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      轉(zhuǎn)錄因子ZmMYB153 與TPL/TPRs 蛋白的互作研究

      2020-07-29 08:24:34曹宏哲劉鵬飛藏金萍董金皋邢繼紅
      關(guān)鍵詞:雙雜交基序酵母

      白 華,曹宏哲,劉鵬飛,周 帆,藏金萍,董金皋,張 康,邢繼紅

      (河北省植物生理與分子病理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/河北農(nóng)業(yè)大學(xué) 真菌毒素與植物分子病理學(xué)實(shí)驗(yàn)室,河北 保定 071000)

      在植物中,MYB 轉(zhuǎn)錄因子超家族數(shù)量龐大且功能多樣,它們在不同組織和不同生理階段特異性表達(dá),是植物發(fā)育、代謝和抗逆反應(yīng)體系中的關(guān)鍵因子[1-2]。R2R3-MYB 型轉(zhuǎn)錄因子是MYB 轉(zhuǎn)錄因子超家族中數(shù)量最多的成員,其包含2 個(gè)保守MYB結(jié)構(gòu)域,在植物初生和次生代謝、細(xì)胞形態(tài)建成、生長發(fā)育、抵抗生物和非生物脅迫中發(fā)揮重要作用[2-4]。R2R3-MYB 型轉(zhuǎn)錄因子中的一些蛋白能夠通過與TPL/TPRs(TOPLESS/TOPLESS-related proteins)蛋白互作,參與植物抗蟲、防御非生物脅迫和種子發(fā)育等多種過程[5]。

      TPL/TPRs 蛋白是一類保守的植物轉(zhuǎn)錄輔抑制因子家族蛋白,包括TPL、TPR1、TPR2、TPR3 和TPR4。在植物中,TPL/TPRs 蛋白家族通過與乙烯反應(yīng)因子相關(guān)的反應(yīng)抑制基序(EAR motif)相互作用,參與調(diào)控植物生長發(fā)育、應(yīng)激反應(yīng)以及信號通路調(diào)節(jié)等一系列生理生化過程[6]。研究發(fā)現(xiàn),TPL/TPR 轉(zhuǎn)錄輔抑制因子蛋白家族在茉莉酸信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路、植物生長激素信號通路和獨(dú)角金內(nèi)酯信號通路中起非常重要的作用[7]。MYB44 轉(zhuǎn)錄因子在R2R3-MYB 型轉(zhuǎn)錄因子中研究最為深入,并含有EAR 基序。研究已明確MYB44 轉(zhuǎn)錄因子通過EAR 基序與TPL/TPRs 蛋白直接互作,從而抑制特定基因的轉(zhuǎn)錄活性,進(jìn)一步調(diào)控植物的發(fā)育、脅迫反應(yīng)和激素信號等[8]。研究發(fā)現(xiàn),MYB44 與TPRs 形成復(fù)合物,并招募組蛋白去乙?;敢孕盘柗且蕾囆苑绞揭种频鞍琢姿崦?C(PP2Cs)基因的轉(zhuǎn)錄,增強(qiáng)植株對干旱和鹽脅迫的耐受性[8-9]。此外,MYB44 參與調(diào)控多種植物抗逆信號通路,包括脫落酸介導(dǎo)的對非生物脅迫的耐受性、通過調(diào)控乙烯信號通路參與抵抗害蟲的作用以及通過水楊酸信號通路增強(qiáng)擬南芥對丁香假單胞菌番茄致病變種(PstDC3000)的抗性[10-11]。Causier 等人通過酵母雙雜交和雙分子熒光互補(bǔ)試驗(yàn),證實(shí)了EAR 基序在MYB44 與TPRs蛋白互作中具有重要作用,EAR 基序突變能阻斷AtMYB44 與TPRs 蛋白之間的互作[12-13]。目前,玉米中R2R3-MYB型轉(zhuǎn)錄因子的相關(guān)研究尚未見報(bào)道。

