靳美 宋培蕓 曹利
【摘 要】 目的:探討組蛋白去乙?;?(HDAC9)基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)與東北地區(qū)漢族人群腦梗死的相關(guān)性。方法:實(shí)驗(yàn)采用病例-對(duì)照方法,隨機(jī)選取符合研究目的的漢族腦梗死患者201名及漢族健康者139名。采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-連接酶檢測(cè)反應(yīng)(PCR-LDR),對(duì)所有受試者HDAC9 基因rs2107595位點(diǎn)進(jìn)行基因分型,統(tǒng)計(jì)分析比較病例組和對(duì)照組不同基因型(TT/CT/CC)及等位基因(C/T)的差異,并以O(shè)R(95%CI)值表示等位基因(C/T)的相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)。結(jié)果:HDAC9基因rs2107595C/T位點(diǎn),病例組TT基因型及T等位基因頻率明顯高于對(duì)照組,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=7.511,P=0.022),T等位基因攜帶者患腦梗死的風(fēng)險(xiǎn)增加(OR=1.490,95% CI:1.081~2.051)。結(jié)論:HDAC9 基因 rs2107595 位點(diǎn) SNP 與腦梗死易感性相關(guān),其中 T 等位基因可能為腦梗死的遺傳易感基因。
【關(guān)鍵詞】 HDAC9、基因多態(tài)性、腦梗死
【中圖分類號(hào)】 R743.3 ? 【文獻(xiàn)標(biāo)志碼】B ? 【文章編號(hào)】1005-0019(2020)17-199-02 ?腦梗死是一種異質(zhì)性綜合疾病,環(huán)境因素和遺傳因素的交互作用在發(fā)病中具有重要的作用[1]?;?HDAC9 是在全基因組測(cè)序研究中發(fā)現(xiàn)的與腦梗死發(fā)生密切相關(guān)的基因,我們通過對(duì)腦梗死患者基因 HDAC9 rs2107595位點(diǎn)多態(tài)性的研究,揭示表觀遺傳學(xué)中遺傳變異因素在腦梗死發(fā)病過程中所起到的作用。
1 對(duì)象與方法
1.1 對(duì)象 實(shí)驗(yàn)組為黑龍江省醫(yī)院 2017 年 1 月至 2019 年 6 月神經(jīng)內(nèi)科 201名腦梗死住院患者,所有研究對(duì)象均滿足人體試驗(yàn)倫理學(xué)標(biāo)準(zhǔn),且已簽署知情同意書。實(shí)驗(yàn)組納入的標(biāo)準(zhǔn):(1)患者均符合第四屆中國(guó)腦血管疾病學(xué)術(shù)會(huì)議關(guān)于腦卒中的診斷標(biāo)準(zhǔn);(2)擁有東北地區(qū)戶籍并且在東北地區(qū)內(nèi)居住年數(shù)大于 5 年:(3)民族為漢族。排除標(biāo)準(zhǔn):1、患者既往史中有心臟、腎臟、肝臟、骨骼和癌癥等主要疾病的,以及艾滋病,梅毒等嚴(yán)重傳染病史;2、排除患者之間存在血緣關(guān)系。
對(duì)照組為黑龍江省醫(yī)院體檢中心2017年1月至2019年6月健康體檢者139名,排除既往曾有腦卒中、腦外傷、腦血管病,排除曾有心臟、腎臟、肝臟、骨骼和癌癥等主要疾病的,以及艾滋病,梅毒等嚴(yán)重傳染病史,排除存在神經(jīng)功能明顯的缺陷者,對(duì)照組均滿足人體試驗(yàn)倫理學(xué)標(biāo)準(zhǔn)。
1.2 方法 清晨空腹肘前靜脈抽取5ml血樣,置于EDTA抗凝管后保存在-80℃冰箱中。應(yīng)用Axygen公司的AxyPrep-96全血基因組DNA試劑盒提取基因組DNA,置于-80℃冰箱保存?zhèn)溆?。使用ABI 公司PRISM3730 電泳測(cè)序儀對(duì)LDR反應(yīng)產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,通過Genemapper 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,根據(jù)不同峰型及堿基大小進(jìn)行基因分型。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 使用SPSS 22.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,不同基因型(TT/CT/CC)及等位基因(C/T)等變量屬計(jì)數(shù)資料,采用頻數(shù)及百分比表示,使用χ2檢驗(yàn)比較病例組和對(duì)照組間上述資料的差異,并以 OR(95%CI)值表示等位基因(C/T)的相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)。
