牛明 于歌
乳腺癌是一種嚴(yán)重威脅女性健康的惡性腫瘤,據(jù)統(tǒng)計在世界范圍內(nèi)每年大約2 088 849新發(fā)病例和626 679死亡病例[1]。盡管手術(shù)、放化療等治療方式不斷進(jìn)步,但乳腺癌的生存率并沒有顯著的改善[2]。因此,需要從基因水平方面發(fā)現(xiàn)更多的腫瘤標(biāo)記物,為乳腺癌的治療提供靶點,進(jìn)一步改善乳腺癌患者的生存率。
Gankyrin由重復(fù)的ankyrin序列構(gòu)成[3]。研究表明Gankyrin可以結(jié)合并磷酸化Rb,釋放激活的轉(zhuǎn)錄因子E2F1[4-5]。Gankyrin能夠通過與MDM2結(jié)合,介導(dǎo)泛素/26S蛋白酶體對p53的降解[6]。在DEN誘導(dǎo)的小鼠模型中,Gankyrin促進(jìn)C/EBP蛋白泛素化誘導(dǎo)肝癌發(fā)生[7]。體內(nèi)實驗也驗證了Gankyrin可以降解Rb、P53、C/EBP和HNF4導(dǎo)致肝癌的發(fā)生[8]。另外,Gankyrin可以通過激活Ras通路促進(jìn)肺癌發(fā)生[9]。近期研究還發(fā)現(xiàn)Gankyrin參與糖酵解和谷氨酰胺代謝加快腫瘤進(jìn)展[10-11]。Gankyrin在多種癌癥組織中過表達(dá),包括乳腺癌[12]、子宮內(nèi)膜癌[13]、肝癌[14]、結(jié)直腸癌[15]和食管癌[16]。然而Gankyrin表達(dá)與乳腺癌患者的臨床病理因素及作用機(jī)制尚不明確。本研究先通過數(shù)據(jù)庫分析Gankyrin與乳腺癌患者臨床病理因素及預(yù)后的相關(guān)性,再利用乳腺癌細(xì)胞系敲減和過表達(dá)分析Gankyrin在乳腺癌發(fā)生發(fā)展過程中的分子機(jī)制。
通過UALCAN(http://ualcan.path.uab.edu/),GEPIA(http://gepia.cancer-pku.cn),Kaplan-Meier Plot(http://kmplot.com)分析Gankyrin在乳腺癌患者中基因表達(dá)情況及其與患者總生存期(Overall survival,OS)和無進(jìn)展生存期(Progression free survival,PFS)的相關(guān)性。通過MethHC tool(http://methhc.mbc.nctu.edu.tw)分析TCGA數(shù)據(jù)庫中Gankyrin基因及啟動子甲基化的相關(guān)性。OS為隨機(jī)化開始至死亡的時間;PFS指隨機(jī)化開始至腫瘤進(jìn)展或死亡的時間。
乳腺癌細(xì)胞系BT549和MDA-MB-231購買于上海中科院細(xì)胞庫,細(xì)胞置于含有10%胎牛血清的RPMI-1640培養(yǎng)基中,并于37℃含5% CO2的溫箱中培養(yǎng)。在BT549細(xì)胞轉(zhuǎn)染Gankyrin過表達(dá)病毒和陰性對照病毒,得到對照組549Flag細(xì)胞和過表達(dá)組549Ad-Gankyrin細(xì)胞。在MDA-MB-231細(xì)胞分別轉(zhuǎn)染RNA干擾siGENOME SMARTpools和Non-Targeting siRNA各0.1 μM,得到對照組231NC細(xì)胞和敲減組231siGankyrin細(xì)胞。
利用TRIzol提取細(xì)胞RNA,利用PrimeScriptTM RT Master Mix進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,按照SYBR?Premix Ex TaqII RT-PCR試劑盒進(jìn)行實時熒光定量PCR檢測。引物合成購自長春庫美公司。引物序列為:Gankyrin:F 5′-AGCAGCCAAGGG-TAACTTGA-3′;R 5′-CCAGCAGTTTTGCTTCTTCC-3′;GAPDH:F 5′-GGA-GCGAGATCCCTCCAAAAT-3′,R 5′-GGCTGTTGTCATACTTCTCATGG-3′。
將細(xì)胞置于96孔板每孔接種細(xì)胞2 000個。培養(yǎng)24 h待細(xì)胞貼壁后加入CCK-8試劑,1 h后利用酶標(biāo)儀檢測450 nm處的OD值,繪制細(xì)胞增殖曲線。
利用APC-CD44和PE-CD24,用預(yù)冷的PBS將轉(zhuǎn)染的細(xì)胞洗滌3遍后,離心收集,加入1×Binding Buffer重懸細(xì)胞,按照說明各加入5 μL的PC-CD44和PE-CD24孵育10~15 min,利用FACSCanto II檢測CD24-/CD44+細(xì)胞比例。