      本實(shí)驗(yàn)室前期通過對玉米R2R3-MYB 基因家族進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)ZmMYB153 與MYB44 序列一致性最高,為63.54%(NCBI-blastp),且同樣含有EAR 基序。但是,ZmMYB153 與TPL/TPRs 的互作關(guān)系以及EAR 基序在其互作中的功能尚未明確。本研究擬利用酵母雙雜交技術(shù)對ZmMYB153與TPL/TPRs 的互作關(guān)系進(jìn)行分析驗(yàn)證,為闡明ZmMYB153 在玉米生長、發(fā)育和抵抗生物、非生物脅迫中的功能和調(diào)控機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 試驗(yàn)材料

      酵母雙雜交載體PGBKT7(BD)和PGADT7(AD)、酵母菌株AH109、玉米自交系B73 和擬南芥野生型Col-0,由河北省植物生理與分子病理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/河北農(nóng)業(yè)大學(xué)真菌毒素與植物分子病理學(xué)實(shí)驗(yàn)室保存和提供。

      1.2 ZmMYB153、ZmMYB153-mEAR 的酵母雙雜交載體的構(gòu)建

      利用SDS 法,提取玉米自交系B73 的總RNA;利用TaKaRa cDNA 合成試劑盒,進(jìn)行其cDNA 的合成。使用ZmMYB153 和ZmMYB153-mEAR 的特異性上下游引物(表1),以玉米自交系B73 的cDNA 為模板,擴(kuò)增ZmMYB153 和ZmMYB153-mEAR。將ZmMYB153 和ZmMYB153-mEAR 分別與入門載體pBM27 連接,轉(zhuǎn)化Trans 5α,抗性篩選獲得的陽性克隆進(jìn)行菌落PCR 和測序鑒定后,與終載體BD、AD 進(jìn)行LR 重組反應(yīng),經(jīng)PCR 和測序鑒定后獲得BD-ZmMYB153、AD-ZmMYB153、BD-ZmMYB153-mEAR、AD-ZmMYB153-mEAR。

      1.3 TPL/TPRs 的酵母雙雜交載體的構(gòu)建

      利用OMEGA 植物RNA 提取試劑盒,提取擬南芥Col-0 的總RNA;利用TaKaRa cDNA 合成試劑盒,進(jìn)行其cDNA 的合成。使用TPL/TPRs 特異性上下游引物(表1),擴(kuò)增TPL/TPRs 基因序列,并將其分別與入門載體pBM27 連接,進(jìn)行克隆、測序后獲TPL/TPRs 的入門載體TPL-pBM27、TPR1-pBM27、TPR2-pBM27、TPR3-pBM27 和TPR4-pBM27。利用LR 重組試劑盒,將TPL/TPRs 的入門載體分別與終載體BD、AD 進(jìn)行重組反應(yīng),經(jīng)PCR 和測序鑒定后獲得TPL/TPRs 的酵母雙雜交載體。

      表1 試驗(yàn)所用引物Table 1 Primers used in this study

      1.4 ZmMYB153、TPL/TPR 的自激活活性檢測

      將5 μL 預(yù)冷的BD-ZmMYB153、BD-TPL、BD-TPR1、BD-TPR2、BD-TPR3、BD-TPR4 和空載體BD 分別轉(zhuǎn)化酵母感受態(tài)AH-109,涂布于-Trp 培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)48 ~96 h。挑取BDZmMYB153、BD-TPL、BD-TPR1、BD-TPR2、BD-TPR3、BD-TPR4 和BD 的酵母菌落, 接種于5 mL 的-Trp 液體培養(yǎng)基中,30 ℃ 200 r/min 震蕩培養(yǎng)24 h,定量點(diǎn)于-Trp 和-Trp/-His 培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)2 ~3 d。依據(jù)菌落生長情況,判定ZmMYB153、TPL/TPRs 的自激活活性。

