劉洋 徐宇 張芙蓉 譚燦 楊國玲
大連醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院皮膚科 116011
犬小孢子菌可引起人畜共患的皮膚癬菌病,是我國兒童頭癬的常見病原菌。本課題組前期已通過抑制消減雜交技術(shù)(SSH)成功構(gòu)建犬小孢子菌差異基因文庫[1],篩選出頭皮誘導(dǎo)培養(yǎng)下呈差異表達的4條基因,其中PQ-LRP基因在頭皮誘導(dǎo)培養(yǎng)下較光滑皮膚呈現(xiàn)高表達[2]。我們通過cDNA末端快速擴增(rapid amplification of cDNA ends,RACE)技術(shù)完成PQ-LRP基因全長cDNA序列的擴增和測序[3],利用RNA干擾技術(shù)構(gòu)建犬小孢子菌PQ-LRP干擾株[4],發(fā)現(xiàn)PQ-LRP基因干擾株較野生株生長受限,不易感染宿主,毒力減弱,推測PQ-LRP基因可能是犬小孢子菌致病毒力因子之一[5]。為研究PQ-LRP在犬小孢子菌中的定位,我們將PQ-LRP基因片段連接至增強型綠色熒光蛋白(EGFP)的上游后在犬小孢子菌中表達,并對融合EGFP在細胞中的定位進行初步研究,為后期探討該基因在頭癬發(fā)病機制中的作用提供理論基礎(chǔ)。
犬小孢子菌標準株(ACTT10394)為大連醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院皮膚科真菌室保存菌種,經(jīng)傳統(tǒng)培養(yǎng)及轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)序列PCR擴增后電泳鑒定為犬小孢子菌。TaKaRa PrimeScriptTMRT-PCR試劑盒、TaKaRa Tks Gflex DNA聚合酶、TaKaRa MiniBEST瓊脂糖DNA提取試劑盒均為日本TaKaRa公司產(chǎn)品;根癌農(nóng)桿菌EHA105電轉(zhuǎn)感受態(tài)細胞、Premix TaqTM、大腸桿菌JM109感受態(tài)細胞、Tks Gflex?DNA聚合酶、In-Fusion?HD Cloning試劑盒均為寶生物工程(大連)有限公司產(chǎn)品;潮霉素產(chǎn)自Sigma-Aldrich(中國)公司;Trizol試劑盒為賽默飛世爾(中國)科技有限公司產(chǎn)品;質(zhì)粒pEGFP-N1、pSilent-1、pCAMBIA1300為武漢淼靈科技有限公司產(chǎn)品。
1.犬小孢子菌總RNA提?。簠⒄誘rizol試劑盒說明書提取總RNA,用紫外分光光度計測定A260/A280比值,10 g/L瓊脂糖凝膠電泳鑒定總RNA片段大小。
2.融合基因表達載體的構(gòu)建及根癌農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化:①將自犬小孢子菌中提取的總RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA;②以上述cDNA為模板,引物見表1,PCR擴增PQ-LRP基因,兩端添加酶切位點SacⅠ/BamHⅠ,反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性1 min,98℃變性10 s,60℃退火15 s,68℃延伸60 s,共35個循環(huán);③將pEGFPN1質(zhì)粒用SacⅠ/BamHⅠ雙酶切(37℃2 h),將酶切后純化回收的pEGFP-N1載體與PQ-LRP基因片段連接(50℃15 min)得到pEGFP-LRP載體,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化到大腸桿菌(E.coli)JM109中,提取質(zhì)粒測序驗證;④以pSilent-1質(zhì)粒為模板,PCR擴增真菌通用啟動子(Ptrpc)和真菌通用終止子(Ttrpc)序列,引物見表1;以pEGFP-LRP載體為模板,PCR擴增LRP-EGFP基因序列,擴增引物見表1,反應(yīng)條件:98℃變性10 s,55℃退火15 s,68℃延伸45 s,共30個循環(huán);⑤SacⅠ/HimdⅢ雙酶切pCAMBIA 1300質(zhì)粒(37℃4 h),將酶切后純化回收的pCAMBIA 1300載體與上述④中PCR擴增產(chǎn)物連接(50℃15 min),得到表達載體。