將轉(zhuǎn)染后的細(xì)胞置于Tanswell小室上室(104個/孔),下室加入含有20%胎牛血清的培養(yǎng)基,放入培養(yǎng)箱培養(yǎng)24 h,將小室用結(jié)晶紫染色后PBS清洗,利用顯微鏡選取5個良好視野拍照計數(shù),取平均值計算細(xì)胞遷移的最終結(jié)果。小室上加入基質(zhì)膠重復(fù)上述步驟計算細(xì)胞侵襲的結(jié)果。
運(yùn)用SPSS軟件進(jìn)行統(tǒng)計學(xué)分析,計量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,兩組間采用t檢驗,多組間比較采用方差分析,重復(fù)測量資料采用重復(fù)測量方差分析,組間多重比較用SNK法,相關(guān)性分析采用Spearman秩相關(guān)性分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
首先通過UALCAN分析Gankyrin在乳腺癌中的表達(dá)情況。結(jié)果表明與正常乳腺組織相比,Gankyrin在乳腺癌組織中高表達(dá)(圖1A)(P<0.01),同時Gankyrin高表達(dá)與較差的OS明顯相關(guān)(圖1B)(P=0.004)。為了進(jìn)一步驗證上述結(jié)論,利用GEPIA分析發(fā)現(xiàn),Gankyrin高表達(dá)與患者較差OS明顯相關(guān)(圖1C)(P=0.004)。Kaplan-Meier Plot分析顯示Gankyrin高表達(dá)患者其PFS(圖1D)(P<0.001)和OS(圖1E)(P=0.062)都較差。因此,Gankyrin可以作為乳腺癌患者預(yù)測預(yù)后的標(biāo)志物。
本研究利用MethHC tool分析乳腺癌及乳腺正常組織中Gankyrin啟動子甲基化水平。結(jié)果表明,與乳腺癌組織相比,乳腺癌中Gankyrin啟動子甲基化水平較低(圖2A)(P<0.01),并且乳腺組織及癌組織中Gankyrin的甲基化水平與其mRNA表達(dá)呈負(fù)相關(guān)(圖2B)(r=-0.258,P<0.01),表明Gankyrin在乳腺癌組織表達(dá)水平升高部分是由于其啟動子低甲基化所導(dǎo)致的。
在MDA-MB-231細(xì)胞系進(jìn)行Gankyrin敲減后,與對照組相比,敲減組Gankyrin mRNA表達(dá)明顯下降(P<0.01)(圖3A)。CCK-8結(jié)果表明兩組細(xì)胞活力值存在統(tǒng)計學(xué)差異(F=4.622,P=0.032),5天后敲減組細(xì)胞增殖明顯低于對照組(P<0.01)(圖3B)。在BT-549細(xì)胞系進(jìn)行Gankyrin過表達(dá)后,與對照組相比,高表達(dá)組Gankyrin mRNA表達(dá)明顯上升(P<0.01)(圖3A)。CCK-8結(jié)果表明兩組細(xì)胞活力值存在統(tǒng)計學(xué)差異(F=49.101,P=0.006),5天后過表達(dá)組細(xì)胞增殖明顯高于對照組(P<0.01)(圖3C)。
圖1 乳腺癌患者Gankyrin的表達(dá)情況及其與預(yù)后的關(guān)系Figure 1 The high expression of Gankyrin was related to the poor prognosis of patients with breast cancerNote:A.The expression of Gankyrin in normal breast tissues and breast cancer tissues;B.The expression of Gankyrin in breast cancer based on lymph node metastases;C.The expression of Gankyrin in breast cancer based on the stages;D.Effect of Gankyrin expression on breast cancer patient survival;E.The expression of Gankyrin and survival analysis was performed by GEPIA;F and G.Survival analysis of Gankyrin in breast cancer was performed at the online website Kaplan-Meier Plotter.**P<0.01,when compared with the normal group.
