• 
    

    
    

      99热精品在线国产_美女午夜性视频免费_国产精品国产高清国产av_av欧美777_自拍偷自拍亚洲精品老妇_亚洲熟女精品中文字幕_www日本黄色视频网_国产精品野战在线观看 ?

      燕麥 AsSnRK2.7編碼蛋白的分子特征及基因表達特異性研究

      2020-07-31 09:05:54向殿軍滿麗莉王曉東張巍巍李志剛
      麥類作物學(xué)報 2020年11期
      關(guān)鍵詞:蛋白激酶燕麥擬南芥

      向殿軍,滿麗莉,王曉東,張巍巍,劉 鵬,李志剛

      (1.內(nèi)蒙古民族大學(xué)農(nóng)學(xué)院,內(nèi)蒙古通遼 028042;2.內(nèi)蒙古民族大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,內(nèi)蒙古通遼 028042)

      植物蔗糖非發(fā)酵-1相關(guān)蛋白激酶(sucrose non-fermenting-1-related protein kinase,SNRK)家族屬于CDPK-SNRK超家族,與酵母的蔗糖非發(fā)酵蛋白激酶1(SNF1)和哺乳動物的AMP激活的蛋白激酶(AMPK)同源[1]。在酵母和哺乳動物中,SNF1和AMPKs在碳水化合物代謝中扮演重要角色;而在植物中,SnRKs在連接脅迫信號和新陳代謝通路方面發(fā)揮關(guān)鍵作用[2-4]。根據(jù)氨基酸序列和結(jié)構(gòu)域的相似性,植物SnRKs又可分為SnRK1、SnRK2和SnRK3三個亞家族[4]。

      SnRK2蛋白激酶是主要的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)因子,在調(diào)節(jié)真核生物適應(yīng)環(huán)境方面起核心作用。水稻中的SAPK4和小麥中的TaSRK2C1均屬于SnRK2蛋白激酶家族基因。在鹽脅迫下,SAPK4基因的過表達減少了水稻中Na+和Cl-的積累,并使水稻光合作用和生長狀況得到明顯改善[5]。與野生型煙草相比,轉(zhuǎn)TaSRK2C1基因煙草中具有較高水平的游離脯氨酸和可溶性碳水化合物,說明TaSRK2C1的異源表達提高了煙草對高鹽、脫水和低溫脅迫的耐受性[6]。TaSnRK2.8基因的異源過表達可改善擬南芥的主根長、相對含水量、細胞膜穩(wěn)定性、滲透勢和葉綠素含量等生理特性,從而使擬南芥對干旱、鹽和冷脅迫的耐受性得到增強[7]。SnRK2蛋白激酶可通過控制鎘離子引發(fā)的活性氧積累,調(diào)節(jié)植物對重金屬脅迫的耐受性[8]。在干旱脅迫下,脫落酸(ABA)使植物氣孔關(guān)閉,從而減少水分損失,而擬南芥snrk2e(snrk2.6/ost1)突變體則破壞了ABA誘導(dǎo)的氣孔關(guān)閉機制,抑制氣孔開放,表明SnRK2E參與ABA信號傳導(dǎo)[9]。

      SnRK2蛋白激酶主要通過ABA依賴或非ABA依賴途徑在應(yīng)答逆境脅迫的防御機制中起著至關(guān)重要的作用[10]。其中,ABA依賴型的SnRK2蛋白激酶(如擬南芥SnRK2D、SnRK2I和SnRK2E)在ABA信號傳遞中起關(guān)鍵作用[11],其調(diào)控通路模型主要由可溶性ABA受體(PYR/PYL/RCAR)、蛋白磷酸酶2C(PP2C)和SnRK2絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶家族組成[12-14]。在沒有ABA的情況下,PP2Cs發(fā)生去磷酸化作用,鈍化了SnRK2s活性,進而抑制SnRK2s磷酸化調(diào)控的反應(yīng)通路。

