趙雅芝,潘 巧,王顯兵,郝文君,劉 桐,王秀梅*,辛九慶*
(1. 吉林農(nóng)業(yè)大學 動物科學技術學院,吉林 長春 130118;2. 中國農(nóng)業(yè)科學院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術國家重點實驗室/動物支原體病創(chuàng)新團隊,黑龍江 哈爾濱 150069)
牛支原體(Mycoplasma bovis,M. bovis)是現(xiàn)有的最小的原核微生物,無細胞壁,可以通過0.22 μm濾器[1],是一種宿主特異性粘膜常在菌,感染能夠引起犢牛的肺炎、關節(jié)炎及奶牛乳房炎等疾病[2],且常常與其它病原體混合感染導致病情復雜持久不愈,是危害我國養(yǎng)牛業(yè)健康發(fā)展的重要因素之一。支原體表面有豐富的脂質(zhì)相關膜蛋白(Lipid-associated mem?brane proteins,LAMPs),其能夠介導支原體黏附感染宿主,調(diào)節(jié)宿主的免疫系統(tǒng)[3],其通過與TLRs 相互作用在炎癥反應的起始中起重要作用[4]。本研究從前期獲得的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)中[5],分析了M.bovis LAMPs 刺激前后EBL 細胞差異表達的基因,發(fā)現(xiàn)M. bovis LAMPs 刺激后EBL 細胞上調(diào)表達TRIM9 基因。TRIM9 基因?qū)儆谌Y構域蛋白(Tripartitemotif,TRIM)家族,該家族蛋白存在于所有多細胞動物體內(nèi),目前包含70 多個成員。越來越多的證據(jù)表明,許多TRIM 家族蛋白與抗感染免疫相關[6]。最近有文獻報道TRIM9 與NF-κB 信號通路的調(diào)控相關[7-8]。而以前的文獻報道表明M.bovis LAMPs 能夠通過NF-κB信號通路誘導EBL 細胞釋放IL-1β[9]。為探究TRIM9基因在M.bovis LAMPs 刺激EBL 細胞釋放IL-1β中的作用,本研究構建TRIM9 基因過表達和敲低的EBL細胞模型,采用qPCR,ELISA 和western blot 等試驗方法,解析了TRIM9 基因在M.bovis LAMPs 誘導EBL細胞釋放IL-1β中積極調(diào)控的作用,為宿主基因調(diào)控M.bovis LAMPs 誘導的天然免疫應答機制提供理論依據(jù),同時也為后期疫苗研發(fā)奠定基礎。
1.1 主要實驗材料M.bovis 牛2c 株、EBL 細胞、M.bovis LAMPs、NP-40、pEGFP-C1 質(zhì)粒均由本實驗室保存;pCMV-C-HA 質(zhì)粒購自碧云天公司。BCA 蛋白濃度測定試劑盒購自碧云天公司;限制性內(nèi)切酶BamH I 與Sal I 購 自NEB 公 司;Prime STAR Max Pre?mix(2×)購自TaKaRa 公司;DMEM/HIGH GLUCOSE購自HyClone;Plasmid Mini Kit I、Gel Extraction Kit購自OMEGA 公司;Simply P 總RNA 提取試劑盒購自博日公司;Transcriptor First Strand cDNA Synthesis Kit、FastStart Universal SYBR?Green Master(ROX)購自Roche 公 司;TransIT-X2?System 購 自Mirus 公 司;Bovine Interleukin 1 Beta ELISE Kit 購自MYBioSource公司。