圖2 Gankyrin啟動子甲基化與其在乳腺癌表達(dá)的關(guān)系Figure 2 The Gankyrin promoter was hypermethylated in breast cancer tissues in the TCGA databaseNote:A.Comparison of average methylation values of Gankyrin gene in normal and breast cancer samples;B.The correlation between promoter methylation value and mRNA expression of Gankyrin in breast cancer by Pearson.**P<0.01,when compared with the normal group.
圖3 Gankyrin促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞增殖Figure 3 The effect of Gankyrin on cell proliferation of breast cancerNote:A.Knockdown and overexpression efficiencies of Gankyrin were confirmed by qPCR;B.Gankyrin silencing inhibited the proliferation of MDA-MB-231 cells;C.Overexpression of Gankyrin promoted the proliferation ability in BT-549 cells.*P<0.05,**P<0.01,when compared with the control group.
Transwell結(jié)果顯示敲減Gankyrin可以降低MDA-MB-231細(xì)胞的轉(zhuǎn)移和侵襲能力(圖4A,圖4B)(P<0.01)。而過表達(dá)Gankyrin能促進(jìn)BT-549細(xì)胞的轉(zhuǎn)移和侵襲能力(圖4C,圖4D)(P<0.05)。
圖4 Gankyrin促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移和侵襲Figure 4 Gankyrin promoted the migration and invasion of breast cancer cellsNote:A.and B.The Changes of cell migration and invasion abilities were measured after Gankyrin silencing in MDA-MB-231 cells;C.and D.The Changes of cell migration and invasion abilities were measured after Gankyrin overexpression in BT-549 cells.*P<0.05,**P<0.01,when compared with the control group.
CD24-/CD44+細(xì)胞具有乳腺癌腫瘤干細(xì)胞特征。流式細(xì)胞檢測發(fā)現(xiàn),敲降Gankyrin后的MDA-MB-231細(xì)胞中,CD24-/CD44+細(xì)胞比例明顯下降(圖5A)(P<0.01)。而在過表達(dá)Gankyrin的BT-549細(xì)胞中,CD24-/CD44+細(xì)胞比例明顯上升(圖5B)(P<0.01)。
圖5 Gankyrin增加乳腺癌腫瘤干細(xì)胞比例Figure 5 Gankyrin increased the percentage of cancer stem cell populationNote:A.Knockdown Gankyrin decreased CD24-/CD44+ proportion in MDA-MB-231 cells;B.Overexpression Gankyrin increased CD24-/CD44+ proportion in BT-549 cells.**P<0.01,when compared with the control group.