將上述重組的表達載體pCAMBIA-LRP-EGFP轉(zhuǎn)化到E.coliJM109中,挑取單菌落,提取質(zhì)粒送至寶生物工程(大連)有限公司進行測序驗證。用電轉(zhuǎn)化方法將表達載體從E.coliJM109供體菌中轉(zhuǎn)入根癌農(nóng)桿菌EHA 105中,對陽性克隆用M13-47、RV-M引物(表1)進行PCR鑒定。
表1 構(gòu)建pCAMBIA-LRP-EGFP表達載體所用引物
3.犬小孢子菌轉(zhuǎn)化及轉(zhuǎn)化子篩選:取1 ml吸光度A600為0.6~0.8的轉(zhuǎn)化后根癌農(nóng)桿菌與1 ml 5×105個/ml的犬小孢子菌分段菌絲混合,將200 μl混合液涂布于添加乙酰丁香酮(AS 200 μmol/L)的誘導(dǎo)平板上,25℃避光培養(yǎng)24、36、48、60、72 h,將共培養(yǎng)的含有根癌農(nóng)桿菌和犬小孢子菌分段菌絲的混合物轉(zhuǎn)移到誘導(dǎo)平板上(含300 mg/L潮霉素、200 μmol/L頭孢噻肟鈉),25℃培養(yǎng)14 d直至菌落出現(xiàn)[4,6]。將犬小孢子菌轉(zhuǎn)化子在無潮霉素的沙氏培養(yǎng)基上傳代5次后,接種至含有潮霉素(300 mg/L)和頭孢噻肟鈉(200 μmol/L)的誘導(dǎo)平板上,檢測轉(zhuǎn)化子的遺傳穩(wěn)定性,提取上述轉(zhuǎn)化子基因組DNA,PCR擴增融合基因LRP-EGFP進行驗證。
4.菌絲處理及LRP-EGFP融合蛋白定位:將帶有融合質(zhì)粒的犬小孢子菌轉(zhuǎn)化子在沙氏培養(yǎng)基上培養(yǎng)14 d后,取菌絲用PBS(pH7.4)沖洗2次,用0.5 mol/L山梨醇溶液處理后置于載玻片上用激光共聚焦顯微鏡觀察并拍照。
1.pEGFP-LRP質(zhì)粒PCR鑒定:用引物L(fēng)RP-EGFP-F、LRP-EGFP-R進行PCR擴增,瓊脂糖凝膠電泳鑒定,可見約1 800 bp的目的片段,證明目的片段連接到pEGFP-N1載體中,得到載體pEGFP-LRP(圖1),經(jīng)測序驗證為目標序列。
2.Ttrpc、Ptrpc的PCR擴增:對Ptrpc與Ttrpc基因片段的擴增產(chǎn)物進行電泳,分別可見約1 300 bp與780 bp左右的片段,與Ptrpc及Ttrpc基因片段相符。見圖1。
3.表達載體pCAMBIA-LRP-EGFP測序驗證:驗證結(jié)果顯示,PQ-LRP與EGFP基因片段蛋白質(zhì)編碼區(qū)(CDS)區(qū)無突變。
將pCAMBIA-LRP-EGFP質(zhì)粒電轉(zhuǎn)化到根癌農(nóng)桿菌EHA105中,PCR鑒定顯示約4 000 pb的片段(圖2),證明載體轉(zhuǎn)入根癌農(nóng)桿菌中。
圖1 LRP-EGFP、Ttrpc、Ptrpc基因片段PCR擴增產(chǎn)物M:標準參照物;1:Ptrpc(1 340 bp);2:LRP-EGFP(1 838 bp);3:Ttrpc(786 bp)圖2轉(zhuǎn)染pCAMBIA-LRP-EGFP質(zhì)粒的根癌農(nóng)桿菌M:DNA標準參照物;1:pCAMBIA-LRP-EGFP質(zhì)粒
圖3 犬小孢子菌轉(zhuǎn)化子DNA電泳圖M:標準參照物;1:犬小孢子菌轉(zhuǎn)化子基因組DNA圖4犬小孢子菌轉(zhuǎn)化子融合基因LRP-EGFP的PCR檢測M:標準參照物;1:轉(zhuǎn)化子LRP-EGFP
