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      絲瓜籽核糖體失活蛋白Luffin-α的基因克隆、表達及抗腫瘤活性研究

      2020-09-04 09:08:38
      關(guān)鍵詞:瓜籽電泳可溶性

      浙江中醫(yī)藥大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 杭州 310053

      絲瓜[Luffa cylindrica (L.) Roem.]中含有甾醇三萜及皂甙類、黃酮體和酚類、蛋白質(zhì)和氨基酸類等藥用成分,具有特殊的藥用價值。1988年,Kamenosono等[1]從絲瓜種子中分離出分子量很接近的兩種絲瓜蛋白Luffin-α和Luffin-β。研究發(fā)現(xiàn),包括Luffin-α、Luffin-β以及Luffin-P1在內(nèi)的多種蛋白均屬于Ⅰ型核糖體失活蛋白(ribosome inactivating proteins,RIPs)[2]。RIPs是通過與核糖體rRNA分子相互作用,從而阻斷蛋白質(zhì)合成的高效毒素[3],通常來源于植物、細菌和真菌,被認為是抗真菌和抗病毒劑,并且具有抗腫瘤、免疫抑制和抗生育活性[4-6],因此是一種具有發(fā)展?jié)摿Φ目鼓[瘤藥物,特別是在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域研究廣泛的Ⅰ型RIPs,可應(yīng)用于腫瘤的免疫治療[7]。但使用天然毒素治療癌癥存在許多固有的問題,如植物資源有限、分離純化過程復(fù)雜等[5],因此通過基因工程技術(shù)獲取該重組蛋白具有明顯的優(yōu)勢。

      在本研究中,通過提取絲瓜籽總RNA,然后逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,并以cDNA為模板,運用反轉(zhuǎn)錄PCR(reverse transcription polymerase chain reaction,RTPCR)技術(shù)克隆Luffin-α基因,并將該基因在大腸桿菌系統(tǒng)中進行可溶性表達,同時檢測其對HepG2和MDA-MB-231細胞的抑瘤活性,以期為后續(xù)抗腫瘤藥物的研發(fā)奠定基礎(chǔ)。

      1 材料和方法

      1.1 材料

      1.1.1 實驗材料 綠皮絲瓜選購自濱江農(nóng)貿(mào)市場。質(zhì)粒pGEX6P-1、大腸桿菌BL21(DE3)、TG1均由本實驗室保存;人肝癌細胞HepG2、人乳腺癌細胞MDA-MB-231均購于中科院上海細胞庫。

      1.1.2 試劑 Trizol試劑購自源葉生物公司(批號:L25M8G32443);T4 DNA連接酶、Taq酶和cDNA反轉(zhuǎn)錄試劑盒均為TAKARA公司產(chǎn)品(批號:AG50076A、AJ51060A、AHE4572A);質(zhì)粒抽提試劑盒、膠回收試劑盒購自Axygen公司(批號:06114KA1、01316KE1);谷胱甘肽瓊脂糖、氨芐青霉素(ampicillin,Amp)、噻唑藍(3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyltetrazolium bromide,MTT)、 異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside,IPTG)、 十二烷基硫酸鈉(sodium dodecyl sulfate,SDS)和蛋白質(zhì)定量檢測試劑盒購于生工生物工程(上海)有限公司(批號:F402DA0003、E702BA0004、F410BA0019、DB16BA 0006、E115BA0019、F129DA0001);胰蛋白酶、雙抗購自吉諾生物醫(yī)藥技術(shù)有限公司(批號:1911150405、1911110107);二甲基亞砜(dimethyl sulfoxide,DMSO)購自SIGMA公司(批號:BCBW5664);DMEM培養(yǎng)液購自HyClone公司(批號:AE29422278);谷胱甘肽硫轉(zhuǎn)移酶(glutathione S-transferase,GST)單克隆抗體(小鼠單抗)、辣根過氧化物酶標(biāo)記山羊抗小鼠lgG(H+L)、蛋白Marker購自上海碧云天生物技術(shù)有限公司(批號:09251911219、080819191204、112618190604)。

      1.1.3 儀器 scientz-950E超聲波裂體儀購于上海虔鈞科學(xué)儀器有限公司;蛋白質(zhì)電泳與轉(zhuǎn)膜儀為美國Bio-rad公司產(chǎn)品;Tanon 2500凝膠成像儀購于上海天能科技有限公司;Tpersonal型PCR儀購于Biometra公司;3K-18臺式高速冷凍離心機為Sigma公司產(chǎn)品;DSHZ-300A恒溫搖床購于江蘇太倉實驗設(shè)備廠。

