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      食品微生物檢驗(yàn)技術(shù)研究進(jìn)展

      2020-01-07 00:05:52高翔崔亞寧
      生物化工 2020年5期
      關(guān)鍵詞:微滴基因芯片噬菌體

      高翔,崔亞寧

      (陜西省食品藥品監(jiān)督檢驗(yàn)研究院,陜西西安 710065)

      隨著社會(huì)各界對(duì)食品衛(wèi)生的高度關(guān)注,研究食品微生物檢驗(yàn)技術(shù)已成為必然趨勢。通過微生物檢驗(yàn)?zāi)軌驗(yàn)槭称返陌踩蕴峁└鼮橛欣目茖W(xué)證據(jù),同時(shí)還能對(duì)食品加工環(huán)境進(jìn)行預(yù)測,并對(duì)食品是否被微生物污染及污染程度進(jìn)行正確評(píng)價(jià)。一直以來,食品微生物檢測都秉承“預(yù)防為主,防治結(jié)合”的原則,在很大程度上避免了人畜共病、食物中毒等食品安全事故發(fā)生。同時(shí),食品微生物檢驗(yàn)還能對(duì)食品生產(chǎn)企業(yè)產(chǎn)生約束力、威懾力,促使企業(yè)能夠重視產(chǎn)品質(zhì)量,極大地保障了食品安全,具有重大意義。

      1 食品微生物檢驗(yàn)技術(shù)現(xiàn)狀

      一直以來,食品微生物檢驗(yàn)采用的是傳統(tǒng)的檢驗(yàn)方法,如增菌培養(yǎng)、分離純化、血清鑒定等,這些方法準(zhǔn)確率較高,但是操作流程煩瑣、檢驗(yàn)周期長,制約了檢測效率的提升。增菌培養(yǎng)、分離純化、生化鑒定等操作所需的培養(yǎng)時(shí)間一般在1 d以上;平板分離的挑菌落操作,則要求操作人員必須具備工作經(jīng)驗(yàn);完成一個(gè)對(duì)象菌的鑒定,通常需要進(jìn)行多次生化實(shí)驗(yàn)[1]。2003年以前,我國所發(fā)布的食品微生物檢驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)幾乎涉及的都是上述傳統(tǒng)的檢驗(yàn)技術(shù)。2008年發(fā)布的檢驗(yàn)國家標(biāo)準(zhǔn)中引入了一些新的檢驗(yàn)技術(shù),而直至最近幾年,才引入PCR檢驗(yàn)方法、基因芯片檢驗(yàn)法等。

      2 食品微生物檢驗(yàn)技術(shù)的新進(jìn)展

      2.1 利用免疫技術(shù)檢測微生物含量

      利用免疫技術(shù)對(duì)食品中微生物的含量進(jìn)行檢測,具有高效、快捷等特點(diǎn),當(dāng)免疫物質(zhì)與所針對(duì)的微生物或病毒接觸時(shí),能夠迅速產(chǎn)生反應(yīng),整個(gè)檢驗(yàn)過程耗時(shí)較短,通常幾分鐘即可完成,最長也只需耗時(shí)幾小時(shí),且免疫反應(yīng)具有較強(qiáng)的針對(duì)性,檢測結(jié)果的可信度也很高。當(dāng)前,在食品微生物檢驗(yàn)中免疫技術(shù)檢測應(yīng)用較廣的是乳膠凝集反應(yīng),即將乳膠中較大的空隙作為抗原抗體發(fā)生特異性結(jié)合的場所,以此來對(duì)食品中的微生物進(jìn)行檢測[2]。乳膠凝集反應(yīng)多用于食品中金黃色葡萄球菌的檢驗(yàn);而酶聯(lián)免疫法則通過免疫反應(yīng)的不同順序來判斷食品中的微生物種類,多用于大腸桿菌0157、李斯特菌、沙門氏菌等危險(xiǎn)微生物的檢測。

      2.2 可視化基因芯片技術(shù)