      1.5 ZmMYB153 與TPL/TPRs 的酵母雙雜交

      將4 μL AD-ZmMYB153 質(zhì)粒分別與4 μL 的BD-TPL、BD-TPR1、BD-TPR2、BD-TPR3 和BDTPR4 質(zhì)粒組合,以及4 μL BD-ZmMYB153 質(zhì)粒分別與4 μL AD-TPL、AD-TPR1、AD-TPR2、ADTPR3 和AD-TPR4 質(zhì)粒組合,同時(shí)設(shè)對照組合ADZmMYB153+BD、AD+BD-TPL、AD+BD-TPR1、AD+BD-TPR2、AD+BD-TPR3、AD+BD-TPR4、BD-ZmMYB153+AD、BD+AD-TPL、BD+ADTPR1、BD+AD-TPR2、BD+AD-TPR3、BD+ADTPR4 和BD+AD,將各個(gè)組合分別轉(zhuǎn)入酵母細(xì)胞。將酵母細(xì)胞涂布在-Leu/-Trp 固體培養(yǎng)基上,30 ℃培養(yǎng)2 ~3 d 直至長出酵母克隆。挑取雙缺培養(yǎng)基上生長較好的酵母單克隆震蕩培養(yǎng)至OD600為0.2,然后將原菌液稀釋10 倍和100 倍,各吸取5 μL 置于-Leu/-Trp、-Leu/-Trp/-His 和-Leu/-Trp/-His+3-AT培養(yǎng)基上,30 ℃繼續(xù)培養(yǎng)2 ~3 d 觀察酵母生長情況。

      1.6 EAR 突變對ZmMYB153 與TPL/TPRs 互作的影響

      利用同樣的方法,將ZmMYB153-mEAR 與上述發(fā)生互作的TPR2 質(zhì)粒組合,轉(zhuǎn)化酵母感受態(tài)細(xì)胞,同時(shí)設(shè)ZmMYB153 與其互作的TPR2 組合為陽性對照設(shè)置以及相對應(yīng)的陰性對照組合,觀察各組合的酵母菌落在-Leu/-Trp、-Leu/-Trp/-His 和-Leu/-Trp/-His+3-AT 培養(yǎng)基上的生長情況。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 ZmMYB153 和ZmMYB153-mEAR 酵母雙雜交載體的構(gòu)建

      根據(jù)圖1 的設(shè)計(jì), 使用ZmMYB153 及ZmMYB153-mEAR 的特異性上下游引物擴(kuò)增得到ZmMYB153(1 038 bp)和ZmMYB153-mEAR(1 014 bp) 的基因片段,與入門載體pBM27 連接,獲得其入門載體ZmMYB153-pBM27 和ZmMYB153-mEAR-pBM27,并將其分別與目標(biāo)載體PGBKT7 和PGADT7 進(jìn)行重組反應(yīng),菌落PCR 鑒定均獲得了目的條帶(圖1)。經(jīng)測序鑒定后獲得目的載體ADZmMYB153、BD-ZmMYB153、AD-ZmMYB153-mEAR 和BD-ZmMYB153-mEAR。

      圖1 ZmMYB153 和ZmMYB153-mEAR 酵母雙雜交 載體的構(gòu)建Fig.1 Vector construction of ZmMYB153 and ZmMYB153-mEAR

      2.2 TPL/TPRs 酵母雙雜交載體的構(gòu)建

      利用TPL/TPRs 特異性上下游引物擴(kuò)增得到TPL (1 032 bp)、TPR1(1 029 bp)、TPR2(1 005 bp)、 TPR3(1 005 bp)和TPR4(1 032 bp)的基因片段, 與入門載體pBM27 連接,獲得這些基因的入門載體 TPL-pBM27、TPR1-pBM27、TPR2-pBM27、TPR3-pBM27 和TPR4-pBM27。將這些基因的入門載體分別與目標(biāo)載體PGADT7 和PGBKT7 重組,菌落PCR 鑒定均獲得了目的條帶(圖2)。經(jīng)測序鑒定后獲得目的基因的酵母雙雜交載體AD-TPL、BD-TPL、AD-TPR1、BD-TPR1、AD-TPR2、BDTPR2、AD-TPR3、BD-TPR3、AD-TPR4 和BDTPR4。