      1.2 方法

      1.2.1 絲瓜籽RNA的提取 在預(yù)冷的研缽中,加入新鮮絲瓜籽0.2g,添加液氮后將其研磨成粉末,再加入Trizol試劑1mL,采用Trizol一步法提取絲瓜籽總RNA,變性瓊脂糖凝膠電泳檢測RNA的完整性,核酸微量分光光度計測A260/A280比值,-70℃凍存?zhèn)溆谩?/p>

      1.2.2 RT-PCR擴增絲瓜籽Luffin-α基因 反轉(zhuǎn)錄的操作步驟根據(jù)TAKARA公司反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書進行。根據(jù)GeneBank中的Luffin-α的cDNA序列,設(shè)計合成引物L(fēng)uffin-F1和Luffin-R1,擴增絲瓜Luffin-α基因,引物設(shè)計和測序均由上海鉑尚生物有限公司完成,引物序列見表1。 反應(yīng)體系如下:cDNA 2μL,10×PCR Buffer 5μL,dNTP (2.5mol·L-1)2μL,Taq酶 (1U·μL-1)0.5μL,正反向引物各1μL,ddH2O 38.5μL,總計50μL。反應(yīng)條件如下:94℃預(yù)變性3min,98℃ 20s,61℃ 45s,68℃ 45s,2個循環(huán);98℃ 20s,59℃ 45s,68℃ 45s,3個循環(huán);98℃ 20s,57℃ 45s,68℃ 45s,共28個循環(huán)。 結(jié)束后,通過1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定PCR產(chǎn)物,然后按照Axygen公司的膠回收試劑盒內(nèi)附說明書進行切膠回收。PCR產(chǎn)物與pTA2載體進行T-A克隆,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至TG1感受態(tài)細胞中,均勻涂布在含Amp的LB固體培養(yǎng)基上,37℃培養(yǎng)12h。隨機挑取6到8個菌落,菌落經(jīng)PCR初步鑒定后,再寄送至上海鉑尚生物有限公司測序。測序結(jié)果通過NCBI上的Blast軟件進行比對。

      表1 引物序列Tab.1 Primer sequences

      1.2.3 pGEX6P-1/Luffin-α重組載體構(gòu)建 以經(jīng)測序驗證的pTA2-Luffin-α質(zhì)粒為模板,采用Luffin-F2/R2引物重新擴增Luffin-α基因,切膠回收擴增產(chǎn)物。然后用限制性內(nèi)切酶BamHI和EcoRI雙酶切Luffin-α基因,再利用T4 DNA連接酶連接至pGEX6P-1載體上,轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)中,涂布在含Amp的LB固體培養(yǎng)基上,挑取單克隆菌落至5mL LB液中搖菌12h左右,抽提質(zhì)粒,通過BamHI和EcoRI雙酶切鑒定陽性克隆。

      1.2.4 絲瓜籽Luffin-α基因在E.coli中的可溶性表達鑒定 挑取重組大腸桿菌單菌落至5mL含Amp的LB培養(yǎng)基中,37℃,180r/min振蕩培養(yǎng)過夜后,將菌液按1∶100的比例接種至200mL含Amp的LB培養(yǎng)基中,37℃,220r/min振蕩培養(yǎng)約2h后,加入IPTG至終濃度為1mmol·L-1,在誘導(dǎo)溫度為16℃,180r/min的條件下培養(yǎng)20h左右。5 000r/min離心收菌后進行超聲裂體,超聲2s,間隙2s,功率50%,總時20min,12 000r/min離心收集上清液與沉淀,以十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳 (sodium dodecyl sulfate-polyacrylamide gel electrophoresis,SDS-PAGE)進行可溶性表達鑒定。

      1.2.5 絲瓜籽Luffin-α基因可溶性表達的優(yōu)化體系構(gòu)建

      1.2.5.1 IPTG濃度的優(yōu)化 按1.2.4中操作常溫培養(yǎng)菌液后,取出冷卻數(shù)分鐘,分別加入IPTG至終濃度為0.3、0.5、0.8、1mmol·L-1, 分別置于16℃的低溫搖床中培養(yǎng)20h,超聲裂解后收集上清液,進行SDS-PAGE電泳檢測,篩選最佳IPTG濃度。

      1.2.5.2 誘導(dǎo)溫度的優(yōu)化 按1.2.4中操作常溫培養(yǎng)菌液后,加入IPTG終濃度至0.8mmol·L-1,分別在10、16、25、37℃的條件下誘導(dǎo)20h左右。誘導(dǎo)結(jié)束后超聲裂體收集上清液,進行SDS-PAGE電泳檢測,篩選最佳誘導(dǎo)溫度。