      基因芯片具有較高的靈敏度,近年來在致病微生物檢驗(yàn)中應(yīng)用非常廣泛。以往常規(guī)的基因芯片雜交反應(yīng)結(jié)束后,無法直接進(jìn)行結(jié)果分析,還需要借助熒光掃描顯微鏡,因此操作比較煩瑣。為有效解決檢驗(yàn)結(jié)果分析的問題,可視化基因芯片技術(shù)隨之產(chǎn)生。Ostroff等[3]學(xué)者通過大量研究證實(shí),在催化作用下,酶將在芯片表面沉淀下來,從而使得芯片的厚度發(fā)生改變,反射到芯片上光的波長隨之改變,實(shí)驗(yàn)結(jié)果只需要根據(jù)基因芯片上的顏色變化進(jìn)行分析即可??梢暬蛐酒夹g(shù)耗時(shí)短、操作便捷、檢測效率較高,能夠一次性對(duì)多種潛在微生物進(jìn)行檢出,但是該技術(shù)應(yīng)用成本較高,對(duì)操作要求較高,因此在食品微生物檢測領(lǐng)域還沒有大范圍推廣。

      2.3 熒光標(biāo)記噬菌體技術(shù)

      熒光標(biāo)記噬菌體技術(shù)的原理是選用相應(yīng)的染色劑對(duì)噬菌體核酸進(jìn)行標(biāo)記,再用標(biāo)記后的噬菌體對(duì)相應(yīng)的宿主菌進(jìn)行特異性侵染,當(dāng)噬菌體在宿主菌的表面吸附后,立刻在宿主細(xì)胞中注入標(biāo)記過的核酸,隨著所標(biāo)記核酸注入量的增加,宿主菌細(xì)胞中的熒光素隨之增多,通過熒光顯微鏡就能判定是否存在宿主菌,以此來完成病原菌的檢測[4]。Mosier-boss等[5]基于前人研究的基礎(chǔ)上,將熒光染料YOYO-1更換為SYBRgold核酸染料,憑借著SYBRgold的高靈敏度特點(diǎn),在不破壞噬菌體結(jié)構(gòu)和性能的情況下,對(duì)沙門氏菌噬菌體P22進(jìn)行標(biāo)記,成功檢出沙門氏菌LT2株,通過進(jìn)行染料對(duì)比,結(jié)果顯示SYBRgold核酸染料的實(shí)驗(yàn)室檢測效果最佳。PheaMH等[6]與FlajshansM等[7]分別在大腸桿菌、沙門氏菌和李斯特菌的檢測中,選用SYBRgreenⅠ和SYBRgreenⅡ染料,均成功檢測出微生物。該方法具有較強(qiáng)的特異性,且靈敏度高,可在食品微生物實(shí)際檢測中應(yīng)用。通常情況下,噬菌體與宿主呈現(xiàn)出一一對(duì)應(yīng)的關(guān)系,但是由于宿主范圍不廣,且兩者之間的作用機(jī)制并不明確,需要進(jìn)一步深入研究,因此該技術(shù)還沒有被廣泛應(yīng)用。但是熒光標(biāo)記噬菌體技術(shù)的檢測周期較短,通常幾個(gè)小時(shí)即可完成,還能夠同時(shí)對(duì)多個(gè)細(xì)菌進(jìn)行檢測,精準(zhǔn)區(qū)分出死活細(xì)菌,在檢測前不需要再進(jìn)行細(xì)菌純化,預(yù)增菌后可以立刻進(jìn)行檢測,因此在食品微生物檢測中具有廣闊的應(yīng)用前景。

      2.4 微滴數(shù)字PCR技術(shù)