      目前,一些植物體內(nèi)的蛋白質(zhì)已被鑒定為SnRK2蛋白激酶的底物[15-17]。此外,在一些異源表達SnRK2基因的植物中,也發(fā)現(xiàn)一些SnRK2蛋白激酶作用的靶標基因[6-7]。如小麥TaSRK2C1蛋白激酶能顯著上調(diào)煙草DREB2、DREB1A和DREB2三個中樞調(diào)節(jié)因子的表達水平[6],而小麥TaSnRK2.8蛋白激酶則能調(diào)控擬南芥中CBF3、CBF2、CBF1、RD29B、RD20A、ABI5、ABI4、ABI3、ABA2和ABA1基因的mRNA水平[7]。

      目前,SnRK2基因家族在小麥[6-7]、波蘭小麥[18]和二穗短柄草[19]等一些燕麥(AvenasativaL.)近源種中已得到研究,但有關(guān)SnRK2基因在燕麥中的功能尚未見報道。因此,本研究以皮燕麥品種美達為材料,借助前人獲得的干旱脅迫下燕麥RNA序列信息,克隆SnRK2蛋白激酶家族基因AsSnRK2.7,利用生物信息學(xué)手段和煙草表皮細胞瞬時表達試驗分別對AsSnRK2.7蛋白的分子特征和亞細胞定位進行分析,同時借助qRT-PCR技術(shù)對AsSnRK2.7基因的非生物脅迫反應(yīng)和組織表達特異性進行研究,以期為揭示AsSnRK2.7基因應(yīng)答逆境脅迫的分子機制及其功能奠定基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 試驗材料

      供試材料為美國皮燕麥品種美達(Monida),購于北京正道生態(tài)科技有限公司,由內(nèi)蒙古民族大學(xué)作物遺傳育種實驗室擴繁并保存。

      1.2 材料處理

      將發(fā)育良好、飽滿的燕麥種子用0.1% HgCl2溶液表面消毒30 min,用無菌水洗滌數(shù)次后,將種子放在鋪有兩層濾紙的培養(yǎng)皿上,置于發(fā)芽箱(23±1 °C,光照12 h,黑暗12 h)中,每日添加10 mL無菌水,至種子發(fā)芽。將發(fā)芽整齊一致的種子分成兩份,一份轉(zhuǎn)移至盛有1/2 Hoagland培養(yǎng)液的水培盤(32.5 cm×26 cm×5.5 cm)中,一份播種到土壤中進行培養(yǎng)。培養(yǎng)條件為相對濕度70%,光照強度400 μmol·m-2·s-1,20 ℃暗培養(yǎng)9 h,25 ℃光照15 h。待水培燕麥幼苗長至三葉一心期時,分別進行ABA、干旱、高鹽和低溫脅迫處理。ABA脅迫處理:用ABA溶液(100 μmol·L-1)噴灑燕麥;干旱脅迫處理:水培液中添加PEG6000(25 mmol·L-1);高鹽脅迫處理:水培液中添加NaCl(300 mmol·L-1);低溫脅迫處理:將水培燕麥幼苗置于低溫(4 ℃)光照培養(yǎng)箱中。水培燕麥在脅迫處理0、1、2、4、8、16、24、48和72 h后,剪取葉片,液氮迅速冷凍后-70 ℃保存,用于脅迫表達模式分析,其中脅迫處理 24 h的葉片用于基因克??;待盆栽燕麥正常生長至苗期、分蘗期、抽穗期、灌漿期和成熟期時,分別收集葉、根、莖和穗組織(抽穗期、灌漿期和成熟期),液氮迅速冷凍后-70 ℃保存,用于組織表達模式分析。