Gankyrin又名p28GANK,或26S蛋白酶體非ATP酶亞基(PSMD10),位于人類染色體Xq22.3上,全長約1.5 kb,編碼由226個氨基酸組成的蛋白質(zhì)。Gankyrin最初發(fā)現(xiàn)于肝癌,隨著研究的深入,發(fā)現(xiàn)其在多種癌癥中過表達(dá)并與患者較差的預(yù)后相關(guān),包括子宮內(nèi)膜癌、結(jié)直腸癌、食管癌和肝癌等[13,15-18]。Gankyrin可以抑制P53及Rb等多種抑癌基因,促進(jìn)腫瘤進(jìn)展,同時其可以調(diào)控多種信號通路。研究表明Gankyrin過表達(dá)可以激活A(yù)KT信號通路,不僅可以誘導(dǎo)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激抑制腫瘤細(xì)胞凋亡[19],而且還能夠提高β-catenin活性,促進(jìn)腫瘤形成[20]。Gankyrin可以激活STAT3信號通路,誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化及基質(zhì)金屬蛋白酶的表達(dá)進(jìn)而促進(jìn)腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移,同時上調(diào)CyclinD1表達(dá)促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖[14,17]。Gankyrin與NF-kB/RelA相互作用,抑制NF-kB/RelA向核內(nèi)轉(zhuǎn)運(yùn),進(jìn)而抑制其活性[21]。因此,Gankyrin可以參與多種信號通路,調(diào)控腫瘤細(xì)胞的生物學(xué)功能。
本研究結(jié)果顯示,與正常乳腺組織相比,Gankyrin在乳腺癌組織中表達(dá)明顯增高,我們進(jìn)一步分析了Gankyrin表達(dá)與表觀遺傳的關(guān)系,發(fā)現(xiàn)乳腺癌組織Gankyrin表達(dá)增高與其啟動子甲基化水平較低具有相關(guān)性。利用多個數(shù)據(jù)庫分析Gankyrin表達(dá)與乳腺癌患者預(yù)后的相關(guān)性,結(jié)果顯示Gankyrin高表達(dá)的乳腺癌患者其預(yù)后較差,表明其在乳腺癌中發(fā)揮癌基因作用,可以促進(jìn)乳腺癌進(jìn)展。通過分子實驗表明,Gankyrin可以增強(qiáng)乳腺癌細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移能力,這與該基因在其它癌癥的研究結(jié)果相似。眾所周知,腫瘤的轉(zhuǎn)移與上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化密切相關(guān)[22]。Fu等[17]發(fā)現(xiàn)Gankyrin可以誘導(dǎo)肝癌細(xì)胞上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化從而促進(jìn)癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移。近期研究表明Gankyrin能夠上調(diào)低氧誘導(dǎo)分子和Rac1表達(dá)進(jìn)而促進(jìn)乳腺癌轉(zhuǎn)移[12,23],本研究結(jié)果進(jìn)一步驗證了上述結(jié)論。
腫瘤干細(xì)胞具有較強(qiáng)的自我更新和分化能力,因此具有高致瘤性,對放化療抵抗的特征,其在癌癥的發(fā)生和進(jìn)展中發(fā)揮重要作用。Qian等[24]發(fā)現(xiàn)Gankyrin可以通過降解Oct-4維持肝癌腫瘤干細(xì)胞特征。但是該基因是否參與調(diào)控乳腺癌腫瘤干細(xì)胞尚未有報道。乳腺癌腫瘤干細(xì)胞分子標(biāo)志物為CD24-/CD44+,本實驗在乳腺癌細(xì)胞中敲降Gankyrin后,CD24-/CD44+細(xì)胞比例明顯下降;而過表達(dá)該基因后,CD24-/CD44+細(xì)胞比例上升,表明Gankyrin對于維持乳腺癌腫瘤干細(xì)胞特征具有重要作用,其成瘤性及具體機(jī)制仍需要進(jìn)一步的研究。
綜上所述,通過分析發(fā)現(xiàn)Gankyrin在乳腺癌表達(dá)增高并且與患者的不良預(yù)后相關(guān)。乳腺癌組織Gankyrin啟動子甲基化水平降低與其表達(dá)增高明顯相關(guān)。Gankyrin可以促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞增殖和轉(zhuǎn)移,維持腫瘤干細(xì)胞特征。因此,Gankyrin在乳腺癌的發(fā)生發(fā)展過程中起到重要作用,基于Gankyrin關(guān)鍵分子的靶向治療有待進(jìn)一步探索。