2 結(jié)果
病例組及對(duì)照組 HDAC9 基因rs2107595位點(diǎn)基因型分布均符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡定律(病例組 P=0.273,對(duì)照組 P=0.919;認(rèn)為P>0.05符合Hardy-Weinberg 平衡),故本研究中病例組及對(duì)照組均有較好的群體代表性。結(jié)果顯示病例組 HDAC9 基因rs2107595 T/C位點(diǎn)TT、CT、CC基因型頻率與對(duì)照組比較,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P <0.05)。病例組T等位基因頻率明顯高于對(duì)照組,T等位基因攜帶者患腦梗死的風(fēng)險(xiǎn)增加(表 1)。
3 討論
隨著分子生物學(xué)研究的深入,遺傳學(xué)、表觀遺傳學(xué)以及環(huán)境因素受到廣泛關(guān)注。最近的全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)表明HDAC9基因與腦卒中有關(guān),但可靠性仍存在爭(zhēng)議,尤其是來(lái)自不同種族和地理位置的數(shù)據(jù)。GWAS報(bào)道HDAC9基因3端 SPN rs2107595多態(tài)性與大動(dòng)脈腦卒中風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)[2]。HDAC9缺失可能導(dǎo)致炎癥基因的下調(diào),脂質(zhì)相關(guān)基因的上調(diào),以及小鼠動(dòng)脈粥樣硬化病變大小的顯著減少[3]。大多數(shù)學(xué)者表明 rs2107595 僅增加大血管動(dòng)脈粥樣硬化性卒中風(fēng)險(xiǎn)。然而Akinyemi[4]研究非洲人群 rs2107595 多態(tài)性也會(huì)增加小血管腦卒中風(fēng)險(xiǎn)。Su[5]研究 rs2107595 與南方漢族人群腦卒中關(guān)系,在加性、顯性、隱性和等位基因模型無(wú)顯著相關(guān)性,表明 rs2107595多態(tài)性與腦梗死無(wú)關(guān)聯(lián)。
本研究發(fā)現(xiàn) HDAC9 基因 rs2107595T/C位點(diǎn)與腦梗死的發(fā)病可能存在相關(guān)性,其中T等位基因可能為腦梗死的遺傳易感基因,進(jìn)一步提示HDAC9基因rs2107595 T/C位點(diǎn)與腦梗死易感性的關(guān)聯(lián)。
同時(shí)本研究存在一定局限性,該研究為基于醫(yī)院的病例對(duì)照研究,不能排除有選擇偏倚的可能性。并且,研究結(jié)果不應(yīng)被推斷適用于其他人群,因?yàn)樵撗芯咳后w均為居住于中國(guó)東北地區(qū)的漢族人群。
綜上所述,本研究提供的數(shù)據(jù)表明,HDAC9 基因rs2107595 T/C 位點(diǎn)可能與腦梗死的疾病易感性相關(guān)。但有關(guān)該基因位點(diǎn)與疾病易感性之間的具體病理生理功能及發(fā)病機(jī)制仍有待進(jìn)一步的研究。
參考文獻(xiàn)
[1] Monitoring Tobacco Use and Prevention Policies: Perspective of WHO Report on the Global Tobacco Epidemic, 2017[J]. Journal of Nursing Science & Practice,2019,9(2).
[2] Jun S,Pierce A,et al.Extracellular superoxide dismutase polymorphism in mice[J].Arterioscler Thromb Vasc Biol.2003 Oct 01; 23(10) :1820-1825.
[3] Weber C, Noels H.Atherosclerosis: current pathogenesis and therapeutic options[J]. Nat Med. 2011 Nov 7; 17(11):1410-1422.
[4] Pearce WJ. Epigenetics: an expanding new piece of the stroke puzzle[J]. Transl Stroke Res. 2011 Sep; 2(3):243-247.
[5] Vidigal JA, Ventura A. The biological functions of mi RNAs: lessons from in vivo studies[J]. Trends Cell Biol. 2015 Mar; 25(3):137-147.