      1.2.6 Luffin-α重組蛋白的SDS-PAGE和Western blot檢測 按照1.2.5探索出的最佳優(yōu)化體系進行目標(biāo)蛋白的可溶性表達,下一步進行GST融合標(biāo)簽純化,步驟如下:取上清液過0.45μm濾膜,將上清液與400μL谷胱甘肽瓊脂糖純化樹脂混合后在冰上搖45min,然后用10倍柱體積的磷酸鹽緩沖液(phosphate buffer saline,PBS)清洗,Bradford檢測是否洗凈,最后用10mmol GST Elution Buffer 400μL洗脫4次,SDSPAGE電泳檢測目標(biāo)蛋白純度。

      提取的Luffin-α蛋白經(jīng)SDS-PAGE電泳后,在轉(zhuǎn)膜儀上將凝膠轉(zhuǎn)至硝酸纖維素膜上,轉(zhuǎn)膜結(jié)束采用脫脂奶封閉2h,加入GST單克隆抗體,4℃孵育過夜,Tris-吐溫緩沖液(Tris buffered saline Tween,TBST)洗滌,加入辣根過氧化物酶標(biāo)記山羊抗小鼠二抗,搖床常溫孵育2h,TBST洗滌,用電化學(xué)(electro-chemiluminescence,ECL)發(fā)光液顯影。

      1.2.7 重組蛋白的抗腫瘤活性實驗 將對數(shù)生長期的HepG2細胞和MDA-MB-231細胞分別按5×104個/L和1×105個/mL的細胞數(shù)量接種于96孔板中,每孔100μL,置于培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24h。細胞貼壁后,分別以6.25、12.5、25、50、100、200、400μg·mL-1的重組蛋白對HepG2細胞和MDA-MB-231細胞進行梯度給藥,每種濃度設(shè)6個復(fù)孔,同時設(shè)置對照組,對照組重組蛋白濃度為0μg·mL-1。HepG2細胞置于5%CO2,37℃培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)24、48、72h,MDA-MB-231細胞則置于無CO2培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)24、48h。終止培養(yǎng)時,每孔加入20μL MTT溶液,培養(yǎng)箱中再孵育4h,然后吸除MTT溶液,加入150μL DMSO,避光振蕩15min后,490nm處檢測吸光度,計算細胞存活率及其半數(shù)抑制濃度(half maximal inhibitory concentration,IC50),并比較Luffinα重組蛋白對兩種細胞的抑制作用。

      1.3 統(tǒng)計學(xué)分析 采用SPSS 25.0統(tǒng)計軟件進行統(tǒng)計學(xué)分析,兩組間比較采用獨立樣本t檢驗。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

      2 結(jié)果

      2.1 絲瓜籽Luffin-α基因的擴增 PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖電泳,發(fā)現(xiàn)一條大小約為800bp的明顯亮帶,與目的基因大小基本吻合。見圖1。該基因經(jīng)過T-A克隆,與pTA2載體相連接并測序,鑒定發(fā)現(xiàn)該基因序列與GeneBank中已報道的Luffin-α基因序列完全相同。

      圖1 RT-PCR擴增絲瓜籽Luffin-α基因Fig.1 Amplification of the Luffin-α gene from the seeds of Luffa Cylindrica by RT-PCR

      2.2 重組表達質(zhì)粒的構(gòu)建 將上述克隆獲得的Luffin-α基因通過酶切、連接方式克隆到pGEX6P-1載體的BamHI和EcoRI位點處。將獲得的重組質(zhì)粒(pGEX6P-1/Luffin-α)進行雙酶切鑒定,1%瓊脂糖電泳檢測結(jié)果顯示,雙酶切(BamHI和EcoRI)產(chǎn)物出現(xiàn)一條大小約為800bp的條帶,與目的條帶大小一致。見圖2。進一步測序驗證后表明重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。

      圖2 重組質(zhì)粒(pGEX6P-1/Luffin-α)雙酶切鑒定Fig.2 Identification of recombinant plasmid(pGEX6P-1/Luffin-α) by restriction enzymatic digestion