      1.3 燕麥 AsSnRK2.7基因的克隆

      表1 本研究所用的引物

      1.4 燕麥 AsSnRK2.7基因生物信息學(xué)分析

      運用ORF finder(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/orffinder/)預(yù)測基因的開放閱讀框。采用Translate(https://web.expasy.org/translate/)推導(dǎo)目的基因編碼的氨基酸序列。使用BLASTP(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)對編碼蛋白進行同源搜索。利用NCBI中的CD-Search(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/cdd/wrpsb.cgi)預(yù)測編碼蛋白的保守結(jié)構(gòu)域。采用ClustalX軟件進行多序列比對分析,基于輸出的序列比對結(jié)果,利用GeneDoc和MEGA 5.1軟件分別進行多重序列比對圖和系統(tǒng)進化樹的繪制。運用SMART(http://smart.embl-heidelberg.de/)工具預(yù)測蛋白的功能區(qū)和激活位點。利用ProtParam(https://web.expasy.org/protparam/)預(yù)測編碼蛋白的理化性質(zhì);利用TMpred(http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html)預(yù)測編碼蛋白的跨膜結(jié)構(gòu);利用ProtScale(https://web.expasy.org/protscale/)編碼蛋白的疏水性/親水性。用DictyOGlyc 1.1(http://www.cbs.dtu.dk/services/dictyoglyc/)預(yù)測編碼蛋白的O-糖基化修飾位點;利用Motif Scan(https://myhits.isb-sib.ch/cgi-bin/motif_scan)預(yù)測編碼蛋白的生物活性位點;利用NetPhos 3.1(http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos/)預(yù)測編碼蛋白的磷酸化修飾位點。利用PONDR(http://www.pondr.com/)分析編碼蛋白的無序化;利用TargetP 1.1(http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP-1.1/)預(yù)測氨基酸序列導(dǎo)肽;利用STRING(https://string-db.org/cgi/input.pl)預(yù)測編碼蛋白的互作蛋白。利用SOPMA(https://npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa_automat.pl?page=npsa_sopma.html)分析編碼蛋白的二級結(jié)構(gòu),利用Phyre 2(http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index)分析編碼蛋白的三級結(jié)構(gòu),利用PDBsum(http://www.ebi.ac.uk/thornton-srv/databases/pdbsum/Generate.html)檢測模型質(zhì)量。

      1.5 燕麥 AsSnRK2.7基因的亞細胞定位

      1.6 燕麥 AsSnRK2.7基因的表達特性分析

      2 結(jié)果與分析

      2.1 燕麥 AsSnRK2.7全長cDNA的克隆結(jié)果

      以干旱脅迫24 h的燕麥葉片cDNA第一鏈為模板,通過RT-PCR擴增,得到長度約250 bp和1 000 bp的2條cDNA片段(圖1),其中,1 000 bp的條帶與預(yù)期大小一致?;厥臻L度約 1 000 bp的片段,進行T-A克隆后并測序,發(fā)現(xiàn)該片段長度為1 074 bp。ORF預(yù)測結(jié)果表明,該基因包含一個1 074 bp的開放閱讀框,編碼357個氨基酸。BLAST結(jié)果顯示,該基因編碼的氨基酸序列與二倍體長穗偃麥草(Thinopyrumelongatum,QDA34118.1)、粗山羊草(Aegilopstauschii,XP_020174011.1)、波蘭小麥(Triticumpolonicum,ALL27274.1)、二穗短柄草(Brachypodiumdistachyon,NP_001304805.1)、水稻(Oryzasativa,XP_004975639.1)、谷子(Setariaitalica,XP_004975639.1)、高粱(Sorghumbicolor,XP_021318906.1)和擬南芥(Arabidopsisthaliana,NP_195711.1)SnRK2蛋白激酶氨基酸序列的一致性分別為99.75%、96.92%、96.64%、96.36%、91.64%、90.50%、89.97%和 62.01%。利用NCBI CD-Search在線工具對該基因編碼的蛋白進行功能結(jié)構(gòu)域預(yù)測,發(fā)現(xiàn)該蛋白含有一個STKc_SnRK2結(jié)構(gòu)域和一個PKc_like superfamily結(jié)構(gòu)域,屬于SnRK2蛋白激酶家族成員(圖2)。將獲得的cDNA片段命名為AsSnRK2.7,提交至Genbank,獲得登錄號為MN729577。

      1:cDNA擴增產(chǎn)物;M:Marker DL2000。

      圖2 AsSnRK2.7蛋白功能結(jié)構(gòu)域預(yù)測結(jié)果

      2.2 燕麥AsSnRK2.7蛋白多序列比對和系統(tǒng)進化分析

      多序列比對結(jié)果表明,AsSnRK2.7蛋白與玉米(Zeamays,ACG50009.1)、粳稻(OryzasativaJaponica,BAD17998.1)、波蘭小麥(Triticumpolonicum,ALL27272.1)、擬南芥(Arabidopsisthaliana,NP_567945.1)和二穗短柄草(BrachySnRK2家族成員在C端呈現(xiàn)多變特異性,而在N端表現(xiàn)出高度的保守性(圖3)。