瓊脂糖凝膠電泳顯示,犬小孢子菌轉(zhuǎn)化子基因組DNA條帶比較透明清晰,無拖帶現(xiàn)象(圖3),紫外分光光度計檢測顯示,濃度和純度均達到要求,可以滿足后續(xù)PCR檢測。PCR擴增LRP-EGFP后瓊脂糖凝膠電泳鑒定顯示約1 800 bp的目的片段,證明外源基因已整合到犬小孢子菌基因組DNA中,見圖4。
共聚焦顯微鏡下可觀察到極強的綠色熒光信號,LRP-EGFP的熒光信號呈顆粒狀或團塊狀集中于收縮的犬小孢子菌細胞的細胞膜上,見圖5。
目前,已有多種多樣的技術(shù)手段運用于探索蛋白質(zhì)的亞細胞定位,如亞細胞定位預(yù)測、特異性抗體免疫組化定位、融合報告基因定位等,其中融合報告基因定位法因具有簡單有效、準確率高、可以活體樣本實時監(jiān)測的優(yōu)點在分子生物學(xué)研究領(lǐng)域應(yīng)用廣泛,其原理是將目的蛋白基因與標記蛋白基因拼接融合共表達,通過檢測標記蛋白研究目標蛋白,最常見的報告分子為GFP,是一種由239個氨基酸組成的單體蛋白[7],其熒光反應(yīng)不需要任何底物及輔助因子,熒光穩(wěn)定,且其分子量相對較小,與其他蛋白融合后不影響自身的發(fā)光功能。本研究所用EGFP是將GFP的Ser65用Thr替代,Phe64用Leu替代,使熒光強度提高35倍,而且激發(fā)后16~24 h仍可穩(wěn)定地檢測到熒光[8]。我們成功構(gòu)建了pCAMBIA-LRP-EGFP表達載體,利用根癌農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化將融合基因整合到犬小孢子菌基因組DNA,實現(xiàn)了Ptrpc和Ttrpc調(diào)控下LRP-EGFP融合基因在犬小孢子菌中的表達。將轉(zhuǎn)化后犬小孢子菌菌絲用0.5 mol/L山梨醇處理使其脫水,細胞膜與細胞壁分離后發(fā)現(xiàn)LRP-EGFP的熒光信號集中于收縮細胞的細胞膜上,而在細胞壁未見明顯熒光信號,說明PQ-LRP蛋白定位于細胞膜。
PQ-LRP基因全長1 522 bp,含有一個1 080 bp的開放閱讀框(翻譯359個氨基酸)以及5′端非編碼區(qū)(49 bp)和3′端非編碼區(qū)(393 bp)。為使融合EGFP能準確報告PQ-LRP基因在犬小孢子菌中的定位,避免遺漏可能存在的定位信號,且不影響EGFP蛋白折疊,我們利用SacⅠ與BamHⅠ酶切位點將PQ-LRP基因片段連接至EGFP的C端(上游),使PQ-LRP基因片段的插入對EGFP的表達無影響,測序結(jié)果證實PQ-LRP與EGFP閱讀框均無突變。
圖5 激光共聚焦顯微鏡分析LRP-EGFP重組蛋白在犬小孢子菌細胞中的定位
PQ-LRP蛋白是一種雙環(huán)狀結(jié)構(gòu)的膜綁定蛋白,在真菌中普遍存在且與真菌的生長生存有密切聯(lián)系[9]。本研究組前期發(fā)現(xiàn),犬小孢子菌PQ-LRP基因干擾株大分生孢子大小不一,形狀不規(guī)則,孢子壁皺褶破裂,分隔減少或缺如,細胞內(nèi)容物不均勻,出現(xiàn)空泡甚至缺失,推測犬小孢子菌的細胞膜和細胞壁與PQ-LRP基因有密切聯(lián)系,當(dāng)外源性加入半胱氨酸時,野生株P(guān)Q-LRP基因表達水平隨半胱氨酸濃度的增加呈上升趨勢[5],Xiao等[10]上調(diào)PQ-LRP基因表達量后發(fā)現(xiàn)半胱氨酸代謝水平隨之提高,PQ-LRP可能通過影響半胱氨酸的合成代謝影響細胞壁主要成分幾丁質(zhì)的合成,使犬小孢子菌細胞壁結(jié)構(gòu)受到破壞。我們猜測PQ-LRP蛋白不僅參與細胞膜和細胞壁成分的合成代謝,并且是犬小孢子菌細胞膜的重要組成部分。
本實驗中,我們對犬小孢子菌PQ-LRP蛋白的亞細胞定位進行初探,建立了一種適用于犬小孢子菌蛋白的GFP標記方法,無論是對犬小孢子菌其他蛋白質(zhì)亞細胞定位的研究,還是對進一步探索PQLRP蛋白的結(jié)構(gòu)及與其他蛋白質(zhì)的相互作用機制等,均提供了理論依據(jù)。