1.2 引物設計和合成參考GenBank 中GAPDH(AC_000162),IL-1β(NM_174093)和 牛 源TRIM9(NM_001076537)基因mRNA 序列,采用Primer Pre?mier 5.0 軟件和CE DesignV1.03 軟件設計qPCR 及PCR引物,TRIM9 基因序列特異性引物兩端分別加入BamH I 和Sal I 酶切位點,引物信息見表1,以上引物均由華大基因科技有限公司合成。委托SIGMA 公司設計合成TRIM9 基因干擾引物si-TRIM9。
1.3 TRIM9 和IL-1β基因表達的檢測將生長至對數(shù)期的EBL 細胞以1×109個/cm2的密度接種于12 孔細胞培養(yǎng)板,待細胞長至80%~90%時,依據(jù)實驗室前期摸索M. bovis LAMPs 刺激EBL 細胞的最佳條件[9],加入終濃度2 μg/mL 的M.bovis LAMPs,設置空白對照,5%CO237 ℃誘導培養(yǎng)12 h 后收集細胞,利用Simply P總RNA提取試劑盒提取RNA,經(jīng)Transcrip?tor First Strand cDNA Synthesis Kit 將RNA 反轉(zhuǎn)錄為cD?NA,并以cDNA 為模板采用1L-1β-F/R 和TRIM9-RTF/R引物,利用qPCR方法分別檢測M.bovis LAMPs刺激后EBL 細胞中TRIM9 和IL-1β的相對表達量,實驗設GAPDH(AC_000162)為內(nèi)參基因,qPCR 反應條件:95 ℃10 min;95 ℃15 s、60 ℃1 min,40個循環(huán);95 ℃15 s;60 ℃1 min;95 ℃1 s。
表1 引物序列Table 1 Primers sequence
1.4 TRIM9 亞細胞定位檢測以1.3 中方法制備EBL 細胞基因組cDNA 作為為模板,采用TRIM9-GFP-F/R 引物,利用PCR 方法擴增TRIM9(擴增條件為:95 ℃5 min;95 ℃30 s、61 ℃30 s、72 ℃30 s,40 個循環(huán);72 ℃10 min),并回收目的片段,連接于BamH I 與Sal I 雙酶切處理純化的pEGFP-C1 載體,構建綠色熒光融合質(zhì)粒pEGFP-C1-TRIM9,雙酶切和測序鑒定陽性質(zhì)粒(終濃度2 μg/mL)轉(zhuǎn)染EBL細胞,對照組轉(zhuǎn)染pEGFP-C1 質(zhì)粒,每組設置3 個樣品,重復3 次實驗,24 h 后用1 mL PBS 洗3 次,10 min/次,然后加入1 mL 的4%多聚甲醛,室溫固定15 min,PBS 洗3 次,加入0.5%Triton-X-100 室溫穿 孔15 min,PBS 洗3 次,加入DAPI 染色15 min,利用高分辨率活細胞共聚焦顯微鏡觀察TRIM9 在EBL 細胞中的定位。
1.5 過表達質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9 轉(zhuǎn)染EBL 細胞的最佳劑量確定按照1.4 中方法采用TRIM9-CHA-F/R引物,構建過表達質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9,將不同濃度的過表達質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9(1 μg/mL、2 μg/mL、3 μg/mL、4 μg/mL、6 μg/mL 和8 μg/mL)分別轉(zhuǎn)染EBL 細胞,以pCMV-C-HA 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染EBL 細胞作為對照,36 h 后利用ELISA 檢測試劑盒檢測培養(yǎng)基中IL-1β的釋放量。同時收集細胞,按1.3中方法提取基因組制備cDNA,并以cDNA為模板,以1L-1β-F/R 為引物,GAPDH(AC000162)為內(nèi)參基因,按照1.3 中qPCR 方法檢測EBL 細胞中IL-1β相對表達量,重復3次實驗,以引起IL-1β最高表達量且對EBL細胞影響輕微的轉(zhuǎn)染劑量作為最佳劑量。