      Ⅰ:蛋白激酶ATP結(jié)合信號區(qū);Ⅱ:N-肉豆蔻?;饔梦稽c;Ⅲ:絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶活性位點;Ⅳ:激活環(huán);Ⅴ:跨膜螺旋位點;Ⅵ:響應(yīng)滲透脅迫所需的結(jié)構(gòu)域Ⅰ;Ⅶ:響應(yīng)ABA所需的結(jié)構(gòu)域Ⅱ。

      進化樹分析表明,來自10個物種的22個SnRK2蛋白被分成3個類群(圖4)。其中,AsSnRK2.7蛋白與普通小麥(Triticumaestivum,ACU65228.1)、波蘭小麥(Triticumpolonicum,AHC00229.1)、玉米(Zeamays,ACG50009.1)、水稻(Oryzasativa,BAD18002.1)、擬南芥(Arabidopsisthaliana,NP_176290.1)、煙草(Nicotianatabacum,AAL89456.1)和馬鈴薯(Solanumtuberosum,AFR68941.1)的7個SnRK2成員親緣關(guān)系最近,被聚為Group Ⅰ(SnRK2b)。

      圖4 不同物種SnRK2蛋白的聚類分析

      2.3 AsSnRK2.7蛋白功能區(qū)與生物活性位點的預(yù)測

      O-糖基化修飾位點預(yù)測結(jié)果表明,AsSnRK2.7蛋白中第133和307位的氨基酸殘基可能成為O-糖基化修飾的位點。NetPhos預(yù)測結(jié)果顯示,該蛋白中有12個絲氨酸、9個蘇氨酸和7個絡(luò)氨酸殘基可能成為磷酸化修飾的位點。利用Motif Scan在線工具預(yù)測AsSnRK2.7生物活性位點,結(jié)果表明,該蛋白包含1個酰胺化位點(324~327 aa)、1個cAMP和cGMP依賴性蛋白激酶磷酸化位點(247~250 aa)、5個酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位點(96~99 aa、129~132 aa、172~175 aa、250~253 aa和290~293 aa)、2個N-肉豆蔻?;饔梦稽c(110~115 aa和239~244 aa)、3個蛋白激酶C磷酸化位點(54~56 aa、172~174 aa和250~252 aa)、2個酪氨酸激酶磷酸化位點(94~102 aa和140~146 aa)、1個蛋白激酶ATP結(jié)合信號區(qū)(10~33 aa)、1個絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶活性位點(119~131 aa)、富含谷氨酸的區(qū)域(318~347 aa)、1個蛋白激酶結(jié)構(gòu)域(4~60 aa)和1個酪氨酸蛋白激酶位點(4~85 aa)。

      2.4 燕麥AsSnRK2.7蛋白的理化性質(zhì)、跨膜結(jié)構(gòu)和疏水性/親水性分析

      基于ProtParam工具對AsSnRK2.7蛋白理化性質(zhì)分析,結(jié)果顯示,該蛋白含有20種氨基酸,帶正電氨基酸(Arg+Lys)和負電氨基酸(Asp+Glu)比例分別為13.16%和15.69%,含量較低的2種氨基酸分別為色氨酸(0.8%)和半胱氨酸(2.2%),含量較高的4種氨基酸分別為谷氨酸(10.4%)、亮氨酸(7.0%)、賴氨酸(7.0%)和丙氨酸(6.4%);理論等電點為5.63,分子量為 40 914.63。該蛋白總平均疏水性(GRAVY)、脂肪系數(shù)和不穩(wěn)定性系數(shù)分別為-0.540、75.94和43.08,是一種親水且不穩(wěn)定蛋白(總平均疏水性負值是親水蛋白,正值為疏水蛋白;穩(wěn)定蛋白系數(shù)小于40,不穩(wěn)定蛋白系數(shù)大于40)。