      圖2 TPL/TPRs 酵母雙雜交載體的構(gòu)建Fig.2 Vector construction of TPL/TPRs

      2.3 ZmMYB153 和TPL/TPRs 的自激活活性檢測

      對ZmMYB153、TPL/TPRs 的自激活活性檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)化了BD-ZmMYB153、BD-TPL、BDTPR1、BD-TPR2、BD-TPR3、BD-TPR4 和 空 載體BD 的酵母均能夠在-Trp 培養(yǎng)基上生長良好,轉(zhuǎn)化了BD-TPR2 和BD-TPR4 的酵母均能夠在-Trp/-His 和-Trp/-His+x-α-gal 的培養(yǎng)基上生長良好,且在-Trp/-His+x-α-gal 的培養(yǎng)基上顯藍(lán)色,說明BDTPR2 和BD-TPR4 有自激活活性(見圖3)。

      圖3 ZmMYB153、TPL/TPRs 的自激活活性檢測Fig.3 Self-activation activity of ZmMYB153 and TPL/TPRs

      2.4 ZmMYB153 與TPL/TPRs 的酵母雙雜交互作鑒定

      利用酵母雙雜交技術(shù),檢測ZmMYB153 與TPL/TPRs 蛋白之間的互作關(guān)系,結(jié)果發(fā)現(xiàn),共同轉(zhuǎn)化AD-ZmMYB153+BD-TPR2、BD-ZmMYB153+ AD-TPR2 組合的酵母菌落在-Lue/-Trp、-Lue/-Trp/ -His 和-Lue/-Trp/-His+3-AT (10 mmol/L) 培養(yǎng)基上均能正常生長;而共同轉(zhuǎn)化AD-ZmMYB153+BD -AtTPR4 組合的酵母菌落能夠在-Leu/-Trp、-Leu/ -Trp/-His 培養(yǎng)基上均能正常生長,不能在-Lue/ -Trp/-His+3-AT (10 mmol/L)培養(yǎng)基上正常生長;其他組合的酵母菌落以及陰性對照組合的酵母菌落只能在-LT 培養(yǎng)基上正常生長,而不能在-Lue/-Trp/-His和-Lue/-Trp/-His+3-AT (10 mmol/L) 培養(yǎng)基上正常生長(圖4)。表明ZmMYB153 與AtTPR2 在酵母細(xì)胞中能夠直接互作。

      圖4 ZmMYB153 與TPL/TPRs 的酵母雙雜交結(jié)果Fig.4 Yeast two-hybrid of ZmMYB153 and TPL/TPR

      2.5 EAR 突變對ZmMYB153 與TPR2 互作的影響

      利用酵母雙雜交技術(shù),檢測EAR 突變對ZmMYB153 與TPR2 互作的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn),與陽性對照相比,試驗(yàn)組合AD-ZmMYB153-mEAR+BDTPR2、BD-ZmMYB153-mEAR+AD-TPR2 的酵母菌落在-Lue/-Trp/-His+3-AT(10 mmol/L)的培養(yǎng)基上均未能生長(見圖5)。表明ZmMYB153-mEAR 與AtTPR2 不互作,同時(shí)說明EAR 基序是ZmMYB153與AtTPR2 蛋白在酵母中互作的關(guān)鍵位點(diǎn)。

      圖5 EAR 突變對ZmMYB153 與TPR2 互作的影響Fig.5 Effect of EAR motif mutation on interaction between ZmMYB153 and TPR2