1.6 過表達及敲低TRIM9 對M. bovis LAMPs 刺激EBL 細胞釋放IL-1β的影響將最佳劑量過表達質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9 和si-TRIM9 分別轉(zhuǎn)染EBL 細胞,同時分別轉(zhuǎn)染pCMV-C-HA 和對照siRNA 作為對照組,在5%CO237 ℃培養(yǎng)24 h后加入終濃度2 μg/mL的牛支原體LAMPs 繼續(xù)培養(yǎng)12 h,重復3 次實驗,利用qPCR 檢測IL-1β相對表達量,同時利用Bovine Interleukin 1 Beta ELISE Kit 檢測EBL 細胞IL-1β的釋放量。
1.7 NF-κB 信號通路激活水平檢測NF-κB 由p50 亞基和p65 亞基組成,p65 亞基進核和磷酸化是激活NF-κB 信號通路的標志。為分析TRIM9 在NF-κB 信號通路中的作用。本試驗檢測了TRIM9 過表達及敲低時LAMPs 刺激EBL 細胞后的p65 磷酸化水平。以1.5 中確定的pCMV-C-HA-TRIM9 最佳濃度和si-TRIM9 分別轉(zhuǎn)染EBL 細胞,5% CO237 ℃培養(yǎng)24 h 后加入終濃度2 μg/mL 的牛支原體LAMPs 繼續(xù)培養(yǎng)12 h,同時設只加入轉(zhuǎn)染試劑組和LAMPs刺激組為對照組。NP-40 裂解細胞獲取總蛋白,以抗p-p65(1:1 000)抗體為一抗,以山羊抗兔IgG(1:10 000)熒光抗體為二抗,進行western blot 檢測,利用Odys?sey?紅外掃描儀掃描NC 膜,使用Image studio 軟件對結果進行灰度值分析,檢測p65 磷酸化水平,本實驗重復3 次。
2.1 M. bovis LAMPs 刺激對EBL 細胞中TRIM9 和IL-1β基因轉(zhuǎn)錄水平的影響M. bovis LAMPs 刺激EBL 細胞后,采用qPCR 方法對TRIM9 和IL-1β基因的mRNA 表達量進行檢測,結果顯示與對照組相比TRIM9 mRNA 表達量上調(diào)2.9 倍(圖1A),與本實驗室前期獲得的轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)[5]分析相符;IL-1β mRNA表達量也上調(diào)2.6 倍(圖1B)。表明TRIM9 基因可能與M.bovis LAMPs刺激EBL 細胞釋放IL-1β相關。
圖1 qPCR 檢測LAMPS 刺激后EBL 細胞TRIM9(A)和IL-1β(B)的相對表達量Fig.1 The relative expression of TRIM9 and IL-1β in EBL cells stimulated by M.bovis LAMPs was detected by qPCR
2.2 TRIM9 蛋白在EBL 細胞中的定位檢測結果以EBL 細胞基因組cDNA 為模板,PCR 擴增TRIM9基因,構建綠色熒光融合質(zhì)粒pEGFP-C1-TRIM9,酶切鑒定結果顯示得到約2 100 bp 大小的目的片段,大小與預期相符(圖2);測序結果與NCBI 參考序列(NM_001076537)的同源性100%。表明正確構建了綠色熒光融合質(zhì)粒pEGFP-C1-TRIM9。
圖2 pEGFP-C1-TRIM9 重組質(zhì)粒雙酶切鑒定Fig.2 Double enzyme digestion of recombinant plasmid pEGFP-C1-TRIM9
將綠色熒光融合質(zhì)粒pEGFP-C1-TRIM9 轉(zhuǎn)染EBL細胞,利用高分辨率活細胞共聚焦顯微鏡LSM800-ZEISS 觀察可見,對照組細胞中無明顯綠色熒光,而轉(zhuǎn)染pEGFP-C1-TRIM9質(zhì)粒的EBL細胞胞漿中呈現(xiàn)綠色熒光,細胞核僅藍色熒光,重復實驗結果一致,表明TRIM9蛋白能夠瞬時表達于EBL細胞的胞漿中。