      利用TMPred在線分析軟件對燕麥AsSnRK2.7蛋白進行跨膜結(jié)構(gòu)分析,結(jié)果表明,該蛋白僅存在一個分值大于500的跨膜區(qū)域(180~200 aa),該跨膜區(qū)域既有從內(nèi)到外的跨膜能力(分值991),又有從外到內(nèi)的跨膜能力(分值734),推斷AsSnRK2.7為跨膜蛋白。利用ProtScale在線工具對燕麥AsSnRK2.7蛋白進行疏水性/親水性分析,結(jié)果顯示,該蛋白包括明顯的疏水區(qū)(分值大于0.5)和親水區(qū)(分值小于-0.5),且疏水區(qū)域少于親水區(qū)域。此外,組成AsSnRK2.7蛋白的357個氨基酸中,第339和340位氨基酸親水性最強,分值為-3.300;第191和192位氨基酸疏水性最強,分值為2.189。這些結(jié)果表明,燕麥AsSnRK2.7可能是一種親水蛋白,與ProtParam在線工具預(yù)測結(jié)果一致。

      2.5 AsSnRK2.7蛋白的固有無序化分析以及導(dǎo)肽和互作蛋白的預(yù)測

      利用PONDR在線程序?qū)sSnRK2.7蛋白進行折疊無序化分析,發(fā)現(xiàn)AsSnRK2.7是一個部分無序蛋白。AsSnRK2.7蛋白包含6個無序化區(qū)域,分別位于3~4 aa、23~36 aa、38~47 aa、159~172 aa、291~304 aa和309~356 aa,最長的無序區(qū)域包含48個氨基酸殘基,無序化氨基酸總數(shù)為103個,無序化程度為28.85%。

      利用TargetP 1.1在線工具對AsSnRk2.7蛋白進行導(dǎo)肽預(yù)測,結(jié)果表明,燕麥AsSnRK2.7蛋白的分泌途徑信號肽、線粒體目標肽、葉綠體轉(zhuǎn)運肽和其他位置導(dǎo)肽的預(yù)測分值分別為0.026、0.168、0.036和0.891,預(yù)測可靠性為2級,不存在導(dǎo)肽酶切位點,不具有導(dǎo)肽性。

      利用STRING在線程序預(yù)測顯示,在小麥中發(fā)現(xiàn)10個與AsSnRK2.7同源蛋白(絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶)的互作蛋白(圖5)。其中,包含6個堿性亮氨酸拉鏈(bZIP)轉(zhuǎn)錄因子、3個胱硫醚-β-合成酶和1個環(huán)核苷酸-單磷酸依賴蛋白激酶。

      圖5 小麥中AsSnRK2.7同源蛋白的互作蛋白

      2.6 AsSnRK2.7蛋白的二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu) 分析

      AsSnRK2.7蛋白是一種混合型結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì),其二級結(jié)構(gòu)主要為α-螺旋和無規(guī)則卷曲,分別占38.94%和40.06%,而β-轉(zhuǎn)角和延伸鏈占比較少,分別為5.60%和15.41%。

      由圖6A可以看出,AsSnRK2.7蛋白三級結(jié)構(gòu)主要為無規(guī)則卷曲和α-螺旋,與其二級結(jié)構(gòu)預(yù)測結(jié)果相一致。利用PDBsum,對AsSnRK2.7蛋白三級結(jié)構(gòu)建模結(jié)果可靠性進行檢測,結(jié)果(圖6B)可以看出,AsSnRK2.7模型氨基酸在最佳允許區(qū)(A、B和L區(qū)域)、次允許區(qū)(a、b、l和p區(qū)域)、一般允許區(qū)(-a、-b、-l和-p區(qū)域)和不允許區(qū)的比列分別為64.1%、29.8%、4.8%和 1.3%。在最佳允許區(qū)和次允許區(qū)的氨基酸的比例為93.9%,說明所構(gòu)建的AsSnRK20.7蛋白三級結(jié)構(gòu)模型符合立體化學(xué)的規(guī)則。

