曾勇波 馬海明
摘? 要:為探討寧鄉(xiāng)豬肉質(zhì)相關(guān)Myo6基因的遺傳變異情況,本研究以寧鄉(xiāng)豬為研究對(duì)象,并與外來(lái)品種大白豬進(jìn)行比較,用PCR-RFLP方法檢測(cè)了該基因的一個(gè)A→G類型的SNP。結(jié)果表明,PCR-RFLP-Xba I多態(tài)性在寧鄉(xiāng)豬和大白豬中G基因均為優(yōu)勢(shì)等位基因,其基因頻率分別為0.576 5和0.691 6。本研究為寧鄉(xiāng)豬的保種選育積累了有益的資料。
關(guān)鍵詞:豬;Myo6基因;PCR-RFLP
中圖分類號(hào):S813.1 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號(hào):1001-0769(2020)04-0026-02
寧鄉(xiāng)豬原產(chǎn)于湖南省寧鄉(xiāng)縣的流沙河及草沖一帶,原名為流沙河豬或草沖豬。寧鄉(xiāng)豬形成的歷史悠久,其體型特征是“絲頸葫蘆肚,耳薄嘴筒齊,稀毛現(xiàn)薄皮,魚尾后腳直,奶頭一斬齊,四腳要撒蹄”以及“烏云蓋雪銀頸圈”。寧鄉(xiāng)豬體型中等,體質(zhì)疏松細(xì)致,體軀呈圓筒狀,毛色為黑白花,基本色調(diào)是四肢、肋腹及頸下的下部為白色,頭和臀部呈黑色。肌球蛋白6 (Myosin 6,Myo6)屬于肌球蛋白家族,Myo6基因與肉質(zhì)性狀有密切的關(guān)系。本研究旨在篩選寧鄉(xiāng)豬肉質(zhì)性狀遺傳標(biāo)記,以期為該標(biāo)記應(yīng)用于寧鄉(xiāng)豬的保種選育提供理論依據(jù)。
1? 材料與方法
1.1 樣品采集
從196頭寧鄉(xiāng)豬和167頭大白豬(共計(jì)363頭)耳部取小塊組織樣品,以供提取DNA,所采樣品在-20 ℃下保存。
1.2 DNA提取及聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)擴(kuò)增基因組DNA提取按常規(guī)酚-氯仿進(jìn)行。Myo6基因SNP位點(diǎn)PCR-RFLP-Xba I的PCR擴(kuò)增條件為:95 ℃ 2 min(預(yù)變性),? 95 ℃ 30 s(變性),59 ℃30 s(退火),72 ℃ 30 s(延伸),40個(gè)循環(huán)。
2? 結(jié)果與分析
Myo6基因A/G位點(diǎn)的基因頻率和基因型頻率見圖1。PCR-RFLP-Xba I多態(tài)性的分布情況如表1所示。
由表2可知,這兩個(gè)豬種的遺傳純合度都在0.5以上,且比較接近。寧鄉(xiāng)豬的有效等位基因數(shù)低于大白豬的。從多態(tài)信息含量上看,這兩個(gè)豬種的多態(tài)信息含量(Polymorphism Information Content,PIC)在0.25~0.5之間,屬于中度多態(tài)。
3? 討論與結(jié)論
PCR-RFLP-Xba I多態(tài)性在寧鄉(xiāng)豬和大白豬中G基因均為優(yōu)勢(shì)等位基因,其基因頻率分別為0.576 5和0.691 6;經(jīng)適合性卡方檢驗(yàn),可知不符合孟德爾遺傳分離定律,其原因可能與樣本數(shù)有關(guān)。大白豬和寧鄉(xiāng)豬在該基因位點(diǎn)具有遺傳多態(tài)性,并且具有較高的遺傳變異。