圖3 高分辨率活細胞共聚焦顯微鏡TRIM9 亞細胞定位Fig.3 The subcellular observation of TRIM9 by LSM800
2.3 過表達質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9 轉(zhuǎn)染EBL 細胞的最佳劑量將鑒定陽性的過表達質(zhì)粒pC?MV-C-HA-TRIM9(圖略)以不同濃度梯度轉(zhuǎn)染EBL細胞,利用qPCR 和ELISA 法分別檢測IL-1β的表達量,結果顯示,轉(zhuǎn)染過表達質(zhì)粒pCMV-C-HATRIM9 后EBL 細胞中IL-1β表達量高于對照組,且兩者呈劑量依賴性,當轉(zhuǎn)染的pCMV-C-HA-TRIM9質(zhì)粒終濃度為4 μg/mL 時IL-1β表達量最高,由此確定重組質(zhì)粒的最佳轉(zhuǎn)染劑量為4 μg/mL(圖4)。
圖4 qPCR(A)和ELISA(B)方法檢測過表達TRIM9 基因后EBL 細胞IL-1β的相對表達量Fig.4 The relative expression of IL-1β in EBL cells after overexpression of TRIM9 gene was detected by qPCR(A)and ELISA(B)
2.4 敲低以及過表達TRIM9 后EBL 細胞中IL-1β檢測結果為確定TRIM9 對IL-1β表達的影響,分別將si-TRIM9 和過表達質(zhì)粒pCMV-C-HA-TRIM9 轉(zhuǎn)染EBL 細胞,經(jīng)M.bovis LAMPs 刺激,利用qPCR 和ELISA 檢測敲低和過表達TRIM9 時IL-1β的表達量,結果顯示,與對照組相比,轉(zhuǎn)染si-TRIM9后TRIM9顯著下調(diào)表達(p<0.001),而轉(zhuǎn)染過表達質(zhì)粒pCMV-CHA-TRIM9 后TRIM9 顯著上調(diào)表達(p<0.001)(圖5A),表明已將TRIM9 基因在EBL 細胞中敲低及過表達。qPCR 檢測結果顯示,與對照組相比,LAMPs 刺激后正常細胞中IL-1β上調(diào)2.4 倍,敲低TRIM9 后,細胞中IL-1β上調(diào)33 倍,而過表達組中IL-1β上調(diào)2.3 倍(圖5B);ELISA 檢測結果顯示LAMPs 刺激后正常細胞中IL-1β上調(diào)2.9 倍,敲低組EBL 細胞IL-1β釋放量上調(diào)30倍,而過表達組EBL細胞IL-1β釋放量上調(diào)2.9倍(圖5C),與qPCR 結果趨勢一致。以上結果表明過表達TRIM9 基因?qū)L-1β表達無影響,而敲低TRIM9基因可促進IL-1β表達。
圖5 敲低及過表達TRIM9 基因后EBL 細胞TRIM9(A)和IL-1β(B,C)的相對表達量Fig.5 The relative expression of TRIM9 and IL-1β in EBL cells after knockdown and over-expression of TRIM9 gene
2.5 NF-κB 信號通路檢測結果分別檢測了敲低和過表達TRIM9 基因后EBL 細胞中p65 磷酸化水平。結果顯示,與對照組相比,敲低TRIM9 后EBL細胞中p65 磷酸化水平顯著升高(p<0.01),而過表達TRIM9 蛋白后EBL 細胞中p65 磷酸化水平無明顯變化(圖6)。表明過表達TRIM9 后牛支原體LAMPs不誘導NF-κB 信號通路激活;而敲低TRIM9 后牛支原體LAMPs 能夠促進p65 磷酸化水平提高從而激活NF-κB 信號通路。