      A:AsSnRK2.7蛋白的三級結(jié)構(gòu);B:AsSnRK2.7蛋白模型的拉氏構(gòu)象。

      2.7 AsSnRK2.7蛋白質(zhì)亞細胞定位分析

      從圖7可以看出,在pCAMBIA2300-CaMV35S-GFP轉(zhuǎn)化的煙草表皮細胞中,綠色熒光信號分布在細胞質(zhì)、細胞核和細胞膜等區(qū)域。而35S-AsSnRK2.7-GFP轉(zhuǎn)化的煙草表皮細胞中,綠色熒光信號主要分布在細胞核。將GFP、CHI、DAPI以及DIC通道融合后,35S-AsSnRK2.7-GFP融合蛋白所表達的綠色熒光與藍色的DAPI相重合,表明AsSnRK2.7蛋白在煙草表皮細胞中定位于細胞核。

      GFP:綠色熒光;CHL:葉綠體自發(fā)熒光;DAPI:細胞核特異標記;DIC:微分干涉對比;Merge:疊加場。35S-GFP為空載體,35S-AsSnRK2.7-GFP為包含AsSnRK2.7的融合蛋白載體。標尺=25 μm。

      2.8 AsSnRK2.7基因的qPCR表達分析

      實時定量PCR結(jié)果(表2)顯示,AsSnRK2.7基因在燕麥被檢測組織中為組成型表達。在根組織中,AsSnRK2.7基因在苗期表達量最高,灌漿期次之,成熟期最低。在葉片組織中,AsSnRK2.7基因在分蘗期的表達量最高,分別是苗期、抽穗期、灌漿期和成熟期的5.57、2.61、2.33和20.19倍。在莖和穗組織中,AsSnRK2.7基因表達量分別在抽穗期和灌漿期最高,在成熟期最低。

      表2 不同組織中 AsSnRK2.7基因的相對表達量

      從表3可以看出,ABA不能激活A(yù)sSnRK2.7基因的表達,但其表達積極響應(yīng)PEG、鹽和低溫(4 ℃)的脅迫。在PEG脅迫下,AsSnRK2.7基因出現(xiàn)了雙峰表達模式,峰值分別出現(xiàn)在2 h和16 h,且在2 h表達量最高。在鹽脅迫下,AsSnRK2.7基因的表達量隨處理時間的延長呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢,在4 h達到最高。在低溫脅迫下,AsSnRK2.7基因的表達量在0~4 h持續(xù)上調(diào),在16 h達到最高。

      表3 不同脅迫下 AsSnRK2.7基因的轉(zhuǎn)錄水平

      3 討 論

      SnRK2蛋白激酶基因?qū)儆诙嗷蚣易?,在水稻[22]、玉米[23]和擬南芥基因組中分別存在10、11和10個AsSnRK2基因[24]。本研究依據(jù)干旱脅迫下燕麥轉(zhuǎn)錄組中的序列信息,利用RT-PCR技術(shù),首次從燕麥中分離出一個SnRK2蛋白激酶基因AsSnRK2.7。AsSnRK2.7基因cDNA長度為1 074 bp,與波蘭小麥[18]和二穗短柄草[19]SnRK2.7基因的開放閱讀框序列長度完全一致。生物信息學(xué)分析表明,AsSnRK2.7蛋白含有SnRK2蛋白激酶家族特有的功能域,包括蛋白激酶ATP結(jié)合信號區(qū)、N-肉豆蔻?;饔梦稽c、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶活性位點、激活環(huán)、跨膜螺旋位點和響應(yīng)滲透脅迫所需的結(jié)構(gòu)域Ⅰ等重要功能區(qū),表明不同植物中SnRK2蛋白激酶成員結(jié)構(gòu)十分保守,這與前人在小麥[6-7]、波蘭小麥[18]和二穗短柄草[19]中的研究結(jié)果一致。

      N-肉豆蔻?;饔梦稽c和跨膜區(qū)是蛋白質(zhì)在植物應(yīng)答環(huán)境脅迫反應(yīng)中調(diào)節(jié)膜靶向和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的關(guān)鍵區(qū)域[25-26]。TaSnRK2.4、TaSnRK2.7和TaSnRK2.8蛋白均定位在細胞膜、細胞質(zhì)和細胞核中,且過表達這3個基因均能增強擬南芥對干旱、鹽和冷脅迫的耐受性[7,27-28]。TaSnRK2.4、TaSnRK2.7和 TaSnRK2.8蛋白中均存在一個潛在的N-肉豆蔻酰化作用位點和一個潛在的跨膜區(qū),表明SnRk2s可能與細胞膜或核受體結(jié)合而相互作用[7,27-28]。本研究發(fā)現(xiàn),AsSnRK2.7蛋白中也存在一個潛在的N-肉豆蔻?;饔梦稽c和一個潛在的跨膜區(qū),但僅定位在細胞核中。

