曾勇波,馬海明
(1 寧鄉(xiāng)市動物疫病預(yù)防控制中心,湖南 寧鄉(xiāng) 410600;2 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,湖南 長沙 410128)
寧鄉(xiāng)豬原產(chǎn)于湖南省寧鄉(xiāng)縣的流沙河及草沖一帶,原名為流沙河豬或草沖豬。寧鄉(xiāng)豬形成的歷史悠久,其體型特征是“絲頸葫蘆肚,耳薄嘴筒齊,稀毛現(xiàn)薄皮,魚尾后腳直,奶頭一斬齊,四腳要撒蹄”以及“烏云蓋雪銀頸圈”。寧鄉(xiāng)豬體型中等,體質(zhì)疏松細(xì)致,體軀呈圓筒狀,毛色為黑白花,基本色調(diào)是四肢、肋腹及頸下的下部為白色,頭和臀部呈黑色。肌球蛋白6(Myosin 6,Myo6) 屬于肌球蛋白家族,Myo6 基因與肉質(zhì)性狀有密切的關(guān)系。本研究旨在篩選寧鄉(xiāng)豬肉質(zhì)性狀遺傳標(biāo)記,以期為該標(biāo)記應(yīng)用于寧鄉(xiāng)豬的保種選育提供理論依據(jù)。
從196頭寧鄉(xiāng)豬和167頭大白豬(共計(jì)363頭)耳部取小塊組織樣品,以供提取DNA,所采樣品在-20℃下保存。
基因組DNA提取按常規(guī)酚-氯仿進(jìn)行。Myo6基因SNP位點(diǎn)PCR-RFLP-XbaI的PCR擴(kuò)增條件為:95℃2 min(預(yù)變性),95℃30 s(變性),59℃30 s(退火),72℃30 s(延伸),40個循環(huán)。
Myo6基因A/G位點(diǎn)的基因頻率和基因型頻率見圖1。PCR-RFLP-XbaI多態(tài)性的分布情況如表1所示。
由表2可知,這兩個豬種的遺傳純合度都在0.5以上,且比較接近。寧鄉(xiāng)豬的有效等位基因數(shù)低于大白豬的。從多態(tài)信息含量上看,這兩個豬種的多態(tài)信息含量(Polymorphism Information Content,PIC)在0.25~0.5之間,屬于中度多態(tài)。
PCR-RFLP-XbaI多態(tài)性在寧鄉(xiāng)豬和大白豬中G基因均為優(yōu)勢等位基因,其基因頻率分別為0.576 5和0.691 6;經(jīng)適合性卡方檢驗(yàn),可知不符合孟德爾遺傳分離定律,其原因可能與樣本數(shù)有關(guān)。大白豬和寧鄉(xiāng)豬在該基因位點(diǎn)具有遺傳多態(tài)性,并且具有較高的遺傳變異。