圖6 Western blot 檢測敲低及過表達TRIM9 基因后EBL 細胞中p65 磷酸化(A)和灰度值分析(B)Fig.6 Detection of p65 phosphorylation(A)and gray value analysis(B)of p65 phosphorylation in EBL cells after knockdown and over expression with TRIM9 gene by western blot
前期研究表明M. bovis LAMPs 通過NF-κB 信號通路誘導EBL 細胞釋放IL-1β[9-10],引發(fā)EBL 細胞的炎性反應,但EBL 細胞中參與M.bovis LAMPs 引起的炎性反應的相關基因尚不明確。本實驗通過對前期獲得的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)[5]分析,篩選出可能參與調(diào)控NF-κB 信號通路的TRIM9 基因,通過參考GenBank中TRIM9 的序列設計引物,采用qPCR 方法驗證,結果表明M.bovis LAMPs 刺激EBL 細胞增強IL-1β表達的同時,TRIM9 基因也上調(diào)表達。相關文獻報道TRIM 家族基因參與多種細胞功能,包括調(diào)節(jié)先天免疫反應[6],TRIM9 最初被認為主要存在于胚胎和成人大腦內(nèi),調(diào)控神經(jīng)元的發(fā)育成熟[11-12]。本研究通過亞細胞定位證明TRIM9基因能夠在EBL細胞內(nèi)表達。為了探究TRIM9 基因是否參與及調(diào)控M. bovis LAMPs 誘導EBL 細胞IL-1β的釋放,采用qPCR 和ELISA 方法檢測過表達和敲低TRIM9 基因后M.bovis LAMPs 刺激EBL 細胞引起IL-1β表達情況,結果顯示當TRIM9 基因過表達時EBL 細胞中IL-1β表達量無明顯變化,而敲低TRIM9 基因后EBL 細胞IL-1β表達量上調(diào)。表明敲低TRIM9 基因促進M. bovis AMPs 誘導EBL 細胞釋放IL-1β。為驗證此過程是否通過NF-κB 信號通路,采用western blot 方法檢測了同樣實驗條件下NF-κB 信號通路激活水平,發(fā)現(xiàn)過表達TRIM9 基因后M. bovis LAMPs 刺激EBL 細胞中p65 磷酸化水平與對照組相比無明顯變化;而敲低TRIM9 后檢測到刺激后的EBL 細胞中p65 磷酸化水平明顯升高,表明敲低TRIM9 基因促進M. bovis AMPs 誘導NF-κB 信號通路激活。由此表明,敲低TRIM9,促進M. bovis LAMPs 誘導EBL 細胞中NF-κB信號通路的激活,從而促進其IL-1β的釋放。Liu Y等發(fā)現(xiàn)牡蠣中TRIM9 同源物參與負調(diào)控NF-κB 活動[7],Shi M 等的研究也顯示TRIM9 磷酸化殘基與β-TrCP的重復區(qū)WD 40 的相互作用阻止了β-TrCP 與底物結合,穩(wěn)定IκBα和P100,從而阻斷NF-κB 的激活直接影響NF-κB 誘導的炎性細胞因子的產(chǎn)生[8],文獻資料說明TRIM9 能夠阻斷NF-κB 的激活,本實驗中敲低TRIM9 基因后M.bovis LAMPs 刺激細胞試驗結果,與之前的文獻結果相一致,但是正向的過表達TRIM9 基因后M.bovis LAMPs 刺激細胞試驗,并未驗證該阻斷效應。推測一方面可能與2 μg/mL M.bovis LAMPs 刺激IL-1β的釋放量不高,過表達TRIM9 基因阻斷效應不明顯,另一方面可能可能與TRIM9 基因過表達模型構建不適當相關。今后研究也將繼續(xù)針對該部分實驗進行進一步驗證和探索。綜上所述,本研究對TRIM9 在調(diào)控M.bovis 誘導宿主細胞免疫應答反應中的機制初步探究,解析宿主基因調(diào)控M.bovis 引起宿主細胞免疫應答反應的機制,為開展進一步研究奠定基礎。