穿山甲可能不是新型冠狀病毒的中間宿主

當(dāng)前，新型冠狀病毒肺炎（COVID-19）疫情仍在全球范圍內(nèi)肆虐，新冠肺炎的防控工作依然是重中之重。研究表明新型冠狀病毒與中菊頭蝠攜帶的Bat-CoV-RaTG13 冠狀病毒全基因組核苷酸一致性高達96%，推測該病毒可能起源于蝙蝠，再由中間野生動物宿主進一步傳播，但目前中間宿主仍然未知。

病毒通過在中間宿主內(nèi)加速進化，通常具有與人類病毒更近的親緣關(guān)系，如人SARS 冠狀病毒與自然宿主中華菊頭蝠和中間宿主果子貍病毒全基因組核苷酸一致性分別為95%和99.8%，中東MERS冠狀病毒與自然宿主蝙蝠（Neoromicia capensis）和中間宿主駱駝病毒全基因組核苷酸一致性分別為85.5% 和99.9%。近期，《PLoS Pathogens》以當(dāng)期封面發(fā)表了“Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus（SARS-CoV-2）?”的研究論文。該研究以新型冠狀病毒全基因組序列（MN908947.3）為參考，對穿山甲攜帶的冠狀病毒進行了重新拼接，獲得了全長29 521 bp 的穿山甲冠狀病毒基因組。系統(tǒng)親緣進化關(guān)系分析表明馬來穿山甲攜帶的冠狀病毒為β 冠狀病毒，其與新型冠狀病毒（SARSCoV-2）全基因組序列一致性為90.3%，而蝙蝠冠狀病毒與SARS-CoV-2 全基因組序列一致性為96.2%。這是首次獲得穿山甲攜帶的冠狀病毒的全長基因組序列，并且該冠狀病毒與來源于其它宿主的冠狀病毒具有明顯的遺傳距離，表明穿山甲感染的是不同于SARS-CoV-2 的另一種新的冠狀病毒。

S 蛋白是冠狀病毒與宿主細胞受體結(jié)合的重要區(qū)域，分析發(fā)現(xiàn)穿山甲冠狀病毒受體結(jié)合域（Receptorbinding domain）與SARS-CoV-2 相應(yīng)區(qū)域氨基酸序列的一致性為96.80%，其中重要結(jié)合位點（Receptorbinding motif）僅有一個氨基酸的變異。鑒于新型冠狀病毒對人類有極強的感染能力，而穿山甲冠狀病毒與新型冠狀病毒重要結(jié)合位點的氨基酸序列極為相似，因此該研究推測馬來穿山甲攜帶的冠狀病毒對人也具有潛在的感染性。

無論從冠狀病毒全基因組還是單個功能基因序列的進化分析, 該研究不支持SARS-CoV-2 直接來源于穿山甲或者穿山甲起到中間宿主的作用。但進一步對穿山甲冠狀病毒的監(jiān)測可以提高對穿山甲冠狀病毒譜的認知。除了保護野生動物外，減少人類與野生動物的接觸對于降低野生動物冠狀病毒對人類的溢出風(fēng)險也至關(guān)重要。