      2.3 重組蛋白的初步表達鑒定 重組質(zhì)粒pGEX6P-1/Luffin-α轉(zhuǎn)化至大腸桿菌BL21(DE3)中進行誘導(dǎo)表達,對細胞裂解后的上清液和沉淀進行SDS-PAGE電泳檢測。第2泳道是pGEX6P-1/Luffin-α轉(zhuǎn)化至大腸桿菌誘導(dǎo)表達后的上清液,發(fā)現(xiàn)有56kD的目標(biāo)蛋白條帶,而沉淀中目標(biāo)蛋白的含量較少。見圖3。由此表明,融合蛋白大多以可溶性形式存在于上清液當(dāng)中。

      2.4 絲瓜籽Luffin-α基因可溶性表達的最佳優(yōu)化條件

      2.4.1 誘導(dǎo)的最佳IPTG濃度 在誘導(dǎo)溫度為16℃,IPTG終濃度分別為0.3、0.5、0.8、1mmol·L-1的條件下分別誘導(dǎo)20h。SDS-PAGE電泳圖顯示重組可溶性蛋白Luffin-α均有表達, 但IPTG終濃度為0.8、1mmol·L-1的表達量比IPTG終濃度為0.3、0.5mmol·L-1的多,且由于IPTG終濃度為0.8和1mmol.L-1時表達量較為接近。見圖4。 因此,選用0.8mmol·L-1作為誘導(dǎo)Luffin-α基因可溶性表達的最佳IPTG濃度。

      圖3 重組蛋白在BL21(DE3)中的表達Fig.3 Expression of recombinant protein in BL21(DE3)

      圖4 IPTG濃度對Luffin-α重組蛋白原核表達的影響Fig.4 Effects of IPTG concentrations on prokaryotic expression of Luffin-α recombinant protein

      2.4.2 誘導(dǎo)的最佳溫度 在IPTG終濃度為0.8mmol·L-1、誘導(dǎo)溫度為10、16、25、37℃的條件下分別誘導(dǎo)20h后進行SDS-PAGE電泳鑒定。結(jié)果表明,Luffin-α重組蛋白均有表達,但以16℃條件下表達量最多。見圖5。

      2.4.3 Luffin-α重組蛋白的可溶性表達 在0.8mmol·L-1IPTG,16℃誘導(dǎo)20h的最佳優(yōu)化體系下可溶性表達Luffin-α重組蛋白,將純化后的蛋白進行SDS-PAGE電泳,結(jié)果顯示56kD處產(chǎn)生一條特異性條帶,表明帶有GST標(biāo)簽的Luffin-α重組蛋白已成功表達。見圖6。Western blot鑒定發(fā)現(xiàn)純化后的重組蛋白條帶濃集,GST標(biāo)簽含量較少,且重組蛋白反應(yīng)原性較強。見圖7。

      圖5 誘導(dǎo)溫度對Luffin-α重組蛋白原核表達的影響Fig.5 Effects of induction temperature on prokaryotic expression of Luffin-α recombinant protein

      圖6 重組GST-Luffin-α蛋白的SDS-PAGE檢測Fig.6 SDS-PAGE analysis of recombinant GST-Luffin-α protein

      圖7 重組GST-Luffin-α蛋白的Western blot鑒定Fig.7 Western blot analysis of recombinant GST-Luffin-α protein

      2.5 重組蛋白的抗腫瘤活性實驗 Luffin-α重組蛋白對HepG2細胞和MDA-MB-231細胞具有不同程度的抑制作用。作用HepG2細胞24、48、72h后,細胞存活率見圖8,IC50分別為182、100.04、87.85μg·mL-1。 作用MDA-MB-231細胞24、48h后,細胞存活率見圖9,IC50分別為278.53、208.94μg·mL-1。隨著Luffin-α蛋白濃度的增加和作用時間的延長,細胞存活率顯著下降,呈現(xiàn)一定的濃度-時間依賴性。 400μg·mL-1Luffin-α重組蛋白對HepG2細胞和MDA-MB-231細胞均具有較好的抑制效果。見圖10、11。分別對HepG2細胞和MDA-MB-231細胞的24、48h給藥組進行比較,兩者只有50、100、200μg·mL-1組差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。見圖12。由此表明低濃度的Luffin-α重組蛋白對兩種細胞的增殖抑制作用較為相似,而高濃度則呈現(xiàn)一定的差異。