      盡管在5個發(fā)育階段的根、葉、莖和穗(抽穗期、灌漿期和成熟期)組織中均能檢測到AsSnRK2.7基因的表達,但在不同發(fā)育階段的不同組織中,AsSnRK2.7基因的相對表達量不同,這與小麥中SnRK2成員研究的報道一致。如小麥TaSnRK2.7基因的表達量在苗期的根組織中較高,而在苗期的葉片、孕穗期的穗和抽穗期的劍葉組織中較低[28]。TaSnRK2.4基因在孕穗期的穗中表達量較高,在苗期的根和抽穗期的劍葉中次之,而在苗期的葉片中最低[27]。這些結(jié)果表明,SnRK2基因存在著明顯的空間和時間上的表達差異,在正常生長條件下調(diào)節(jié)不同生理代謝過程。

      根據(jù)C末端富集的酸性氨基酸的類型,SnRK2蛋白激酶可分為兩個亞組:富含天冬氨酸的SnRK2a(為ABA依賴型SnRK2s)和富含谷氨酸的SnRK2b(為非ABA依賴型SnRK2s)[2,29]。根據(jù)序列相似性、功能域結(jié)構(gòu)和細胞功能,植物SnRK2亞家族可分為三個亞組:Group Ⅰ、Group Ⅱ和Group Ⅲ,其中,Group Ⅱ和Group Ⅲ兩個亞組屬于SnRK2a,而Group Ⅰ屬于SnRK2b[1]。Group III中的SnRK2成員對ABA具有強烈的響應(yīng),Group II成員不受或微弱受ABA激活,Group I成員不被ABA脅迫誘導(dǎo),而Group Ⅰ、Group Ⅱ和Group Ⅲ成員均受滲透脅迫的激活[22,24]。本研究發(fā)現(xiàn),AsSnRK2.7屬于Group I(SnRK2b)中成員,對外源ABA的誘導(dǎo)不敏感,說明AsSnRK2.7蛋白激酶可能是一個非ABA依賴型SnRK2成員,這與Group I成員不被ABA脅迫誘導(dǎo)的研究結(jié)果一致。然而,在玉米中ZmSnRK2.4、ZmSnRK2.5、ZmSnRK2.7和小麥中的TaSnRK2.4也屬于Group I成員,但卻能被ABA脅迫誘導(dǎo)[23,27]。此外,在本研究中,AsSnRK2.7基因能夠積極應(yīng)答低溫、鹽和PEG脅迫,表明AsSnRK2.7基因同其他SnRK2成員一樣在植物信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和脅迫耐受性中起關(guān)鍵作用。然而,前人研究表明,ZmSnRK2.7基因不含低溫應(yīng)答元件(LTRE),但仍可被冷脅迫所誘導(dǎo)[23]。所以,非ABA依賴型SnRK2基因結(jié)構(gòu)與其受逆境脅迫應(yīng)答的關(guān)系還需進一步深入研究。