      3 結(jié)論與討論

      R2R3-MYB 蛋白在植物中起到非常重要的作用,MYB44 屬于R2R3-MYB 蛋白家族的第22 亞家族,現(xiàn)已明確AtMYB44 通過調(diào)節(jié)細(xì)胞分裂素和生長素相關(guān)基因的表達(dá)參與N-3-氧代-己酰-高絲氨酸內(nèi)酯介導(dǎo)擬南芥的初級根生長[14];AtMYB44基因在植株干旱、低溫和高鹽等各種非生物脅迫下被活化表達(dá),從而增強(qiáng)植物的抗逆性[9,15];AtMYB44與ABA 受體PYR1-LIKE8(PYL8)的相互作用還介導(dǎo)葉片衰老過程并對外界的刺激和傷害作出反 應(yīng)[16]。此外,在甘藍(lán)型油菜中發(fā)現(xiàn)BnMYB44 可能有助于甘藍(lán)型油菜抵抗干旱和鹽脅迫,StMYB44通過抑制馬鈴薯中PHOSPHATE1 的表達(dá)來負(fù)調(diào)節(jié)磷酸鹽轉(zhuǎn)運(yùn),促進(jìn)植物吸收無機(jī)磷酸鹽(Pi)以滿足植物各種結(jié)構(gòu)和生理功能對磷的需求[17-18]。

      在擬南芥中,AtMYB44 與TPL/TPRs 蛋白家族中的TPR1 和TPR3 有相互作用的關(guān)系,參與調(diào)控?cái)M南芥種子發(fā)育、抵抗PstDC3000、灰葡萄孢和蚜蟲等生物脅迫過程以及對干旱、低溫和高鹽等非生物脅迫的多種過程,其主要機(jī)制是LSLSL 型乙烯反應(yīng)元件結(jié)合因子相關(guān)的兩親抑制基序(EAR)介導(dǎo)的基因轉(zhuǎn)錄[19]。在擬南芥中證明了EAR 阻遏物通過招募染色質(zhì)重塑因子的模型(通過募集染色質(zhì)修飾劑實(shí)現(xiàn)EAR 介導(dǎo)的抑制模型),促進(jìn)基因表達(dá)的表觀遺傳調(diào)控。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)AtMYB44 與ZmMYB153 同源,但其與TPL/TPRs 之間的互作關(guān)系及其在玉米中的調(diào)控機(jī)制尚未明確。本研究結(jié)果為闡明ZmMYB153 在玉米生長、發(fā)育和抵抗生物、非生物脅迫中的功能和調(diào)控機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

      植物轉(zhuǎn)錄輔抑制因子TPL/TPRs 家族蛋白調(diào)節(jié)多種過程中的基因表達(dá),在水稻中LxLxL 類型EAR基序以疏水鍵為主要作用結(jié)合OsTPR2 的TPD 單體的CTLH 口袋[20-23]。TPL/TPRs 家族蛋白N 末端含有LisH 和CTLH 結(jié)構(gòu)域,而LisH 和CTLH 結(jié)構(gòu)域已被證明能促進(jìn)蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用,它可能在結(jié)合伴侶蛋白中起共同作用[24]。乙?;D(zhuǎn)移酶PopP2 通過假定的EAR 基序,可與對茄形青枯菌(Pseudomonas solanacearum)具有抗性的免疫受體RRS1 DNA 結(jié)合域結(jié)合并對其進(jìn)行乙?;?,導(dǎo)致RRS1-DNA 結(jié)合減少,從而激活植物的免疫 力[25]。此外,EAR 阻遏物的功能可能與磷酸化和泛素化有關(guān)[20]。本研究初步確定了ZmMYB153 與TPL/TPRs 之間的相互作用,推測ZmMYB153 通過自身的LSLSL 型EAR 基序招募TPL/TPRs 家族中一些蛋白的LisH 或CTLH 結(jié)構(gòu)域,形成復(fù)合體,從而抑制相關(guān)基因的表達(dá),進(jìn)一步參與玉米生長發(fā)育以及響應(yīng)生物和非生物脅迫過程。本試驗(yàn)將對ZmMYB153 調(diào)控的靶基因及其調(diào)控機(jī)制進(jìn)行深入研究,為闡明ZmMYB153 在玉米生長、發(fā)育和抵抗生物、非生物脅迫中的功能和調(diào)控機(jī)制奠定基礎(chǔ)。

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