 m。將采集樣品迅速放進變色硅膠進行干燥處理,帶回實驗室常溫保存?zhèn)溆谩?/p>

      1.2 試驗方法

      1.2.1 雄黃連木DNA抽提 采用改良CTAB(十六烷基三甲基溴化銨)法[17]提取雄黃連木基因組總DNA。

      1.2.2 雄黃連木AFLP分析 參照李琬婷等的反應體系及反應程序[9,18],進行AFLP相關分析。選擇性擴增引物編號及序列見表1。

      1.2.3 帶型統(tǒng)計與數(shù)據(jù)分析 采用人工讀帶法,將凝膠電泳圖上難以分辨的弱帶或無帶記作“0”,同一位置的清晰條帶記作“1”,據(jù)此構建原始數(shù)據(jù)矩陣。利用POPEGENE Version1.31軟件進行綜合分析,計算有效等位基因數(shù)(Ne)、等位基因數(shù)(Na)、香農(Shannon)指數(shù)(I)、遺傳分化系數(shù)(Gst)、Neis多樣性指數(shù)(He)、基因流(Nm)以及遺傳距離(D)等相關參數(shù)。采用AMOVA軟件分析樣品遺傳變異在群體內與群體間的分布。

      2 結果與分析

      2.1 雄黃連木遺傳多樣性分析

      利用EA16MC8、EA16MC12、EA15MC9、EA13MC5、EA13MC8、EA13MC10、EA13MC12、EA12MC15、EA11MC1、EA11MC14這10對篩選出的AFLP引物組合,對來自6個不同雄黃連木種群的136株樣品進行遺傳多樣性分析。研究結果(表2)表明,10對引物的有效等位基因數(shù)(Ne)變異區(qū)間在1.28(EA13/MC12)~1.70(EA16/MC8),變幅為0.42,平均值為1.56;香農指數(shù)(I)最大的位點是EA16/MC8,為0.58,最小的是EA13/MC12,為0.26,平均值為0.49;而Neis基因多樣性指數(shù)(He)的變化范圍在0.17(EA13/MC12)~0.39(EA16/MC8),AFLP檢測的結果說明雄黃連木種質資源具有中等水平的遺傳多樣性。

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      收稿日期:2018-08-21

      基金項目:國家自然科學基金(編號:31100292);云南省自然科學基金(編號:2010ZC267);云南省省級重點學科園林植物與觀賞園藝建設經(jīng)費(編號:50097401)。

      作者簡介:李琬婷(1993—),女,云南昆明人,碩士,主要從事園林植物應用研究。E-mail:2861283663@qq.com。

      通信作者:程小毛,博士,副教授,主要從事林木遺傳育種研究。E-mail:30375713@qq.com。

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