      3 討論

      RIPs是廣泛存在于不同植物細胞中并能抑制真核細胞蛋白質(zhì)合成的一類毒素蛋白[8],現(xiàn)已從350余種植物中篩選到110多種RIPs。根據(jù)分子結(jié)構(gòu)的不同可以分為3型:Ⅰ型RIPs為單鏈蛋白,只含有單一的RNA N-糖苷酶結(jié)構(gòu)域,其代表是天花粉蛋白(trichosanthin,TCS)[9]、 苦瓜蛋白 (momoridica anti-HIV protein,MAP30)、絲瓜蛋白(Luffin)等,因其具有良好的抗腫瘤、抗病毒活性,特別是具有抗艾滋病毒的活性而引起廣泛關(guān)注[10];Ⅱ型RIPs含有一個具有RNA N-糖苷酶活性的A鏈和一個具有糖基識別活性的B鏈[4],例如蓖麻毒素[11]、相思豆毒素等;Ⅲ型RIPs只有一條多肽鏈且不具備RNA N-糖苷酶活性,該類RIPs并不多見。

      圖8 Luffin-α重組蛋白對HepG2細胞增殖的影響Fig.8 Effects of Luffin-α recombinant protein on HepG2 cell proliferation

      圖9 Luffin-α重組蛋白對MDA-MB-231細胞增殖的影響Fig.9 Effects of Luffin-α recombinant protein on MDA-MB-231 cell proliferation

      圖10 Luffin-α重組蛋白對MDA-MB-231細胞的抑制作用(100×)Fig.10 The inhibition of 400μg·mL-1Luffin-α recombinant protein on MDA-MB-231 cell (100×)

      圖11 Luffin-α重組蛋白對HepG2細胞抑制作用(100×)Fig.11 The inhibition of Luffin-α recombinant proteinon HepG2 cell(100×)

      絲瓜籽中存在—組單鏈RIP,包括Luffin-α、Luffin-β、Luffin-S等,其中Luffin-α是迄今為止分離到的毒性最強的RIP之一[12]。RIPs對腫瘤細胞的殺傷作用遠高于對正常細胞的影響,而且由于I型RIPs缺乏B鏈,所以這類毒素對完整的細胞幾乎沒有毒性[13],而對單細胞系統(tǒng)中的蛋白生物合成則具有強烈的抑制活性,因此它是—種很有效的抗腫瘤蛋白[14-15]。

      圖12 Luffin-α重組蛋白作用于HepG2和MDA-MB-231的細胞毒性分析Fig.12 Cytotoxicity analysis of Luffin-α recombinant protein on HepG2 and MDA-MB-231

      鑒于Luffin-α顯著的抗腫瘤活性,本實驗構(gòu)建了Luffin-α的GST標(biāo)簽融合蛋白,但作為重組蛋白其在大腸桿菌中的表達較為復(fù)雜。通常情況下,融合蛋白的可溶性受到培養(yǎng)條件和表達載體的影響。大腸桿菌表達系統(tǒng)具有操作簡便、成本低廉的優(yōu)點,但在表達過程中極易形成不溶性的包涵體,影響可溶性蛋白的表達[16]。為盡可能增加Luffin-α重組蛋白在上清液中的含量,本實驗從IPTG濃度和誘導(dǎo)溫度兩方面進行考察,期望能盡量減少低溫誘導(dǎo)過程中蛋白質(zhì)的不正確折疊。 結(jié)果表明,IPTG終濃度為0.8mmol·L-1、16℃下誘導(dǎo)20h能最大程度地獲得Luffin-α重組蛋白,并用于下一步細胞毒性實驗研究。將Luffin-α重組蛋白分別作用于HepG2和MDA-MB-231兩種腫瘤細胞,由于不同細胞對藥物的敏感度存在差異,所以Luffin-α重組蛋白對兩種細胞顯示出不同程度的抑制作用。針對MDA-MB-231細胞的IC50明顯高于HepG2細胞,可能是因為與HepG2細胞比較,MDA-MB-231細胞對Luffin-α重組蛋白的吸收能力較差。而高濃度Luffinα重組蛋白對兩種細胞均顯示出較高的抑制作用,表明進入細胞內(nèi)的Luffin-α重組蛋白均能夠發(fā)揮較強的抗腫瘤活性。

      本實驗對絲瓜籽Luffin-α基因進行了成功的克隆和原核表達,并通過SDS-PAGE和Western blot驗證了重組蛋白的純度和反應(yīng)原性,進一步通過細胞增殖抑制實驗,初步鑒定了重組Luffin-α蛋白對腫瘤細胞的毒性作用,為抗腫瘤藥物的研發(fā)提供了新思路。但由于其腫瘤細胞靶向性不強[17],一定程度上需要增加給藥濃度,無可避免地增強了其毒性,下一步將考慮將其與腫瘤導(dǎo)向肽結(jié)合,增強其針對腫瘤細胞的導(dǎo)向性[18-19],從而達到靶向治療的目的。

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