      已有研究表明,SnRK2蛋白激酶N端激活環(huán)上絲氨酸殘基的可逆磷酸化可調(diào)控SnRK2活性[31-33]。目前對于非ABA依賴型SnRK2的可逆磷酸化報道較少,但有關(guān)ABA依賴型SnRK2的可逆磷酸化的研究較多。SnRK2蛋白激酶在響應(yīng)滲透脅迫與ABA過程中自身磷酸化機制不同,滲透脅迫誘導(dǎo)的磷酸化水平普遍高于ABA誘導(dǎo)的磷酸化水平,另外在滲透脅迫下不同的SnRK2蛋白激酶的磷酸化水平也不同[31]。煙草中的NtOSAK和擬南芥中的SnRK2.10均屬于GroupI,為響應(yīng)滲透脅迫的非ABA依賴型SnRK2成員,這2個蛋白激酶激活環(huán)中均存在2個蛋白磷酸化位點,且這2個位點的可逆磷酸化均可調(diào)節(jié)激酶活性,并存在順序性,其中一個絲氨酸的磷酸化是另一個絲氨酸磷酸化所必需的[29-30]。然而,Group III中擬南芥ABA依賴型激酶則是通過2個位點單獨磷酸化來調(diào)控激酶活性[30]。本研究基于NetPhos在線分析,發(fā)現(xiàn)AsSnRK2.7蛋白質(zhì)的激活環(huán)(ICDFGYSKSSLLHSKPKSTVGTPAYIAPE)上存在2個可逆的蛋白質(zhì)磷酸化殘基(帶下劃線的氨基酸殘基),分別位于Ser-154和Ser-158,但其激活環(huán)上的2個磷酸化位點磷酸化是否對AsSnRK2.7蛋白激酶活性調(diào)控具有協(xié)同作用,還需進一步的研究。

      SnRK2蛋白激酶可通過磷酸化作用來影響下游底物的活性。SnRK2蛋白激酶如SnRK2.2/SRK2D、SnRK2.6/SRK2E和SnRK2.3/SRK2I可以在體外磷酸化擬南芥AREB1蛋白[11]。目前,植物中僅有少數(shù)蛋白被被證實為SnRK2蛋白激酶的底物,包括轉(zhuǎn)錄bZIP型轉(zhuǎn)錄因子ABF/AREB和AP2/ERF-型轉(zhuǎn)錄因子DREB[15,17]。此外,Wang等[16]通過定量磷酸化蛋白組學(xué)鑒定了一些SnRK2s底物,這些SnRK2s底物包括參與開花時間調(diào)控、RNA和DNA結(jié)合、miRNA和表觀遺傳調(diào)控、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)(ABF2、AREB3、TAF5、EEL和FBH3等)、葉綠體功能及許多其他細胞過程的蛋白質(zhì)。本研究使用STRING在線程序在小麥中找到與AsSnRK2.7同源蛋白可能存在互作關(guān)系的蛋白,包括bZIP轉(zhuǎn)錄因子、胱硫醚-β-合成酶和環(huán)核苷酸-單磷酸依賴蛋白激酶。這些蛋白對植物抗逆性有重要影響,因此,這些蛋白的發(fā)現(xiàn)將為利用燕麥AsSnRK2.7基因來改善植物的抗逆性提供理論基礎(chǔ)。

      猜你喜歡
      蛋白激酶燕麥擬南芥
      擬南芥:活得粗糙,才讓我有了上太空的資格
      可嚼燕麥,營養(yǎng)打折
      中老年保健(2022年5期)2022-11-25 14:16:14
      燕麥的栽培技術(shù)
      晉??笛帑?守護您的健康
      解析參與植物脅迫應(yīng)答的蛋白激酶—底物網(wǎng)絡(luò)
      科學(xué)(2020年2期)2020-08-24 07:57:00
      尿黑酸對擬南芥酪氨酸降解缺陷突變體sscd1的影響
      行了,我像所有的他們一樣
      延河(2017年7期)2017-07-19 21:01:10
      兩種LED光源作為擬南芥生長光源的應(yīng)用探究
      擬南芥干旱敏感突變體篩選及其干旱脅迫響應(yīng)機制探究
      蛋白激酶Pkmyt1對小鼠1-細胞期受精卵發(fā)育的抑制作用
      高州市| 织金县| 敦化市| 穆棱市| 扶风县| 乌兰察布市| 广汉市| 当阳市| 陇川县| 九江市| 陈巴尔虎旗| 罗定市| 贞丰县| 西畴县| 九龙坡区| 固安县| 故城县| 新疆| 桂林市| 阿拉善右旗| 阜南县| 长海县| 芮城县| 巫溪县| 五大连池市| 河北区| 隆安县| 东丰县| 射洪县| 会昌县| 会东县| 东台市| 巴东县| 盘山县| 祁东县| 铁力市| 永定县| 张家川| 合山市| 饶河县| 黄平县|