      微滴式數(shù)字PCR技術(shù)簡稱ddPCR技術(shù),在擴(kuò)增菌前,通過微滴化技術(shù)對(duì)一個(gè)相對(duì)比較大的反應(yīng)體系進(jìn)行處理,同時(shí)借助油包水技術(shù),將反應(yīng)體系分割成成千上萬個(gè)納升級(jí)微滴,每個(gè)微滴中不含或至少含有一個(gè)待檢測的核酸靶分子,且每個(gè)微滴都形成獨(dú)立的PCR反應(yīng)體系。通過泊松分布原理,根據(jù)陽性微滴的個(gè)數(shù)和比例,可以獲得靶分子的起始拷貝數(shù),從而能夠?qū)ψ畛醴磻?yīng)體系中的核酸靶分子數(shù)量進(jìn)行定量處理[8]。ddPCR技術(shù)在分割含有核酸分子的反應(yīng)體系時(shí),需要在PCR擴(kuò)增前進(jìn)行,通過PCR擴(kuò)增和熒光信號(hào)的積累,對(duì)陽性反應(yīng)的單元數(shù)進(jìn)行讀取,從而將樣本中DNA分子數(shù)目計(jì)算出來[9]。該技術(shù)對(duì)反應(yīng)擴(kuò)增效率的要求并不高,在很多稀有變異檢測中也能夠有效應(yīng)用。與傳統(tǒng)的PCR技術(shù)相比,ddPCR是一種全新的定量核酸分子的方式,其結(jié)果精確度更高、準(zhǔn)確性更強(qiáng)、靈敏度更佳,能夠?qū)崿F(xiàn)絕對(duì)定量。該項(xiàng)技術(shù)在多個(gè)領(lǐng)域已經(jīng)表現(xiàn)出明顯的技術(shù)優(yōu)勢,如微生物檢測、動(dòng)物疫病檢測、地溝油檢測等。而隨著微滴數(shù)字PCR儀的廣泛普及,在今后生命科學(xué)的各個(gè)領(lǐng)域中,ddPCR技術(shù)應(yīng)用將更加廣泛。

      2.5 代謝學(xué)檢測技術(shù)

      代謝學(xué)檢測技術(shù)是微生物檢測領(lǐng)域所產(chǎn)生的新興檢測技術(shù),主要是對(duì)微生物的繁殖過程進(jìn)行檢測,通過培養(yǎng)基可以明確獲取食品中微生物的含量,并開展量化分析。當(dāng)前,常見的代謝學(xué)檢測技術(shù)主要有電阻抗法、放射測量法以及微量生化法等,均能檢測出食品中霉菌和細(xì)菌的總量。此外,通過微量生化檢驗(yàn)技術(shù),借助試劑的顏色就可以對(duì)食品中具體含有細(xì)菌的種類進(jìn)行精準(zhǔn)判斷,不僅提高了微生物檢測的精確度,也推動(dòng)了我國食品安全管理工作的系統(tǒng)化、規(guī)范化發(fā)展。

      3 結(jié)論與展望

      立足分子學(xué)角度,食品微生物檢測技術(shù)的發(fā)展實(shí)現(xiàn)了質(zhì)的飛躍,從以往傳統(tǒng)的培養(yǎng)基培養(yǎng)法,逐漸向PCR技術(shù)、熒光定量PCR技術(shù)發(fā)展,使得食品微生物檢測從定性分析轉(zhuǎn)變?yōu)槎糠治觥6陙?,微滴式?shù)字PCR技術(shù)的產(chǎn)生,是一種絕對(duì)的定量分析檢測技術(shù),在PCR擴(kuò)增前,就有效分割了含有核酸分子的反應(yīng)體系,提高了檢測的靈敏度和精準(zhǔn)性。ddPCR技術(shù)與傳統(tǒng)的PCR技術(shù)相比,定量檢測限更低,且具有較強(qiáng)的特異性和重復(fù)性。此外,通過微滴式數(shù)字PCR技術(shù)能最大限度地對(duì)反應(yīng)體系進(jìn)行分散,從而起到消除抑制因子的作用,使得檢測過程中的擴(kuò)增效得到充分保障,對(duì)于核酸含量比較低的目標(biāo)樣品,也能夠進(jìn)行有效檢測[10]。因此,在今后的食品微生物檢測技術(shù)的研究過程中,可以將ddPCR技術(shù)與EMA-PCR結(jié)合起來進(jìn)行微生物檢測,充分發(fā)揮出絕對(duì)定量檢測的優(yōu)勢,使其在日常微生物檢測中廣泛應(yīng)用。與常規(guī)PCR檢測技術(shù)相比,在進(jìn)行相同數(shù)量的樣品檢測時(shí),采用ddPCR技術(shù)聯(lián)合EMA-PCR技術(shù),能夠在較短時(shí)間內(nèi)完成檢測,且檢測結(jié)果精確度高,能夠真正實(shí)現(xiàn)絕對(duì)定量。

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