我繪出人類(lèi)最準(zhǔn)確“RNA修飾”地圖

眭黎曦

記者從位于蘇州的西交利物浦大學(xué)獲悉，由該校生物科學(xué)系孟佳博士帶領(lǐng)的科研團(tuán)隊(duì)，近期實(shí)現(xiàn)了對(duì)全轉(zhuǎn)錄組RNA分子m6A修飾的最精準(zhǔn)預(yù)測(cè)，相當(dāng)于繪制了人類(lèi)迄今為止最精準(zhǔn)的m6A表觀轉(zhuǎn)錄修飾地圖。進(jìn)一步研究或?qū)⒔沂净蛐誀钆c人類(lèi)某些重大疾病的關(guān)聯(lián)作用。相關(guān)研究成果已于近日發(fā)表在生物信息領(lǐng)域知名期刊《核酸研究》（Nucleic?Acids?Research）上。

據(jù)介紹，“RNA修飾”指的是發(fā)生在RNA分子上的生物化學(xué)修飾，可以在不改變RNA分子序列信息的情況下改變其特性，并調(diào)控基因信息的表達(dá)。“目前已知的RNA修飾有100多種，其中m6A修飾是含量最高的一種?！泵霞呀忉尩馈?/p>

“最近，已有研究表明m6ARNA甲基化修飾的酶在白血病、膠質(zhì)母細(xì)胞瘤、非小細(xì)胞肺癌、乳腺癌等疾病中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。”孟佳介紹道。

孟佳指出，在RNA修飾領(lǐng)域，西交利物浦大學(xué)團(tuán)隊(duì)是第一個(gè)應(yīng)用35種組學(xué)信息進(jìn)行預(yù)測(cè)的科研團(tuán)隊(duì)?！斑^(guò)去的研究只考慮序列信息，預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確率是80%，在此基礎(chǔ)上我們加入了35種其他組學(xué)信息，使準(zhǔn)確性提升到90%，這是一個(gè)比較大的突破?！泵霞蜒a(bǔ)充道。

據(jù)研究團(tuán)隊(duì)成員、西浦生物科學(xué)系博士生陳鯤淇介紹，在繪制m6A表觀轉(zhuǎn)錄組地圖的過(guò)程中，該團(tuán)隊(duì)運(yùn)用機(jī)器學(xué)習(xí)的技術(shù)，通過(guò)已有的特征，訓(xùn)練出預(yù)測(cè)模型，該工作為未來(lái)人類(lèi)RNA修飾領(lǐng)域的研究工作提供了更為可靠的參考信息。